EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000005405 (Gene tree)
Gene ID: 101162520
Gene Symbol: mars
Alias: -
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19197 bases
Position: chr5:10645967-10665163
Accession: 101162520
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000006813	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.7e-150	1	1
ENSORLP00000006811	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.7e-150	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000006812	-	5660	XM_004068766	ENSORLP00000006811	924 (aa)	XP_004068814	H2LLA1
ENSORLT00000006814	-	5633	XM_011474871	ENSORLP00000006813	915 (aa)	XP_011473173	H2LLA3

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000005405's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola00450	Selenocompound metabolism	KEGG
ola00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000005405's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000005405	mars	100	62.514	ENSG00000166986	MARS	99	62.297	Homo_sapiens
ENSORLG00000005405	mars	100	84.314	ENSAPOG00000020238	mars	99	84.314	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005405	mars	100	63.043	ENSAMEG00000004962	MARS	99	62.717	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000005405	mars	100	83.079	ENSACIG00000016271	mars	100	83.910	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000005405	mars	100	84.766	ENSAOCG00000011411	mars	99	84.766	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000005405	mars	100	84.657	ENSAPEG00000008610	mars	99	84.657	Amphiprion_percula
ENSORLG00000005405	mars	100	82.882	ENSATEG00000025019	mars	100	82.882	Anabas_testudineus
ENSORLG00000005405	mars	93	63.490	ENSAPLG00000014821	MARS	100	64.426	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000005405	mars	99	62.061	ENSACAG00000006698	MARS	99	61.842	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000005405	mars	99	61.765	ENSANAG00000027589	MARS	100	61.589	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000005405	mars	100	82.590	ENSACLG00000018937	mars	100	82.590	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000005405	mars	100	74.002	ENSAMXG00000017335	mars	100	68.906	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.283	ENSBTAG00000018405	MARS	99	62.297	Bos_taurus
ENSORLG00000005405	mars	71	55.556	WBGene00003415	mars-1	85	59.138	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000005405	mars	100	61.630	ENSCJAG00000007249	MARS	99	61.630	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.174	ENSCAFG00000000229	MARS	99	62.609	Canis_familiaris
ENSORLG00000005405	mars	100	62.174	ENSCAFG00020023661	MARS	99	62.609	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000005405	mars	100	62.391	ENSCHIG00000027023	MARS	99	62.174	Capra_hircus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.391	ENSTSYG00000005193	MARS	99	62.080	Carlito_syrichta
ENSORLG00000005405	mars	83	60.315	ENSCAPG00000014448	MARS	99	60.315	Cavia_aperea
ENSORLG00000005405	mars	100	61.480	ENSCPOG00000012866	MARS	99	61.045	Cavia_porcellus
ENSORLG00000005405	mars	100	61.889	ENSCCAG00000032206	MARS	97	64.450	Cebus_capucinus
ENSORLG00000005405	mars	100	61.983	ENSCATG00000038907	MARS	99	61.983	Cercocebus_atys
ENSORLG00000005405	mars	97	62.921	ENSCLAG00000012164	MARS	99	62.809	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000005405	mars	100	61.123	ENSCSAG00000004852	MARS	99	60.907	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000005405	mars	100	61.505	ENSCPBG00000017136	MARS	99	61.396	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000005405	mars	72	60.272	ENSCING00000018550	-	99	60.203	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000005405	mars	62	64.198	ENSCSAVG00000006145	-	97	64.198	Ciona_savignyi
ENSORLG00000005405	mars	100	61.957	ENSCANG00000034583	MARS	99	61.848	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.242	ENSCGRG00001019238	Mars	99	62.024	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000005405	mars	100	62.242	ENSCGRG00000017321	Mars	99	62.024	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000005405	mars	99	80.413	ENSCSEG00000010816	mars	99	80.522	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000005405	mars	100	83.188	ENSCVAG00000009314	mars	99	83.188	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000005405	mars	100	71.756	ENSDARG00000034396	mars	97	71.538	Danio_rerio
ENSORLG00000005405	mars	100	62.717	ENSDNOG00000017502	MARS	99	62.350	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.391	ENSDORG00000007127	Mars	99	62.391	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000005405	mars	98	48.462	FBgn0034401	MetRS	85	48.253	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000005405	mars	60	66.969	ENSETEG00000007106	MARS	99	66.969	Echinops_telfairi
ENSORLG00000005405	mars	69	53.774	ENSEBUG00000010439	mars	97	53.774	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000005405	mars	100	62.717	ENSEASG00005007208	MARS	99	62.717	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.717	ENSECAG00000015175	MARS	99	62.717	Equus_caballus
ENSORLG00000005405	mars	89	59.716	ENSEEUG00000015503	MARS	89	59.716	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000005405	mars	100	75.652	ENSELUG00000010453	mars	100	75.082	Esox_lucius
ENSORLG00000005405	mars	100	62.935	ENSFCAG00000002083	MARS	99	62.609	Felis_catus
ENSORLG00000005405	mars	100	60.609	ENSFDAG00000010217	MARS	99	60.501	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000005405	mars	100	84.341	ENSFHEG00000016374	mars	100	84.341	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000005405	mars	100	76.009	ENSGMOG00000007987	mars	100	76.009	Gadus_morhua
ENSORLG00000005405	mars	92	60.588	ENSGALG00000039315	MARS	95	59.255	Gallus_gallus
ENSORLG00000005405	mars	99	81.818	ENSGAFG00000013461	mars	100	79.415	Gambusia_affinis
ENSORLG00000005405	mars	100	82.807	ENSGACG00000006474	mars	100	82.073	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000005405	mars	96	64.699	ENSGAGG00000011640	MARS	97	64.699	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000005405	mars	100	62.391	ENSGGOG00000001982	MARS	99	62.283	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000005405	mars	91	86.102	ENSHBUG00000009575	mars	96	86.102	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000005405	mars	97	52.121	ENSHGLG00000019739	-	93	52.961	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000005405	mars	99	62.459	ENSHGLG00000013493	MARS	100	62.350	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000005405	mars	99	62.459	ENSHGLG00100006885	MARS	100	62.350	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000005405	mars	97	51.116	ENSHGLG00100004906	-	93	51.936	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000005405	mars	100	79.325	ENSHCOG00000001090	mars	100	78.953	Hippocampus_comes
ENSORLG00000005405	mars	90	73.398	ENSIPUG00000024410	mars	98	73.487	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000005405	mars	66	79.734	ENSIPUG00000024413	mars	98	79.236	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000005405	mars	100	61.455	ENSSTOG00000001128	MARS	99	61.238	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.500	ENSJJAG00000018827	Mars	99	62.283	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000005405	mars	100	84.914	ENSKMAG00000012408	mars	99	86.538	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000005405	mars	100	81.808	ENSLBEG00000013609	mars	100	81.917	Labrus_bergylta
ENSORLG00000005405	mars	100	63.725	ENSLACG00000018854	MARS	99	63.508	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000005405	mars	100	62.215	ENSLAFG00000013525	MARS	99	61.889	Loxodonta_africana
ENSORLG00000005405	mars	100	62.065	ENSMFAG00000010123	MARS	99	62.065	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000005405	mars	100	61.957	ENSMMUG00000011277	MARS	99	61.957	Macaca_mulatta
ENSORLG00000005405	mars	100	60.978	ENSMNEG00000044464	MARS	99	60.870	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000005405	mars	90	65.726	ENSMLEG00000034638	MARS	99	65.726	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000005405	mars	96	81.532	ENSMAMG00000010012	mars	97	81.194	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000005405	mars	100	82.372	ENSMZEG00005007092	mars	100	82.372	Maylandia_zebra
ENSORLG00000005405	mars	100	61.045	ENSMAUG00000011482	Mars	99	60.936	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.459	ENSMICG00000032056	MARS	99	62.350	Microcebus_murinus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.350	ENSMOCG00000010941	Mars	99	62.024	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000005405	mars	99	78.993	ENSMMOG00000007461	mars	99	78.798	Mola_mola
ENSORLG00000005405	mars	100	82.789	ENSMALG00000010005	mars	99	84.903	Monopterus_albus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.350	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.024	Mus_caroli
ENSORLG00000005405	mars	100	62.024	ENSMUSG00000040354	Mars	99	61.697	Mus_musculus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.174	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.065	Mus_pahari
ENSORLG00000005405	mars	100	62.133	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.806	Mus_spretus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.826	ENSMPUG00000001831	MARS	99	62.717	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000005405	mars	100	62.242	ENSMLUG00000001037	MARS	99	62.133	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000005405	mars	100	61.957	ENSNGAG00000018824	Mars	99	61.848	Nannospalax_galili
ENSORLG00000005405	mars	94	83.681	ENSNBRG00000004105	mars	100	82.768	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000005405	mars	100	62.080	ENSNLEG00000017297	MARS	99	61.848	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000005405	mars	90	63.450	ENSMEUG00000007195	MARS	99	63.952	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000005405	mars	100	60.174	ENSOPRG00000006518	MARS	99	60.065	Ochotona_princeps
ENSORLG00000005405	mars	100	62.133	ENSODEG00000001752	MARS	99	61.915	Octodon_degus
ENSORLG00000005405	mars	100	82.759	ENSONIG00000005090	mars	100	82.759	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000005405	mars	72	63.540	ENSOANG00000013318	MARS	100	63.540	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.174	ENSOCUG00000007373	MARS	99	61.957	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000005405	mars	100	99.134	ENSORLG00020017397	mars	100	99.134	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000005405	mars	100	98.798	ENSORLG00015012976	mars	100	98.798	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000005405	mars	100	95.738	ENSOMEG00000018411	mars	100	95.738	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000005405	mars	100	61.472	ENSOGAG00000005226	MARS	99	61.165	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000005405	mars	100	62.391	ENSOARG00000006477	MARS	99	62.174	Ovis_aries
ENSORLG00000005405	mars	100	62.148	ENSPPAG00000025147	MARS	99	62.024	Pan_paniscus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.826	ENSPPRG00000023243	MARS	99	62.609	Panthera_pardus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.935	ENSPTIG00000006721	MARS	99	62.717	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000005405	mars	100	62.283	ENSPTRG00000005135	MARS	99	62.174	Pan_troglodytes
ENSORLG00000005405	mars	100	61.957	ENSPANG00000009140	MARS	99	61.957	Papio_anubis
ENSORLG00000005405	mars	100	71.320	ENSPKIG00000002833	mars	100	71.101	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000005405	mars	83	45.098	ENSPSIG00000013607	MARS	99	41.573	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000005405	mars	99	79.956	ENSPMGG00000014847	mars	99	79.847	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.568	ENSPEMG00000000046	Mars	99	62.894	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000005405	mars	100	63.003	ENSPCIG00000023765	MARS	99	62.677	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000005405	mars	100	82.811	ENSPFOG00000006998	mars	100	82.703	Poecilia_formosa
ENSORLG00000005405	mars	100	82.642	ENSPLAG00000017870	mars	100	82.533	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000005405	mars	100	82.751	ENSPMEG00000008197	mars	100	82.642	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000005405	mars	100	82.443	ENSPREG00000008123	mars	100	82.205	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000005405	mars	100	62.174	ENSPPYG00000004691	MARS	99	62.065	Pongo_abelii
ENSORLG00000005405	mars	85	63.636	ENSPCAG00000016037	MARS	88	63.252	Procavia_capensis
ENSORLG00000005405	mars	100	62.283	ENSPCOG00000017598	MARS	99	62.174	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000005405	mars	80	59.636	ENSPVAG00000012112	MARS	79	63.158	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000005405	mars	100	82.155	ENSPNYG00000013809	mars	100	82.155	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000005405	mars	100	75.652	ENSPNAG00000017290	mars	100	75.652	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000005405	mars	100	62.350	ENSRNOG00000025459	Mars	99	62.350	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000005405	mars	99	61.547	ENSRBIG00000044782	MARS	99	61.438	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000005405	mars	100	62.092	ENSRROG00000042331	MARS	99	62.092	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000005405	mars	62	52.539	YGR264C	MES1	75	52.632	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00000005405	mars	100	58.849	ENSSBOG00000022875	MARS	99	58.849	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000005405	mars	100	63.656	ENSSHAG00000007182	MARS	99	63.330	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000005405	mars	100	71.538	ENSSFOG00015011038	mars	99	71.507	Scleropages_formosus
ENSORLG00000005405	mars	100	81.957	ENSSMAG00000012409	mars	100	81.739	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000005405	mars	100	84.565	ENSSDUG00000019070	mars	100	84.783	Seriola_dumerili
ENSORLG00000005405	mars	90	87.288	ENSSLDG00000005561	mars	96	86.962	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000005405	mars	92	67.220	ENSSARG00000002477	MARS	92	66.191	Sorex_araneus
ENSORLG00000005405	mars	85	71.053	ENSSPUG00000007756	MARS	99	66.667	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000005405	mars	100	84.875	ENSSPAG00000022691	mars	100	84.984	Stegastes_partitus
ENSORLG00000005405	mars	100	62.324	ENSSSCG00000023318	MARS	95	62.324	Sus_scrofa
ENSORLG00000005405	mars	100	77.620	ENSTRUG00000014774	mars	100	77.620	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000005405	mars	100	74.218	ENSTNIG00000007060	mars	100	74.218	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000005405	mars	74	60.656	ENSTBEG00000000303	MARS	86	60.899	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000005405	mars	76	68.247	ENSTTRG00000013088	MARS	75	67.821	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000005405	mars	51	55.864	ENSUAMG00000019284	-	94	57.569	Ursus_americanus
ENSORLG00000005405	mars	100	61.957	ENSUMAG00000019826	MARS	99	62.717	Ursus_maritimus
ENSORLG00000005405	mars	64	73.684	ENSVPAG00000008665	MARS	66	73.684	Vicugna_pacos
ENSORLG00000005405	mars	100	62.717	ENSVVUG00000017940	MARS	99	62.391	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000005405	mars	68	71.061	ENSXETG00000025174	mars	99	70.032	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000005405	mars	100	81.441	ENSXCOG00000013878	mars	100	81.332	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000005405	mars	100	82.595	ENSXMAG00000017920	mars	100	82.486	Xiphophorus_maculatus