EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00000029369 (Gene tree)
Gene ID: 101165123
Gene Symbol: tnpo3
Alias: -
Full Name: transportin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15142 bases
Position: chr23:23833162-23848303
Accession: 101165123
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00000034030	Xpo1	PF08389.12	5.8e-27	1	1
ENSORLP00000030729	Xpo1	PF08389.12	6e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00000030916	-	6285	-	ENSORLP00000030729	2094 (aa)	-	-
ENSORLT00000043842	-	3923	XM_023952159	ENSORLP00000034030	923 (aa)	XP_023807927	UPI0009DA023E

Gene Model

Click here to download ENSORLG00000029369's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00000029369's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSG00000064419	TNPO3	100	85.000	Homo_sapiens
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	95.341	ENSAPOG00000018347	tnpo3	100	95.341	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	81.723	ENSAMEG00000005135	TNPO3	98	81.723	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00000029369	tnpo3	96	91.874	ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.265	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	95.233	ENSAOCG00000008264	tnpo3	100	95.233	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00000029369	tnpo3	96	95.243	ENSAPEG00000024300	tnpo3	100	95.243	Amphiprion_percula
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.691	ENSATEG00000003197	tnpo3	100	94.691	Anabas_testudineus
ENSORLG00000029369	tnpo3	72	81.475	ENSAPLG00000005946	TNPO3	91	81.475	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00000029369	tnpo3	82	84.474	ENSACAG00000013470	TNPO3	95	84.474	Anolis_carolinensis
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSANAG00000037940	TNPO3	100	85.278	Aotus_nancymaae
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.583	ENSACLG00000005561	tnpo3	100	94.583	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	91.658	ENSAMXG00000016236	tnpo3	100	91.658	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	85.049	ENSBTAG00000004992	TNPO3	100	85.049	Bos_taurus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSCJAG00000018085	TNPO3	100	85.278	Callithrix_jacchus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSCAFG00000001543	TNPO3	100	84.832	Canis_familiaris
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSCAFG00020022462	TNPO3	99	84.432	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSCHIG00000011721	TNPO3	100	84.940	Capra_hircus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSTSYG00000002989	TNPO3	100	85.278	Carlito_syrichta
ENSORLG00000029369	tnpo3	72	86.022	ENSCAPG00000005843	TNPO3	91	86.022	Cavia_aperea
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.507	ENSCPOG00000039784	TNPO3	100	84.507	Cavia_porcellus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSCCAG00000033826	TNPO3	100	85.278	Cebus_capucinus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSCATG00000030018	TNPO3	100	85.000	Cercocebus_atys
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	83.711	ENSCLAG00000016298	TNPO3	100	83.711	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSCSAG00000009966	TNPO3	100	84.832	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	60.568	ENSCHOG00000011547	TNPO3	99	60.568	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00000029369	tnpo3	93	83.897	ENSCPBG00000017497	TNPO3	100	83.897	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	48.475	ENSCING00000005042	-	99	48.475	Ciona_intestinalis
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	47.231	ENSCSAVG00000008623	-	96	53.047	Ciona_savignyi
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSCANG00000033070	TNPO3	100	85.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSCGRG00001015925	Tnpo3	100	84.940	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSCGRG00000010379	Tnpo3	100	84.940	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.091	ENSCSEG00000005952	tnpo3	100	92.091	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	93.174	ENSCVAG00000020285	tnpo3	100	93.174	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	90.574	ENSDARG00000045680	tnpo3	100	90.574	Danio_rerio
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSDNOG00000002556	TNPO3	100	84.724	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00000029369	tnpo3	62	83.420	ENSDORG00000002433	Tnpo3	95	83.420	Dipodomys_ordii
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	43.089	FBgn0031456	Tnpo-SR	99	43.089	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00000029369	tnpo3	94	84.106	ENSETEG00000002101	TNPO3	90	84.106	Echinops_telfairi
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	70.652	ENSEBUG00000016931	tnpo3	99	70.652	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSEASG00005008677	TNPO3	100	84.724	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSECAG00000012815	TNPO3	100	84.724	Equus_caballus
ENSORLG00000029369	tnpo3	64	31.174	ENSEEUG00000011681	IPO13	77	31.174	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	79.468	ENSEEUG00000005178	TNPO3	98	79.468	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	92.818	ENSELUG00000012153	tnpo3	99	92.818	Esox_lucius
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSFCAG00000018186	TNPO3	100	85.000	Felis_catus
ENSORLG00000029369	tnpo3	96	80.045	ENSFALG00000010667	TNPO3	100	80.045	Ficedula_albicollis
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.216	ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.216	Fukomys_damarensis
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	93.261	ENSFHEG00000012859	tnpo3	99	93.261	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	91.766	ENSGMOG00000007324	tnpo3	100	91.766	Gadus_morhua
ENSORLG00000029369	tnpo3	61	83.392	ENSGALG00000039420	TNPO3	99	83.392	Gallus_gallus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.366	ENSGACG00000000699	tnpo3	100	94.366	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	93	83.781	ENSGAGG00000006777	TNPO3	100	83.781	Gopherus_agassizii
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSGGOG00000008339	TNPO3	100	85.000	Gorilla_gorilla
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.583	ENSHBUG00000008351	tnpo3	100	94.583	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSHGLG00000004463	TNPO3	100	84.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSHGLG00100005509	TNPO3	100	84.724	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	91.441	ENSHCOG00000007221	tnpo3	100	91.441	Hippocampus_comes
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	90.033	ENSIPUG00000014979	TNPO3	99	90.033	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSSTOG00000004885	TNPO3	100	84.724	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	78.817	ENSJJAG00000013530	Tnpo3	100	78.817	Jaculus_jaculus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.258	ENSKMAG00000010497	tnpo3	100	94.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00000029369	tnpo3	96	91.619	ENSLBEG00000016595	tnpo3	100	91.619	Labrus_bergylta
ENSORLG00000029369	tnpo3	96	89.241	ENSLBEG00000011988	-	99	89.241	Labrus_bergylta
ENSORLG00000029369	tnpo3	87	85.870	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	85.870	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	90.574	ENSLOCG00000015556	tnpo3	100	90.574	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.142	ENSLAFG00000002738	TNPO3	100	84.142	Loxodonta_africana
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMFAG00000032385	TNPO3	100	85.000	Macaca_fascicularis
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMMUG00000004311	TNPO3	100	85.000	Macaca_mulatta
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMNEG00000045277	TNPO3	100	85.000	Macaca_nemestrina
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMLEG00000037881	TNPO3	100	85.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.800	ENSMAMG00000021096	tnpo3	100	94.800	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.583	ENSMZEG00005015084	tnpo3	100	94.583	Maylandia_zebra
ENSORLG00000029369	tnpo3	78	80.552	ENSMGAG00000002839	TNPO3	99	80.552	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMAUG00000013463	Tnpo3	100	84.832	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMICG00000000140	TNPO3	100	85.000	Microcebus_murinus
ENSORLG00000029369	tnpo3	70	33.077	ENSMICG00000011003	IPO13	79	33.136	Microcebus_murinus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSMOCG00000013264	Tnpo3	100	84.940	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.150	ENSMMOG00000005887	tnpo3	100	94.150	Mola_mola
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	85.374	ENSMODG00000014700	TNPO3	100	85.374	Monodelphis_domestica
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.366	ENSMALG00000006675	tnpo3	100	94.366	Monopterus_albus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	MGP_CAROLIEiJ_G0028176	Tnpo3	100	84.724	Mus_caroli
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSMUSG00000012535	Tnpo3	100	84.724	Mus_musculus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	MGP_PahariEiJ_G0021934	Tnpo3	100	84.724	Mus_pahari
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.615	MGP_SPRETEiJ_G0029176	Tnpo3	100	84.615	Mus_spretus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSMPUG00000006021	TNPO3	100	84.832	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	76.706	ENSMLUG00000000947	TNPO3	100	76.706	Myotis_lucifugus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSNGAG00000008722	Tnpo3	100	84.724	Nannospalax_galili
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	93.066	ENSNBRG00000019001	tnpo3	100	94.589	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	81.714	ENSNLEG00000012491	TNPO3	100	85.000	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00000029369	tnpo3	52	30.288	ENSMEUG00000002835	IPO13	61	30.288	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	66.213	ENSMEUG00000002445	TNPO3	98	66.213	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00000029369	tnpo3	91	85.326	ENSOPRG00000006163	TNPO3	90	85.326	Ochotona_princeps
ENSORLG00000029369	tnpo3	98	84.479	ENSODEG00000012826	TNPO3	100	84.479	Octodon_degus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.800	ENSONIG00000007604	tnpo3	100	94.800	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00000029369	tnpo3	95	81.759	ENSOANG00000011451	TNPO3	100	81.759	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	81.723	ENSOCUG00000010105	TNPO3	99	81.723	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	100.000	ENSORLG00020003464	tnpo3	100	100.000	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	99.892	ENSORLG00015002610	tnpo3	100	99.892	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	98.483	ENSOMEG00000021006	tnpo3	100	98.483	Oryzias_melastigma
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSOGAG00000015340	TNPO3	100	84.724	Otolemur_garnettii
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSOARG00000004026	TNPO3	100	84.940	Ovis_aries
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSPPAG00000034975	TNPO3	100	85.000	Pan_paniscus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	85.000	Panthera_pardus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSPTIG00000016167	TNPO3	100	85.000	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSPTRG00000019676	TNPO3	100	85.000	Pan_troglodytes
ENSORLG00000029369	tnpo3	98	84.641	ENSPANG00000022226	TNPO3	100	85.000	Papio_anubis
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	87.757	ENSPKIG00000023234	tnpo3	100	87.757	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	83.909	ENSPKIG00000008628	-	100	83.909	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00000029369	tnpo3	62	87.148	ENSPMGG00000009763	tnpo3	99	87.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSPEMG00000000422	Tnpo3	100	84.832	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00000029369	tnpo3	95	72.480	ENSPMAG00000008621	tnpo3	100	72.480	Petromyzon_marinus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.940	ENSPCIG00000011366	TNPO3	100	84.940	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.849	ENSPFOG00000013592	tnpo3	99	92.849	Poecilia_formosa
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.849	ENSPLAG00000010188	tnpo3	100	92.849	Poecilia_latipinna
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.958	ENSPMEG00000022731	tnpo3	100	92.958	Poecilia_mexicana
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSPPYG00000017990	TNPO3	100	84.832	Pongo_abelii
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	75.761	ENSPCAG00000010158	TNPO3	98	75.761	Procavia_capensis
ENSORLG00000029369	tnpo3	87	86.513	ENSPCOG00000023901	TNPO3	96	86.513	Propithecus_coquereli
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	78.992	ENSPVAG00000015757	TNPO3	98	78.992	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.583	ENSPNYG00000002349	tnpo3	100	94.583	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.091	ENSPNAG00000001142	tnpo3	100	92.091	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSRNOG00000021758	Tnpo3	100	84.832	Rattus_norvegicus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSRBIG00000042549	TNPO3	100	85.000	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.724	ENSRROG00000039264	TNPO3	100	85.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00000029369	tnpo3	93	75.944	ENSSBOG00000029642	TNPO3	100	75.944	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00000029369	tnpo3	96	85.504	ENSSHAG00000006837	TNPO3	100	85.504	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	83.974	ENSSFOG00015004256	tnpo3	100	83.974	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	88.841	ENSSFOG00015001474	tnpo3	100	88.841	Scleropages_formosus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	94.691	ENSSMAG00000010422	tnpo3	97	94.691	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	95.341	ENSSDUG00000004850	tnpo3	100	95.341	Seriola_dumerili
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	95.341	ENSSLDG00000016927	tnpo3	100	95.341	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00000029369	tnpo3	95	73.487	ENSSARG00000013893	TNPO3	98	73.487	Sorex_araneus
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	80.586	ENSSPUG00000007457	TNPO3	99	80.628	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	79	95.179	ENSSPAG00000014209	tnpo3	99	95.179	Stegastes_partitus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSSSCG00000016572	TNPO3	100	84.832	Sus_scrofa
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.225	ENSTNIG00000003347	tnpo3	100	92.225	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00000029369	tnpo3	88	84.790	ENSTBEG00000007220	TNPO3	90	84.790	Tupaia_belangeri
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	72.059	ENSTTRG00000014618	TNPO3	98	72.059	Tursiops_truncatus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSUAMG00000021281	TNPO3	100	84.832	Ursus_americanus
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSUMAG00000006882	TNPO3	100	84.832	Ursus_maritimus
ENSORLG00000029369	tnpo3	85	72.261	ENSVPAG00000006166	TNPO3	88	72.261	Vicugna_pacos
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.832	ENSVVUG00000011004	TNPO3	100	84.688	Vulpes_vulpes
ENSORLG00000029369	tnpo3	99	76.706	ENSXETG00000015009	tnpo3	99	76.706	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00000029369	tnpo3	100	92.741	ENSXMAG00000013062	tnpo3	100	92.741	Xiphophorus_maculatus