EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015001986 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eefsec
Alias: -
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14156 bases
Position: chr5:3741425-3755580
Accession: 101175147
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015022537	GTP_EFTU	PF00009.27	4e-30	1	1
ENSORLP00015022537	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015012762	-	4051	-	ENSORLP00015022537	576 (aa)	XP_004068536	H2L793

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015001986's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015001986's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.667	ENSG00000132394	EEFSEC	99	61.770	Homo_sapiens
ENSORLG00015001986	eefsec	100	87.069	ENSAPOG00000015931	eefsec	100	87.069	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015001986	eefsec	79	61.311	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	88	63.596	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015001986	eefsec	65	86.842	ENSACIG00000022407	eefsec	99	90.514	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	87.241	ENSAOCG00000008603	eefsec	100	87.241	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015001986	eefsec	100	85.812	ENSAPEG00000017090	eefsec	100	86.667	Amphiprion_percula
ENSORLG00015001986	eefsec	100	84.786	ENSATEG00000002753	eefsec	100	84.786	Anabas_testudineus
ENSORLG00015001986	eefsec	72	68.837	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	68.837	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015001986	eefsec	98	60.935	ENSANAG00000032691	EEFSEC	99	60.935	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.838	ENSACLG00000024565	eefsec	100	91.538	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015001986	eefsec	98	74.695	ENSAMXG00000002260	eefsec	98	74.695	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	64.576	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	99	70.866	Bos_taurus
ENSORLG00015001986	eefsec	88	32.882	WBGene00008133	efsc-1	92	32.882	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00015001986	eefsec	98	60.667	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.768	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.462	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	80	61.564	Canis_familiaris
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.462	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	99	61.564	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.946	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	99	63.946	Capra_hircus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.709	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.814	Carlito_syrichta
ENSORLG00015001986	eefsec	82	56.883	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	56.883	Cavia_aperea
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.521	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	92	69.880	Cavia_porcellus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	60.870	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	99	60.972	Cebus_capucinus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.500	ENSCATG00000019414	EEFSEC	99	61.603	Cercocebus_atys
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.245	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	99	62.245	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.667	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	99	61.770	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015001986	eefsec	99	67.123	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	88	67.808	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015001986	eefsec	98	56.696	ENSCSAVG00000002208	-	100	58.389	Ciona_savignyi
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.667	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	61.937	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.265	ENSCGRG00001018089	Eefsec	99	63.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.077	ENSCGRG00000010063	Eefsec	99	63.077	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015001986	eefsec	100	83.503	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	86.891	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015001986	eefsec	100	87.024	ENSCVAG00000005381	eefsec	100	87.024	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	76.440	ENSDARG00000004696	eefsec	99	76.440	Danio_rerio
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.732	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	99	63.051	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015001986	eefsec	82	52.546	ENSDORG00000000264	Eefsec	84	77.049	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015001986	eefsec	98	48.070	FBgn0034627	eEFSec	99	48.070	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015001986	eefsec	98	56.324	ENSETEG00000007406	EEFSEC	99	55.912	Echinops_telfairi
ENSORLG00015001986	eefsec	70	75.510	ENSEBUG00000015029	eefsec	93	51.625	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.814	ENSEASG00005006786	EEFSEC	99	62.919	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.982	ENSECAG00000016565	EEFSEC	99	63.087	Equus_caballus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	78.223	ENSELUG00000016632	eefsec	98	78.223	Esox_lucius
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.791	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	99	63.228	Felis_catus
ENSORLG00015001986	eefsec	82	67.008	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	67.008	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015001986	eefsec	82	61.336	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	61.336	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015001986	eefsec	100	88.062	ENSFHEG00000007155	eefsec	100	88.062	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015001986	eefsec	99	76.708	ENSGMOG00000007705	eefsec	99	76.883	Gadus_morhua
ENSORLG00015001986	eefsec	98	68.729	ENSGALG00000038684	EEFSEC	99	68.729	Gallus_gallus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.851	ENSGAFG00000021692	eefsec	100	87.716	Gambusia_affinis
ENSORLG00015001986	eefsec	99	85.986	ENSGACG00000000793	eefsec	99	85.986	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015001986	eefsec	99	66.781	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	98	67.466	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015001986	eefsec	86	61.628	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	98	61.748	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015001986	eefsec	100	87.197	ENSHBUG00000008917	eefsec	100	87.521	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.265	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	99	67.333	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.248	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	94	63.356	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015001986	eefsec	99	80.729	ENSHCOG00000004193	eefsec	99	80.556	Hippocampus_comes
ENSORLG00015001986	eefsec	99	73.565	ENSIPUG00000017291	eefsec	98	75.292	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015001986	eefsec	82	61.992	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.914	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	88.062	ENSKMAG00000019907	eefsec	100	88.062	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.575	ENSLBEG00000017908	eefsec	100	86.575	Labrus_bergylta
ENSORLG00015001986	eefsec	85	71.543	ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.142	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015001986	eefsec	99	76.883	ENSLOCG00000014535	eefsec	98	76.883	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	60.441	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	99	60.678	Loxodonta_africana
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.667	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	99	61.500	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015001986	eefsec	81	60.532	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	99	60.327	Macaca_mulatta
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.500	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	99	61.333	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015001986	eefsec	83	60.400	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	60.521	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	84.444	ENSMAMG00000023964	eefsec	99	86.090	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015001986	eefsec	67	87.912	ENSMZEG00005009380	eefsec	100	91.538	Maylandia_zebra
ENSORLG00015001986	eefsec	65	66.667	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	66.667	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015001986	eefsec	88	65.465	ENSMAUG00000011197	Eefsec	98	66.288	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.621	ENSMOCG00000017748	Eefsec	99	63.621	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015001986	eefsec	65	87.594	ENSMMOG00000021820	eefsec	99	87.594	Mola_mola
ENSORLG00015001986	eefsec	88	66.541	ENSMODG00000008034	EEFSEC	81	66.667	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015001986	eefsec	98	85.639	ENSMALG00000016211	eefsec	98	86.745	Monopterus_albus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.963	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	98	66.000	Mus_caroli
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.283	ENSMUSG00000033216	Eefsec	96	67.480	Mus_musculus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.113	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	98	66.000	Mus_pahari
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.944	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	98	66.000	Mus_spretus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.745	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	95	61.913	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015001986	eefsec	83	59.519	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	59.438	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.496	ENSNBRG00000002387	eefsec	100	90.769	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.167	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	99	61.269	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015001986	eefsec	82	64.008	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	99	63.395	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.795	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	99	62.901	Ochotona_princeps
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.521	ENSODEG00000002928	EEFSEC	99	62.521	Octodon_degus
ENSORLG00015001986	eefsec	81	84.906	ENSONIG00000019038	eefsec	100	85.325	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015001986	eefsec	81	64.523	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	64.523	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.514	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	99	63.621	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	100.000	ENSORLG00000001377	eefsec	100	100.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00015001986	eefsec	100	99.479	ENSORLG00020000729	eefsec	100	99.479	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015001986	eefsec	82	88.285	ENSOMEG00000010071	eefsec	89	87.552	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015001986	eefsec	73	64.384	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	64.384	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015001986	eefsec	63	62.797	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	62.797	Ovis_aries
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.500	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	99	61.603	Pan_paniscus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.545	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	99	63.652	Panthera_pardus
ENSORLG00015001986	eefsec	85	61.598	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	92	61.719	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.500	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	99	61.603	Pan_troglodytes
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.667	ENSPANG00000017041	EEFSEC	99	61.770	Papio_anubis
ENSORLG00015001986	eefsec	98	76.215	ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.303	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015001986	eefsec	88	69.750	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	98	69.333	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015001986	eefsec	99	83.275	ENSPMGG00000020300	eefsec	99	83.275	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.925	ENSPEMG00000013677	Eefsec	98	65.909	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015001986	eefsec	89	69.011	ENSPMAG00000006779	eefsec	98	69.202	Petromyzon_marinus
ENSORLG00015001986	eefsec	81	62.940	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	99	62.940	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	87.024	ENSPFOG00000003748	eefsec	100	86.505	Poecilia_formosa
ENSORLG00015001986	eefsec	99	87.108	ENSPLAG00000018012	eefsec	99	86.585	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015001986	eefsec	100	87.024	ENSPMEG00000001202	eefsec	100	86.505	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.505	ENSPREG00000012235	eefsec	100	86.505	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.167	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	99	61.269	Pongo_abelii
ENSORLG00015001986	eefsec	88	57.576	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.576	Procavia_capensis
ENSORLG00015001986	eefsec	98	60.840	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	99	61.176	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015001986	eefsec	65	66.409	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	64	66.409	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.838	ENSPNYG00000005726	eefsec	100	91.154	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015001986	eefsec	99	74.261	ENSPNAG00000016724	eefsec	99	74.606	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.669	ENSRNOG00000012954	Eefsec	99	69.565	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	61.667	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	99	61.770	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015001986	eefsec	81	59.305	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	99	59.426	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015001986	eefsec	81	63.354	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	99	63.354	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015001986	eefsec	98	75.804	ENSSFOG00015021109	eefsec	98	75.973	Scleropages_formosus
ENSORLG00015001986	eefsec	99	84.749	ENSSMAG00000001454	eefsec	99	84.749	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.177	ENSSDUG00000007924	eefsec	100	86.177	Seriola_dumerili
ENSORLG00015001986	eefsec	98	85.714	ENSSLDG00000024985	eefsec	99	85.714	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015001986	eefsec	51	75.510	ENSSARG00000003789	-	55	75.510	Sorex_araneus
ENSORLG00015001986	eefsec	81	66.460	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	66.667	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	85.983	ENSSPAG00000001320	eefsec	100	87.692	Stegastes_partitus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.300	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	99	65.693	Sus_scrofa
ENSORLG00015001986	eefsec	98	66.954	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	99	66.954	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015001986	eefsec	99	82.902	ENSTRUG00000010327	eefsec	99	82.902	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015001986	eefsec	99	82.902	ENSTNIG00000003225	eefsec	99	82.902	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015001986	eefsec	98	63.051	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	99	62.775	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.814	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	99	62.814	Ursus_americanus
ENSORLG00015001986	eefsec	72	63.889	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	90	63.889	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015001986	eefsec	79	68.511	ENSXETG00000002066	eefsec	99	68.511	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015001986	eefsec	99	87.304	ENSXCOG00000019916	eefsec	99	87.652	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015001986	eefsec	100	86.851	ENSXMAG00000001839	eefsec	100	86.851	Xiphophorus_maculatus