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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSORLG00000006457 (Gene tree)
Gene ID: 101159051
Gene Symbol: ipo4
Alias: -
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14486 bases
Position: chr20:12549376-12563861
Accession: 101159051
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000030142	IBN_N	PF03810.19	4.5e-15	1	1
ENSORLP00000030907	IBN_N	PF03810.19	4.5e-14	1	1
ENSORLP00000008108	IBN_N	PF03810.19	6.2e-14	1	1
ENSORLP00000008107	IBN_N	PF03810.19	9.9e-13	1	1
ENSORLP00000042487	IBN_N	PF03810.19	5.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000031345	-	5720	-	ENSORLP00000030907	1051 (aa)	-	-
ENSORLT00000041378	-	5702	XM_004080961	ENSORLP00000030142	1121 (aa)	XP_004081009	-
ENSORLT00000008108	-	3210	-	ENSORLP00000008107	1069 (aa)	-	H2LPX1
ENSORLT00000039737	-	5420	-	ENSORLP00000042487	1027 (aa)	-	-
ENSORLT00000008109	-	5104	XM_023950238	ENSORLP00000008108	1079 (aa)	XP_023806006	H2LPX2

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.173	ENSG00000196497	IPO4	99	45.046	Homo_sapiens
ENSORLG00000006457	ipo4	100	77.395	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	79.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.873	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.318	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000006457	ipo4	99	77.958	ENSACIG00000004246	ipo4	100	76.292	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.439	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	82.222	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.630	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	82.222	Amphiprion_percula
ENSORLG00000006457	ipo4	95	81.312	ENSATEG00000017082	ipo4	99	81.972	Anabas_testudineus
ENSORLG00000006457	ipo4	87	47.346	ENSACAG00000003973	-	97	47.397	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.918	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.526	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000006457	ipo4	100	77.281	ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.561	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000006457	ipo4	99	68.744	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	66.944	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.319	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.871	Bos_taurus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.568	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.078	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.728	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	44.977	Canis_familiaris
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.294	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.734	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.319	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	43.687	Capra_hircus
ENSORLG00000006457	ipo4	98	44.811	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.722	Carlito_syrichta
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.446	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	45.069	Cavia_porcellus
ENSORLG00000006457	ipo4	98	45.340	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.802	Cebus_capucinus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.267	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.078	Cercocebus_atys
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.446	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.069	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000006457	ipo4	93	45.880	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	43.393	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000006457	ipo4	95	37.109	ENSCING00000008639	-	99	37.012	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000006457	ipo4	95	37.697	ENSCSAVG00000011482	-	98	37.955	Ciona_savignyi
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.986	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.802	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.715	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	44.044	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.715	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	44.044	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.663	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	74.376	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.648	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.828	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	73.659	ENSDARG00000041493	ipo4	99	72.525	Danio_rerio
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.917	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.732	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.883	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	44.793	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000006457	ipo4	99	30.805	FBgn0042178	CG32165	97	31.226	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000006457	ipo4	99	31.047	FBgn0042177	CG32164	96	30.612	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.275	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.028	Echinops_telfairi
ENSORLG00000006457	ipo4	94	46.755	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.802	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.403	ENSECAG00000009909	IPO4	99	44.977	Equus_caballus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	71.469	ENSELUG00000020628	ipo4	100	70.364	Esox_lucius
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.446	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	44.885	Felis_catus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	41.643	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	42.052	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000006457	ipo4	89	79.946	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	84.559	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.096	ENSGMOG00000001801	ipo4	98	74.416	Gadus_morhua
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.362	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	79.686	Gambusia_affinis
ENSORLG00000006457	ipo4	99	78.257	ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.016	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.986	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.894	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000006457	ipo4	100	78.293	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	78.108	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.164	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.885	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.883	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.700	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.635	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.373	Hippocampus_comes
ENSORLG00000006457	ipo4	99	72.387	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	69.697	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.446	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.438	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000006457	ipo4	98	45.343	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	45.194	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000006457	ipo4	100	81.061	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	79.760	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	79.139	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	76.525	Labrus_bergylta
ENSORLG00000006457	ipo4	99	50.467	ENSLACG00000001428	IPO4	100	49.464	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000006457	ipo4	82	63.520	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	63.520	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.621	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	43.566	Loxodonta_africana
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.267	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.078	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.267	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.078	Macaca_mulatta
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.173	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.986	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.267	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.078	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	78.927	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	76.271	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000006457	ipo4	100	77.922	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	78.200	Maylandia_zebra
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.373	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	43.882	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.070	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.700	Microcebus_murinus
ENSORLG00000006457	ipo4	98	43.932	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.675	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000006457	ipo4	100	76.731	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	76.217	Mola_mola
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.624	ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.105	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000006457	ipo4	99	77.481	ENSMALG00000001587	ipo4	99	76.503	Monopterus_albus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.675	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.535	Mus_caroli
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.306	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	46.040	Mus_musculus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.530	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	46.344	Mus_pahari
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.583	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	46.344	Mus_spretus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.634	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.346	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.530	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	45.372	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.424	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.796	Nannospalax_galili
ENSORLG00000006457	ipo4	99	82.184	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	80.908	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000006457	ipo4	99	46.213	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.572	Ochotona_princeps
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.352	ENSODEG00000002609	IPO4	99	44.977	Octodon_degus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	82.184	ENSONIG00000014574	ipo4	99	80.445	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.062	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.118	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000006457	ipo4	100	99.026	ENSORLG00020004286	ipo4	100	99.026	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000006457	ipo4	100	99.513	ENSORLG00015021856	ipo4	100	99.513	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000006457	ipo4	99	89.894	ENSOMEG00000016203	ipo4	98	89.691	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.695	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	43.871	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.652	ENSOARG00000019188	IPO4	99	43.377	Ovis_aries
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.080	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.710	Pan_paniscus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.634	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.069	Panthera_pardus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.540	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	44.977	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.892	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.710	Pan_troglodytes
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.361	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.170	Papio_anubis
ENSORLG00000006457	ipo4	99	66.412	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	63.894	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000006457	ipo4	99	67.114	ENSPKIG00000007683	-	99	64.875	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000006457	ipo4	97	73.607	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	71.707	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.490	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.675	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000006457	ipo4	97	45.446	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	45.064	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.821	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	78.044	Poecilia_formosa
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.916	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	78.133	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.821	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	78.044	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.248	ENSPREG00000017605	ipo4	100	77.600	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.080	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	44.986	Pongo_abelii
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.822	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.069	Procavia_capensis
ENSORLG00000006457	ipo4	98	44.767	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.663	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000006457	ipo4	98	45.377	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.093	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.364	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	79.055	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000006457	ipo4	99	74.305	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	71.258	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.900	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.188	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.080	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	44.894	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.986	ENSRROG00000011492	IPO4	99	44.894	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.640	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	44.118	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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