EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000028029 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2877 bases
Position: chr1:35219661-35222537
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000038306	RVT_1	PF00078.27	3.6e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000034644	-	2877	-	ENSORLP00000038306	958 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000028029's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000028029's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000027645	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	31.641	ENSORLG00000026112	-	91	31.166
ENSORLG00000028029	-	67	31.700	ENSORLG00000025112	-	88	31.240
ENSORLG00000028029	-	95	32.112	ENSORLG00000024556	-	91	31.411
ENSORLG00000028029	-	94	32.599	ENSORLG00000030541	-	88	32.379
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000028518	-	91	31.302
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000023676	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000027439	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	95	31.857	ENSORLG00000027434	-	91	31.166
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000030049	-	98	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000027862	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	91	31.186	ENSORLG00000030514	-	92	30.496
ENSORLG00000028029	-	95	32.397	ENSORLG00000022907	-	91	31.785
ENSORLG00000028029	-	95	31.818	ENSORLG00000024801	-	91	31.127
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000023624	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000023626	-	91	31.405
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000024537	-	91	31.302
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000028249	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000023217	-	91	31.269
ENSORLG00000028029	-	50	31.056	ENSORLG00000029093	-	97	31.056
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000024342	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000021832	-	98	31.579
ENSORLG00000028029	-	66	32.399	ENSORLG00000023326	-	93	31.787
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000024622	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000025896	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	31.823	ENSORLG00000029382	-	91	31.237
ENSORLG00000028029	-	95	32.324	ENSORLG00000024101	-	91	31.715
ENSORLG00000028029	-	87	32.189	ENSORLG00000024563	-	98	31.757
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000023036	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000025556	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	99	31.785	ENSORLG00000024333	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000021860	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	99	31.921	ENSORLG00000023640	-	91	31.715
ENSORLG00000028029	-	95	31.892	ENSORLG00000026767	-	91	31.198
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000024689	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	84	31.790	ENSORLG00000030467	-	87	31.425
ENSORLG00000028029	-	82	31.414	ENSORLG00000025843	-	81	31.043
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000026392	-	98	31.405
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000027933	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000025393	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	31.926	ENSORLG00000022102	-	91	31.231
ENSORLG00000028029	-	87	32.033	ENSORLG00000022101	-	90	31.678
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000028713	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000027354	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000026400	-	91	31.405
ENSORLG00000028029	-	95	32.324	ENSORLG00000022897	-	91	31.715
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000029073	-	91	31.405
ENSORLG00000028029	-	91	32.050	ENSORLG00000021932	-	86	31.823
ENSORLG00000028029	-	88	99.168	ENSORLG00000030217	-	100	99.168
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000029576	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000023380	-	91	31.302
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000028859	-	91	31.405
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000027132	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000026178	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	79	31.503	ENSORLG00000028330	-	98	31.064
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000022049	-	98	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	32.255	ENSORLG00000022044	-	91	31.546
ENSORLG00000028029	-	51	32.724	ENSORLG00000027624	-	99	32.724
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000025138	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	91	32.200	ENSORLG00000026815	-	87	31.973
ENSORLG00000028029	-	95	32.324	ENSORLG00000021789	-	91	31.612
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000028694	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	31.749	ENSORLG00000022924	-	98	31.166
ENSORLG00000028029	-	95	32.255	ENSORLG00000029970	-	91	31.546
ENSORLG00000028029	-	99	31.818	ENSORLG00000025543	-	91	31.612
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000026507	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000028734	-	91	31.818
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000029692	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000026123	-	91	31.612
ENSORLG00000028029	-	95	31.892	ENSORLG00000024897	-	91	31.302
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000029331	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000029332	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000022537	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	99	31.682	ENSORLG00000025512	-	91	31.379
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000024646	-	90	31.940
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000024645	-	98	31.508
ENSORLG00000028029	-	94	32.237	ENSORLG00000027325	-	90	31.723
ENSORLG00000028029	-	99	31.302	ENSORLG00000030118	-	91	31.095
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000023104	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	81	31.726	ENSORLG00000024673	-	98	31.106
ENSORLG00000028029	-	81	31.766	ENSORLG00000025758	-	98	31.022
ENSORLG00000028029	-	56	36.969	ENSORLG00000028845	-	93	37.057
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000022645	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000030097	-	91	31.612
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000026650	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000028304	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	94	32.489	ENSORLG00000027945	-	90	32.159
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000027942	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	31.857	ENSORLG00000026499	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	78	35.163	ENSORLG00000029966	-	95	35.496
ENSORLG00000028029	-	95	32.039	ENSORLG00000028546	-	91	31.340
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000024298	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	94	32.563	ENSORLG00000026622	-	91	32.120
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000030281	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	84	30.817	ENSORLG00000028786	-	99	30.817
ENSORLG00000028029	-	95	32.432	ENSORLG00000026509	-	91	31.818
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000030289	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	81	31.639	ENSORLG00000024229	-	98	30.900
ENSORLG00000028029	-	95	31.931	ENSORLG00000027598	-	91	31.237
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000029193	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	100	99.791	ENSORLG00000028947	-	100	99.791
ENSORLG00000028029	-	54	32.342	ENSORLG00000030105	-	79	31.716
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000028340	-	91	31.269
ENSORLG00000028029	-	95	31.857	ENSORLG00000030605	-	91	31.269
ENSORLG00000028029	-	95	32.255	ENSORLG00000028712	-	91	31.649
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000024187	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	87	35.119	ENSORLG00000029282	-	94	35.424
ENSORLG00000028029	-	95	32.324	ENSORLG00000029283	-	91	31.715
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000030347	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	32.255	ENSORLG00000027111	-	91	31.443
ENSORLG00000028029	-	95	31.749	ENSORLG00000030535	-	91	31.269
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000024473	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	88	99.405	ENSORLG00000028726	-	99	99.405
ENSORLG00000028029	-	64	31.470	ENSORLG00000029231	-	88	30.990
ENSORLG00000028029	-	87	34.900	ENSORLG00000023376	-	94	35.206
ENSORLG00000028029	-	95	32.289	ENSORLG00000026477	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	79	31.634	ENSORLG00000030153	-	98	31.188
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000029753	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	31.715	ENSORLG00000024822	-	91	31.340
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000024533	-	91	31.405
ENSORLG00000028029	-	79	32.068	ENSORLG00000028921	-	98	31.351
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000024048	-	91	31.715
ENSORLG00000028029	-	95	32.147	ENSORLG00000029999	-	91	31.546
ENSORLG00000028029	-	95	32.039	ENSORLG00000025298	-	91	31.546
ENSORLG00000028029	-	76	34.953	ENSORLG00000029262	-	93	35.302
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000026850	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000030391	-	91	31.269
ENSORLG00000028029	-	100	99.374	ENSORLG00000029318	-	100	99.374
ENSORLG00000028029	-	95	31.857	ENSORLG00000021880	-	91	31.373
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000029433	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	32.073	ENSORLG00000025533	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	56	36.794	ENSORLG00000027144	-	98	36.516
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000027738	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000025240	-	91	31.269
ENSORLG00000028029	-	50	36.992	ENSORLG00000029299	-	98	37.195
ENSORLG00000028029	-	95	32.147	ENSORLG00000024793	-	91	31.443
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000021825	-	91	31.579
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000023871	-	91	31.612
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000026895	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	95	31.965	ENSORLG00000022934	-	98	31.476
ENSORLG00000028029	-	95	32.181	ENSORLG00000030142	-	91	31.476
ENSORLG00000028029	-	90	32.151	ENSORLG00000029790	-	91	32.037
ENSORLG00000028029	-	79	31.503	ENSORLG00000026947	-	94	31.824
ENSORLG00000028029	-	95	32.108	ENSORLG00000027461	-	91	31.508
ENSORLG00000028029	-	51	38.966	ENSORLG00000015190	-	99	38.966
ENSORLG00000028029	-	95	31.784	ENSORLG00000023992	-	91	31.612
ENSORLG00000028029	-	83	31.250	ENSORLG00000028876	-	96	30.620
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000023209	-	91	31.405
ENSORLG00000028029	-	87	31.765	ENSORLG00000023760	-	91	31.529
ENSORLG00000028029	-	94	34.783	ENSORLG00000025024	-	84	34.889
ENSORLG00000028029	-	95	32.000	ENSORLG00000025027	-	91	31.302
ENSORLG00000028029	-	95	32.397	ENSORLG00000025030	-	91	31.682
ENSORLG00000028029	-	83	35.229	ENSORLG00000030430	-	83	35.018
ENSORLG00000028029	-	95	32.216	ENSORLG00000029439	-	91	31.508

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000028029	-	95	34.995	ENSATEG00000023604	-	88	34.295	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	91	35.690	ENSATEG00000014211	-	96	35.241	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	95	34.886	ENSATEG00000020292	-	88	34.295	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	95	34.811	ENSATEG00000009553	-	85	34.341	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	99	34.394	ENSATEG00000014941	-	94	33.881	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	95	34.995	ENSATEG00000024954	-	87	34.713	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	90	34.350	ENSATEG00000009235	-	87	34.463	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	95	34.995	ENSATEG00000010056	-	88	34.398	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	95	34.995	ENSATEG00000017504	-	88	34.398	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	94	34.868	ENSATEG00000014139	-	88	34.978	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028029	-	78	33.997	ENSACLG00000000593	-	85	34.238	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028029	-	56	37.085	ENSACLG00000019356	-	97	36.689	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028029	-	56	36.900	ENSACLG00000018836	-	97	36.441	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028029	-	51	37.195	ENSACLG00000001165	-	93	37.195	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028029	-	82	35.411	ENSAMXG00000039954	-	98	35.411	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000028029	-	51	38.415	ENSELUG00000024014	-	96	38.415	Esox_lucius
ENSORLG00000028029	-	94	34.239	ENSORLG00020009508	-	84	34.538	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028029	-	56	36.643	ENSORLG00020018851	-	93	37.043	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028029	-	100	96.973	ENSORLG00020020316	-	100	96.973	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028029	-	78	35.241	ENSORLG00020001879	-	95	35.570	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028029	-	93	97.750	ENSORLG00020002875	-	99	97.750	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028029	-	100	97.286	ENSORLG00020009614	-	100	97.286	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028029	-	53	36.893	ENSORLG00015008483	-	98	36.893	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028029	-	91	97.353	ENSORLG00015000605	-	100	97.353	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028029	-	56	36.794	ENSORLG00015020439	-	93	36.888	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028029	-	58	96.396	ENSORLG00015005190	-	100	96.396	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028029	-	58	36.767	ENSORLG00015011987	-	99	36.767	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028029	-	94	36.057	ENSOMEG00000007004	-	87	35.921	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	78	36.592	ENSOMEG00000019233	-	98	36.579	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	94	36.075	ENSOMEG00000010058	-	87	36.334	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	56	38.574	ENSOMEG00000019854	-	97	38.409	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	56	38.208	ENSOMEG00000022295	-	97	38.071	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	78	36.592	ENSOMEG00000013646	-	98	36.579	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	94	35.948	ENSOMEG00000000581	-	87	35.818	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	78	36.435	ENSOMEG00000016368	-	98	36.431	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028029	-	95	35.683	ENSSFOG00015020002	-	88	35.258	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	95	35.097	ENSSFOG00015016653	-	86	34.497	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	91	35.883	ENSSFOG00015007656	-	99	35.714	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	94	36.087	ENSSFOG00015021945	-	84	35.699	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	75	36.327	ENSSFOG00015011969	-	98	36.640	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	94	36.413	ENSSFOG00015014529	-	92	36.017	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	94	36.304	ENSSFOG00015000961	-	93	35.427	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	95	35.390	ENSSFOG00015004005	-	89	35.144	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028029	-	80	35.264	ENSSMAG00000001945	-	94	35.521	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028029	-	67	36.883	ENSSMAG00000012694	-	93	37.191	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028029	-	74	35.270	ENSSMAG00000002122	-	93	35.546	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028029	-	59	37.961	ENSSMAG00000012898	-	92	38.380	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028029	-	96	34.222	ENSSMAG00000015938	-	85	34.395	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028029	-	77	35.153	ENSSMAG00000011751	-	94	35.419	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028029	-	83	36.115	ENSXMAG00000025249	-	99	36.115	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	99	34.845	ENSXMAG00000025091	-	85	34.845	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	99	35.191	ENSXMAG00000021961	-	88	35.191	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	83	36.250	ENSXMAG00000021177	-	99	36.250	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	83	35.741	ENSXMAG00000022769	-	99	35.741	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	84	36.005	ENSXMAG00000025224	-	98	36.005	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	99	34.778	ENSXMAG00000023179	-	88	34.778	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000028029	-	99	34.881	ENSXMAG00000023308	-	88	34.881	Xiphophorus_maculatus