EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015002000 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC101158774
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14457 bases
Position: chr9:13464473-13478929
Accession: 101158774
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015022543	MMR_HSR1	PF01926.23	5.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015012761	-	3729	XM_004072610	ENSORLP00015022543	448 (aa)	XP_004072658	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_percula
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_percula
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Anabas_testudineus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Anabas_testudineus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	57.143	ENSACAG00000028632	-	99	57.143	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	79.510	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.510	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.471	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.471	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	79	61.517	ENSCING00000020807	-	94	61.517	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	98	55.682	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.136	Ciona_savignyi
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.906	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	98	82.727	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	Danio_rerio
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	82	55.526	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	55.526	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	80.269	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.269	Esox_lucius
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	89	54.613	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.613	Gadus_morhua
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Gambusia_affinis
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	89.062	Gambusia_affinis
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	85	62.924	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	60.945	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	58	94.186	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.186	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.628	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.000	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	83.333	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.333	Hippocampus_comes
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	76.615	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.615	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	84	57.447	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.447	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	96	58.891	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.891	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.393	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.393	Labrus_bergylta
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	61.915	ENSLACG00000004899	-	99	61.915	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	61.573	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.573	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	68.694	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.694	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	72.931	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.931	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	96	59.584	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.584	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.186	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.186	Maylandia_zebra
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Maylandia_zebra
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	57.206	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.206	Mola_mola
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	98	88.383	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.383	Monopterus_albus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Monopterus_albus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	96	59.122	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.122	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	95.759	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	95.759	Oryzias_latipes
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	98.661	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	98.661	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	95.982	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	95.982	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	57.238	ENSPKIG00000023918	-	98	57.238	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.914	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	88.914	Poecilia_formosa
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