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Description
Ensembl ID
ENSORLG00000005370 (Gene tree)
Gene ID
101166080
Gene Symbol
RBMS3
Alias
-
Full Name
RNA binding motif single stranded interacting protein 3
Gene Type
protein_coding
Species
Oryzias_latipes
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
107248 bases
Position
chr16:13211682-13318929
Accession
101166080
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSORLP00000006773RRM_1PF00076.222.8e-3212
ENSORLP00000006773RRM_1PF00076.222.8e-3222
ENSORLP00000006771RRM_1PF00076.223.8e-3212
ENSORLP00000006771RRM_1PF00076.223.8e-3222
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSORLT00000006772RBMS3-2021266XM_011485042ENSORLP00000006771421 (aa)XP_011483344H2LL61
ENSORLT00000006774RBMS3-2011155-ENSORLP00000006773384 (aa)-H2LL63
Gene Model
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSORLG00000005370RBMS36738.158ENSORLG00000002630celf3a7638.158
ENSORLG00000005370RBMS37868.468ENSORLG00000016818RBMS18864.785
ENSORLG00000005370RBMS35534.348ENSORLG00000000087-5634.951
ENSORLG00000005370RBMS38158.213ENSORLG00000003917rbms1a9058.213
ENSORLG00000005370RBMS38769.482ENSORLG00000015426rbms2a9569.482
ENSORLG00000005370RBMS39981.710ENSORLG00000002306-9981.710
ENSORLG00000005370RBMS35032.039ENSORLG00000012435elavl1a5632.161
ENSORLG00000005370RBMS35337.430ENSORLG00000004217ELAVL26737.430
ENSORLG00000005370RBMS37738.158ENSORLG00000010447celf3b8138.889
ENSORLG00000005370RBMS36340.789ENSORLG00000008913celf46140.260
ENSORLG00000005370RBMS38467.836ENSORLG00000007807rbms2b8472.615
ENSORLG00000005370RBMS35439.474ENSORLG00000013392si:dkey-205h23.27140.278
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSORLG00000005370RBMS310080.615ENSG00000144642RBMS310085.985Homo_sapiens
ENSORLG00000005370RBMS39981.473ENSAPOG00000003432-9981.473Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005370RBMS310084.279ENSAPOG00000007266rbms39393.750Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005370RBMS36874.754ENSAMEG00000005947RBMS310074.754Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000005370RBMS37286.755ENSACIG00000006987-8187.000Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000005370RBMS38781.793ENSACIG00000021113RBMS39682.656Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000005370RBMS39975.455ENSAOCG00000024104-9975.682Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000005370RBMS310093.443ENSAOCG00000021274rbms310093.443Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000005370RBMS38789.356ENSAPEG00000016299rbms38696.024Amphiprion_percula
ENSORLG00000005370RBMS39975.895ENSAPEG00000009481-9975.895Amphiprion_percula
ENSORLG00000005370RBMS39981.473ENSATEG00000008433-9981.473Anabas_testudineus
ENSORLG00000005370RBMS310092.471ENSATEG00000024295rbms310092.706Anabas_testudineus
ENSORLG00000005370RBMS39978.391ENSAPLG00000012270RBMS310078.851Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000005370RBMS310081.087ENSACAG00000028664RBMS39981.560Anolis_carolinensis
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSANAG00000021899RBMS310078.211Aotus_nancymaae
ENSORLG00000005370RBMS310092.453ENSACLG00000018506rbms310092.689Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000005370RBMS39974.324ENSACLG00000008976-9474.550Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000005370RBMS310080.189ENSAMXG00000020388rbms310082.547Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000005370RBMS36280.228ENSAMXG00000043770-10080.228Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000005370RBMS310081.087ENSBTAG00000044062RBMS310081.087Bos_taurus
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSCJAG00000004312RBMS310078.211Callithrix_jacchus
ENSORLG00000005370RBMS310077.626ENSCAFG00000005464RBMS39977.626Canis_familiaris
ENSORLG00000005370RBMS310077.626ENSCAFG00020024980RBMS310077.626Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000005370RBMS310080.615ENSCHIG00000009144RBMS39980.615Capra_hircus
ENSORLG00000005370RBMS37677.778ENSTSYG00000002615RBMS310077.778Carlito_syrichta
ENSORLG00000005370RBMS38779.235ENSCAPG00000017783RBMS39379.235Cavia_aperea
ENSORLG00000005370RBMS310078.960ENSCPOG00000006457RBMS39980.615Cavia_porcellus
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSCCAG00000008671RBMS310078.211Cebus_capucinus
ENSORLG00000005370RBMS310077.982ENSCATG00000013222RBMS310077.982Cercocebus_atys
ENSORLG00000005370RBMS310080.851ENSCLAG00000005866RBMS39980.851Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000005370RBMS36477.656ENSCSAG00000009655RBMS39977.656Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000005370RBMS38684.000ENSCHOG00000000758RBMS38178.310Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000005370RBMS310081.087ENSCPBG00000022678RBMS39981.560Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSCANG00000032137RBMS310078.211Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000005370RBMS310075.414ENSCGRG00001007243Rbms39978.723Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000005370RBMS310075.414ENSCGRG00000004599Rbms39978.723Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000005370RBMS310091.080ENSCSEG00000010011RBMS310091.549Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000005370RBMS310081.368ENSCSEG00000014677-9487.500Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000005370RBMS310092.654ENSCVAG00000022354rbms310092.654Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000005370RBMS39978.860ENSCVAG00000022814-9978.860Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000005370RBMS310081.754ENSDARG00000044574rbms39097.674Danio_rerio
ENSORLG00000005370RBMS39980.095ENSDNOG00000016645RBMS39779.905Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000005370RBMS310080.142ENSDORG00000007220Rbms39980.142Dipodomys_ordii
ENSORLG00000005370RBMS38064.689ENSETEG00000009485-8164.689Echinops_telfairi
ENSORLG00000005370RBMS37153.791ENSEBUG00000005830rbms38356.202Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000005370RBMS310080.378ENSEASG00005006152RBMS39980.378Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000005370RBMS310080.378ENSECAG00000017871RBMS39980.378Equus_caballus
ENSORLG00000005370RBMS39071.899ENSEEUG00000014337RBMS39972.081Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000005370RBMS310079.812ENSELUG00000002862rbms39481.572Esox_lucius
ENSORLG00000005370RBMS39083.202ENSELUG00000006905-9887.097Esox_lucius
ENSORLG00000005370RBMS310080.142ENSFCAG00000002130RBMS39980.142Felis_catus
ENSORLG00000005370RBMS310081.087ENSFALG00000009165RBMS39981.560Ficedula_albicollis
ENSORLG00000005370RBMS310080.378ENSFDAG00000008278RBMS39980.378Fukomys_damarensis
ENSORLG00000005370RBMS39778.049ENSFHEG00000004787RBMS39583.469Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000005370RBMS38777.296ENSGMOG00000002600-9377.692Gadus_morhua
ENSORLG00000005370RBMS310081.087ENSGALG00000011439RBMS39981.560Gallus_gallus
ENSORLG00000005370RBMS39981.235ENSGAFG00000003329-9981.235Gambusia_affinis
ENSORLG00000005370RBMS310094.076ENSGAFG00000000168rbms310094.076Gambusia_affinis
ENSORLG00000005370RBMS36578.467ENSGAGG00000004039RBMS310078.467Gopherus_agassizii
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSGGOG00000007228RBMS310078.211Gorilla_gorilla
ENSORLG00000005370RBMS310077.551ENSHBUG00000019785-9677.551Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000005370RBMS36392.937ENSHBUG00000021196rbms39492.937Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000005370RBMS310080.378ENSHGLG00000002170RBMS39980.378Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000005370RBMS310080.378ENSHGLG00100014278RBMS39980.378Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000005370RBMS39980.569ENSHCOG00000007894-9980.569Hippocampus_comes
ENSORLG00000005370RBMS310081.368ENSIPUG00000017680rbms310083.726Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000005370RBMS310080.615ENSSTOG00000006324RBMS39980.615Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000005370RBMS310077.541ENSJJAG00000014708Rbms39977.541Jaculus_jaculus
ENSORLG00000005370RBMS310092.541ENSKMAG00000020500rbms310092.541Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000005370RBMS39981.235ENSKMAG00000012586-9981.235Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000005370RBMS36083.270ENSLBEG00000006677rbms39783.270Labrus_bergylta
ENSORLG00000005370RBMS39980.476ENSLBEG00000027388-9980.952Labrus_bergylta
ENSORLG00000005370RBMS310083.215ENSLACG00000010581RBMS310083.215Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000005370RBMS36981.293ENSLOCG00000002328rbms310081.293Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000005370RBMS310077.626ENSLAFG00000000354RBMS310077.626Loxodonta_africana
ENSORLG00000005370RBMS310080.615ENSMFAG00000033300RBMS39980.615Macaca_fascicularis
ENSORLG00000005370RBMS310080.615ENSMMUG00000004404RBMS39980.615Macaca_mulatta
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSMNEG00000035839RBMS310078.211Macaca_nemestrina
ENSORLG00000005370RBMS310077.982ENSMLEG00000029464RBMS310077.982Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000005370RBMS310092.488ENSMAMG00000024043rbms310092.488Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000005370RBMS39979.426ENSMAMG00000002176-8384.474Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000005370RBMS310078.621ENSMZEG00005026469-9678.851Maylandia_zebra
ENSORLG00000005370RBMS310092.453ENSMZEG00005006308rbms310092.689Maylandia_zebra
ENSORLG00000005370RBMS310075.414ENSMAUG00000016436Rbms39978.723Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSMICG00000049249RBMS310078.211Microcebus_murinus
ENSORLG00000005370RBMS310077.305ENSMOCG00000006997Rbms39978.487Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000005370RBMS38789.266ENSMMOG00000008471RBMS38996.012Mola_mola
ENSORLG00000005370RBMS39981.146ENSMMOG00000015071-9981.146Mola_mola
ENSORLG00000005370RBMS310072.052ENSMODG00000015125RBMS39973.497Monodelphis_domestica
ENSORLG00000005370RBMS39981.948ENSMALG00000009155-9981.948Monopterus_albus
ENSORLG00000005370RBMS310090.588ENSMALG00000019536RBMS310093.192Monopterus_albus
ENSORLG00000005370RBMS310077.069MGP_CAROLIEiJ_G0032783Rbms39978.251Mus_caroli
ENSORLG00000005370RBMS310075.414ENSMUSG00000039607Rbms39986.256Mus_musculus
ENSORLG00000005370RBMS310075.236MGP_PahariEiJ_G0015650Rbms39986.256Mus_pahari
ENSORLG00000005370RBMS310075.414MGP_SPRETEiJ_G0033930Rbms39986.256Mus_spretus
ENSORLG00000005370RBMS310077.626ENSMPUG00000011956RBMS310077.626Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000005370RBMS310080.615ENSMLUG00000000659RBMS310080.615Myotis_lucifugus
ENSORLG00000005370RBMS310077.541ENSNGAG00000014039Rbms39979.669Nannospalax_galili
ENSORLG00000005370RBMS39981.235ENSNBRG00000018065-9981.235Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSNLEG00000004129RBMS310078.211Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000005370RBMS39971.298ENSMEUG00000004772RBMS310072.210Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000005370RBMS39977.803ENSOPRG00000006808RBMS38577.803Ochotona_princeps
ENSORLG00000005370RBMS310080.378ENSODEG00000003651RBMS39980.378Octodon_degus
ENSORLG00000005370RBMS310087.441ENSONIG00000007172rbms310087.678Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000005370RBMS310079.043ENSOANG00000010529RBMS39979.043Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000005370RBMS310077.169ENSOCUG00000004840RBMS39977.169Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000005370RBMS39981.710ENSORLG00020008496-9981.710Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000005370RBMS310099.050ENSORLG00020022674RBMS310099.050Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000005370RBMS310099.287ENSORLG00015005509rbms310099.287Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000005370RBMS39981.710ENSORLG00015015719-9981.710Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000005370RBMS310098.337ENSOMEG00000014805RBMS310098.966Oryzias_melastigma
ENSORLG00000005370RBMS39181.395ENSOMEG00000007677-9583.333Oryzias_melastigma
ENSORLG00000005370RBMS310077.169ENSOARG00000014684RBMS39977.169Ovis_aries
ENSORLG00000005370RBMS310078.211ENSPPAG00000036519RBMS310078.211Pan_paniscus
ENSORLG00000005370RBMS310077.523ENSPPRG00000002761RBMS310077.523Panthera_pardus
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ENSORLG00000005370RBMS36284.411ENSPKIG00000007989-10084.411Paramormyrops_kingsleyae
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