EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000017730 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16490 bases
Position: chr22:19882382-19898871
Accession: 101159398
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000022193	NRDE-2	PF08424.10	1.1e-101	1	1
ENSORLP00000040366	NRDE-2	PF08424.10	1.8e-100	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000036118	-	2946	-	ENSORLP00000040366	981 (aa)	-	-
ENSORLT00000022194	-	3273	XM_020713690	ENSORLP00000022193	1090 (aa)	XP_020569349	H2MTT5

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000017730's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000017730's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000017730	nrde2	95	47.802	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.667	Homo_sapiens
ENSORLG00000017730	nrde2	95	70.219	ENSAPOG00000009202	nrde2	91	70.265	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.254	ENSAMEG00000001807	NRDE2	89	47.777	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000017730	nrde2	96	70.336	ENSACIG00000014783	nrde2	98	70.783	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000017730	nrde2	95	70.696	ENSAOCG00000015576	nrde2	95	70.026	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000017730	nrde2	95	70.653	ENSAPEG00000001711	nrde2	95	69.982	Amphiprion_percula
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.559	ENSATEG00000010247	nrde2	96	67.657	Anabas_testudineus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.817	ENSAPLG00000015870	NRDE2	89	48.555	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000017730	nrde2	97	44.821	ENSACAG00000014571	NRDE2	88	47.228	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000017730	nrde2	97	42.802	ENSANAG00000025313	NRDE2	87	45.481	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.102	ENSACLG00000025154	nrde2	95	67.898	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000017730	nrde2	88	69.767	ENSAMXG00000034642	nrde2	92	46.154	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000017730	nrde2	96	46.432	ENSBTAG00000005427	NRDE2	86	51.882	Bos_taurus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.367	ENSCJAG00000017711	NRDE2	87	48.403	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	43.966	ENSCAFG00000017515	NRDE2	90	45.249	Canis_familiaris
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.154	ENSCAFG00020016346	NRDE2	89	47.673	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.161	ENSCHIG00000005876	NRDE2	89	47.154	Capra_hircus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.673	ENSTSYG00000000161	NRDE2	87	48.738	Carlito_syrichta
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.184	ENSCAPG00000012039	NRDE2	88	49.419	Cavia_aperea
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.087	ENSCPOG00000002428	NRDE2	87	49.322	Cavia_porcellus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.394	ENSCCAG00000024917	NRDE2	89	47.531	Cebus_capucinus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.034	ENSCLAG00000015185	NRDE2	87	48.112	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.849	ENSCSAG00000011451	NRDE2	87	48.986	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000017730	nrde2	70	46.591	ENSCHOG00000006165	NRDE2	63	60.526	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.096	ENSCPBG00000008537	NRDE2	85	47.801	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.042	ENSCANG00000029067	NRDE2	87	49.179	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.324	ENSCGRG00001015658	Nrde2	87	48.216	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.717	ENSCGRG00000005062	Nrde2	87	48.833	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000017730	nrde2	94	66.285	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	67.841	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.606	ENSCVAG00000023105	nrde2	96	67.489	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000017730	nrde2	96	57.342	ENSDARG00000074726	nrde2	91	56.901	Danio_rerio
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.065	ENSDNOG00000024057	NRDE2	87	48.835	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000017730	nrde2	89	46.659	ENSDORG00000003197	Nrde2	96	49.073	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000017730	nrde2	68	49.091	ENSETEG00000000198	NRDE2	65	49.091	Echinops_telfairi
ENSORLG00000017730	nrde2	98	38.600	ENSEBUG00000014552	nrde2	87	40.984	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.191	ENSEASG00005020675	NRDE2	89	48.243	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.206	ENSECAG00000003862	NRDE2	89	48.393	Equus_caballus
ENSORLG00000017730	nrde2	58	57.143	ENSEEUG00000004026	-	63	57.143	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	55.061	ENSELUG00000005973	nrde2	91	57.900	Esox_lucius
ENSORLG00000017730	nrde2	99	46.667	ENSFCAG00000011312	NRDE2	87	48.792	Felis_catus
ENSORLG00000017730	nrde2	96	48.417	ENSFALG00000012260	NRDE2	88	48.944	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.077	ENSFDAG00000021350	NRDE2	87	48.602	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.691	ENSFHEG00000021385	nrde2	95	67.838	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000017730	nrde2	73	66.008	ENSGMOG00000015815	nrde2	90	70.522	Gadus_morhua
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.437	ENSGALG00000010677	NRDE2	88	48.123	Gallus_gallus
ENSORLG00000017730	nrde2	96	68.466	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	70.833	Gambusia_affinis
ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.405	ENSGACG00000012619	nrde2	91	68.216	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.577	ENSGAGG00000003252	NRDE2	88	48.138	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000017730	nrde2	95	47.575	ENSGGOG00000008835	NRDE2	90	48.338	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.190	ENSHBUG00000016736	nrde2	95	68.074	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000017730	nrde2	95	48.093	ENSHGLG00000006731	NRDE2	88	49.470	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000017730	nrde2	95	48.093	ENSHGLG00100017736	NRDE2	88	49.470	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000017730	nrde2	96	62.069	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	62.088	Hippocampus_comes
ENSORLG00000017730	nrde2	98	49.123	ENSIPUG00000016129	nrde2	91	50.613	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.542	ENSSTOG00000001678	NRDE2	87	48.938	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.724	ENSJJAG00000000907	Nrde2	87	49.516	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.728	ENSKMAG00000008647	nrde2	95	69.137	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	66.699	ENSLBEG00000021428	nrde2	96	68.785	Labrus_bergylta
ENSORLG00000017730	nrde2	81	48.118	ENSLACG00000013921	NRDE2	98	51.345	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000017730	nrde2	98	53.140	ENSLOCG00000009037	nrde2	90	55.231	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.503	ENSLAFG00000004966	NRDE2	89	48.309	Loxodonta_africana
ENSORLG00000017730	nrde2	88	46.552	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	66.176	Macaca_mulatta
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.435	ENSMAMG00000013452	nrde2	96	68.407	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.190	ENSMZEG00005008319	nrde2	95	67.986	Maylandia_zebra
ENSORLG00000017730	nrde2	96	44.780	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	47.242	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.236	ENSMAUG00000018578	Nrde2	88	47.788	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.577	ENSMICG00000016741	NRDE2	88	49.232	Microcebus_murinus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	44.671	ENSMOCG00000014472	Nrde2	86	47.338	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000017730	nrde2	85	64.106	ENSMMOG00000004703	nrde2	92	66.589	Mola_mola
ENSORLG00000017730	nrde2	93	46.571	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	48.494	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000017730	nrde2	99	64.938	ENSMALG00000021869	nrde2	99	67.889	Monopterus_albus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.577	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	48.444	Mus_caroli
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.865	ENSMUSG00000021179	Nrde2	86	48.785	Mus_musculus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.717	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	48.346	Mus_pahari
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.525	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	88	67.925	Mus_spretus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.597	ENSMPUG00000008135	NRDE2	88	47.734	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000017730	nrde2	95	47.152	ENSMLUG00000007484	NRDE2	87	48.887	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	44.828	ENSNGAG00000002993	Nrde2	89	47.905	Nannospalax_galili
ENSORLG00000017730	nrde2	99	66.667	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	71.429	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000017730	nrde2	96	45.418	ENSNLEG00000017032	NRDE2	87	47.787	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000017730	nrde2	84	48.583	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	47.368	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000017730	nrde2	61	58.889	ENSOPRG00000001375	-	60	61.386	Ochotona_princeps
ENSORLG00000017730	nrde2	97	44.348	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	47.030	Octodon_degus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	69.183	ENSONIG00000019512	nrde2	91	70.140	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.679	ENSOCUG00000010083	NRDE2	87	49.174	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	89.364	ENSORLG00020015965	nrde2	96	89.625	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000017730	nrde2	100	92.000	ENSORLG00015012437	nrde2	100	90.191	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000017730	nrde2	99	79.181	ENSOMEG00000010890	nrde2	95	79.983	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.910	ENSOGAG00000006624	NRDE2	88	48.651	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000017730	nrde2	96	44.705	ENSOARG00000003475	NRDE2	90	45.720	Ovis_aries
ENSORLG00000017730	nrde2	96	47.514	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	49.891	Pan_paniscus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	46.205	ENSPPRG00000006422	NRDE2	87	48.986	Panthera_pardus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	46.395	ENSPTIG00000009989	NRDE2	87	48.986	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000017730	nrde2	95	47.753	ENSPTRG00000023399	NRDE2	90	48.623	Pan_troglodytes
ENSORLG00000017730	nrde2	98	48.615	ENSPKIG00000009331	nrde2	91	51.772	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.043	ENSPSIG00000005588	NRDE2	87	48.263	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000017730	nrde2	96	65.974	ENSPMGG00000024089	nrde2	93	65.679	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.813	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.125	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.902	ENSPCIG00000018567	NRDE2	93	49.037	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	65.039	ENSPFOG00000013217	nrde2	95	65.271	Poecilia_formosa
ENSORLG00000017730	nrde2	99	66.870	ENSPLAG00000022350	nrde2	95	67.103	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000017730	nrde2	99	66.783	ENSPMEG00000000778	nrde2	95	67.016	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.277	ENSPREG00000009066	nrde2	95	67.393	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000017730	nrde2	94	45.965	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	47.130	Pongo_abelii
ENSORLG00000017730	nrde2	78	72.500	ENSPCAG00000016399	NRDE2	69	64.615	Procavia_capensis
ENSORLG00000017730	nrde2	94	46.309	ENSPCOG00000024684	NRDE2	87	47.992	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000017730	nrde2	96	42.970	ENSPVAG00000010023	NRDE2	89	43.817	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.824	ENSPNYG00000022833	nrde2	95	72.637	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000017730	nrde2	98	50.916	ENSPNAG00000015807	nrde2	95	53.955	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000017730	nrde2	89	46.113	ENSRNOG00000004004	Nrde2	87	47.543	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.656	ENSSBOG00000024346	NRDE2	87	48.403	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.545	ENSSHAG00000016736	NRDE2	85	49.468	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000017730	nrde2	96	53.247	ENSSFOG00015011794	nrde2	91	53.277	Scleropages_formosus
ENSORLG00000017730	nrde2	96	68.170	ENSSMAG00000011671	nrde2	90	68.459	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	69.896	ENSSDUG00000017948	nrde2	96	69.291	Seriola_dumerili
ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.248	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	72.846	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.673	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	49.324	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	71.012	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	72.253	Stegastes_partitus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.013	ENSSSCG00000002434	NRDE2	88	47.736	Sus_scrofa
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.146	ENSTGUG00000012462	-	90	48.555	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000017730	nrde2	90	62.354	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	67.067	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000017730	nrde2	92	51.961	ENSTBEG00000011834	NRDE2	83	51.300	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000017730	nrde2	97	45.385	ENSTTRG00000013583	NRDE2	89	47.037	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	44.861	ENSUAMG00000004159	NRDE2	93	47.962	Ursus_americanus
ENSORLG00000017730	nrde2	98	46.002	ENSUMAG00000006393	NRDE2	91	47.383	Ursus_maritimus
ENSORLG00000017730	nrde2	97	46.346	ENSVVUG00000018202	NRDE2	93	45.625	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000017730	nrde2	98	43.453	ENSXETG00000015708	nrde2	89	46.467	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000017730	nrde2	96	68.109	ENSXCOG00000013298	nrde2	96	68.065	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.073	ENSXMAG00000009320	nrde2	95	67.132	Xiphophorus_maculatus