EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000006904 (Gene tree)
Gene ID: 101158141
Gene Symbol: rexo4
Alias: -
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3406 bases
Position: chr19:8250912-8254317
Accession: 101158141
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000008673	RNase_T	PF00929.24	1.2e-20	1	1
ENSORLP00000045460	RNase_T	PF00929.24	1.5e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000042330	-	1867	-	ENSORLP00000045460	441 (aa)	-	-
ENSORLT00000008674	-	1795	XM_004080329	ENSORLP00000008673	417 (aa)	XP_004080377	H2LRH4

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000006904	rexo4	85	52.877	ENSG00000148300	REXO4	91	51.399	Homo_sapiens
ENSORLG00000006904	rexo4	85	69.972	ENSAPOG00000019264	rexo4	99	64.720	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000006904	rexo4	84	51.099	ENSAMEG00000011649	REXO4	90	49.482	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000006904	rexo4	90	70.157	ENSAOCG00000004087	rexo4	99	66.121	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000006904	rexo4	90	69.110	ENSAPEG00000009106	rexo4	99	65.187	Amphiprion_percula
ENSORLG00000006904	rexo4	89	67.725	ENSATEG00000017662	rexo4	98	63.507	Anabas_testudineus
ENSORLG00000006904	rexo4	79	58.507	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.507	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000006904	rexo4	81	53.390	ENSANAG00000028404	REXO4	89	51.157	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000006904	rexo4	95	62.322	ENSACLG00000006007	rexo4	98	62.322	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000006904	rexo4	83	56.486	ENSAMXG00000013291	rexo4	87	55.897	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000006904	rexo4	83	50.276	ENSBTAG00000019721	REXO4	85	50.829	Bos_taurus
ENSORLG00000006904	rexo4	81	53.352	ENSCJAG00000009774	REXO4	89	51.036	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000006904	rexo4	90	49.123	ENSCAFG00000019767	REXO4	93	49.123	Canis_familiaris
ENSORLG00000006904	rexo4	91	47.002	ENSCAFG00020000983	-	82	52.925	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000006904	rexo4	83	50.000	ENSCHIG00000009517	REXO4	90	47.668	Capra_hircus
ENSORLG00000006904	rexo4	85	48.196	ENSTSYG00000027492	REXO4	90	49.239	Carlito_syrichta
ENSORLG00000006904	rexo4	52	68.837	ENSCAPG00000014583	REXO4	63	68.981	Cavia_aperea
ENSORLG00000006904	rexo4	85	49.485	ENSCPOG00000001386	REXO4	94	47.806	Cavia_porcellus
ENSORLG00000006904	rexo4	81	47.207	ENSCCAG00000027049	REXO4	88	45.361	Cebus_capucinus
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.315	ENSCATG00000028646	REXO4	91	51.531	Cercocebus_atys
ENSORLG00000006904	rexo4	52	67.442	ENSCLAG00000006919	REXO4	65	67.593	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.039	ENSCSAG00000015280	REXO4	91	51.276	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000006904	rexo4	96	51.059	ENSCPBG00000021152	REXO4	99	51.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000006904	rexo4	53	60.274	ENSCING00000010751	-	80	59.193	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000006904	rexo4	84	52.139	ENSCANG00000029855	REXO4	91	50.495	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000006904	rexo4	82	50.269	ENSCGRG00001013126	Rexo4	88	48.878	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000006904	rexo4	82	50.269	ENSCGRG00000009819	Rexo4	92	48.030	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000006904	rexo4	89	59.231	ENSCSEG00000019343	rexo4	89	59.231	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000006904	rexo4	81	80.426	ENSCVAG00000014963	rexo4	100	80.426	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000006904	rexo4	87	57.880	ENSDARG00000088619	rexo4	89	73.029	Danio_rerio
ENSORLG00000006904	rexo4	81	47.794	ENSDNOG00000002429	REXO4	90	45.721	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000006904	rexo4	52	70.370	ENSDORG00000006190	Rexo4	62	70.370	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000006904	rexo4	83	52.778	ENSECAG00000007896	REXO4	86	48.910	Equus_caballus
ENSORLG00000006904	rexo4	86	58.808	ENSELUG00000003539	rexo4	95	55.787	Esox_lucius
ENSORLG00000006904	rexo4	83	51.801	ENSFCAG00000011652	REXO4	86	49.100	Felis_catus
ENSORLG00000006904	rexo4	83	54.717	ENSFALG00000001520	REXO4	89	53.968	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000006904	rexo4	81	53.333	ENSFDAG00000016050	REXO4	91	49.876	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000006904	rexo4	98	64.183	ENSFHEG00000002413	rexo4	99	64.183	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000006904	rexo4	53	63.348	ENSGMOG00000012876	rexo4	67	63.348	Gadus_morhua
ENSORLG00000006904	rexo4	77	58.434	ENSGAFG00000015404	-	99	58.434	Gambusia_affinis
ENSORLG00000006904	rexo4	88	61.308	ENSGACG00000008065	rexo4	94	58.543	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000006904	rexo4	82	55.041	ENSGAGG00000010260	REXO4	99	50.935	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.168	ENSGGOG00000014508	REXO4	91	51.399	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000006904	rexo4	99	62.207	ENSHBUG00000000542	rexo4	98	62.207	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000006904	rexo4	81	51.724	ENSHGLG00000016901	REXO4	91	49.749	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000006904	rexo4	81	51.724	ENSHGLG00100017444	REXO4	91	49.749	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000006904	rexo4	57	65.823	ENSHCOG00000018196	rexo4	70	60.145	Hippocampus_comes
ENSORLG00000006904	rexo4	87	54.155	ENSIPUG00000021084	rexo4	86	54.278	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000006904	rexo4	91	49.618	ENSSTOG00000003754	REXO4	91	49.618	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000006904	rexo4	85	50.820	ENSJJAG00000013002	Rexo4	88	50.255	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000006904	rexo4	99	67.548	ENSKMAG00000015039	rexo4	100	67.548	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000006904	rexo4	100	63.208	ENSLBEG00000025570	rexo4	98	63.294	Labrus_bergylta
ENSORLG00000006904	rexo4	82	54.902	ENSLACG00000012399	REXO4	97	50.966	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000006904	rexo4	62	68.182	ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.873	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000006904	rexo4	84	48.564	ENSLAFG00000011274	REXO4	89	48.564	Loxodonta_africana
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.297	ENSMFAG00000042425	REXO4	91	51.020	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.571	ENSMMUG00000000935	REXO4	91	51.276	Macaca_mulatta
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.591	ENSMNEG00000031604	REXO4	91	51.786	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000006904	rexo4	84	52.575	ENSMLEG00000037716	REXO4	91	51.493	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000006904	rexo4	88	66.846	ENSMAMG00000011251	rexo4	98	61.772	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000006904	rexo4	99	59.857	ENSMZEG00005012336	rexo4	95	73.106	Maylandia_zebra
ENSORLG00000006904	rexo4	82	54.017	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	54.017	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000006904	rexo4	82	51.206	ENSMAUG00000015137	Rexo4	82	51.206	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000006904	rexo4	81	51.944	ENSMICG00000008422	REXO4	90	49.490	Microcebus_murinus
ENSORLG00000006904	rexo4	81	53.295	ENSMOCG00000020607	Rexo4	88	50.000	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000006904	rexo4	83	54.768	ENSMODG00000012817	REXO4	93	52.580	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000006904	rexo4	99	60.190	ENSMALG00000019705	rexo4	97	60.190	Monopterus_albus
ENSORLG00000006904	rexo4	82	53.955	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	85	53.955	Mus_caroli
ENSORLG00000006904	rexo4	83	53.221	ENSMUSG00000052406	Rexo4	85	53.221	Mus_musculus
ENSORLG00000006904	rexo4	83	52.841	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.841	Mus_pahari
ENSORLG00000006904	rexo4	82	53.803	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	85	53.803	Mus_spretus
ENSORLG00000006904	rexo4	68	56.338	ENSMPUG00000012315	REXO4	75	56.338	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000006904	rexo4	83	52.235	ENSNGAG00000010700	Rexo4	85	52.235	Nannospalax_galili
ENSORLG00000006904	rexo4	87	64.456	ENSNBRG00000011712	rexo4	88	64.456	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000006904	rexo4	84	52.459	ENSNLEG00000013130	-	91	50.758	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000006904	rexo4	53	65.315	ENSNLEG00000007556	-	55	65.315	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000006904	rexo4	84	43.052	ENSMEUG00000006513	-	92	42.347	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000006904	rexo4	52	68.664	ENSODEG00000015721	REXO4	62	68.664	Octodon_degus
ENSORLG00000006904	rexo4	94	64.179	ENSONIG00000020052	rexo4	94	64.179	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000006904	rexo4	82	54.620	ENSOANG00000002453	REXO4	92	54.620	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000006904	rexo4	100	98.561	ENSORLG00020013768	rexo4	100	98.561	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000006904	rexo4	100	97.362	ENSORLG00015012070	rexo4	100	97.362	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000006904	rexo4	100	86.811	ENSOMEG00000018327	rexo4	99	86.811	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000006904	rexo4	92	49.261	ENSOGAG00000014040	REXO4	92	49.502	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000006904	rexo4	84	51.743	ENSPPAG00000027911	REXO4	91	50.124	Pan_paniscus
ENSORLG00000006904	rexo4	91	49.500	ENSPPRG00000002894	REXO4	93	49.500	Panthera_pardus
ENSORLG00000006904	rexo4	83	44.986	ENSPTIG00000012007	REXO4	83	44.986	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000006904	rexo4	84	52.279	ENSPTRG00000023363	REXO4	91	50.620	Pan_troglodytes
ENSORLG00000006904	rexo4	84	53.117	ENSPANG00000026040	REXO4	91	51.378	Papio_anubis
ENSORLG00000006904	rexo4	87	55.844	ENSPKIG00000024761	rexo4	87	55.844	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000006904	rexo4	85	55.615	ENSPSIG00000016908	REXO4	99	52.459	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000006904	rexo4	87	59.690	ENSPMGG00000005312	rexo4	94	56.542	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000006904	rexo4	82	51.429	ENSPEMG00000017982	Rexo4	85	52.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000006904	rexo4	83	54.472	ENSPCIG00000017379	REXO4	84	54.472	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000006904	rexo4	96	63.636	ENSPFOG00000017751	rexo4	100	63.183	Poecilia_formosa
ENSORLG00000006904	rexo4	96	63.325	ENSPLAG00000010487	rexo4	96	63.325	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000006904	rexo4	96	63.902	ENSPMEG00000020767	rexo4	100	63.443	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000006904	rexo4	99	62.353	ENSPREG00000021841	rexo4	100	62.353	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000006904	rexo4	84	52.459	ENSPPYG00000019735	REXO4	91	50.758	Pongo_abelii
ENSORLG00000006904	rexo4	81	48.718	ENSPCAG00000010581	REXO4	83	49.148	Procavia_capensis
ENSORLG00000006904	rexo4	83	51.630	ENSPCOG00000025466	REXO4	91	48.762	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000006904	rexo4	92	45.000	ENSPVAG00000001429	REXO4	92	45.000	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000006904	rexo4	99	61.972	ENSPNYG00000013712	rexo4	98	61.972	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000006904	rexo4	84	54.521	ENSPNAG00000019227	rexo4	89	51.345	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000006904	rexo4	82	51.705	ENSRNOG00000027867	Rexo4	85	51.705	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000006904	rexo4	84	52.011	ENSRBIG00000037515	REXO4	91	50.249	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000006904	rexo4	84	51.743	ENSRROG00000028864	REXO4	91	50.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000006904	rexo4	81	43.575	ENSSBOG00000032587	REXO4	90	41.687	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000006904	rexo4	88	53.806	ENSSHAG00000005827	REXO4	95	54.569	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000006904	rexo4	57	71.784	ENSSFOG00015017394	rexo4	67	71.784	Scleropages_formosus
ENSORLG00000006904	rexo4	86	68.132	ENSSMAG00000015441	rexo4	97	61.702	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000006904	rexo4	85	68.649	ENSSDUG00000023346	rexo4	96	63.134	Seriola_dumerili
ENSORLG00000006904	rexo4	85	71.031	ENSSLDG00000011085	rexo4	98	64.775	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000006904	rexo4	83	54.496	ENSSPUG00000015868	REXO4	97	51.190	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000006904	rexo4	90	69.816	ENSSPAG00000007221	rexo4	98	65.094	Stegastes_partitus
ENSORLG00000006904	rexo4	91	47.733	ENSSSCG00000023173	REXO4	91	47.733	Sus_scrofa
ENSORLG00000006904	rexo4	82	55.738	ENSTGUG00000005537	REXO4	92	54.762	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000006904	rexo4	86	66.216	ENSTRUG00000013225	rexo4	93	67.147	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000006904	rexo4	87	63.144	ENSTNIG00000005873	rexo4	99	63.144	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000006904	rexo4	86	50.943	ENSUAMG00000018676	REXO4	88	50.259	Ursus_americanus
ENSORLG00000006904	rexo4	58	59.363	ENSUMAG00000023164	REXO4	66	59.363	Ursus_maritimus
ENSORLG00000006904	rexo4	91	49.132	ENSVVUG00000027337	REXO4	90	49.132	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000006904	rexo4	70	55.068	ENSXETG00000023096	rexo4	99	50.420	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000006904	rexo4	99	62.233	ENSXMAG00000013686	rexo4	100	62.233	Xiphophorus_maculatus