EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000007958 (Gene tree)
Gene ID: 101158774
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC101158774
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10186 bases
Position: chr9:13356570-13366755
Accession: 101158774
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000009980	MMR_HSR1	PF01926.23	4.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000009981	-	1343	XM_004072610	ENSORLP00000009980	431 (aa)	XP_004072658	H2LV51

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	58.000	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	57.778

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.244	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	91	60.244	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.277	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	87.277	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	94	60.197	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	91	60.197	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.607	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	86.607	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.488	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	91	60.488	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.488	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	91	60.488	Amphiprion_percula
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Amphiprion_percula
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.268	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	85.268	Anabas_testudineus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	61.463	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	91	61.463	Anabas_testudineus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.223	ENSACAG00000028632	-	99	56.473	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.607	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	86.607	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.756	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	91	59.756	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	76.837	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	76.837	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	61.314	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	91	61.314	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	76	63.110	ENSCING00000020807	-	87	63.110	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	57.178	ENSCSAVG00000009987	-	92	57.664	Ciona_savignyi
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	95	87.073	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.124	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	90	59.367	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	61.220	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	91	61.463	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	61.800	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	80	80.892	Danio_rerio
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	98	78.636	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	78.636	Danio_rerio
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	82	52.830	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	52.830	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	77.803	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	77.803	Esox_lucius
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	56.889	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	56.889	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	84	54.696	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	90	54.696	Gadus_morhua
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	85.491	Gambusia_affinis
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.732	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	91	60.732	Gambusia_affinis
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	56	87.597	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	87.597	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	79	65.205	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	89	62.881	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.000	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	91	60.000	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	79.730	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	79.730	Hippocampus_comes
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.512	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	91	59.512	Hippocampus_comes
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	92	59.950	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	91	59.950	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	84	57.576	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	81	57.576	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	73.274	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	73.274	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.054	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	87.054	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.000	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	57.111	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Labrus_bergylta
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	65.991	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	65.991	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	63.659	ENSLACG00000004899	-	91	63.659	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	69.799	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	69.799	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	91	61.069	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	90	61.069	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.512	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	91	59.512	Maylandia_zebra
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Maylandia_zebra
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	58.537	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	90	58.537	Mola_mola
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	98	85.616	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	85.616	Monopterus_albus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	96	59.662	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	92	59.903	Monopterus_albus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.161	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	86.161	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	93	59.649	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	91	59.649	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.756	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	91	59.756	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	57.778	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	57.556	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	95.312	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	95.312	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	95.759	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	95.759	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	58.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	58.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	61.220	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	91	60.976	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	60.732	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	91	60.732	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	73.497	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	73.497	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	58.780	ENSPKIG00000023918	-	90	58.780	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	95	59.756	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	91	59.756	Periophthalmus_magnuspinnatus
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