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Description

Ensembl ID: ENSORLG00000011231 (Gene tree)
Gene ID: 101171250
Gene Symbol: xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17178 bases
Position: chr8:14401618-14418795
Accession: 101171250
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000014084	Xpo1	PF08389.12	3e-20	1	1
ENSORLP00000026040	Xpo1	PF08389.12	5.9e-20	1	1
ENSORLP00000045069	Xpo1	PF08389.12	1.5e-18	1	1
ENSORLP00000045069	IBN_N	PF03810.19	1.1e-06	1	1
ENSORLP00000014084	IBN_N	PF03810.19	1.2e-06	1	1
ENSORLP00000026040	IBN_N	PF03810.19	1.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000043334	-	4025	-	ENSORLP00000045069	1108 (aa)	-	-
ENSORLT00000034781	-	4151	XM_011478307	ENSORLP00000026040	1150 (aa)	XP_011476609	UPI0005CB834D
ENSORLT00000014085	-	3393	-	ENSORLP00000014084	1130 (aa)	-	H2M6I9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.421	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.587	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	91.761	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.560	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	75.133	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000011231	xpo6	100	89.692	ENSACIG00000008055	xpo6	99	90.489	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.587	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	91.761	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.500	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	91.674	Amphiprion_percula
ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.373	ENSATEG00000002273	xpo6	100	90.546	Anabas_testudineus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	76.056	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	76.588	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000011231	xpo6	100	68.063	ENSACAG00000016883	XPO6	100	68.052	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	ENSANAG00000031761	XPO6	100	75.155	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.067	ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.240	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.931	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	75.931	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.800	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	74.800	Bos_taurus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.244	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.244	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.648	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	75.222	Canis_familiaris
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	75.333	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.800	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	74.800	Capra_hircus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	72.462	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	72.339	Carlito_syrichta
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.978	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	74.978	Cavia_porcellus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	75.155	Cebus_capucinus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSCATG00000034030	XPO6	100	75.333	Cercocebus_atys
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.384	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.956	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000011231	xpo6	92	73.832	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	73.832	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000011231	xpo6	83	85.294	ENSCPBG00000024660	XPO6	98	85.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000011231	xpo6	100	44.674	ENSCING00000006884	-	99	45.326	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	43.997	ENSCSAVG00000000850	-	99	43.511	Ciona_savignyi
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	ENSCANG00000041578	XPO6	100	75.155	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	75.155	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000011231	xpo6	100	89.159	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	89.159	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.783	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	90.783	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000011231	xpo6	98	74.688	ENSDARG00000041217	xpo6	99	75.223	Danio_rerio
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.067	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	75.067	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.244	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	75.244	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000011231	xpo6	87	30.075	FBgn0266572	ebo	87	32.461	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000011231	xpo6	83	75.676	ENSETEG00000018768	XPO6	85	76.562	Echinops_telfairi
ENSORLG00000011231	xpo6	100	59.411	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	59.464	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.510	ENSEASG00005017296	XPO6	100	75.510	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.510	ENSECAG00000008601	XPO6	100	75.510	Equus_caballus
ENSORLG00000011231	xpo6	97	69.721	ENSEEUG00000014587	XPO6	99	69.721	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	84.087	ENSELUG00000009159	xpo6	100	84.087	Esox_lucius
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.510	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	75.510	Felis_catus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	76.144	ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.849	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.648	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	75.222	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.957	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	90.957	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	76.609	ENSGALG00000035360	XPO6	100	76.609	Gallus_gallus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.696	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	90.696	Gambusia_affinis
ENSORLG00000011231	xpo6	96	75.069	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	75.710	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	75.333	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.327	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	91.500	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000011231	xpo6	94	61.792	ENSHGLG00000003865	-	99	61.792	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.304	ENSHGLG00000009679	-	100	75.304	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000011231	xpo6	94	63.522	ENSHGLG00100001081	-	99	63.522	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.217	ENSHGLG00100003673	-	99	75.217	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000011231	xpo6	100	88.552	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	88.638	Hippocampus_comes
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.451	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	74.870	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.889	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	74.889	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.889	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	74.889	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.826	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	91.826	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.893	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	91.067	Labrus_bergylta
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.510	ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.510	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000011231	xpo6	95	80.240	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.794	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.208	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	74.778	Loxodonta_africana
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	75.333	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	75.333	Macaca_mulatta
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	75.333	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	75.333	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.546	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	90.720	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.154	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	91.327	Maylandia_zebra
ENSORLG00000011231	xpo6	98	75.312	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	75.847	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000011231	xpo6	100	65.817	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	66.260	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSMICG00000001923	XPO6	100	75.333	Microcebus_murinus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.130	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	75.130	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000011231	xpo6	100	88.998	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	88.998	Mola_mola
ENSORLG00000011231	xpo6	100	76.368	ENSMODG00000015516	XPO6	100	76.368	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000011231	xpo6	100	80.088	ENSMALG00000020612	xpo6	99	80.923	Monopterus_albus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	100	75.155	Mus_caroli
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	75.155	Mus_musculus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.155	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	75.155	Mus_pahari
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.978	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	74.978	Mus_spretus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.296	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	74.867	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.032	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	74.600	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.736	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	75.311	Nannospalax_galili
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.414	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	91.587	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.421	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	75.421	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000011231	xpo6	87	74.146	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	74.160	Ochotona_princeps
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.326	ENSODEG00000012917	XPO6	100	75.326	Octodon_degus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.327	ENSONIG00000019366	xpo6	100	91.500	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.824	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.400	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	99.391	ENSORLG00020000386	xpo6	100	99.391	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000011231	xpo6	100	99.130	ENSORLG00015003636	xpo6	100	99.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000011231	xpo6	100	96.609	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	96.609	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.824	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	75.400	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.296	ENSOARG00000000960	XPO6	100	74.867	Ovis_aries
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	75.333	Pan_paniscus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.824	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	75.382	Panthera_pardus
ENSORLG00000011231	xpo6	97	74.182	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	74.839	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	75.333	Pan_troglodytes
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSPANG00000017103	XPO6	100	75.333	Papio_anubis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	79.307	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.394	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.494	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	75.022	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	87.852	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	88.820	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.244	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.244	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000011231	xpo6	100	67.252	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	67.882	Petromyzon_marinus
ENSORLG00000011231	xpo6	97	76.054	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	75.619	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.051	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.051	Poecilia_formosa
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.043	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	91.043	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.217	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	91.217	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000011231	xpo6	98	90.170	ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.153	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.421	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	75.421	Pongo_abelii
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ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.421	ENSPCOG00000017886	XPO6	100	75.421	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000011231	xpo6	80	90.909	ENSPVAG00000012234	XPO6	79	90.909	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.327	ENSPNYG00000008375	xpo6	100	91.500	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.692	ENSPNAG00000008284	xpo6	100	75.692	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.889	ENSRNOG00000016722	Xpo6	100	74.889	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSRBIG00000031469	XPO6	100	75.333	Rhinopithecus_bieti
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ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.327	ENSSLDG00000006580	xpo6	100	91.500	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSORLG00000011231	xpo6	100	87.796	ENSTNIG00000018949	xpo6	99	88.628	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000011231	xpo6	93	88.430	ENSTBEG00000009945	XPO6	92	88.430	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.296	ENSTTRG00000009558	XPO6	100	74.867	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000011231	xpo6	100	73.063	ENSUMAG00000007086	XPO6	99	73.620	Ursus_maritimus
ENSORLG00000011231	xpo6	91	90.909	ENSVPAG00000008493	XPO6	92	90.909	Vicugna_pacos
ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.333	ENSVVUG00000024150	XPO6	100	75.333	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000011231	xpo6	100	70.536	ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.217	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.478	ENSXMAG00000011630	xpo6	100	91.478	Xiphophorus_maculatus