EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000014748 (Gene tree)
Gene ID: 101155839
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 37222 bases
Position: chr4:26585563-26622784
Accession: 101155839
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000018484	Xpo1	PF08389.12	2.8e-23	1	1
ENSORLP00000045435	Xpo1	PF08389.12	3.9e-23	1	1
ENSORLP00000018484	IBN_N	PF03810.19	1.3e-09	1	1
ENSORLP00000045435	IBN_N	PF03810.19	1.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000044094	-	6468	XM_004068183	ENSORLP00000045435	1005 (aa)	XP_004068231	UPI0005CBF032
ENSORLT00000018485	-	2769	-	ENSORLP00000018484	922 (aa)	-	H2MIK2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000014748	ipo13	99	64.946	ENSORLG00000010213	si:ch73-182a11.2	99	65.063

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSG00000117408	IPO13	99	81.081	Homo_sapiens
ENSORLG00000014748	ipo13	100	69.882	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	100	69.650	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	95.450	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	95.946	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.607	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.185	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000014748	ipo13	100	69.668	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	69.506	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	90.761	ENSACIG00000008146	ipo13	100	91.630	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	68.810	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.519	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000014748	ipo13	100	94.908	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	95.426	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000014748	ipo13	100	94.908	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	95.322	Amphiprion_percula
ENSORLG00000014748	ipo13	100	68.917	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.621	Amphiprion_percula
ENSORLG00000014748	ipo13	100	95.016	ENSATEG00000018367	ipo13	100	95.530	Anabas_testudineus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	68.676	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.249	Anabas_testudineus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	81.365	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	81.751	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000014748	ipo13	100	81.257	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.403	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSANAG00000034183	IPO13	99	81.152	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000014748	ipo13	100	94.691	ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.558	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000014748	ipo13	100	69.239	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	100	69.033	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000014748	ipo13	100	63.489	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.076	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	89.166	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	89.720	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.065	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	80.665	Bos_taurus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.607	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	81.257	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.390	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	80.977	Canis_familiaris
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.390	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	80.977	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.173	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	80.769	Capra_hircus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.081	Carlito_syrichta
ENSORLG00000014748	ipo13	88	82.340	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	81.781	Cavia_aperea
ENSORLG00000014748	ipo13	99	79.956	ENSCPOG00000012445	IPO13	99	80.462	Cavia_porcellus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.607	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	81.257	Cebus_capucinus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.081	Cercocebus_atys
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.173	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.769	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.081	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	81.264	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	81.917	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000014748	ipo13	100	37.313	ENSCING00000001863	-	99	37.773	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000014748	ipo13	99	36.461	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.534	Ciona_savignyi
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.081	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	79.307	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	79.834	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000014748	ipo13	100	79.307	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	79.834	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000014748	ipo13	100	63.666	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	63.066	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000014748	ipo13	100	91.874	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	92.412	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000014748	ipo13	100	95.341	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	95.842	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000014748	ipo13	96	66.556	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	66.415	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	88.516	ENSDARG00000060618	ipo13	99	89.662	Danio_rerio
ENSORLG00000014748	ipo13	100	65.655	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	65.823	Danio_rerio
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.173	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	80.769	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.390	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	80.873	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000014748	ipo13	100	67.811	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.961	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.390	ENSEASG00005001738	IPO13	99	80.977	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.390	ENSECAG00000015508	IPO13	99	80.977	Equus_caballus
ENSORLG00000014748	ipo13	67	83.598	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	85.185	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	91.549	ENSELUG00000001498	ipo13	100	91.996	Esox_lucius
ENSORLG00000014748	ipo13	100	67.020	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	66.972	Esox_lucius
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	81.081	Felis_catus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	81.046	ENSFALG00000005368	IPO13	100	81.808	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.065	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	80.665	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000014748	ipo13	99	67.634	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.078	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	95.341	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	95.738	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	59.914	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	60.145	Gadus_morhua
ENSORLG00000014748	ipo13	100	93.391	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	93.776	Gadus_morhua
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.932	ENSGALG00000010087	IPO13	99	82.192	Gallus_gallus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	95.450	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.946	Gambusia_affinis
ENSORLG00000014748	ipo13	99	66.916	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	66.428	Gambusia_affinis
ENSORLG00000014748	ipo13	99	68.534	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	68.149	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	92.308	ENSGACG00000014562	ipo13	99	92.427	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	81.473	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.340	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.081	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000014748	ipo13	100	68.777	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.107	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000014748	ipo13	100	94.691	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	95.218	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000014748	ipo13	100	79.740	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	80.249	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000014748	ipo13	100	79.740	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	80.249	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000014748	ipo13	99	63.922	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	64.255	Hippocampus_comes
ENSORLG00000014748	ipo13	100	90.141	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	93.441	Hippocampus_comes
ENSORLG00000014748	ipo13	100	88.082	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	88.773	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	59.655	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	100	59.854	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.390	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.977	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.173	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	80.665	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	69.032	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	68.589	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	94.863	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	95.493	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	93.066	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	93.361	Labrus_bergylta
ENSORLG00000014748	ipo13	98	68.450	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	99	67.809	Labrus_bergylta
ENSORLG00000014748	ipo13	87	31.902	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	32.418	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000014748	ipo13	100	76.609	ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.143	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000014748	ipo13	100	82.378	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	83.247	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	78.618	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.171	Loxodonta_africana
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	81.081	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	81.081	Macaca_mulatta
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	81.081	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000014748	ipo13	100	80.498	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	81.081	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	94.583	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	95.114	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	69.239	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	69.033	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	69.132	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	100	68.930	Maylandia_zebra
ENSORLG00000014748	ipo13	100	94.691	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	95.218	Maylandia_zebra
ENSORLG00000014748	ipo13	100	79.415	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	80.426	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000014748	ipo13	82	81.398	ENSMAUG00000013018	Ipo13	99	81.932	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000014748	ipo13	93	83.333	ENSMICG00000011003	IPO13	99	83.240	Microcebus_murinus
ENSORLG00000014748	ipo13	100	79.740	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	80.249	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000014748	ipo13	100	91.766	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	92.758	Mola_mola
ENSORLG00000014748	ipo13	99	66.738	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	66.353	Mola_mola
ENSORLG00000014748	ipo13	99	80.283	ENSMODG00000003017	IPO13	100	80.937	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000014748	ipo13	80	69.629	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	68.056	Monopterus_albus
ENSORLG00000014748	ipo13	99	92.408	ENSMALG00000010805	ipo13	100	93.275	Monopterus_albus
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