EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000029282 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2637 bases
Position: chr3:18395085-18397721
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000034264	RVT_1	PF00078.27	6.7e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000035285	-	2637	-	ENSORLP00000034264	878 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000029282's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000029282's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024473	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000029382	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000023624	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.606	ENSORLG00000023626	-	79	33.172
ENSORLG00000029282	-	92	31.900	ENSORLG00000024537	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024533	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000026850	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000023217	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000029073	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000028304	-	80	32.773
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000027645	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000025030	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	78	33.286	ENSORLG00000023326	-	91	33.807
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000026178	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	89	98.338	ENSORLG00000029966	-	100	98.338
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024101	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000028546	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000023036	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	86	31.723	ENSORLG00000028786	-	92	32.524
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000025556	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.931	ENSORLG00000024646	-	81	33.293
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000024333	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000024689	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	33.013	ENSORLG00000029193	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000027461	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000026392	-	86	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000027933	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000025393	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000021825	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000022102	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	85	33.159	ENSORLG00000022101	-	83	33.636
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000029283	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000022897	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	100	98.405	ENSORLG00000025024	-	83	98.405
ENSORLG00000029282	-	92	32.533	ENSORLG00000026112	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.567	ENSORLG00000030391	-	80	32.651
ENSORLG00000029282	-	94	35.424	ENSORLG00000028029	-	87	35.119
ENSORLG00000029282	-	93	35.100	ENSORLG00000030217	-	94	35.206
ENSORLG00000029282	-	94	35.094	ENSORLG00000028726	-	94	35.199
ENSORLG00000029282	-	60	31.676	ENSORLG00000029231	-	78	32.541
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000023380	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	85	31.921	ENSORLG00000024673	-	93	32.543
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000027598	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	83	32.440	ENSORLG00000028921	-	93	33.067
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000029999	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000022049	-	86	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000022044	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000025298	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000025138	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	88	96.753	ENSORLG00000029262	-	99	96.753
ENSORLG00000029282	-	89	32.875	ENSORLG00000026815	-	81	33.458
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000025543	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000021789	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.039	ENSORLG00000028340	-	80	32.609
ENSORLG00000029282	-	91	32.112	ENSORLG00000021932	-	81	32.685
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000024342	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.648	ENSORLG00000024801	-	80	33.213
ENSORLG00000029282	-	85	32.365	ENSORLG00000025758	-	93	32.720
ENSORLG00000029282	-	94	35.540	ENSORLG00000029318	-	87	35.238
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000029433	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000025896	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	53	98.715	ENSORLG00000029299	-	99	98.715
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000022537	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	96	32.401	ENSORLG00000025512	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000024645	-	86	33.133
ENSORLG00000029282	-	96	31.702	ENSORLG00000030118	-	80	32.413
ENSORLG00000029282	-	64	32.582	ENSORLG00000025112	-	79	33.391
ENSORLG00000029282	-	92	31.731	ENSORLG00000027325	-	80	32.297
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000023104	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000027862	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000028734	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	87	32.822	ENSORLG00000029790	-	83	33.418
ENSORLG00000029282	-	93	32.082	ENSORLG00000022645	-	80	32.651
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000030097	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000021860	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000026767	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	85	31.935	ENSORLG00000025843	-	94	32.571
ENSORLG00000029282	-	85	32.589	ENSORLG00000028876	-	91	33.203
ENSORLG00000029282	-	80	33.057	ENSORLG00000030467	-	78	33.700
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000024793	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000027945	-	84	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000027942	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000027354	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.488	ENSORLG00000026400	-	80	32.692
ENSORLG00000029282	-	92	32.246	ENSORLG00000026499	-	80	32.812
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000024298	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000030289	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024563	-	93	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000023871	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000027132	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000028518	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	85	31.842	ENSORLG00000024229	-	93	32.461
ENSORLG00000029282	-	52	35.230	ENSORLG00000027624	-	88	35.748
ENSORLG00000029282	-	51	96.667	ENSORLG00000030105	-	71	96.667
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000030605	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000024187	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.160	ENSORLG00000030347	-	80	32.729
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000026509	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000030535	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.282	ENSORLG00000026507	-	80	32.850
ENSORLG00000029282	-	100	98.292	ENSORLG00000023376	-	100	98.292
ENSORLG00000029282	-	92	32.773	ENSORLG00000028249	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.852	ENSORLG00000026123	-	80	33.413
ENSORLG00000029282	-	53	33.333	ENSORLG00000029093	-	97	33.543
ENSORLG00000029282	-	92	32.769	ENSORLG00000022924	-	86	33.333
ENSORLG00000029282	-	83	32.574	ENSORLG00000030153	-	93	33.200
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000024897	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000029753	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000026650	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000025533	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000023640	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000027738	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000025240	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000028694	-	80	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000028713	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000028712	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000026622	-	82	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000029576	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000026895	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000028859	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	94	35.540	ENSORLG00000028947	-	87	35.238
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000022934	-	86	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000030142	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	66	97.935	ENSORLG00000027144	-	100	97.935
ENSORLG00000029282	-	54	98.947	ENSORLG00000015190	-	100	98.947
ENSORLG00000029282	-	92	32.082	ENSORLG00000023992	-	80	32.651
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000023209	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	83	32.306	ENSORLG00000028330	-	93	32.933
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000029439	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	85	32.415	ENSORLG00000023760	-	83	32.898
ENSORLG00000029282	-	92	32.087	ENSORLG00000025027	-	80	32.653
ENSORLG00000029282	-	85	98.522	ENSORLG00000030430	-	80	98.522
ENSORLG00000029282	-	83	31.903	ENSORLG00000026947	-	93	32.533
ENSORLG00000029282	-	92	32.893	ENSORLG00000027111	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000029970	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.282	ENSORLG00000026477	-	80	32.850
ENSORLG00000029282	-	92	31.928	ENSORLG00000024556	-	80	32.494
ENSORLG00000029282	-	92	32.403	ENSORLG00000030541	-	82	32.971
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024822	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.811	ENSORLG00000030281	-	80	33.373
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000029692	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000029331	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.727	ENSORLG00000029332	-	79	33.293
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000023676	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024048	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	92	32.690	ENSORLG00000027439	-	80	33.253
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000027434	-	80	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.328	ENSORLG00000030049	-	86	32.893
ENSORLG00000029282	-	92	32.207	ENSORLG00000030514	-	84	32.773
ENSORLG00000029282	-	92	32.449	ENSORLG00000024622	-	80	33.013
ENSORLG00000029282	-	66	97.935	ENSORLG00000028845	-	100	97.935
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000021832	-	86	33.133
ENSORLG00000029282	-	92	32.646	ENSORLG00000022907	-	80	33.213
ENSORLG00000029282	-	92	32.569	ENSORLG00000021880	-	80	33.133

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000029282	-	100	85.194	ENSATEG00000010056	-	83	85.194	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	97	84.724	ENSATEG00000024954	-	82	84.724	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	89	84.507	ENSATEG00000009235	-	81	84.507	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	100	84.624	ENSATEG00000014941	-	89	84.624	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	92	84.710	ENSATEG00000014139	-	82	84.710	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	100	84.966	ENSATEG00000023604	-	83	84.966	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	97	82.824	ENSATEG00000009553	-	81	82.824	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	100	85.194	ENSATEG00000014211	-	99	85.194	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	100	84.966	ENSATEG00000020292	-	83	84.966	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	100	85.194	ENSATEG00000017504	-	83	85.194	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029282	-	86	76.882	ENSACLG00000000593	-	87	76.571	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029282	-	66	79.346	ENSACLG00000019356	-	99	79.346	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029282	-	52	81.481	ENSACLG00000005592	-	94	81.304	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029282	-	56	81.557	ENSACLG00000001165	-	95	81.557	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029282	-	66	80.379	ENSACLG00000018836	-	99	80.379	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029282	-	89	80.563	ENSAMXG00000039954	-	100	80.563	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000029282	-	56	70.492	ENSELUG00000008022	-	99	70.259	Esox_lucius
ENSORLG00000029282	-	56	86.640	ENSELUG00000024014	-	99	86.640	Esox_lucius
ENSORLG00000029282	-	52	64.254	ENSELUG00000020034	-	96	64.254	Esox_lucius
ENSORLG00000029282	-	94	35.506	ENSORLG00020020316	-	87	35.190	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029282	-	89	96.675	ENSORLG00020001879	-	100	96.675	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029282	-	100	97.494	ENSORLG00020009508	-	83	97.494	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029282	-	94	35.376	ENSORLG00020009614	-	87	35.315	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029282	-	66	99.139	ENSORLG00020018851	-	100	99.139	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029282	-	90	35.480	ENSORLG00020002875	-	90	35.480	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029282	-	51	38.841	ENSORLG00015016973	-	99	38.841	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029282	-	57	98.394	ENSORLG00015008483	-	100	98.394	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029282	-	61	38.129	ENSORLG00015005190	-	99	38.129	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029282	-	62	96.852	ENSORLG00015011987	-	100	96.852	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029282	-	87	35.250	ENSORLG00015000605	-	91	35.250	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029282	-	66	98.795	ENSORLG00015020439	-	100	98.795	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029282	-	89	92.839	ENSOMEG00000013646	-	100	92.839	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	89	93.095	ENSOMEG00000019233	-	100	93.095	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	100	92.597	ENSOMEG00000000581	-	83	92.597	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	100	92.825	ENSOMEG00000007004	-	83	92.825	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	89	92.967	ENSOMEG00000016368	-	100	92.967	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	66	92.427	ENSOMEG00000022295	-	100	92.427	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	96	92.562	ENSOMEG00000010058	-	82	92.562	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	66	92.083	ENSOMEG00000019854	-	100	92.083	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029282	-	96	83.235	ENSSFOG00015014529	-	86	83.235	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	98	82.755	ENSSFOG00015020002	-	83	82.574	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	100	82.688	ENSSFOG00015000961	-	87	82.688	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	100	81.093	ENSSFOG00015007656	-	96	81.093	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	94	81.486	ENSSFOG00015004005	-	81	81.486	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	100	82.005	ENSSFOG00015016653	-	81	82.005	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	100	83.144	ENSSFOG00015021945	-	81	83.144	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	84	82.162	ENSSFOG00015011969	-	100	82.162	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029282	-	83	69.904	ENSSMAG00000002122	-	99	69.892	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029282	-	65	71.478	ENSSMAG00000012898	-	99	71.429	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029282	-	88	70.169	ENSSMAG00000001945	-	99	70.153	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029282	-	98	69.480	ENSSMAG00000015938	-	83	69.818	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029282	-	75	70.687	ENSSMAG00000012694	-	100	70.659	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029282	-	85	70.053	ENSSMAG00000011751	-	100	70.039	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029282	-	99	80.616	ENSXMAG00000023179	-	83	80.616	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	99	80.388	ENSXMAG00000021961	-	83	80.388	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	89	80.179	ENSXMAG00000025249	-	100	80.179	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	99	80.664	ENSXMAG00000023308	-	83	80.664	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	90	80.355	ENSXMAG00000025224	-	99	80.355	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	56	82.281	ENSXMAG00000029351	-	99	82.281	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	94	79.493	ENSXMAG00000025091	-	75	79.487	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	89	79.668	ENSXMAG00000021177	-	100	79.668	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00000029282	-	89	79.540	ENSXMAG00000022769	-	100	79.540	Xiphophorus_maculatus