EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000028970 (Gene tree)
Gene ID: 101159497
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC101159497
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4681 bases
Position: chr4:26341311-26345991
Accession: 101159497
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000026499	Isy1	PF06246.12	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000035284	-	3082	XM_004068274	ENSORLP00000026499	306 (aa)	XP_004068322	UPI0002A47B8B

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000028970's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000028970's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	59.683	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	57.585	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	53.746	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	53.922	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	57.096	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	57.096	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	57.006	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	58.306	Amphiprion_percula
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	57.895	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	57.895	Anabas_testudineus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	56.376	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	56.678	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	49.020	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	48.525	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	49.363	ENSCSEG00000007482	-	99	49.363	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	56.410	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	56.410	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	45.545	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	45.545	Danio_rerio
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	46.708	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	45.768	Esox_lucius
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	58.252	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	58.252	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	77	66.390	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	66.116	Gambusia_affinis
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	56.376	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	56.678	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	44.408	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	44.408	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	58.786	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	58.786	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	50.498	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	49.511	Labrus_bergylta
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	40.000	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	39.286	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	45.395	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	46.104	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	55.828	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	55.828	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	56.376	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	56.678	Maylandia_zebra
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	55.882	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	55.882	Mola_mola
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	55.452	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	52.597	Monopterus_albus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	53.177	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	53.571	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	57.525	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	57.792	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	95.425	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	95.425	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	97.059	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	97.059	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	81.908	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	81.908	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	40.924	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	99	40.594	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	47.727	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	47.727	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	60.000	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	60.000	Poecilia_formosa
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	59.554	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	59.554	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	59.365	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	59.365	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	55.375	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	55.375	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	97	56.040	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	56.352	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	45.724	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	45.574	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	99	42.623	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	42.623	Scleropages_formosus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	96	52.866	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	98	53.560	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	58.176	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	58.176	Seriola_dumerili
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	57.321	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	57.321	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	60.510	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	60.510	Stegastes_partitus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	53.548	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	53.526	Takifugu_rubripes
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	54.248	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	54.248	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	57.729	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	57.729	Xiphophorus_maculatus