EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000011763 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2 (1 of many)
Alias: -
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4114 bases
Position: chr1:28617224-28621337
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000014744	IBN_N	PF03810.19	1.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000014745	TNPO2 (1 of many)-201	1515	-	ENSORLP00000014744	504 (aa)	-	H2M8C9

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000011763's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000011763's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSORLG00000010363	tnpo2	56	95.400
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	83.400	ENSORLG00000003182	tnpo1	65	83.600

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSG00000105576	TNPO2	100	90.588	Homo_sapiens
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSAPOG00000009339	TNPO2	56	98.800	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSAPOG00000013185	-	66	95.400	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	88.400	ENSAMEG00000012123	TNPO2	55	88.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSACIG00000009586	-	65	98.800	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.600	ENSACIG00000007518	tnpo2	63	95.600	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSAOCG00000010152	-	56	98.800	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSAOCG00000010374	tnpo2	56	95.400	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSAPEG00000008429	tnpo2	56	95.400	Amphiprion_percula
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSAPEG00000013268	-	56	98.800	Amphiprion_percula
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	94.800	ENSATEG00000024761	TNPO2	56	94.800	Anabas_testudineus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSATEG00000019171	-	56	98.800	Anabas_testudineus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.000	ENSACAG00000003576	TNPO2	56	90.800	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.200	ENSANAG00000036645	TNPO2	56	90.800	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.200	ENSACLG00000001853	tnpo2	56	95.200	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSACLG00000020672	-	58	98.800	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSAMXG00000010246	tnpo2	55	95.400	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.018	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	90.619	Bos_taurus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCJAG00000005096	TNPO2	56	91.000	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCAFG00020005115	TNPO2	56	91.000	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.000	ENSCHIG00000011718	TNPO2	57	90.600	Capra_hircus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSTSYG00000003828	TNPO2	56	91.000	Carlito_syrichta
ENSORLG00000011763	TNPO2	88	91.176	ENSCAPG00000015700	TNPO2	50	90.950	Cavia_aperea
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.800	ENSCPOG00000007033	TNPO2	56	90.400	Cavia_porcellus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCCAG00000024574	TNPO2	56	91.000	Cebus_capucinus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCATG00000042599	TNPO2	57	91.000	Cercocebus_atys
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.800	ENSCLAG00000013442	TNPO2	56	90.400	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCSAG00000006597	TNPO2	56	91.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCPBG00000023892	TNPO2	56	91.200	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000011763	TNPO2	95	90.397	ENSCANG00000027834	TNPO2	55	89.979	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	56	91.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	56	91.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.200	ENSCSEG00000011477	-	64	95.200	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	88.800	ENSCSEG00000012923	tnpo2	55	88.800	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSCVAG00000001908	TNPO2	56	98.600	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.617	ENSCVAG00000002750	tnpo2	56	92.615	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	89.400	ENSDARG00000038239	tnpo2	56	89.400	Danio_rerio
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	78.287	ENSDNOG00000043264	TNPO2	54	78.088	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.000	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.971	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	70.495	FBgn0024921	Tnpo	57	70.099	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.200	ENSEASG00005004160	TNPO2	56	90.800	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.200	ENSECAG00000013673	TNPO2	56	90.800	Equus_caballus
ENSORLG00000011763	TNPO2	97	96.741	ENSELUG00000016542	-	66	96.741	Esox_lucius
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	96.200	ENSELUG00000008680	tnpo2	55	96.200	Esox_lucius
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.200	ENSFCAG00000000467	TNPO2	55	90.800	Felis_catus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.800	ENSFDAG00000021543	TNPO2	56	90.400	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSFHEG00000009734	TNPO2	57	98.600	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.816	ENSFHEG00000016501	tnpo2	56	92.814	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000011763	TNPO2	83	98.148	ENSGMOG00000014237	-	52	98.148	Gadus_morhua
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	80.800	ENSGMOG00000009021	tnpo2	55	80.000	Gadus_morhua
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSGAFG00000010401	TNPO2	56	98.600	Gambusia_affinis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.415	ENSGAFG00000018993	tnpo2	58	93.413	Gambusia_affinis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSGAGG00000010150	TNPO2	56	91.200	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.200	ENSHBUG00000014849	tnpo2	56	95.200	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSHBUG00000018317	-	56	98.800	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.600	ENSHGLG00000016928	TNPO2	56	90.200	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	89.600	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	89.051	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSHCOG00000020440	-	56	98.600	Hippocampus_comes
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.800	ENSHCOG00000005914	tnpo2	56	92.800	Hippocampus_comes
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	96.000	ENSIPUG00000006884	TNPO2	56	96.000	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.600	ENSIPUG00000005768	tnpo2	56	95.600	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSSTOG00000006952	TNPO2	56	91.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	56	91.000	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.400	ENSKMAG00000018430	TNPO2	56	98.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.000	ENSKMAG00000021274	TNPO2	56	90.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSLBEG00000005301	-	56	98.800	Labrus_bergylta
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.800	ENSLBEG00000026241	tnpo2	58	95.800	Labrus_bergylta
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	86.600	ENSLACG00000012322	TNPO2	56	86.400	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.600	ENSLOCG00000006178	tnpo2	56	95.600	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSLAFG00000003661	TNPO2	56	91.000	Loxodonta_africana
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMFAG00000037531	TNPO2	57	91.000	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMMUG00000005684	TNPO2	56	91.000	Macaca_mulatta
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMNEG00000041024	TNPO2	57	91.000	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000011763	TNPO2	95	90.397	ENSMLEG00000018391	TNPO2	53	91.026	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	94.400	ENSMAMG00000023658	tnpo2	63	94.400	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSMAMG00000011862	-	56	98.800	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.434	ENSMZEG00005011298	TNPO2	58	91.434	Maylandia_zebra
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.200	ENSMZEG00005023965	tnpo2	56	95.200	Maylandia_zebra
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSMZEG00005007408	-	56	98.800	Maylandia_zebra
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMICG00000016153	TNPO2	57	91.000	Microcebus_murinus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	56	91.000	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	89.264	ENSMMOG00000005063	TNPO2	60	89.264	Mola_mola
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.200	ENSMMOG00000021390	TNPO2	64	98.200	Mola_mola
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.600	ENSMODG00000006888	TNPO2	56	92.600	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	93.600	ENSMALG00000004721	tnpo2	56	93.600	Monopterus_albus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.200	ENSMALG00000006232	TNPO2	56	98.200	Monopterus_albus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	56	91.000	Mus_caroli
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	91.971	Mus_musculus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	56	91.000	Mus_pahari
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	56	91.000	Mus_spretus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSMPUG00000004663	TNPO2	56	91.000	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000011763	TNPO2	93	91.239	ENSMLUG00000012669	TNPO2	55	90.812	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	56	91.000	Nannospalax_galili
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSNBRG00000023849	TNPO2	56	98.800	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	85.800	ENSNBRG00000006242	TNPO2	54	85.800	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000011763	TNPO2	100	74.653	ENSNLEG00000012758	TNPO2	55	74.851	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	84.200	ENSMEUG00000016658	TNPO2	57	84.200	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.800	ENSODEG00000009670	TNPO2	56	90.400	Octodon_degus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSONIG00000017706	-	56	98.800	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.200	ENSONIG00000002147	tnpo2	56	95.200	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.200	ENSOANG00000010051	TNPO2	56	91.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSORLG00020015785	tnpo2	56	95.400	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000011763	TNPO2	100	99.802	ENSORLG00020001020	TNPO2	100	99.802	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	94.200	ENSORLG00015005489	tnpo2	56	94.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000011763	TNPO2	100	100.000	ENSORLG00015003941	TNPO2	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSOMEG00000014877	TNPO2	56	95.400	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	99.600	ENSOMEG00000013440	TNPO2	56	99.600	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.000	ENSOARG00000011717	TNPO2	58	90.600	Ovis_aries
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPPAG00000019494	TNPO2	56	91.000	Pan_paniscus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPPRG00000003075	TNPO2	56	91.000	Panthera_pardus
ENSORLG00000011763	TNPO2	96	84.886	ENSPTIG00000011213	TNPO2	62	84.472	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPTRG00000010535	TNPO2	56	91.000	Pan_troglodytes
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPANG00000016857	TNPO2	56	91.000	Papio_anubis
ENSORLG00000011763	TNPO2	94	92.516	ENSPKIG00000002899	-	55	90.852	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	93.800	ENSPKIG00000004824	tnpo2	56	93.800	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	87.302	ENSPSIG00000010215	TNPO2	56	87.103	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSPMGG00000016459	TNPO2	64	98.800	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	94.810	ENSPMGG00000022850	tnpo2	100	93.812	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	56	91.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000011763	TNPO2	97	89.528	ENSPCIG00000015327	TNPO2	52	92.308	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	99.000	ENSPFOG00000005417	TNPO2	56	99.000	Poecilia_formosa
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.216	ENSPFOG00000012466	tnpo2	56	93.214	Poecilia_formosa
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.216	ENSPLAG00000018842	tnpo2	56	93.214	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	99.000	ENSPLAG00000010687	TNPO2	59	99.000	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.216	ENSPMEG00000006069	tnpo2	56	93.214	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	99.000	ENSPMEG00000014011	-	56	99.000	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.816	ENSPREG00000001121	TNPO2	56	92.814	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	99.000	ENSPREG00000000415	TNPO2	56	99.000	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPPYG00000009602	TNPO2	56	91.000	Pongo_abelii
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	83.698	ENSPCAG00000014916	TNPO2	56	83.300	Procavia_capensis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPCOG00000018386	TNPO2	56	91.000	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSPVAG00000013411	TNPO2	55	91.000	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSPNYG00000001235	-	58	98.800	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.200	ENSPNYG00000013748	tnpo2	56	95.200	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.600	ENSPNAG00000024491	tnpo2	56	95.600	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.000	ENSPNAG00000026208	-	56	98.000	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSRNOG00000003970	Tnpo2	55	91.000	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSRBIG00000036652	TNPO2	56	91.000	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSRROG00000040402	TNPO2	56	91.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSSBOG00000019551	TNPO2	56	91.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000011763	TNPO2	93	92.735	ENSSHAG00000015858	TNPO2	54	92.735	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	96.400	ENSSFOG00015018955	TNPO2	56	96.400	Scleropages_formosus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	93.200	ENSSFOG00015010934	tnpo2	56	93.200	Scleropages_formosus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.200	ENSSMAG00000004050	-	64	93.625	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	96.000	ENSSMAG00000012008	tnpo2	56	96.000	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.800	ENSSDUG00000001767	tnpo2	56	95.800	Seriola_dumerili
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	ENSSDUG00000002607	TNPO2	56	98.800	Seriola_dumerili
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSSLDG00000013107	-	56	98.600	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.800	ENSSLDG00000025629	tnpo2	64	95.800	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.200	ENSSPUG00000000736	TNPO2	56	91.000	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	94.810	ENSSPAG00000008511	-	56	94.810	Stegastes_partitus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.400	ENSSPAG00000008512	tnpo2	56	95.400	Stegastes_partitus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSSSCG00000013726	TNPO2	56	91.000	Sus_scrofa
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	97.800	ENSTRUG00000009453	TNPO2	56	97.800	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.600	ENSTRUG00000012698	tnpo2	56	92.600	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	78.400	ENSTNIG00000003295	TNPO2	51	92.219	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	93.200	ENSTNIG00000014071	TNPO2	55	93.200	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSTTRG00000005443	TNPO2	56	91.000	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	ENSUAMG00000019621	TNPO2	56	91.000	Ursus_americanus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	86.879	ENSUMAG00000006504	TNPO2	55	86.481	Ursus_maritimus
ENSORLG00000011763	TNPO2	85	90.845	ENSVVUG00000023860	TNPO2	92	89.908	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	89.400	ENSXETG00000004771	tnpo2	56	88.600	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSXCOG00000014460	TNPO2	57	98.600	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	92.216	ENSXMAG00000014217	TNPO2	56	93.214	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.600	ENSXMAG00000012793	TNPO2	56	98.600	Xiphophorus_maculatus