EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000029071 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2669 bases
Position: chr20:23917810-23920478
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000028367	RVT_1	PF00078.27	1e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000027513	-	2669	-	ENSORLP00000028367	671 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000029071's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000029071's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000029071	-	77	95.000	ENSORLG00000028439	-	50	95.000
ENSORLG00000029071	-	94	39.291	ENSORLG00000026117	-	50	39.291
ENSORLG00000029071	-	93	34.477	ENSORLG00000027914	-	51	34.477
ENSORLG00000029071	-	94	95.397	ENSORLG00000024921	-	57	95.397
ENSORLG00000029071	-	92	34.945	ENSORLG00000027601	-	50	34.945
ENSORLG00000029071	-	97	31.649	ENSORLG00000029419	-	51	31.649
ENSORLG00000029071	-	94	95.556	ENSORLG00000026409	-	51	95.556
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000023904	-	51	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	95.397	ENSORLG00000025035	-	51	95.397
ENSORLG00000029071	-	54	45.205	ENSORLG00000022016	-	68	45.205
ENSORLG00000029071	-	94	95.079	ENSORLG00000022458	-	50	95.079
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000027545	-	78	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	95.238	ENSORLG00000027879	-	51	95.238
ENSORLG00000029071	-	94	94.286	ENSORLG00000024335	-	51	94.286
ENSORLG00000029071	-	94	95.556	ENSORLG00000024230	-	51	95.556
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000027043	-	71	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	95.238	ENSORLG00000027515	-	59	95.238
ENSORLG00000029071	-	70	94.030	ENSORLG00000023700	-	98	94.030
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000024526	-	59	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000026318	-	74	94.444
ENSORLG00000029071	-	93	38.438	ENSORLG00000027370	-	50	38.438
ENSORLG00000029071	-	94	95.079	ENSORLG00000025323	-	74	95.079
ENSORLG00000029071	-	96	92.248	ENSORLG00000024972	-	70	92.248
ENSORLG00000029071	-	64	96.056	ENSORLG00000030126	-	100	96.056
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000022241	-	51	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	95.714	ENSORLG00000022242	-	51	95.714
ENSORLG00000029071	-	94	93.651	ENSORLG00000029714	-	74	93.651
ENSORLG00000029071	-	95	93.260	ENSORLG00000027333	-	56	93.260
ENSORLG00000029071	-	92	31.868	ENSORLG00000024310	-	50	31.868
ENSORLG00000029071	-	94	99.206	ENSORLG00000025984	-	51	99.206
ENSORLG00000029071	-	94	94.603	ENSORLG00000026574	-	51	94.603
ENSORLG00000029071	-	57	40.967	ENSORLG00000024464	-	68	40.967
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000025676	-	52	95.873
ENSORLG00000029071	-	94	98.254	ENSORLG00000024415	-	59	98.254
ENSORLG00000029071	-	59	95.477	ENSORLG00000023046	-	99	95.477
ENSORLG00000029071	-	94	95.238	ENSORLG00000028121	-	74	95.238
ENSORLG00000029071	-	100	94.188	ENSORLG00000025887	-	57	94.188
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000025213	-	51	95.873
ENSORLG00000029071	-	94	96.190	ENSORLG00000025260	-	81	96.190
ENSORLG00000029071	-	93	36.462	ENSORLG00000026511	-	63	36.462
ENSORLG00000029071	-	55	46.092	ENSORLG00000028976	-	97	46.092
ENSORLG00000029071	-	94	60.190	ENSORLG00000029798	-	51	60.190
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00000022346	-	53	35.276
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000025476	-	76	94.127
ENSORLG00000029071	-	94	95.714	ENSORLG00000023962	-	51	95.714
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000027031	-	59	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	36.434	ENSORLG00000027244	-	62	36.279
ENSORLG00000029071	-	94	94.603	ENSORLG00000028129	-	51	94.603
ENSORLG00000029071	-	99	92.654	ENSORLG00000029928	-	100	92.654
ENSORLG00000029071	-	97	37.147	ENSORLG00000024714	-	75	37.147
ENSORLG00000029071	-	94	95.397	ENSORLG00000022453	-	51	95.397
ENSORLG00000029071	-	63	94.062	ENSORLG00000028858	-	100	94.062
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000027755	-	59	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	60.348	ENSORLG00000025420	-	51	60.348
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000030319	-	51	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000029491	-	66	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000022606	-	51	94.127
ENSORLG00000029071	-	75	63.189	ENSORLG00000027405	-	57	62.476
ENSORLG00000029071	-	82	95.091	ENSORLG00000027816	-	52	95.091
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000028545	-	51	94.444
ENSORLG00000029071	-	79	61.423	ENSORLG00000022093	-	51	61.423
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000022848	-	51	95.873
ENSORLG00000029071	-	93	37.618	ENSORLG00000029532	-	51	37.618
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000028057	-	51	94.127
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000027430	-	51	94.444
ENSORLG00000029071	-	76	40.613	ENSORLG00000030415	-	64	40.613
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000023842	-	51	94.127
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000026236	-	51	95.873
ENSORLG00000029071	-	65	32.671	ENSORLG00000028717	-	99	32.671
ENSORLG00000029071	-	94	94.286	ENSORLG00000029461	-	51	94.286
ENSORLG00000029071	-	94	94.286	ENSORLG00000029348	-	51	94.286
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000025057	-	51	95.873
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000023575	-	80	95.873
ENSORLG00000029071	-	75	94.433	ENSORLG00000024329	-	93	94.433
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000024437	-	74	94.127
ENSORLG00000029071	-	94	95.556	ENSORLG00000025901	-	78	95.556
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000025613	-	58	94.127
ENSORLG00000029071	-	94	94.286	ENSORLG00000026019	-	66	94.286
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000023192	-	50	94.127
ENSORLG00000029071	-	92	34.898	ENSORLG00000023193	-	75	35.055
ENSORLG00000029071	-	74	30.020	ENSORLG00000028041	-	50	30.020
ENSORLG00000029071	-	94	94.603	ENSORLG00000024212	-	51	94.603
ENSORLG00000029071	-	94	99.365	ENSORLG00000021840	-	59	99.365
ENSORLG00000029071	-	94	60.190	ENSORLG00000023016	-	66	60.190
ENSORLG00000029071	-	94	60.348	ENSORLG00000026691	-	51	60.348
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000027152	-	53	94.444
ENSORLG00000029071	-	94	94.286	ENSORLG00000022925	-	51	94.286
ENSORLG00000029071	-	94	94.286	ENSORLG00000029560	-	51	94.286
ENSORLG00000029071	-	94	99.365	ENSORLG00000030529	-	66	99.365
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00000022264	-	51	94.444
ENSORLG00000029071	-	65	64.465	ENSORLG00000028706	-	89	64.465
ENSORLG00000029071	-	94	95.873	ENSORLG00000025803	-	51	95.873
ENSORLG00000029071	-	94	94.127	ENSORLG00000028541	-	51	94.127
ENSORLG00000029071	-	94	95.556	ENSORLG00000029308	-	70	95.556

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000029071	-	92	36.234	ENSAPOG00000013536	-	50	36.234	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000029071	-	94	37.191	ENSAPOG00000011184	-	56	37.191	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000029071	-	93	52.255	ENSAOCG00000011998	-	58	52.255	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029071	-	94	54.025	ENSAOCG00000017045	-	56	54.025	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029071	-	98	36.095	ENSAOCG00000022482	-	83	36.095	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029071	-	98	35.517	ENSAOCG00000019370	-	60	35.517	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029071	-	98	36.119	ENSAOCG00000013559	-	79	36.119	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029071	-	94	54.180	ENSAOCG00000021572	-	52	54.180	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029071	-	92	34.858	ENSAPEG00000019256	-	63	34.858	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	35.781	ENSAPEG00000003616	-	50	35.781	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	54.037	ENSAPEG00000015961	-	80	54.037	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	99	51.367	ENSAPEG00000001971	-	55	51.367	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	78	55.514	ENSAPEG00000003065	-	61	55.514	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	54.489	ENSAPEG00000017003	-	52	54.489	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	35.781	ENSAPEG00000013213	-	50	35.781	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	54.193	ENSAPEG00000007540	-	54	54.193	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	85	54.281	ENSAPEG00000017325	-	63	54.281	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	54.348	ENSAPEG00000006674	-	52	54.348	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	94	54.658	ENSAPEG00000010007	-	78	54.658	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	78	55.327	ENSAPEG00000002696	-	61	55.327	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029071	-	93	30.139	ENSACAG00000029404	-	53	30.139	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000029071	-	92	30.312	ENSACAG00000028252	-	67	30.312	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000029071	-	94	60.979	ENSACLG00000009895	-	50	60.979	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	94	61.927	ENSACLG00000025597	-	52	61.927	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	94	62.243	ENSACLG00000007324	-	66	62.243	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	94	61.927	ENSACLG00000020885	-	79	61.927	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	95	37.043	ENSACLG00000027433	-	67	37.043	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	97	36.486	ENSACLG00000003800	-	51	36.486	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	94	62.085	ENSACLG00000018473	-	70	62.085	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	94	60.664	ENSACLG00000020106	-	81	60.664	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	92	36.094	ENSACLG00000015440	-	57	36.520	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	82	61.594	ENSACLG00000003896	-	100	61.594	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	93	36.476	ENSACLG00000012223	-	61	36.476	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	72	44.088	ENSACLG00000003130	-	54	44.088	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	94	61.453	ENSACLG00000008786	-	79	61.453	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	59	66.497	ENSACLG00000010837	-	97	66.497	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	73	37.449	ENSACLG00000020021	-	59	37.449	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	97	36.036	ENSACLG00000010561	-	60	36.036	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	98	37.240	ENSACLG00000011463	-	79	37.240	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029071	-	92	36.751	ENSAMXG00000041150	-	59	36.751	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000029071	-	52	58.689	ENSAMXG00000040763	-	89	58.689	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000029071	-	93	39.590	ENSAMXG00000036146	-	50	39.590	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000029071	-	93	39.717	ENSAMXG00000037256	-	50	39.717	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000029071	-	93	37.975	ENSDARG00000086420	CABZ01046949.1	79	37.975	Danio_rerio
ENSORLG00000029071	-	93	37.975	ENSDARG00000088493	si:ch211-149k12.3	50	37.975	Danio_rerio
ENSORLG00000029071	-	75	38.281	ENSDARG00000103562	CU462878.2	62	37.004	Danio_rerio
ENSORLG00000029071	-	54	32.240	ENSIPUG00000010242	-	97	32.240	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000029071	-	92	36.045	ENSKMAG00000015838	-	71	36.045	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	93	32.710	ENSKMAG00000008495	-	50	32.710	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	92	36.378	ENSKMAG00000014872	-	75	36.378	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	93	37.184	ENSKMAG00000022168	-	50	37.184	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	93	33.079	ENSKMAG00000000167	-	58	33.079	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	94	58.926	ENSKMAG00000000885	-	57	58.926	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	85	32.765	ENSKMAG00000003480	-	57	32.765	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	92	36.045	ENSKMAG00000015935	-	54	36.045	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	85	32.765	ENSKMAG00000006263	-	58	32.765	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	93	39.724	ENSKMAG00000015028	-	79	39.724	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	93	32.710	ENSKMAG00000006247	-	50	32.710	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029071	-	68	32.340	ENSLACG00000022376	-	98	32.340	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000029071	-	94	62.085	ENSMZEG00005015509	-	80	62.085	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029071	-	52	43.380	ENSMZEG00005011529	-	67	43.380	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029071	-	88	32.790	ENSMZEG00005012878	-	75	32.790	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029071	-	52	43.380	ENSMZEG00005017030	-	67	43.380	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029071	-	60	66.914	ENSMZEG00005006211	-	100	66.914	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029071	-	93	34.735	ENSMZEG00005020294	-	55	34.735	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029071	-	82	61.525	ENSORLG00020017925	-	98	61.525	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	36.687	ENSORLG00020010757	-	76	36.687	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	93	33.798	ENSORLG00020006733	-	57	33.798	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00020017795	-	51	35.276	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	79	95.265	ENSORLG00020010425	-	93	95.265	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	95	37.094	ENSORLG00020002715	-	64	37.094	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00020011252	-	51	35.276	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	73	94.286	ENSORLG00020003980	-	60	94.286	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	35.835	ENSORLG00020005675	-	53	35.835	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	92	35.148	ENSORLG00020007463	-	53	35.148	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	86	95.486	ENSORLG00020013149	-	63	95.486	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	60.190	ENSORLG00020005776	-	67	60.190	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00020004108	-	51	35.276	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	95.556	ENSORLG00020006395	-	53	95.556	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	59.558	ENSORLG00020001651	-	74	59.558	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00020002457	-	51	35.276	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	50	97.917	ENSORLG00020018629	-	89	97.917	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	36.687	ENSORLG00020017758	-	50	36.687	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	52	45.634	ENSORLG00020014626	-	66	45.634	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	87	95.369	ENSORLG00020004271	-	86	95.369	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	75	61.584	ENSORLG00020016429	-	98	61.584	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	95.556	ENSORLG00020000993	-	67	95.556	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	92	35.148	ENSORLG00020022564	-	50	35.148	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029071	-	94	93.968	ENSORLG00015006862	-	80	93.968	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	52	41.808	ENSORLG00015021206	-	70	41.808	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	52	98.851	ENSORLG00015007703	-	90	98.851	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	54	91.413	ENSORLG00015007976	-	98	91.413	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	94	34.644	ENSORLG00015002104	-	51	34.969	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	94	94.444	ENSORLG00015015728	-	80	94.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00015015916	-	51	35.276	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	94	35.276	ENSORLG00015015244	-	51	35.276	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029071	-	92	33.281	ENSOMEG00000023189	-	55	33.281	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029071	-	94	37.072	ENSOMEG00000010354	-	66	37.072	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029071	-	93	37.125	ENSOMEG00000001546	-	65	37.125	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029071	-	69	83.261	ENSOMEG00000022009	-	100	83.261	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029071	-	75	33.142	ENSPFOG00000024463	-	65	33.142	Poecilia_formosa
ENSORLG00000029071	-	92	34.380	ENSPMEG00000013148	-	67	34.380	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000029071	-	93	30.805	ENSPMEG00000015117	-	74	30.805	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000029071	-	58	41.985	ENSPREG00000006501	-	69	41.985	Poecilia_reticulata
ENSORLG00000029071	-	55	47.709	ENSPNAG00000014375	-	90	47.709	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000029071	-	94	33.230	ENSSLDG00000004747	-	55	33.230	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000029071	-	94	33.230	ENSSLDG00000000631	-	54	33.230	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000029071	-	92	38.983	ENSXETG00000030860	-	63	38.983	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000029071	-	88	36.842	ENSXETG00000032833	-	83	36.842	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000029071	-	92	48.958	ENSXETG00000032308	-	62	48.958	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000029071	-	91	38.889	ENSXETG00000034134	-	70	38.889	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000029071	-	92	35.479	ENSXMAG00000023746	-	55	35.479	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029071	-	93	31.490	ENSXMAG00000027569	-	68	31.490	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029071	-	93	31.490	ENSXMAG00000024176	-	65	31.490	Xiphophorus_maculatus