EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015002960 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: -
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11561 bases
Position: chr1:29435726-29447286
Accession: 101173124
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015002305	RRM_1	PF00076.22	4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015011195	-	3259	XM_023959938	ENSORLP00015002305	926 (aa)	XP_023815706	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	84	78.205	ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	76	78.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	67	43.992	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	63	43.615	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	65	42.770	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	60	42.436	Amphiprion_percula
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	76.774	ENSACLG00000019359	-	67	77.215	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	93	55.233	ENSDARG00000098666	si:dkey-93h22.8	63	37.725	Danio_rerio
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	76.774	ENSHBUG00000019347	-	67	77.215	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	71	65.169	ENSHCOG00000015325	-	67	31.509	Hippocampus_comes
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	64	43.373	ENSKMAG00000019855	si:dkey-93h22.8	77	38.471	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	76.282	ENSLBEG00000024075	-	57	41.616	Labrus_bergylta
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	78.205	ENSMAMG00000011169	-	72	78.125	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	76.774	ENSMZEG00005008228	-	70	77.215	Maylandia_zebra
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	71	76.282	ENSMALG00000005052	-	69	76.250	Monopterus_albus
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	100	94.816	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	100	95.032	Oryzias_latipes
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	100	94.181	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	100	94.181	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	100	75.560	ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	100	74.066	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	84	80.916	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	84	68.966	Poecilia_formosa
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	87	75.316	ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	84	75.472	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	76.923	ENSPNYG00000002682	-	70	77.215	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	67	58.750	ENSPNAG00000023094	si:dkey-93h22.8	61	59.006	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	66	42.775	ENSSMAG00000005915	si:dkey-93h22.8	72	72.500	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	80	76.923	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	72	76.875	Seriola_dumerili
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	88	76.923	ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	89	41.924	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	60	45.735	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	61	44.118	Stegastes_partitus