EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015002726 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13604 bases
Position: chr12:2346210-2359813
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015002089	ResIII	PF04851.15	8.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015011558	-	6400	-	ENSORLP00015002089	1401 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015002726's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015002726's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00015002726	sbno1	70	65.138	ENSORLG00015000202	si:ch73-63e15.2	70	58.004

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.806	ENSG00000139697	SBNO1	99	74.877	Homo_sapiens
ENSORLG00015002726	sbno1	82	93.136	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.050	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.351	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015002726	sbno1	100	85.674	ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.533	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.050	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.192	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.979	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	90.121	Amphiprion_percula
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.064	ENSATEG00000006667	sbno1	100	90.064	Anabas_testudineus
ENSORLG00015002726	sbno1	98	75.501	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.828	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.499	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.173	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.759	ENSANAG00000029958	-	99	82.374	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015002726	sbno1	100	83.678	ENSACLG00000024913	sbno1	100	83.535	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015002726	sbno1	100	81.250	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	81.192	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	75.246	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.316	Bos_taurus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.947	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.018	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.264	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	83.730	Canis_familiaris
ENSORLG00015002726	sbno1	95	80.505	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.505	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.032	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.032	Capra_hircus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.158	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.087	Carlito_syrichta
ENSORLG00015002726	sbno1	96	76.531	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.183	Cavia_aperea
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.183	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.183	Cavia_porcellus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	70.886	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.609	Cebus_capucinus
ENSORLG00015002726	sbno1	91	82.585	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	82.585	Cercocebus_atys
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.183	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.183	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015002726	sbno1	82	81.357	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.529	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	69.529	ENSCHOG00000008814	SBNO1	99	69.599	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.982	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.177	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015002726	sbno1	99	71.519	ENSCANG00000042688	-	99	71.338	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	81.622	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	81.622	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015002726	sbno1	95	81.622	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	81.622	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015002726	sbno1	100	87.784	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	87.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.410	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	89.694	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	80.114	ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.840	Danio_rerio
ENSORLG00015002726	sbno1	99	77.757	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	80.198	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	67.960	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.413	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015002726	sbno1	93	72.013	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.013	Echinops_telfairi
ENSORLG00015002726	sbno1	75	61.645	ENSEBUG00000013823	sbno1	77	71.103	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015002726	sbno1	51	73.066	ENSEASG00005012595	-	92	73.343	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.229	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	75.962	Equus_caballus
ENSORLG00015002726	sbno1	81	77.596	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.596	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	82.424	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.003	Esox_lucius
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.352	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.141	Felis_catus
ENSORLG00015002726	sbno1	98	75.359	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.811	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015002726	sbno1	100	74.542	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.401	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.268	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.047	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015002726	sbno1	94	84.563	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.036	Gadus_morhua
ENSORLG00015002726	sbno1	88	75.458	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.936	Gallus_gallus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.616	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.545	Gambusia_affinis
ENSORLG00015002726	sbno1	94	87.453	ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.528	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.148	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.332	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.002	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.002	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015002726	sbno1	100	77.667	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	77.809	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.303	ENSHGLG00000014165	-	99	82.796	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015002726	sbno1	92	92.871	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	92.871	Hippocampus_comes
ENSORLG00015002726	sbno1	100	81.006	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	81.818	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.032	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.032	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	79.422	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.422	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	89.530	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	89.672	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	88.173	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	88.173	Labrus_bergylta
ENSORLG00015002726	sbno1	100	71.670	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.224	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015002726	sbno1	100	80.704	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.845	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.736	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.789	Loxodonta_africana
ENSORLG00015002726	sbno1	95	79.821	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	79.821	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015002726	sbno1	95	79.821	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	79.821	Macaca_mulatta
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.852	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.852	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.541	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	90.612	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015002726	sbno1	98	75.683	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.989	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015002726	sbno1	50	73.184	ENSMAUG00000004834	-	99	73.287	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	79.855	ENSMICG00000006573	-	99	79.496	Microcebus_murinus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.491	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.491	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015002726	sbno1	100	81.889	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	82.812	Mola_mola
ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.542	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	74.824	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.212	ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.567	Monopterus_albus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.335	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.228	Mus_caroli
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.316	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.228	Mus_musculus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.527	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.228	Mus_pahari
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.282	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.228	Mus_spretus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.581	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.369	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.176	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	74.806	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015002726	sbno1	92	83.694	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	83.694	Nannospalax_galili
ENSORLG00015002726	sbno1	100	84.391	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	84.462	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015002726	sbno1	99	71.890	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.910	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015002726	sbno1	63	70.625	ENSMEUG00000008768	-	93	71.875	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.666	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.384	Ochotona_princeps
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.363	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.363	Octodon_degus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	88.628	ENSONIG00000015348	sbno1	100	88.699	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.608	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.267	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	99.643	ENSORLG00000001593	sbno1	100	99.643	Oryzias_latipes
ENSORLG00015002726	sbno1	100	99.358	ENSORLG00020015216	sbno1	100	99.358	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015002726	sbno1	100	96.574	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	96.574	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015002726	sbno1	50	72.409	ENSOGAG00000010781	-	99	72.511	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015002726	sbno1	100	74.877	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.211	Ovis_aries
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.002	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.002	Pan_paniscus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.352	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.141	Panthera_pardus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.371	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.247	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.002	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.002	Pan_troglodytes
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.852	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	82.852	Papio_anubis
ENSORLG00015002726	sbno1	99	80.255	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.538	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.892	ENSPSIG00000009572	-	99	74.789	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015002726	sbno1	92	71.723	ENSPSIG00000009256	-	99	72.485	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.310	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.310	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.841	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	74.982	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.043	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	89.972	Poecilia_formosa
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.043	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	89.972	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.050	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	89.979	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.410	ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.339	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.000	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	75.070	Pongo_abelii
ENSORLG00015002726	sbno1	84	76.018	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	68.575	Procavia_capensis
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.696	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	82.696	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015002726	sbno1	87	83.698	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.698	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	88.415	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	88.486	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015002726	sbno1	100	80.807	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	80.595	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.491	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	82.640	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.852	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	82.852	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015002726	sbno1	97	73.158	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.939	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015002726	sbno1	99	80.905	ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.047	Scleropages_formosus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.765	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	89.837	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.632	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	90.632	Seriola_dumerili
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.419	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	90.419	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015002726	sbno1	89	80.515	ENSSARG00000002594	SBNO1	88	81.469	Sorex_araneus
ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.586	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.646	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.348	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	90.845	Stegastes_partitus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.141	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	75.211	Sus_scrofa
ENSORLG00015002726	sbno1	98	75.305	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.670	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015002726	sbno1	99	86.548	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	86.396	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015002726	sbno1	57	83.085	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	82.456	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.440	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	75.229	Ursus_americanus
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.440	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	75.229	Ursus_maritimus
ENSORLG00015002726	sbno1	95	75.556	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	75.556	Vicugna_pacos
ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.369	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	75.158	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015002726	sbno1	99	72.874	ENSXETG00000031930	SBNO1	94	80.066	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015002726	sbno1	88	86.791	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	84.038	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.979	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	89.908	Xiphophorus_maculatus