EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000004005 (Gene tree)
Gene ID: 101173234
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6323 bases
Position: chr11:9794973-9801295
Accession: 101173234
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000005003	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000005004	-	2288	XM_011480818	ENSORLP00000005003	418 (aa)	XP_011479120	H2LGA8

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.333	ENSG00000105849	TWISTNB	88	44.089	Homo_sapiens
ENSORLG00000004005	twistnb	88	67.725	ENSAPOG00000011796	twistnb	96	67.480	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000004005	twistnb	88	64.865	ENSACIG00000020400	twistnb	97	64.384	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000004005	twistnb	86	68.293	ENSAOCG00000024200	twistnb	96	67.480	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000004005	twistnb	86	68.564	ENSAPEG00000016750	twistnb	96	68.022	Amphiprion_percula
ENSORLG00000004005	twistnb	85	68.508	ENSATEG00000017956	twistnb	96	67.027	Anabas_testudineus
ENSORLG00000004005	twistnb	89	65.957	ENSACLG00000022280	twistnb	95	65.526	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000004005	twistnb	65	51.408	ENSAMXG00000035868	twistnb	61	61.386	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.667	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	88	48.562	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000004005	twistnb	83	45.070	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	91	44.136	Cavia_porcellus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSCATG00000035621	TWISTNB	88	45.048	Cercocebus_atys
ENSORLG00000004005	twistnb	83	43.697	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	86	46.926	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	88	45.048	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSCANG00000038759	TWISTNB	88	45.048	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000004005	twistnb	86	60.158	ENSCVAG00000014324	twistnb	97	63.061	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000004005	twistnb	73	44.058	ENSDARG00000024416	twistnb	87	44.868	Danio_rerio
ENSORLG00000004005	twistnb	76	45.427	ENSDORG00000007795	Twistnb	90	44.771	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000004005	twistnb	88	54.032	ENSELUG00000000098	TWISTNB	94	55.014	Esox_lucius
ENSORLG00000004005	twistnb	66	45.907	ENSFALG00000009761	TWISTNB	51	58.974	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000004005	twistnb	59	71.600	ENSFHEG00000013318	twistnb	97	57.412	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000004005	twistnb	86	59.682	ENSGAFG00000018309	twistnb	97	59.151	Gambusia_affinis
ENSORLG00000004005	twistnb	61	67.059	ENSGACG00000006425	twistnb	89	67.490	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.333	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	88	45.283	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000004005	twistnb	89	65.957	ENSHBUG00000020155	twistnb	95	65.526	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000004005	twistnb	79	46.018	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	91	43.302	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000004005	twistnb	85	56.576	ENSHCOG00000010590	twistnb	96	57.320	Hippocampus_comes
ENSORLG00000004005	twistnb	81	48.295	ENSIPUG00000004117	twistnb	87	49.226	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000004005	twistnb	88	59.786	ENSKMAG00000001591	twistnb	96	60.753	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000004005	twistnb	86	63.736	ENSLBEG00000024225	twistnb	96	63.043	Labrus_bergylta
ENSORLG00000004005	twistnb	72	47.841	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	88	44.728	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000004005	twistnb	72	47.841	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	87	44.728	Macaca_mulatta
ENSORLG00000004005	twistnb	73	45.833	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	86	44.337	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	88	45.048	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000004005	twistnb	89	65.957	ENSMZEG00005007561	twistnb	95	65.526	Maylandia_zebra
ENSORLG00000004005	twistnb	72	47.541	ENSMICG00000036489	TWISTNB	90	46.057	Microcebus_murinus
ENSORLG00000004005	twistnb	71	47.826	ENSMOCG00000003458	Twistnb	90	45.307	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000004005	twistnb	87	59.318	ENSMMOG00000020085	twistnb	95	57.219	Mola_mola
ENSORLG00000004005	twistnb	70	44.966	ENSMODG00000001402	-	64	43.730	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000004005	twistnb	83	57.065	ENSMALG00000016407	twistnb	85	59.941	Monopterus_albus
ENSORLG00000004005	twistnb	74	48.726	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	83	49.045	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000004005	twistnb	85	66.111	ENSNBRG00000008652	twistnb	96	66.022	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000004005	twistnb	79	46.246	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	88	46.645	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000004005	twistnb	72	46.667	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	90	46.326	Ochotona_princeps
ENSORLG00000004005	twistnb	83	44.729	ENSODEG00000007222	TWISTNB	91	43.789	Octodon_degus
ENSORLG00000004005	twistnb	88	97.290	ENSORLG00020002579	twistnb	98	97.290	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000004005	twistnb	99	96.394	ENSORLG00015013403	twistnb	99	96.394	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.333	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	88	45.192	Pan_paniscus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	45.000	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	54	59.551	Panthera_pardus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.333	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	88	45.048	Pan_troglodytes
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSPANG00000015736	TWISTNB	88	45.048	Papio_anubis
ENSORLG00000004005	twistnb	50	63.158	ENSPKIG00000025635	twistnb	54	64.948	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000004005	twistnb	86	60.541	ENSPMGG00000019023	twistnb	95	61.202	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000004005	twistnb	73	42.997	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	51	59.172	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000004005	twistnb	72	46.000	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	88	47.284	Pongo_abelii
ENSORLG00000004005	twistnb	85	65.922	ENSPNYG00000002674	twistnb	96	65.470	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000004005	twistnb	85	46.218	ENSPNAG00000011956	twistnb	98	45.040	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	87	45.048	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000004005	twistnb	72	48.173	ENSRROG00000040155	TWISTNB	88	45.048	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000004005	twistnb	72	47.000	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	88	46.645	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000004005	twistnb	64	46.465	ENSSFOG00015012788	twistnb	58	64.324	Scleropages_formosus
ENSORLG00000004005	twistnb	88	66.489	ENSSMAG00000012792	twistnb	95	67.493	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000004005	twistnb	85	65.574	ENSSDUG00000007038	twistnb	96	65.054	Seriola_dumerili
ENSORLG00000004005	twistnb	85	67.680	ENSSPAG00000005871	twistnb	96	66.576	Stegastes_partitus
ENSORLG00000004005	twistnb	80	57.015	ENSTNIG00000017778	twistnb	90	57.729	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000004005	twistnb	86	61.957	ENSXCOG00000020199	twistnb	96	60.870	Xiphophorus_couchianus