EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000005143 (Gene tree)
Gene ID: 101163387
Gene Symbol: polr1e
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3887 bases
Position: chr1:12630703-12634589
Accession: 101163387
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000006482	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	5.3e-119	1	1
ENSORLP00000039741	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	5.3e-119	1	1
ENSORLP00000006483	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	6e-119	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000006484	-	1916	XM_004065729	ENSORLP00000006483	431 (aa)	XP_004065777	H2LKD2
ENSORLT00000041064	-	2126	XM_023956414	ENSORLP00000039741	416 (aa)	XP_023812182	UPI0002A4CB66
ENSORLT00000006483	-	1784	-	ENSORLP00000006482	416 (aa)	-	H2LKD1

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000005143's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000005143's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.310	ENSG00000137054	POLR1E	98	44.310	Homo_sapiens
ENSORLG00000005143	polr1e	100	67.308	ENSAPOG00000012452	polr1e	100	67.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	40.652	ENSAMEG00000010193	POLR1E	95	40.652	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000005143	polr1e	100	64.115	ENSACIG00000009884	polr1e	99	68.448	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.154	ENSAOCG00000005665	polr1e	100	71.154	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.394	ENSAPEG00000020581	polr1e	100	71.394	Amphiprion_percula
ENSORLG00000005143	polr1e	100	74.519	ENSATEG00000020609	polr1e	100	74.519	Anabas_testudineus
ENSORLG00000005143	polr1e	81	40.000	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	40.000	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.686	ENSANAG00000038046	POLR1E	98	44.686	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.798	ENSACLG00000013685	polr1e	99	73.798	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000005143	polr1e	99	55.181	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.181	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.894	ENSBTAG00000012243	POLR1E	98	45.894	Bos_taurus
ENSORLG00000005143	polr1e	94	43.641	ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	46.237	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.686	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	44.686	Canis_familiaris
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.444	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	44.444	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.894	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	45.894	Capra_hircus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.444	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	44.444	Carlito_syrichta
ENSORLG00000005143	polr1e	70	43.986	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	43.986	Cavia_aperea
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.819	ENSCPOG00000009965	POLR1E	98	44.819	Cavia_porcellus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	40.194	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	40.194	Cebus_capucinus
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSCATG00000031732	POLR1E	98	44.552	Cercocebus_atys
ENSORLG00000005143	polr1e	87	45.856	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.856	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSCSAG00000010782	POLR1E	98	44.552	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000005143	polr1e	95	37.186	ENSCHOG00000013024	POLR1E	83	37.186	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000005143	polr1e	99	46.283	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	46.283	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000005143	polr1e	98	45.036	ENSCANG00000036112	POLR1E	98	45.036	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	42.651	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	42.651	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000005143	polr1e	99	42.169	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	42.169	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000005143	polr1e	99	64.819	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	64.819	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.875	ENSCVAG00000019759	polr1e	100	71.875	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000005143	polr1e	97	56.436	ENSDARG00000006434	polr1e	100	56.250	Danio_rerio
ENSORLG00000005143	polr1e	99	37.234	ENSDNOG00000010257	POLR1E	96	38.022	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000005143	polr1e	83	43.353	ENSETEG00000018204	POLR1E	96	43.353	Echinops_telfairi
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.203	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	44.203	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	43.961	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	43.961	Equus_caballus
ENSORLG00000005143	polr1e	92	40.209	ENSEEUG00000011928	POLR1E	84	39.196	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	64.578	ENSELUG00000008150	polr1e	99	64.578	Esox_lucius
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.578	ENSFCAG00000013081	POLR1E	98	44.578	Felis_catus
ENSORLG00000005143	polr1e	95	43.970	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	43.970	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.418	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	44.418	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.942	ENSFHEG00000009801	polr1e	100	71.942	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	51.306	ENSGMOG00000003336	POLR1E	99	51.306	Gadus_morhua
ENSORLG00000005143	polr1e	97	44.554	ENSGALG00000005395	POLR1E	97	44.554	Gallus_gallus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.394	ENSGAFG00000004850	polr1e	100	71.394	Gambusia_affinis
ENSORLG00000005143	polr1e	100	67.542	ENSGACG00000016087	polr1e	100	67.542	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000005143	polr1e	97	41.133	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	41.007	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.231	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	44.231	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.798	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	73.798	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.783	ENSHGLG00000002036	POLR1E	98	45.783	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000005143	polr1e	99	46.024	ENSHGLG00100012784	POLR1E	98	46.024	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000005143	polr1e	100	66.587	ENSHCOG00000002774	polr1e	100	66.587	Hippocampus_comes
ENSORLG00000005143	polr1e	99	56.145	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	56.145	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.203	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	44.203	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	43.932	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	43.932	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.558	ENSKMAG00000000046	polr1e	100	73.558	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	70.602	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	70.602	Labrus_bergylta
ENSORLG00000005143	polr1e	86	49.315	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.315	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000005143	polr1e	99	52.392	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	52.392	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.411	ENSLAFG00000012831	POLR1E	98	45.411	Loxodonta_africana
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSMFAG00000045465	POLR1E	97	44.444	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSMMUG00000017892	POLR1E	98	44.552	Macaca_mulatta
ENSORLG00000005143	polr1e	98	40.515	ENSMNEG00000040283	POLR1E	97	42.152	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSMLEG00000031135	POLR1E	98	44.552	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	71.566	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	71.566	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.317	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	73.317	Maylandia_zebra
ENSORLG00000005143	polr1e	99	42.995	ENSMAUG00000021044	Polr1e	95	42.995	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.928	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	44.928	Microcebus_murinus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	41.646	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	41.646	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000005143	polr1e	100	70.264	ENSMMOG00000007391	polr1e	100	70.264	Mola_mola
ENSORLG00000005143	polr1e	94	45.960	ENSMODG00000002884	POLR1E	95	45.960	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.875	ENSMALG00000002665	polr1e	99	71.875	Monopterus_albus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	41.063	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	98	41.457	Mus_caroli
ENSORLG00000005143	polr1e	99	42.169	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	42.356	Mus_musculus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	43.614	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	98	43.860	Mus_pahari
ENSORLG00000005143	polr1e	99	42.169	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	98	42.356	Mus_spretus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	40.086	ENSMPUG00000006040	POLR1E	98	38.925	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.169	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	45.169	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.175	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	44.175	Nannospalax_galili
ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.798	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	73.798	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.686	ENSNLEG00000003616	POLR1E	98	44.686	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000005143	polr1e	74	49.558	ENSMEUG00000015372	-	80	49.558	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000005143	polr1e	86	40.934	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	40.934	Ochotona_princeps
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.301	ENSODEG00000014565	POLR1E	96	45.301	Octodon_degus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	73.558	ENSONIG00000008921	polr1e	99	73.558	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	43.237	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	43.237	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000005143	polr1e	94	94.602	ENSORLG00020007271	polr1e	100	94.602	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000005143	polr1e	100	98.798	ENSORLG00015000137	polr1e	100	98.798	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000005143	polr1e	100	88.942	ENSOMEG00000013264	polr1e	100	88.679	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000005143	polr1e	99	43.750	ENSOGAG00000012981	POLR1E	96	43.750	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000005143	polr1e	99	46.135	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	46.135	Ovis_aries
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.310	ENSPPAG00000034566	POLR1E	98	44.310	Pan_paniscus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.578	ENSPPRG00000005649	POLR1E	98	44.578	Panthera_pardus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.578	ENSPTIG00000009774	POLR1E	98	44.578	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.310	ENSPTRG00000020944	POLR1E	98	44.310	Pan_troglodytes
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSPANG00000025563	POLR1E	98	44.552	Papio_anubis
ENSORLG00000005143	polr1e	99	57.518	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.518	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.499	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	44.988	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000005143	polr1e	95	63.889	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	63.889	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	37.198	ENSPEMG00000022300	-	94	37.198	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000005143	polr1e	99	42.995	ENSPEMG00000019151	-	95	42.995	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.107	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	45.107	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	68.027	ENSPFOG00000019627	polr1e	100	68.090	Poecilia_formosa
ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.115	ENSPLAG00000022679	polr1e	100	72.115	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000005143	polr1e	87	73.333	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	73.333	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000005143	polr1e	100	70.913	ENSPREG00000009470	polr1e	100	70.913	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.203	ENSPPYG00000019061	POLR1E	98	44.203	Pongo_abelii
ENSORLG00000005143	polr1e	50	41.706	ENSPCAG00000004891	POLR1E	68	41.706	Procavia_capensis
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.068	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	44.068	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000005143	polr1e	96	44.389	ENSPVAG00000007940	POLR1E	84	44.389	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	74.038	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	74.038	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000005143	polr1e	99	54.808	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	54.808	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000005143	polr1e	99	41.063	ENSRNOG00000012664	Polr1e	96	40.855	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000005143	polr1e	94	45.088	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	45.789	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.552	ENSRROG00000031986	POLR1E	98	44.552	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000005143	polr1e	98	44.526	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	44.526	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000005143	polr1e	82	45.665	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	45.665	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000005143	polr1e	99	57.074	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	57.074	Scleropages_formosus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	71.807	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	71.807	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.115	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	72.115	Seriola_dumerili
ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.115	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	72.115	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000005143	polr1e	56	39.224	ENSSARG00000009810	-	58	39.224	Sorex_araneus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	44.391	ENSSPUG00000009499	POLR1E	100	44.391	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.837	ENSSPAG00000021240	polr1e	100	72.837	Stegastes_partitus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.444	ENSSSCG00000005347	POLR1E	98	44.444	Sus_scrofa
ENSORLG00000005143	polr1e	95	39.732	ENSTGUG00000007169	POLR1E	100	39.732	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000005143	polr1e	99	65.550	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.227	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000005143	polr1e	99	67.788	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	67.788	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000005143	polr1e	96	44.527	ENSTBEG00000013786	POLR1E	85	44.527	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000005143	polr1e	95	43.641	ENSTTRG00000008294	POLR1E	85	43.641	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.169	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	46.814	Ursus_americanus
ENSORLG00000005143	polr1e	99	45.169	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	45.169	Ursus_maritimus
ENSORLG00000005143	polr1e	82	41.691	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	41.691	Vicugna_pacos
ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.203	ENSVVUG00000019954	POLR1E	98	44.203	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000005143	polr1e	95	43.176	ENSXETG00000006533	polr1e	95	43.176	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000005143	polr1e	100	68.750	ENSXCOG00000013706	polr1e	100	68.750	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.596	ENSXMAG00000012484	polr1e	100	72.596	Xiphophorus_maculatus