EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000020420 (Gene tree)
Gene ID: 101162511
Gene Symbol: rpp30
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2004 bases
Position: chr19:1038664-1040667
Accession: 101162511
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000025307	RNase_P_p30	PF01876.16	1.3e-65	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000025308	-	870	XM_004086809	ENSORLP00000025307	289 (aa)	XP_004086857	H2N1K2

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
ola03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSG00000148688	RPP30	100	54.331	Homo_sapiens
ENSORLG00000020420	rpp30	80	82.833	ENSAPOG00000023156	rpp30	97	73.413	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.843	ENSAMEG00000016776	RPP30	95	59.843	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000020420	rpp30	79	84.783	ENSACIG00000022810	rpp30	97	70.916	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	83.333	ENSAOCG00000016438	rpp30	85	83.333	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000020420	rpp30	87	83.333	ENSAPEG00000008697	rpp30	87	83.333	Amphiprion_percula
ENSORLG00000020420	rpp30	87	80.156	ENSATEG00000015263	rpp30	94	80.156	Anabas_testudineus
ENSORLG00000020420	rpp30	75	57.534	ENSAPLG00000009959	RPP30	91	57.534	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.039	ENSACAG00000007996	RPP30	97	55.039	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000020420	rpp30	87	48.031	ENSANAG00000009439	RPP30	79	48.031	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000020420	rpp30	100	75.862	ENSACLG00000015389	-	100	75.862	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000020420	rpp30	88	61.024	ENSAMXG00000040653	rpp30	93	61.024	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.661	ENSBTAG00000002973	RPP30	95	58.661	Bos_taurus
ENSORLG00000020420	rpp30	90	55.970	ENSCJAG00000011045	RPP30	92	59.756	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.449	ENSCAFG00000031801	RPP30	95	59.449	Canis_familiaris
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.449	ENSCAFG00020000258	RPP30	95	59.449	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.118	ENSCHIG00000012901	RPP30	95	55.118	Capra_hircus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.661	ENSTSYG00000013903	RPP30	95	58.661	Carlito_syrichta
ENSORLG00000020420	rpp30	77	34.483	ENSCAPG00000001326	RPP30	93	41.593	Cavia_aperea
ENSORLG00000020420	rpp30	87	56.299	ENSCPOG00000033174	RPP30	95	56.299	Cavia_porcellus
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.397	ENSCCAG00000029514	RPP30	96	58.397	Cebus_capucinus
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.397	ENSCATG00000042072	RPP30	96	58.397	Cercocebus_atys
ENSORLG00000020420	rpp30	87	56.693	ENSCLAG00000008595	RPP30	95	56.693	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSCSAG00000006694	RPP30	96	58.015	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000020420	rpp30	79	30.078	ENSCHOG00000007023	-	100	30.078	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000020420	rpp30	84	59.756	ENSCPBG00000026518	RPP30	92	59.756	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000020420	rpp30	51	50.340	ENSCING00000019714	-	93	36.719	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000020420	rpp30	98	36.519	ENSCSAVG00000011282	-	95	36.519	Ciona_savignyi
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSCANG00000041084	RPP30	96	58.015	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000020420	rpp30	79	57.759	ENSCGRG00001017068	-	97	57.759	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000020420	rpp30	87	50.394	ENSCGRG00001000834	-	95	50.394	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000020420	rpp30	87	50.394	ENSCGRG00000006196	-	95	50.394	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000020420	rpp30	87	56.693	ENSCGRG00000002508	-	95	56.693	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000020420	rpp30	87	68.872	ENSCSEG00000001779	rpp30	89	68.872	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000020420	rpp30	84	79.918	ENSCVAG00000003139	rpp30	100	71.034	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000020420	rpp30	85	65.854	ENSDARG00000027428	rpp30	92	65.854	Danio_rerio
ENSORLG00000020420	rpp30	87	57.087	ENSDNOG00000010186	RPP30	88	57.087	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.055	ENSDORG00000015333	Rpp30	95	59.055	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.055	ENSETEG00000018823	RPP30	95	59.055	Echinops_telfairi
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.661	ENSEASG00005011050	RPP30	95	58.661	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.661	ENSECAG00000021917	RPP30	95	58.661	Equus_caballus
ENSORLG00000020420	rpp30	85	41.270	ENSEEUG00000009986	-	96	41.270	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000020420	rpp30	85	64.228	ENSELUG00000003731	rpp30	88	64.228	Esox_lucius
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.843	ENSFCAG00000029073	RPP30	88	59.843	Felis_catus
ENSORLG00000020420	rpp30	84	58.130	ENSFALG00000007711	RPP30	92	58.130	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000020420	rpp30	87	57.480	ENSFDAG00000019241	RPP30	95	57.480	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000020420	rpp30	89	76.265	ENSFHEG00000014739	rpp30	98	69.811	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000020420	rpp30	83	62.903	ENSGMOG00000005379	rpp30	99	62.903	Gadus_morhua
ENSORLG00000020420	rpp30	84	58.537	ENSGALG00000006486	RPP30	89	63.636	Gallus_gallus
ENSORLG00000020420	rpp30	89	75.290	ENSGAFG00000001445	rpp30	96	75.290	Gambusia_affinis
ENSORLG00000020420	rpp30	87	75.486	ENSGACG00000010285	rpp30	92	75.486	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000020420	rpp30	85	58.468	ENSGAGG00000000980	RPP30	64	58.468	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.397	ENSGGOG00000026917	RPP30	96	58.397	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000020420	rpp30	100	75.862	ENSHBUG00000019332	rpp30	100	75.862	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.268	ENSHGLG00000013072	RPP30	95	58.268	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.268	ENSHGLG00100017798	RPP30	95	58.268	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000020420	rpp30	99	61.017	ENSHCOG00000004763	-	99	61.017	Hippocampus_comes
ENSORLG00000020420	rpp30	99	56.552	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	56.552	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000020420	rpp30	90	55.970	ENSSTOG00000027002	RPP30	100	55.970	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000020420	rpp30	90	57.895	ENSJJAG00000020041	Rpp30	99	57.895	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000020420	rpp30	89	79.767	ENSKMAG00000015355	rpp30	96	79.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000020420	rpp30	86	68.235	ENSLBEG00000019989	rpp30	94	68.235	Labrus_bergylta
ENSORLG00000020420	rpp30	65	46.575	ENSLACG00000002534	RPP30	96	46.575	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000020420	rpp30	87	64.143	ENSLOCG00000000031	rpp30	94	64.143	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.268	ENSLAFG00000015931	RPP30	95	58.268	Loxodonta_africana
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSMFAG00000031109	RPP30	96	58.015	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSMMUG00000006628	RPP30	96	58.015	Macaca_mulatta
ENSORLG00000020420	rpp30	90	57.634	ENSMNEG00000033838	RPP30	90	65.254	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSMLEG00000037578	RPP30	96	58.015	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000020420	rpp30	100	71.959	ENSMAMG00000010934	rpp30	100	71.959	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000020420	rpp30	100	76.552	ENSMZEG00005018508	-	100	76.552	Maylandia_zebra
ENSORLG00000020420	rpp30	84	52.846	ENSMGAG00000008452	RPP30	92	53.252	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000020420	rpp30	87	57.874	ENSMAUG00000008797	Rpp30	95	57.874	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000020420	rpp30	91	57.037	ENSMICG00000012019	RPP30	95	59.449	Microcebus_murinus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	57.087	ENSMOCG00000016872	Rpp30	95	57.087	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000020420	rpp30	86	76.172	ENSMMOG00000009266	rpp30	95	76.172	Mola_mola
ENSORLG00000020420	rpp30	87	49.213	ENSMODG00000009342	-	95	49.213	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000020420	rpp30	90	57.736	ENSMODG00000006863	-	99	57.736	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000020420	rpp30	89	76.154	ENSMALG00000011718	rpp30	96	76.154	Monopterus_albus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.118	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	95	55.118	Mus_caroli
ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.512	ENSMUSG00000024800	Rpp30	95	55.512	Mus_musculus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.118	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	95	55.118	Mus_pahari
ENSORLG00000020420	rpp30	89	55.000	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	96	55.000	Mus_spretus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.843	ENSMPUG00000017258	RPP30	89	59.843	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000020420	rpp30	89	59.073	ENSMLUG00000017169	RPP30	95	59.073	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000020420	rpp30	70	56.585	ENSNGAG00000014392	-	85	56.585	Nannospalax_galili
ENSORLG00000020420	rpp30	87	58.268	ENSNGAG00000012018	-	95	58.268	Nannospalax_galili
ENSORLG00000020420	rpp30	89	72.868	ENSNBRG00000024170	-	97	72.868	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.397	ENSNLEG00000012383	RPP30	96	58.397	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000020420	rpp30	87	53.462	ENSMEUG00000015587	-	96	53.462	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000020420	rpp30	87	57.480	ENSODEG00000004530	-	97	57.480	Octodon_degus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	43.426	ENSODEG00000004560	-	94	43.426	Octodon_degus
ENSORLG00000020420	rpp30	70	81.863	ENSONIG00000019140	rpp30	100	79.710	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000020420	rpp30	85	60.643	ENSOANG00000003415	RPP30	93	60.643	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.906	ENSOCUG00000006896	RPP30	87	55.906	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000020420	rpp30	100	89.310	ENSORLG00020009037	-	100	89.310	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000020420	rpp30	100	89.655	ENSORLG00015008300	rpp30	93	89.655	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000020420	rpp30	62	91.160	ENSOMEG00000012640	-	98	91.160	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.449	ENSOGAG00000013963	RPP30	95	59.449	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000020420	rpp30	87	54.331	ENSOARG00000015789	RPP30	95	54.331	Ovis_aries
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.397	ENSPPAG00000043779	RPP30	96	58.397	Pan_paniscus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.843	ENSPPRG00000000115	RPP30	95	59.843	Panthera_pardus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.843	ENSPTIG00000014949	RPP30	95	59.843	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000020420	rpp30	87	59.055	ENSPTRG00000002742	RPP30	96	55.344	Pan_troglodytes
ENSORLG00000020420	rpp30	90	58.015	ENSPANG00000021710	RPP30	96	58.015	Papio_anubis
ENSORLG00000020420	rpp30	78	56.957	ENSPSIG00000013213	RPP30	95	56.957	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000020420	rpp30	79	52.838	ENSPMGG00000014872	rpp30	93	52.838	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	46.457	ENSPEMG00000001948	Rpp30	94	46.457	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000020420	rpp30	90	57.736	ENSPCIG00000015730	RPP30	99	57.736	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000020420	rpp30	87	79.365	ENSPFOG00000000610	rpp30	94	79.365	Poecilia_formosa
ENSORLG00000020420	rpp30	89	75.290	ENSPLAG00000003728	rpp30	89	75.290	Poecilia_latipinna
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ENSORLG00000020420	rpp30	78	57.826	ENSXETG00000021785	rpp30	86	57.826	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000020420	rpp30	93	73.063	ENSXCOG00000017864	rpp30	99	73.063	Xiphophorus_couchianus