EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000022561 (Gene tree)
Gene ID: 101158863
Gene Symbol: ehd1a
Alias: -
Full Name: EH domain-containing protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14135 bases
Position: chr10:12387431-12401565
Accession: 101158863
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000042894	MMR_HSR1	PF01926.23	9.6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000036595	-	4415	-	ENSORLP00000028945	511 (aa)	-	-
ENSORLT00000040747	-	4635	XM_004073164	ENSORLP00000042894	532 (aa)	XP_004073212	UPI0002A498E9

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000022561's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000022561's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	57.169	ENSORLG00000012013	-	99	57.169
ENSORLG00000022561	ehd1a	70	32.732	ENSORLG00000015064	SRL	86	31.959
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	70.076	ENSORLG00000002244	ehd2b	98	70.455
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	75.530	ENSORLG00000010433	ehd4	95	75.530
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	85.962	ENSORLG00000017118	ehd3	97	85.962
ENSORLG00000022561	ehd1a	73	30.864	ENSORLG00000008291	srl	89	31.398

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSG00000110047	EHD1	100	93.827	Homo_sapiens
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.797	ENSAPOG00000013440	ehd1a	100	93.797	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.923	ENSAMEG00000017785	EHD1	94	86.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.528	ENSACIG00000022182	ehd1a	99	94.528	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.162	ENSAOCG00000016322	ehd1a	99	94.162	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.162	ENSAPEG00000010363	ehd1a	99	94.162	Amphiprion_percula
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.409	ENSATEG00000013980	ehd1a	99	93.409	Anabas_testudineus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSANAG00000034810	EHD1	97	87.500	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	95.094	ENSACLG00000016016	ehd1a	99	95.094	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.260	ENSAMXG00000031892	-	98	86.260	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	89.981	ENSAMXG00000039344	ehd1a	99	89.981	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSBTAG00000050712	EHD1	97	87.500	Bos_taurus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	68.302	WBGene00004373	rme-1	95	68.302	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCJAG00000002660	EHD1	97	87.500	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000022561	ehd1a	77	86.861	ENSCAFG00000014128	EHD1	90	86.525	Canis_familiaris
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCAFG00020014846	EHD1	97	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCHIG00000020707	-	97	87.500	Capra_hircus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCPOG00000008157	EHD1	97	87.500	Cavia_porcellus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCCAG00000004590	EHD1	97	87.500	Cebus_capucinus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCATG00000010658	EHD1	95	87.500	Cercocebus_atys
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSCLAG00000016412	EHD1	97	87.500	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSCSAG00000007397	EHD1	97	87.692	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000022561	ehd1a	97	85.521	ENSCPBG00000023692	EHD1	96	85.521	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSCANG00000042123	EHD1	97	87.692	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	ENSCGRG00001019701	Ehd1	97	87.308	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000022561	ehd1a	94	86.800	ENSCGRG00000000662	Ehd1	99	86.800	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	91.698	ENSCSEG00000006078	ehd1a	99	91.698	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.797	ENSCVAG00000012152	ehd1a	100	93.797	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	90.385	ENSDARG00000098853	ehd1a	98	90.385	Danio_rerio
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	90.962	ENSDARG00000014793	ehd1b	98	90.962	Danio_rerio
ENSORLG00000022561	ehd1a	66	88.825	ENSDNOG00000017834	EHD1	93	88.825	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSDORG00000030186	Ehd1	97	87.500	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	69.187	FBgn0016693	Past1	99	69.187	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000022561	ehd1a	58	80.519	ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.519	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	76.616	ENSEBUG00000009968	EHD1	98	76.616	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.885	ENSEASG00005018250	EHD1	97	87.885	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.885	ENSECAG00000011638	EHD1	97	87.885	Equus_caballus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	90.512	ENSELUG00000016093	ehd1b	99	90.512	Esox_lucius
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	90.323	ENSELUG00000007973	-	99	90.323	Esox_lucius
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.885	ENSFCAG00000027734	EHD1	95	87.885	Felis_catus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSFDAG00000007697	EHD1	97	87.500	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.518	ENSFHEG00000002690	ehd1a	99	94.518	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.346	ENSGMOG00000012192	ehd1a	100	93.346	Gadus_morhua
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	94.184	ENSGAFG00000000730	ehd1a	100	94.184	Gambusia_affinis
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.609	ENSGACG00000017605	ehd1a	100	93.609	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.346	ENSGAGG00000001677	-	90	86.346	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.906	ENSHBUG00000012087	ehd1a	99	94.906	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSHGLG00000010254	EHD1	97	87.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSHGLG00100014206	EHD1	97	87.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	92.293	ENSHCOG00000006825	ehd1a	100	92.293	Hippocampus_comes
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	91.429	ENSIPUG00000002819	ehd1a	98	91.429	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.154	ENSIPUG00000017390	EHD1	97	86.154	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSSTOG00000009829	EHD1	97	87.692	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.115	ENSJJAG00000022299	Ehd1	97	87.115	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.421	ENSKMAG00000004764	ehd1a	100	93.421	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.985	ENSLBEG00000004390	ehd1a	100	93.985	Labrus_bergylta
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.165	ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.165	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	83.939	ENSLOCG00000000924	ehd1b	94	83.939	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	84.808	ENSLAFG00000011643	EHD1	97	84.808	Loxodonta_africana
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSMFAG00000032608	EHD1	97	87.692	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSMMUG00000003972	EHD1	95	87.692	Macaca_mulatta
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSMNEG00000031673	EHD1	97	87.692	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSMLEG00000031992	EHD1	97	87.692	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.974	ENSMAMG00000021737	ehd1a	99	93.974	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	95.094	ENSMZEG00005004305	ehd1a	99	95.094	Maylandia_zebra
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	ENSMAUG00000013823	Ehd1	97	87.308	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSMICG00000001239	EHD1	96	86.806	Microcebus_murinus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSMOCG00000015517	Ehd1	97	87.500	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.974	ENSMMOG00000003005	ehd1a	100	93.974	Mola_mola
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.915	ENSMALG00000012679	ehd1a	99	94.915	Monopterus_albus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	97	87.308	Mus_caroli
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	ENSMUSG00000024772	Ehd1	97	87.308	Mus_musculus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.115	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	97	87.115	Mus_pahari
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	97	87.308	Mus_spretus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSMPUG00000012497	EHD1	97	87.692	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSNGAG00000020358	Ehd1	97	87.500	Nannospalax_galili
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.717	ENSNBRG00000002933	ehd1a	99	94.717	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSNLEG00000005375	EHD1	97	87.692	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.923	ENSOPRG00000011350	EHD1	97	86.923	Ochotona_princeps
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSODEG00000014527	EHD1	97	87.692	Octodon_degus
ENSORLG00000022561	ehd1a	59	90.735	ENSOCUG00000029532	EHD1	92	90.735	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	99.812	ENSORLG00020018451	ehd1a	100	99.812	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	99.812	ENSORLG00015017672	ehd1a	100	99.812	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	97.744	ENSOMEG00000019329	ehd1a	100	97.744	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSOGAG00000009351	EHD1	97	87.500	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000022561	ehd1a	91	88.041	ENSOARG00000010447	EHD1	99	88.041	Ovis_aries
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSPPAG00000037178	EHD1	97	87.692	Pan_paniscus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	85.577	ENSPPRG00000006031	EHD1	95	85.577	Panthera_pardus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSPTRG00000003851	EHD1	95	87.692	Pan_troglodytes
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSPANG00000023358	EHD1	95	87.692	Papio_anubis
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	88.403	ENSPKIG00000023165	-	99	88.403	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000022561	ehd1a	66	94.556	ENSPKIG00000020297	-	85	94.556	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.538	ENSPSIG00000005727	EHD1	97	86.538	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.536	ENSPMGG00000017810	ehd1a	99	93.019	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSPEMG00000010917	Ehd1	97	87.500	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000022561	ehd1a	72	69.816	ENSPCIG00000017053	-	94	69.816	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	ENSPCIG00000014850	EHD1	97	87.308	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.621	ENSPFOG00000010613	ehd1a	99	93.621	Poecilia_formosa
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.621	ENSPLAG00000023296	ehd1a	100	93.621	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.809	ENSPMEG00000003397	ehd1a	100	93.809	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.621	ENSPREG00000015893	ehd1a	100	93.621	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSPPYG00000003093	EHD1	97	87.692	Pongo_abelii
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSPCOG00000010309	EHD1	97	87.500	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.115	ENSPVAG00000007890	EHD1	97	87.115	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.906	ENSPNYG00000015448	ehd1a	99	94.906	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	89.143	ENSPNAG00000007408	EHD1	99	89.143	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	90.857	ENSPNAG00000023091	ehd1a	98	90.857	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	ENSRNOG00000043503	Ehd1	97	87.308	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSRBIG00000039111	EHD1	97	87.692	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.692	ENSRROG00000026366	EHD1	97	87.692	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSSBOG00000023399	EHD1	97	87.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000022561	ehd1a	74	68.922	ENSSHAG00000007430	-	96	66.747	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000022561	ehd1a	91	90.123	ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.123	Scleropages_formosus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	91.555	ENSSFOG00015006481	-	98	91.555	Scleropages_formosus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.233	ENSSMAG00000018210	ehd1a	100	93.233	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	94.737	ENSSDUG00000016436	ehd1a	100	94.737	Seriola_dumerili
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	94.737	ENSSLDG00000015328	ehd1a	100	94.737	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	94.329	ENSSPAG00000008682	ehd1a	99	94.329	Stegastes_partitus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSSSCG00000013017	EHD1	97	87.500	Sus_scrofa
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.985	ENSTRUG00000025890	ehd1a	99	93.985	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.573	ENSTNIG00000016792	ehd1a	98	93.573	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000022561	ehd1a	76	78.325	ENSTBEG00000007057	EHD1	98	78.325	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.308	ENSTTRG00000008887	EHD1	97	87.308	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSUAMG00000012071	EHD1	97	87.500	Ursus_americanus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	85.579	ENSUMAG00000007890	EHD1	98	86.398	Ursus_maritimus
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.500	ENSVVUG00000027552	EHD1	82	87.500	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.538	ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.538	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000022561	ehd1a	99	93.233	ENSXCOG00000001781	ehd1a	99	93.233	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000022561	ehd1a	100	93.621	ENSXMAG00000005301	ehd1a	100	93.621	Xiphophorus_maculatus