EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000028330 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2440 bases
Position: chr12:4924841-4927280
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000027442	RVT_1	PF00078.27	1.1e-41	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000029971	-	2440	-	ENSORLP00000027442	768 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000028330's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000028330's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000029999	-	77	97.917
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000023626	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000023624	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000025393	-	77	99.219
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000025533	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000030153	-	100	98.958
ENSORLG00000028330	-	61	98.726	ENSORLG00000025112	-	67	98.726
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000024048	-	77	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000025758	-	98	97.917
ENSORLG00000028330	-	85	96.764	ENSORLG00000023760	-	74	96.764
ENSORLG00000028330	-	100	97.638	ENSORLG00000025843	-	99	97.638
ENSORLG00000028330	-	88	98.077	ENSORLG00000026815	-	71	98.077
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000026123	-	77	99.219
ENSORLG00000028330	-	58	96.606	ENSORLG00000029231	-	66	96.606
ENSORLG00000028330	-	100	97.656	ENSORLG00000026499	-	77	97.656
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000023871	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000029439	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000022044	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000022934	-	83	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00000027461	-	77	98.047
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000024101	-	77	97.917
ENSORLG00000028330	-	60	37.137	ENSORLG00000015190	-	98	36.402
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000024556	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000029073	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000028876	-	96	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	97.526	ENSORLG00000022645	-	77	97.526
ENSORLG00000028330	-	90	33.151	ENSORLG00000029966	-	91	32.510
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000030391	-	77	98.177
ENSORLG00000028330	-	93	32.933	ENSORLG00000023376	-	83	32.306
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000025298	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	94	97.514	ENSORLG00000030541	-	75	97.514
ENSORLG00000028330	-	100	99.349	ENSORLG00000027439	-	77	99.349
ENSORLG00000028330	-	83	33.038	ENSORLG00000030430	-	71	32.344
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000027132	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000028518	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000030049	-	83	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000027111	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	61	99.153	ENSORLG00000022572	-	100	99.153
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000023036	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	59	36.134	ENSORLG00000029299	-	98	35.381
ENSORLG00000028330	-	99	30.685	ENSORLG00000029318	-	79	31.242
ENSORLG00000028330	-	95	97.934	ENSORLG00000023326	-	99	97.934
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000023104	-	77	97.786
ENSORLG00000028330	-	89	32.539	ENSORLG00000029262	-	80	33.333
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000026509	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000026507	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000027598	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000024333	-	77	97.917
ENSORLG00000028330	-	65	36.329	ENSORLG00000028845	-	88	35.645
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000030514	-	81	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00000024822	-	77	98.047
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000028921	-	100	98.568
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000022924	-	83	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000024897	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000026650	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000023380	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	84	97.519	ENSORLG00000022101	-	73	97.519
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000022102	-	77	99.219
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000029283	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	93	32.933	ENSORLG00000029282	-	83	32.306
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00000026400	-	77	98.047
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000024801	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00000030535	-	77	98.047
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000029193	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000022537	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	97.396	ENSORLG00000026947	-	100	97.396
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000026895	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000021860	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	51	37.136	ENSORLG00000026257	-	95	36.675
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000022049	-	83	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000026112	-	77	97.917
ENSORLG00000028330	-	61	98.517	ENSORLG00000024322	-	100	98.517
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000027738	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000028859	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000028304	-	77	98.177
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000029753	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000023217	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000025896	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000026767	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000025030	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	100	97.656	ENSORLG00000029382	-	77	97.656
ENSORLG00000028330	-	100	97.135	ENSORLG00000024673	-	98	97.135
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000030347	-	77	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000025027	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	93	33.066	ENSORLG00000025024	-	69	32.574
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000028734	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000022907	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000024793	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000027862	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000024342	-	77	99.219
ENSORLG00000028330	-	99	95.789	ENSORLG00000028786	-	100	95.789
ENSORLG00000028330	-	80	98.217	ENSORLG00000030467	-	70	98.217
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000024187	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000028546	-	77	98.177
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000029433	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000030289	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000030281	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000025138	-	77	99.219
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000029576	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000027645	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000027434	-	77	99.219
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000024645	-	83	98.307
ENSORLG00000028330	-	97	97.849	ENSORLG00000024646	-	76	97.849
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000025512	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000024563	-	90	98.177
ENSORLG00000028330	-	100	97.656	ENSORLG00000021880	-	77	97.656
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000027933	-	77	98.177
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000024537	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000024298	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000026392	-	83	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000030605	-	77	98.177
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000023209	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000029970	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	97.266	ENSORLG00000023992	-	77	97.266
ENSORLG00000028330	-	98	31.111	ENSORLG00000028947	-	79	31.373
ENSORLG00000028330	-	100	97.526	ENSORLG00000025543	-	77	97.526
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000022897	-	77	97.917
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000024533	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	98	30.817	ENSORLG00000028726	-	90	31.242
ENSORLG00000028330	-	100	97.266	ENSORLG00000023640	-	77	97.266
ENSORLG00000028330	-	95	98.224	ENSORLG00000026622	-	76	98.224
ENSORLG00000028330	-	100	97.786	ENSORLG00000026477	-	77	97.786
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000029692	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00000030097	-	77	97.917
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00000024622	-	77	98.568
ENSORLG00000028330	-	100	97.005	ENSORLG00000030118	-	77	97.005
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000021825	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	61	96.610	ENSORLG00000027624	-	100	96.610
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00000026850	-	77	98.177
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000021789	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	99.219	ENSORLG00000021832	-	83	99.219
ENSORLG00000028330	-	88	99.257	ENSORLG00000029790	-	75	99.257
ENSORLG00000028330	-	98	31.064	ENSORLG00000028029	-	79	31.503
ENSORLG00000028330	-	66	35.350	ENSORLG00000027144	-	90	34.981
ENSORLG00000028330	-	100	98.438	ENSORLG00000025240	-	77	98.438
ENSORLG00000028330	-	100	97.005	ENSORLG00000028340	-	77	97.005
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000030142	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	97.656	ENSORLG00000024229	-	98	97.656
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000029332	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	98.828	ENSORLG00000029331	-	77	98.828
ENSORLG00000028330	-	100	95.979	ENSORLG00000027325	-	77	95.979
ENSORLG00000028330	-	92	96.728	ENSORLG00000021932	-	73	96.728
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000028713	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000023676	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000026178	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000027942	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	94	98.889	ENSORLG00000027945	-	76	98.889
ENSORLG00000028330	-	98	30.817	ENSORLG00000030217	-	90	31.242
ENSORLG00000028330	-	58	30.704	ENSORLG00000029093	-	96	30.490
ENSORLG00000028330	-	100	98.958	ENSORLG00000024689	-	77	98.958
ENSORLG00000028330	-	100	99.089	ENSORLG00000025556	-	77	99.089
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00000028249	-	77	98.047
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000027354	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	100	98.698	ENSORLG00000024473	-	77	98.698
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000028712	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	100	98.307	ENSORLG00000028694	-	77	98.307
ENSORLG00000028330	-	50	34.351	ENSORLG00000029683	-	93	34.351

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000028330	-	74	31.438	ENSAPEG00000009254	-	99	31.104	Amphiprion_percula
ENSORLG00000028330	-	97	95.181	ENSATEG00000006562	-	90	95.181	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028330	-	100	92.448	ENSATEG00000011048	-	98	92.448	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028330	-	88	32.286	ENSACLG00000013208	-	81	32.909	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028330	-	90	32.455	ENSACLG00000017252	-	91	31.950	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028330	-	61	35.343	ENSACLG00000000577	-	97	34.381	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028330	-	61	81.144	ENSCSEG00000000334	-	100	81.144	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028330	-	99	77.705	ENSCSEG00000017238	-	90	77.705	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028330	-	50	82.199	ENSCSEG00000009301	-	97	82.199	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028330	-	81	78.939	ENSCSEG00000016291	-	97	78.939	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028330	-	83	78.438	ENSCSEG00000008847	-	99	78.438	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028330	-	63	34.608	ENSELUG00000023077	-	87	34.406	Esox_lucius
ENSORLG00000028330	-	69	30.331	ENSLACG00000006699	-	88	31.405	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000028330	-	99	46.907	ENSLACG00000011569	-	89	46.354	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000028330	-	59	40.263	ENSLOCG00000008864	-	98	40.263	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000028330	-	82	39.494	ENSLOCG00000016955	-	94	40.577	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000028330	-	52	35.904	ENSMALG00000007492	-	99	35.784	Monopterus_albus
ENSORLG00000028330	-	93	32.710	ENSORLG00020007707	-	69	31.963	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00020015867	-	98	98.047	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00020002609	-	90	98.047	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	71	30.872	ENSORLG00020005057	-	78	30.164	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	100	97.266	ENSORLG00020004369	-	98	97.266	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	99	96.834	ENSORLG00020020442	-	100	96.834	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	100	98.047	ENSORLG00020005006	-	98	98.047	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028330	-	60	32.218	ENSORLG00015014615	-	86	31.789	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	99	98.026	ENSORLG00015005006	-	100	98.026	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	92	98.166	ENSORLG00015006293	-	100	98.166	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	54	94.915	ENSORLG00015020118	-	100	94.915	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	61	98.305	ENSORLG00015015659	-	100	98.305	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	58	32.347	ENSORLG00015011564	-	93	32.415	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	100	97.917	ENSORLG00015008272	-	90	97.917	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	61	98.093	ENSORLG00015010665	-	100	98.093	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00015004990	-	99	98.177	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	100	98.568	ENSORLG00015018638	-	90	98.568	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	99	98.289	ENSORLG00015010878	-	100	98.289	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	61	98.517	ENSORLG00015012247	-	100	98.517	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	53	97.789	ENSORLG00015012611	-	100	97.789	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	100	98.177	ENSORLG00015005235	-	98	98.177	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	76	31.587	ENSORLG00015009448	-	80	31.161	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	61	97.881	ENSORLG00015021074	-	100	97.881	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028330	-	98	79.789	ENSOMEG00000010125	-	90	78.864	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028330	-	99	79.584	ENSOMEG00000004553	-	99	78.804	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028330	-	100	79.740	ENSOMEG00000004044	-	87	78.831	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028330	-	100	79.740	ENSOMEG00000008315	-	90	78.831	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028330	-	97	80.054	ENSOMEG00000004401	-	90	79.116	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028330	-	57	32.969	ENSPKIG00000021701	-	94	32.522	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000028330	-	79	31.250	ENSPKIG00000009130	-	84	30.469	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000028330	-	93	32.114	ENSPREG00000017352	-	69	31.707	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000028330	-	59	35.897	ENSSMAG00000002801	-	97	35.897	Scophthalmus_maximus