EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000028820 (Gene tree)
Gene ID: 101160610
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7645 bases
Position: chr22:17074971-17082615
Accession: 101160610
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000027274	SYF2	PF08231.12	2.4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000030350	-	4278	XM_004082390	ENSORLP00000027274	233 (aa)	XP_004082438	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000028820's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ola03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000028820's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	ENSG00000117614	SYF2	90	82.648	Homo_sapiens
ENSORLG00000028820	syf2	95	92.793	ENSAPOG00000001174	syf2	98	90.129	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000028820	syf2	82	83.854	ENSAMEG00000010134	-	98	83.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSAMEG00000010115	-	90	81.735	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000028820	syf2	99	90.435	ENSACIG00000023688	syf2	92	90.435	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000028820	syf2	93	88.426	ENSAOCG00000010912	syf2	67	88.426	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000028820	syf2	100	89.270	ENSAOCG00000022046	syf2	98	90.000	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000028820	syf2	100	89.270	ENSAPEG00000018858	syf2	90	89.270	Amphiprion_percula
ENSORLG00000028820	syf2	93	92.627	ENSATEG00000007745	syf2	98	88.412	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028820	syf2	86	85.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000028820	syf2	88	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000028820	syf2	71	70.659	ENSACAG00000026777	-	100	70.659	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	ENSANAG00000032473	SYF2	93	80.617	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000028820	syf2	95	92.342	ENSACLG00000019916	syf2	98	89.700	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028820	syf2	100	81.116	ENSAMXG00000004051	syf2	98	81.116	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.060	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	79.060	Bos_taurus
ENSORLG00000028820	syf2	89	53.333	WBGene00019402	syf-2	90	52.857	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.105	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000028820	syf2	93	82.407	ENSCAFG00000012895	-	89	81.735	Canis_familiaris
ENSORLG00000028820	syf2	93	77.778	ENSCAFG00000030331	-	92	77.778	Canis_familiaris
ENSORLG00000028820	syf2	78	74.176	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000028820	syf2	93	82.407	ENSCAFG00020021091	-	89	81.735	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000028820	syf2	100	78.059	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	78.059	Capra_hircus
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	80.631	Carlito_syrichta
ENSORLG00000028820	syf2	85	82.828	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	Cavia_aperea
ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	ENSCPOG00000005326	SYF2	94	80.000	Cavia_porcellus
ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	ENSCCAG00000022459	SYF2	93	80.617	Cebus_capucinus
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSCATG00000026917	SYF2	90	81.735	Cercocebus_atys
ENSORLG00000028820	syf2	99	80.435	ENSCLAG00000008474	SYF2	94	80.435	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000028820	syf2	99	78.696	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	78.696	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000028820	syf2	71	64.458	ENSCHOG00000005273	-	91	64.458	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	79.487	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000028820	syf2	91	54.460	ENSCING00000003017	-	89	54.930	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000028820	syf2	91	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSORLG00000028820	syf2	94	71.689	ENSCANG00000037322	SYF2	89	71.689	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	81.532	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000028820	syf2	84	83.163	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.915	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000028820	syf2	94	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	95	86.726	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028820	syf2	95	93.213	ENSCVAG00000019543	syf2	96	91.304	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000028820	syf2	100	81.974	ENSDARG00000004706	syf2	98	81.974	Danio_rerio
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	81.532	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	ENSDORG00000001274	Syf2	91	82.432	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000028820	syf2	92	56.019	FBgn0033556	CG12343	94	56.019	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000028820	syf2	94	65.297	ENSETEG00000015729	SYF2	93	65.297	Echinops_telfairi
ENSORLG00000028820	syf2	85	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000028820	syf2	94	83.562	ENSEASG00005004224	-	89	83.562	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000028820	syf2	99	70.386	ENSEASG00005004232	-	96	70.386	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000028820	syf2	94	83.562	ENSECAG00000010440	-	92	83.562	Equus_caballus
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.982	ENSECAG00000012023	-	91	81.982	Equus_caballus
ENSORLG00000028820	syf2	74	67.045	ENSEEUG00000015084	SYF2	96	67.045	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000028820	syf2	96	86.547	ENSELUG00000003465	syf2	94	86.547	Esox_lucius
ENSORLG00000028820	syf2	94	83.562	ENSFCAG00000010324	-	76	83.562	Felis_catus
ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	ENSFCAG00000043095	-	89	82.648	Felis_catus
ENSORLG00000028820	syf2	88	83.333	ENSFALG00000000460	SYF2	88	82.870	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	ENSFDAG00000008310	SYF2	95	80.000	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000028820	syf2	97	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000028820	syf2	97	84.581	ENSGMOG00000019138	syf2	100	84.581	Gadus_morhua
ENSORLG00000028820	syf2	94	84.862	ENSGALG00000013639	SYF2	87	84.862	Gallus_gallus
ENSORLG00000028820	syf2	99	90.000	ENSGAFG00000019435	syf2	97	90.000	Gambusia_affinis
ENSORLG00000028820	syf2	96	92.857	ENSGACG00000007305	syf2	97	90.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.883	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.915	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	82.648	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000028820	syf2	99	90.435	ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.435	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000028820	syf2	97	70.925	ENSHGLG00000004304	-	95	71.366	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	ENSHGLG00000014393	SYF2	94	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	ENSHGLG00100014722	SYF2	94	80.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000028820	syf2	100	84.583	ENSHCOG00000012904	syf2	73	89.640	Hippocampus_comes
ENSORLG00000028820	syf2	100	83.691	ENSIPUG00000019859	syf2	97	83.691	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000028820	syf2	63	77.397	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000028820	syf2	85	83.417	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000028820	syf2	98	91.266	ENSKMAG00000013856	syf2	97	91.266	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000028820	syf2	94	94.064	ENSLBEG00000014425	syf2	98	90.987	Labrus_bergylta
ENSORLG00000028820	syf2	93	81.944	ENSLACG00000012064	SYF2	91	81.944	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000028820	syf2	100	83.262	ENSLOCG00000002728	syf2	93	83.262	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.982	ENSLAFG00000023150	-	91	81.982	Loxodonta_africana
ENSORLG00000028820	syf2	79	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	81.735	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000028820	syf2	93	82.407	ENSMMUG00000002968	SYF2	95	78.696	Macaca_mulatta
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	81.735	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	81.735	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000028820	syf2	93	92.627	ENSMAMG00000010403	syf2	97	87.983	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000028820	syf2	100	89.700	ENSMZEG00005006429	syf2	98	89.700	Maylandia_zebra
ENSORLG00000028820	syf2	85	85.427	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	82.432	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000028820	syf2	85	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.982	ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.982	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000028820	syf2	99	86.207	ENSMMOG00000002396	syf2	97	86.207	Mola_mola
ENSORLG00000028820	syf2	95	76.786	ENSMODG00000013951	-	98	76.786	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000028820	syf2	99	88.312	ENSMALG00000010706	syf2	96	88.745	Monopterus_albus
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	82.432	Mus_caroli
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	82.432	Mus_musculus
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	82.432	Mus_pahari
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	82.432	Mus_spretus
ENSORLG00000028820	syf2	93	82.407	ENSMPUG00000015802	-	89	81.735	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	ENSMPUG00000015801	-	89	82.648	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	81.532	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	ENSNGAG00000007912	Syf2	93	79.565	Nannospalax_galili
ENSORLG00000028820	syf2	100	80.591	ENSNBRG00000010720	syf2	97	80.591	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	82.648	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.130	ENSOPRG00000012870	SYF2	95	79.130	Ochotona_princeps
ENSORLG00000028820	syf2	99	69.565	ENSODEG00000014338	-	96	69.565	Octodon_degus
ENSORLG00000028820	syf2	97	79.295	ENSODEG00000017664	-	95	79.295	Octodon_degus
ENSORLG00000028820	syf2	95	91.441	ENSONIG00000008213	syf2	98	88.841	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000028820	syf2	87	82.673	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	ENSOCUG00000013050	SYF2	94	80.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000028820	syf2	100	99.571	ENSORLG00020018333	syf2	98	99.571	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028820	syf2	100	98.712	ENSORLG00015014665	syf2	97	98.712	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028820	syf2	100	95.279	ENSOMEG00000013911	syf2	97	95.279	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000028820	syf2	99	77.966	ENSOARG00000006348	-	96	77.966	Ovis_aries
ENSORLG00000028820	syf2	84	55.897	ENSOARG00000006269	-	100	55.897	Ovis_aries
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	82.648	Pan_paniscus
ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	ENSPPRG00000001651	-	89	82.648	Panthera_pardus
ENSORLG00000028820	syf2	94	83.562	ENSPPRG00000001638	-	89	83.562	Panthera_pardus
ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	ENSPTIG00000007036	-	89	82.648	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000028820	syf2	93	84.259	ENSPTIG00000005711	-	80	83.486	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	82.648	Pan_troglodytes
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSPANG00000008139	SYF2	90	81.735	Papio_anubis
ENSORLG00000028820	syf2	98	83.843	ENSPKIG00000008130	syf2	97	83.843	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000028820	syf2	98	78.541	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.541	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00000028820	syf2	95	88.688	ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.688	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.532	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000028820	syf2	94	83.486	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	83.486	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000028820	syf2	99	89.565	ENSPFOG00000004116	syf2	95	89.565	Poecilia_formosa
ENSORLG00000028820	syf2	100	89.270	ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000028820	syf2	99	86.522	ENSPMEG00000011684	syf2	98	86.900	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000028820	syf2	93	93.519	ENSPREG00000003009	syf2	97	90.000	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	82.648	Pongo_abelii
ENSORLG00000028820	syf2	97	54.185	ENSPCOG00000027011	SYF2	90	54.185	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000028820	syf2	95	72.523	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.523	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000028820	syf2	95	92.342	ENSPNYG00000004979	syf2	98	89.700	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000028820	syf2	100	81.116	ENSPNAG00000015570	syf2	98	81.116	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	82.432	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000028820	syf2	94	79.452	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	79.452	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSRROG00000001347	SYF2	90	81.735	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000028820	syf2	93	83.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	93	80.176	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000028820	syf2	88	83.010	ENSSHAG00000007152	-	100	83.010	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000028820	syf2	95	81.081	ENSSHAG00000015630	-	89	81.081	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000028820	syf2	98	82.895	ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.895	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028820	syf2	100	87.554	ENSSMAG00000009867	syf2	98	87.554	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028820	syf2	94	93.119	ENSSDUG00000013072	syf2	98	89.270	Seriola_dumerili
ENSORLG00000028820	syf2	94	93.119	ENSSLDG00000012677	syf2	98	89.270	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000028820	syf2	94	64.384	ENSSARG00000012889	SYF2	91	63.514	Sorex_araneus
ENSORLG00000028820	syf2	100	79.828	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	79.828	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000028820	syf2	100	89.700	ENSSPAG00000009626	syf2	98	89.700	Stegastes_partitus
ENSORLG00000028820	syf2	98	79.310	ENSSSCG00000037481	SYF2	95	79.310	Sus_scrofa
ENSORLG00000028820	syf2	64	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	56.442	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00000028820	syf2	100	84.255	ENSTRUG00000001499	syf2	94	84.255	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000028820	syf2	95	86.486	ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.486	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000028820	syf2	97	59.471	ENSTBEG00000017370	SYF2	92	59.471	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000028820	syf2	93	83.333	ENSTTRG00000003550	SYF2	97	78.059	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.735	Ursus_americanus
ENSORLG00000028820	syf2	93	81.944	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.279	Ursus_maritimus
ENSORLG00000028820	syf2	96	81.614	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	81.614	Vicugna_pacos
ENSORLG00000028820	syf2	88	82.439	ENSVVUG00000027181	-	95	77.872	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000028820	syf2	93	82.407	ENSVVUG00000027175	-	89	81.735	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000028820	syf2	95	80.180	ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000028820	syf2	92	92.558	ENSXMAG00000022698	syf2	97	89.130	Xiphophorus_maculatus