EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000008753 (Gene tree)
Gene ID: 101156830
Gene Symbol: polr1a
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24214 bases
Position: chr10:24582715-24606928
Accession: 101156830
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000010996	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	5.9e-99	1	1
ENSORLP00000010996	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.7e-21	1	1
ENSORLP00000010996	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	7.2e-69	1	1
ENSORLP00000010996	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	4.7e-35	1	1
ENSORLP00000010996	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	8.5e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000010997	-	7024	XM_011480453	ENSORLP00000010996	1693 (aa)	XP_011478755	H2LXY4

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000008753's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000008753's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000008753	polr1a	84	31.757	ENSORLG00000008958	polr3a	88	31.757
ENSORLG00000008753	polr1a	67	34.286	ENSORLG00000006431	polr2a	57	34.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.210	ENSG00000068654	POLR1A	100	65.152	Homo_sapiens
ENSORLG00000008753	polr1a	69	84.143	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	84.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.099	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	68.298	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000008753	polr1a	99	78.258	ENSACIG00000022147	polr1a	100	78.271	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	82.447	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	84.003	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000008753	polr1a	99	82.388	ENSAPEG00000016105	polr1a	100	82.683	Amphiprion_percula
ENSORLG00000008753	polr1a	99	82.704	ENSATEG00000016773	polr1a	100	82.753	Anabas_testudineus
ENSORLG00000008753	polr1a	85	66.531	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	66.667	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.028	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	64.028	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.426	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	64.971	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000008753	polr1a	99	76.937	ENSACLG00000020541	polr1a	100	76.523	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.197	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	65.313	Bos_taurus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	38.353	WBGene00012999	rpoa-1	98	38.405	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.679	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	64.757	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.597	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	64.655	Canis_familiaris
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.588	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	64.495	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.846	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	64.829	Capra_hircus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.132	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.559	Carlito_syrichta
ENSORLG00000008753	polr1a	97	62.312	ENSCAPG00000010132	POLR1A	99	62.455	Cavia_aperea
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.055	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	65.192	Cavia_porcellus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.563	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	65.104	Cebus_capucinus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.200	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	65.278	Cercocebus_atys
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.000	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.600	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.873	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	64.635	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	66.356	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	66.239	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000008753	polr1a	99	47.760	ENSCSAVG00000007184	-	99	48.455	Ciona_savignyi
ENSORLG00000008753	polr1a	99	62.384	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	61.932	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	58.991	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	59.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000008753	polr1a	60	63.060	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	63.291	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000008753	polr1a	99	75.411	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	75.426	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	79.894	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	80.270	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	71.387	ENSDARG00000098375	polr1a	100	71.637	Danio_rerio
ENSORLG00000008753	polr1a	99	62.500	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	62.580	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.995	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.111	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000008753	polr1a	80	44.877	FBgn0019938	RpI1	99	43.680	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000008753	polr1a	71	90.625	ENSETEG00000000412	-	71	90.625	Echinops_telfairi
ENSORLG00000008753	polr1a	89	47.798	ENSEBUG00000005667	-	99	47.997	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.006	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	65.084	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000008753	polr1a	95	69.565	ENSECAG00000036306	-	99	69.565	Equus_caballus
ENSORLG00000008753	polr1a	95	69.565	ENSECAG00000030510	-	99	69.565	Equus_caballus
ENSORLG00000008753	polr1a	95	69.565	ENSECAG00000010092	POLR1A	99	69.565	Equus_caballus
ENSORLG00000008753	polr1a	85	76.210	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	76.210	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	73.610	ENSELUG00000012769	polr1a	99	73.610	Esox_lucius
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.385	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	64.447	Felis_catus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.452	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	65.412	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.381	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	64.962	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	77.417	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	77.476	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	67.279	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	67.416	Gadus_morhua
ENSORLG00000008753	polr1a	89	63.748	ENSGALG00000038160	-	98	63.636	Gallus_gallus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	79.174	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	78.820	Gambusia_affinis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	77.173	ENSGACG00000018791	polr1a	100	77.173	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000008753	polr1a	89	67.390	ENSGAGG00000004984	-	95	71.959	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.104	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	64.713	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000008753	polr1a	90	78.525	ENSHBUG00000020021	polr1a	100	78.606	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.139	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	65.447	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.951	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	65.258	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000008753	polr1a	99	75.000	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	74.765	Hippocampus_comes
ENSORLG00000008753	polr1a	99	71.537	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	71.537	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.764	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	64.921	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.421	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	65.020	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	83.600	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	83.600	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000008753	polr1a	94	82.736	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	82.736	Labrus_bergylta
ENSORLG00000008753	polr1a	53	70.467	ENSLACG00000003218	polr1a	100	70.467	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000008753	polr1a	99	71.005	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	70.971	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.576	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	64.873	Loxodonta_africana
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.046	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	65.298	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.931	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	65.182	Macaca_mulatta
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.046	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	65.298	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.621	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	64.988	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	81.598	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	81.598	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	82.367	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	82.130	Maylandia_zebra
ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.143	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	63.304	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000008753	polr1a	91	64.245	ENSMAUG00000008497	Polr1a	99	64.408	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.401	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	64.658	Microcebus_murinus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.887	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	65.487	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000008753	polr1a	99	77.915	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	77.882	Mola_mola
ENSORLG00000008753	polr1a	99	60.974	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.239	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000008753	polr1a	99	81.062	ENSMALG00000013363	polr1a	100	81.180	Monopterus_albus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.327	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	64.542	Mus_caroli
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.327	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	64.232	Mus_musculus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.327	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	64.348	Mus_pahari
ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.248	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	63.362	Mus_spretus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.879	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	64.948	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.824	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	65.115	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.501	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	65.101	Nannospalax_galili
ENSORLG00000008753	polr1a	99	81.834	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	81.716	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.091	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.343	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000008753	polr1a	75	85.039	ENSMEUG00000011665	-	76	85.039	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000008753	polr1a	98	60.601	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	60.721	Ochotona_princeps
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.535	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	64.942	Octodon_degus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	81.775	ENSONIG00000015895	polr1a	100	81.775	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.910	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	66.105	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000008753	polr1a	100	92.807	ENSORLG00020020726	polr1a	100	92.807	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000008753	polr1a	95	98.936	ENSORLG00015016071	polr1a	99	98.936	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.150	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.621	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.913	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.951	Ovis_aries
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.931	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	64.540	Pan_paniscus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.566	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	64.617	Panthera_pardus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.228	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	64.277	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.924	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	64.540	Pan_troglodytes
ENSORLG00000008753	polr1a	99	65.026	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	65.104	Papio_anubis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	70.685	ENSPKIG00000005468	polr1a	98	72.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000008753	polr1a	63	64.378	ENSPSIG00000009321	-	99	64.286	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000008753	polr1a	55	80.498	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	80.498	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.617	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.928	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000008753	polr1a	95	63.697	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	63.758	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	80.529	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	80.529	Poecilia_formosa
ENSORLG00000008753	polr1a	99	80.731	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	80.731	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000008753	polr1a	99	77.693	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	78.325	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000008753	polr1a	99	80.494	ENSPREG00000002389	polr1a	100	80.564	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.641	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	64.815	Pongo_abelii
ENSORLG00000008753	polr1a	90	64.760	ENSPCAG00000011582	POLR1A	91	64.760	Procavia_capensis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.479	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	64.988	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000008753	polr1a	94	63.962	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	64.623	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	82.189	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	82.012	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000008753	polr1a	99	71.028	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	71.028	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.423	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	64.774	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.737	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	64.462	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.679	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	64.405	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000008753	polr1a	99	36.712	YOR341W	RPA190	99	36.759	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.832	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	64.910	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	59.908	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	60.276	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000008753	polr1a	99	70.427	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	70.386	Scleropages_formosus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	81.087	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	81.028	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	83.048	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	83.225	Seriola_dumerili
ENSORLG00000008753	polr1a	99	79.929	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	79.929	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000008753	polr1a	70	97.561	ENSSARG00000003136	-	71	97.561	Sorex_araneus
ENSORLG00000008753	polr1a	94	72.821	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	72.821	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000008753	polr1a	64	85.568	ENSSPAG00000016341	polr1a	95	85.568	Stegastes_partitus
ENSORLG00000008753	polr1a	83	66.434	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	66.364	Sus_scrofa
ENSORLG00000008753	polr1a	98	64.855	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	64.737	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000008753	polr1a	99	76.210	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	76.582	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000008753	polr1a	99	71.112	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	70.979	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000008753	polr1a	73	82.743	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	82.743	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.167	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	63.357	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000008753	polr1a	69	65.763	ENSUAMG00000012158	-	94	65.424	Ursus_americanus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.558	ENSUMAG00000006700	POLR1A	97	67.553	Ursus_maritimus
ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.791	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	64.849	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000008753	polr1a	99	61.327	ENSXETG00000001952	polr1a	99	62.544	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000008753	polr1a	99	80.505	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	80.388	Xiphophorus_maculatus