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Description

Ensembl ID: ENSORLG00000005827 (Gene tree)
Gene ID: 101171202
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9678 bases
Position: chr19:7505467-7515144
Accession: 101171202
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000043226	eRF1_2	PF03464.15	2.5e-34	1	1
ENSORLP00000007332	eRF1_2	PF03464.15	1.8e-31	1	1
ENSORLP00000043226	eRF1_3	PF03465.15	5.8e-26	1	1
ENSORLP00000007332	eRF1_3	PF03465.15	2.2e-17	1	1
ENSORLP00000043226	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-51	1	1
ENSORLP00000007332	eRF1_1	PF03463.15	2.3e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000040856	-	2606	XM_004080297	ENSORLP00000043226	385 (aa)	XP_004080345	UPI0000E9F739
ENSORLT00000007333	-	1131	-	ENSORLP00000007332	376 (aa)	-	H2LMQ9

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSG00000152684	PELO	100	81.039	Homo_sapiens
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.688	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.688	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005827	pelo	66	91.498	ENSAPOG00000023700	-	90	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005827	pelo	66	91.498	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.299	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000005827	pelo	97	86.863	ENSACIG00000014386	pelo	97	92.604	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.948	ENSAOCG00000023717	pelo	100	91.948	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.948	ENSAPEG00000011235	pelo	100	91.948	Amphiprion_percula
ENSORLG00000005827	pelo	100	92.468	ENSATEG00000019550	pelo	100	92.468	Anabas_testudineus
ENSORLG00000005827	pelo	77	72.148	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.148	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000005827	pelo	97	80.533	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.000	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.039	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.390	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000005827	pelo	97	90.885	ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.415	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.779	Bos_taurus
ENSORLG00000005827	pelo	100	59.221	WBGene00011280	pelo-1	100	59.221	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.558	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.519	ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.519	Capra_hircus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSTSYG00000005203	PELO	100	81.558	Carlito_syrichta
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.299	Cavia_porcellus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.299	Cebus_capucinus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.558	Cercocebus_atys
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSCHOG00000000523	PELO	100	81.039	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000005827	pelo	97	81.600	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000005827	pelo	97	63.003	ENSCING00000001979	-	100	63.117	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000005827	pelo	100	64.935	ENSCSAVG00000006158	-	100	64.935	Ciona_savignyi
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000005827	pelo	97	80.697	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000005827	pelo	97	81.501	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.558	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.948	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.688	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.688	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000005827	pelo	100	88.052	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.052	Danio_rerio
ENSORLG00000005827	pelo	100	78.756	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.756	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.558	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000005827	pelo	96	68.919	FBgn0011207	pelo	97	67.624	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000005827	pelo	71	76.608	ENSEBUG00000004955	pelo	99	76.608	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSEASG00005013348	PELO	100	80.779	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000005827	pelo	100	89.870	ENSELUG00000023229	pelo	100	89.870	Esox_lucius
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.039	Felis_catus
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000005827	pelo	74	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.390	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000005827	pelo	98	89.390	ENSGMOG00000005849	pelo	100	89.351	Gadus_morhua
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.130	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.130	Gambusia_affinis
ENSORLG00000005827	pelo	100	92.987	ENSGACG00000007245	pelo	100	92.987	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000005827	pelo	97	81.333	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.779	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.558	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.390	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.299	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000005827	pelo	100	79.221	ENSHGLG00100017627	PELO	100	79.221	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000005827	pelo	100	89.351	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	Hippocampus_comes
ENSORLG00000005827	pelo	100	87.532	ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.532	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.818	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000005827	pelo	100	78.961	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.961	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000005827	pelo	100	92.468	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.468	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.649	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.649	Labrus_bergylta
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.039	Loxodonta_africana
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.558	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.558	Macaca_mulatta
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.558	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.558	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000005827	pelo	97	94.370	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.390	Maylandia_zebra
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.779	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.299	Microcebus_murinus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.299	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.649	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.649	Mola_mola
ENSORLG00000005827	pelo	100	92.468	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.468	Monopterus_albus
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.779	Mus_caroli
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.779	Mus_musculus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	81.039	Mus_pahari
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	81.299	Mus_spretus
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.519	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.519	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.558	Nannospalax_galili
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.390	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.558	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000005827	pelo	100	79.740	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.740	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000005827	pelo	98	80.475	ENSOPRG00000018793	PELO	100	80.475	Ochotona_princeps
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.779	Octodon_degus
ENSORLG00000005827	pelo	96	91.375	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.169	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.299	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000005827	pelo	100	99.740	ENSORLG00020016456	pelo	100	99.740	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000005827	pelo	100	98.701	ENSORLG00015014447	pelo	100	98.701	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000005827	pelo	100	96.623	ENSOMEG00000021567	pelo	100	96.623	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.818	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.818	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	ENSOARG00000008324	PELO	99	80.779	Ovis_aries
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.558	Pan_paniscus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.039	Panthera_pardus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.039	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	Pan_troglodytes
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.558	Papio_anubis
ENSORLG00000005827	pelo	100	88.831	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000005827	pelo	97	81.333	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000005827	pelo	68	91.339	ENSPMGG00000014561	pelo	94	91.339	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.039	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000005827	pelo	100	80.260	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.260	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.429	Poecilia_formosa
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.429	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.429	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.429	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000005827	pelo	97	81.769	ENSPPYG00000015451	PELO	96	81.558	Pongo_abelii
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.299	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.390	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000005827	pelo	97	89.544	ENSPNAG00000012458	pelo	99	88.312	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	81.299	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.558	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.558	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000005827	pelo	97	32.895	YNL001W	-	97	32.895	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.039	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSORLG00000005827	pelo	98	89.655	ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.610	Scleropages_formosus
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