EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000012355 (Gene tree)
Gene ID: 101173124
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: -
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10607 bases
Position: chr1:29077970-29088576
Accession: 101173124
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000015469	RRM_1	PF00076.22	3.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000015470	-	3347	XM_023959928	ENSORLP00000015469	922 (aa)	XP_023815696	H2MAB8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	81	77.564	ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	73	77.707	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	82	76.582	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	74	76.433	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	82	76.582	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	80	59.211	Amphiprion_percula
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	80	75.484	ENSACLG00000019359	-	68	75.484	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	53	69.767	ENSELUG00000018785	-	52	49.793	Esox_lucius
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	80	75.484	ENSHBUG00000019347	-	67	75.484	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	83	57.616	ENSIPUG00000021651	si:dkey-93h22.8	78	57.616	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	79	79.104	ENSKMAG00000019855	si:dkey-93h22.8	76	73.885	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	80	75.641	ENSLBEG00000024075	-	57	41.700	Labrus_bergylta
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	80	77.564	ENSMAMG00000011169	-	71	77.070	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	80	75.484	ENSMZEG00005008228	-	69	75.484	Maylandia_zebra
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	72	75.000	ENSMALG00000005052	-	69	74.522	Monopterus_albus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	100	93.750	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	100	93.319	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	100	95.032	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	100	94.816	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	100	74.867	ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	100	73.639	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	71	34.958	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	66	34.123	Poecilia_formosa
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	88	74.684	ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	84	74.522	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	64	75.641	ENSPNYG00000002682	-	69	75.484	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	65	58.125	ENSPNAG00000023094	si:dkey-93h22.8	57	58.974	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	67	42.197	ENSSMAG00000005915	si:dkey-93h22.8	59	39.884	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	81	75.641	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	71	75.159	Seriola_dumerili
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	86	75.641	ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	73	75.159	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	77	73.718	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	75	73.248	Stegastes_partitus
ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	64	74.684	ENSXMAG00000000243	si:dkey-93h22.8	58	74.522	Xiphophorus_maculatus