EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000005786 (Gene tree)
Gene ID: 101169469
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 78622 bases
Position: chr12:9628398-9707019
Accession: 101169469
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000007268	MIF4G	PF02854.19	8.2e-25	1	1
ENSORLP00000026005	MIF4G	PF02854.19	1.1e-24	1	1
ENSORLP00000040148	MIF4G	PF02854.19	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000007269	-	1797	-	ENSORLP00000007268	598 (aa)	-	H2LMJ6
ENSORLT00000045010	-	2430	XM_023961200	ENSORLP00000040148	699 (aa)	XP_023816968	UPI000CE2667B
ENSORLT00000028194	-	5976	XM_023961201	ENSORLP00000026005	672 (aa)	XP_023816969	UPI000CE27AA2

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.481	ENSG00000134030	CTIF	100	65.468	Homo_sapiens
ENSORLG00000005786	ctif	100	75.167	ENSAPOG00000020192	ctif	100	81.536	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005786	ctif	87	55.699	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	54.945	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000005786	ctif	100	78.732	ENSACIG00000017099	ctif	100	78.451	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000005786	ctif	100	66.993	ENSAOCG00000014275	ctif	82	92.105	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000005786	ctif	100	81.754	ENSAPEG00000016975	ctif	100	80.588	Amphiprion_percula
ENSORLG00000005786	ctif	100	80.622	ENSATEG00000016752	ctif	100	81.188	Anabas_testudineus
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.944	ENSACAG00000018006	CTIF	99	57.918	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.226	ENSANAG00000024925	CTIF	99	57.674	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000005786	ctif	100	78.642	ENSACLG00000005956	ctif	100	79.491	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000005786	ctif	60	58.649	ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.117	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000005786	ctif	89	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.600	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.488	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000005786	ctif	97	57.285	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	57.351	Canis_familiaris
ENSORLG00000005786	ctif	97	57.285	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	57.351	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000005786	ctif	99	56.640	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	55.981	Capra_hircus
ENSORLG00000005786	ctif	90	56.250	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	55.714	Carlito_syrichta
ENSORLG00000005786	ctif	99	53.387	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	52.951	Cavia_aperea
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.278	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	56.646	Cavia_porcellus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.878	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	57.327	Cebus_capucinus
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.320	ENSCATG00000038134	CTIF	99	57.767	Cercocebus_atys
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.920	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	57.372	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.323	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	56.782	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000005786	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.600	ENSCANG00000030916	CTIF	99	57.051	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000005786	ctif	99	59.061	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	58.509	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000005786	ctif	99	55.070	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	54.531	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000005786	ctif	100	74.719	ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.264	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000005786	ctif	100	76.554	ENSCVAG00000017158	ctif	100	77.684	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000005786	ctif	99	65.819	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.726	Danio_rerio
ENSORLG00000005786	ctif	72	55.408	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	54.105	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000005786	ctif	99	56.960	ENSDORG00000003221	Ctif	99	56.410	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.226	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.387	ENSECAG00000020473	CTIF	100	57.835	Equus_caballus
ENSORLG00000005786	ctif	90	52.265	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	51.573	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000005786	ctif	99	64.613	ENSELUG00000008733	ctif	100	64.899	Esox_lucius
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.532	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSORLG00000005786	ctif	96	56.951	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.500	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.393	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	56.847	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000005786	ctif	100	77.856	ENSFHEG00000004334	ctif	100	77.856	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.720	ENSGALG00000035912	-	93	89.583	Gallus_gallus
ENSORLG00000005786	ctif	92	84.746	ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	Gambusia_affinis
ENSORLG00000005786	ctif	67	54.964	ENSGAGG00000020663	CTIF	92	56.122	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.853	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	57.742	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000005786	ctif	100	78.784	ENSHBUG00000018092	ctif	100	79.632	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.955	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	57.398	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.792	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	57.236	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000005786	ctif	99	66.230	ENSHCOG00000011784	ctif	98	69.565	Hippocampus_comes
ENSORLG00000005786	ctif	99	66.224	ENSIPUG00000014050	ctif	99	63.725	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.717	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	57.166	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.635	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	57.072	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000005786	ctif	100	76.652	ENSKMAG00000014651	ctif	100	77.386	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000005786	ctif	99	73.544	ENSLBEG00000018277	ctif	99	93.220	Labrus_bergylta
ENSORLG00000005786	ctif	99	64.348	ENSLOCG00000011697	ctif	100	64.110	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000005786	ctif	99	49.091	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.379	Loxodonta_africana
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.320	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	57.767	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.320	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	57.767	Macaca_mulatta
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.320	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	57.767	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.132	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	57.581	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000005786	ctif	100	80.147	ENSMAMG00000014741	ctif	100	80.588	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000005786	ctif	91	76.161	ENSMZEG00005019767	ctif	92	77.090	Maylandia_zebra
ENSORLG00000005786	ctif	51	89.583	ENSMGAG00000001378	CTIF	63	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.643	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	57.097	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.810	ENSMICG00000010167	CTIF	100	57.581	Microcebus_murinus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.962	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	57.416	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000005786	ctif	100	75.862	ENSMMOG00000000831	ctif	100	75.530	Mola_mola
ENSORLG00000005786	ctif	99	54.619	ENSMODG00000003464	CTIF	100	54.045	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000005786	ctif	85	70.680	ENSMALG00000020553	ctif	99	88.462	Monopterus_albus
ENSORLG00000005786	ctif	99	56.656	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	56.124	Mus_caroli
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.076	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	56.542	Mus_musculus
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.214	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	57.668	Mus_pahari
ENSORLG00000005786	ctif	99	56.406	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.280	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	56.508	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000005786	ctif	99	56.913	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	56.796	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.548	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	58.132	Nannospalax_galili
ENSORLG00000005786	ctif	100	78.235	ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.118	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.293	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	57.742	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000005786	ctif	99	52.742	ENSMEUG00000000218	CTIF	86	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.235	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	56.683	Ochotona_princeps
ENSORLG00000005786	ctif	99	56.347	ENSODEG00000018390	CTIF	100	55.728	Octodon_degus
ENSORLG00000005786	ctif	99	77.011	ENSONIG00000007750	ctif	100	76.337	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000005786	ctif	70	64.583	ENSOANG00000001337	CTIF	95	64.583	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.188	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	56.778	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000005786	ctif	100	97.711	ENSORLG00020005385	ctif	100	97.711	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000005786	ctif	100	98.283	ENSORLG00015011872	ctif	100	98.283	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000005786	ctif	100	93.276	ENSOMEG00000007917	ctif	100	93.276	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.280	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	56.640	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.372	ENSOARG00000003754	CTIF	100	56.709	Ovis_aries
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.293	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	57.742	Pan_paniscus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.464	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	56.913	Panthera_pardus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.280	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	56.640	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.293	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	57.742	Pan_troglodytes
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.132	ENSPANG00000017087	CTIF	99	57.581	Papio_anubis
ENSORLG00000005786	ctif	84	57.760	ENSPKIG00000011234	ctif	99	57.677	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000005786	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000005786	ctif	100	70.028	ENSPMGG00000022958	ctif	100	69.886	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.120	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	57.006	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000005786	ctif	75	54.681	ENSPCIG00000026247	CTIF	82	67.636	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000005786	ctif	100	77.292	ENSPFOG00000009243	ctif	100	77.292	Poecilia_formosa
ENSORLG00000005786	ctif	100	77.433	ENSPLAG00000019171	ctif	100	77.433	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000005786	ctif	100	77.433	ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.433	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000005786	ctif	100	75.141	ENSPREG00000017326	ctif	100	75.141	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000005786	ctif	84	57.795	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	57.195	Pongo_abelii
ENSORLG00000005786	ctif	99	55.859	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	55.305	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.199	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	57.649	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000005786	ctif	100	78.784	ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.632	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000005786	ctif	99	55.241	ENSPNAG00000029174	ctif	100	66.430	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000005786	ctif	99	59.547	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.995	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.132	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	57.581	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.188	ENSRROG00000006039	CTIF	99	57.419	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000005786	ctif	89	86.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	98	86.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000005786	ctif	99	54.472	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	53.896	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000005786	ctif	99	65.487	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.243	Scleropages_formosus
ENSORLG00000005786	ctif	100	80.147	ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.912	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000005786	ctif	100	90.476	ENSSDUG00000016033	ctif	93	90.476	Seriola_dumerili
ENSORLG00000005786	ctif	100	80.059	ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.941	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000005786	ctif	99	58.091	ENSSPUG00000014734	CTIF	93	89.583	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000005786	ctif	100	76.480	ENSSPAG00000003721	ctif	100	77.303	Stegastes_partitus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.674	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	57.027	Sus_scrofa
ENSORLG00000005786	ctif	99	52.550	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	55.694	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000005786	ctif	57	69.942	ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.942	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000005786	ctif	99	69.243	ENSTNIG00000018763	ctif	100	69.067	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000005786	ctif	88	66.250	ENSTBEG00000002613	CTIF	89	66.250	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000005786	ctif	99	55.145	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	54.575	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000005786	ctif	85	53.160	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	52.514	Ursus_americanus
ENSORLG00000005786	ctif	99	57.785	ENSUMAG00000002735	CTIF	98	87.500	Ursus_maritimus
ENSORLG00000005786	ctif	52	62.651	ENSVPAG00000001497	-	60	62.651	Vicugna_pacos
ENSORLG00000005786	ctif	97	57.072	ENSVVUG00000014347	CTIF	98	85.417	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000005786	ctif	96	48.112	ENSXETG00000026836	ctif	72	69.084	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000005786	ctif	68	69.007	ENSXCOG00000002477	ctif	98	68.834	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000005786	ctif	100	75.000	ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.554	Xiphophorus_maculatus