EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015003636 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17432 bases
Position: chr8:14505886-14523317
Accession: ZDB-GENE-030131-5912
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015023557	Xpo1	PF08389.12	1.4e-20	1	1
ENSORLP00015023552	Xpo1	PF08389.12	3.4e-19	1	1
ENSORLP00015023557	IBN_N	PF03810.19	9.4e-07	1	1
ENSORLP00015023552	IBN_N	PF03810.19	1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015010226	-	4791	-	ENSORLP00015023552	1108 (aa)	-	-
ENSORLT00015010190	-	4917	-	ENSORLP00015023557	1150 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.510	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.847	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.021	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.222	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	75.222	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015003636	xpo6	99	90.576	ENSACIG00000008055	xpo6	99	90.663	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.847	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	92.021	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.761	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	91.934	Amphiprion_percula
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.460	ENSATEG00000002273	xpo6	100	90.633	Anabas_testudineus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	76.501	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	76.501	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015003636	xpo6	100	67.965	ENSACAG00000016883	XPO6	100	67.965	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	ENSANAG00000031761	XPO6	100	75.244	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.893	ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.067	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015003636	xpo6	100	76.190	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.190	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	74.889	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	74.889	Bos_taurus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.333	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.333	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.311	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	75.311	Canis_familiaris
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	75.421	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015003636	xpo6	100	74.889	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	74.889	Capra_hircus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	72.426	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	72.426	Carlito_syrichta
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.067	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	75.067	Cavia_porcellus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	75.244	Cebus_capucinus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSCATG00000034030	XPO6	100	75.421	Cercocebus_atys
ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.867	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.867	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015003636	xpo6	92	74.065	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	74.070	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015003636	xpo6	82	85.294	ENSCPBG00000024660	XPO6	98	85.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015003636	xpo6	99	45.198	ENSCING00000006884	-	99	45.198	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015003636	xpo6	99	44.020	ENSCSAVG00000000850	-	99	43.936	Ciona_savignyi
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	ENSCANG00000041578	XPO6	100	75.244	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	75.244	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015003636	xpo6	100	89.245	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	89.245	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.870	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	90.870	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015003636	xpo6	97	75.401	ENSDARG00000041217	xpo6	99	75.401	Danio_rerio
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.155	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	75.155	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.333	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	75.333	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015003636	xpo6	87	30.943	FBgn0266572	ebo	92	30.682	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015003636	xpo6	83	75.290	ENSETEG00000018768	XPO6	85	75.290	Echinops_telfairi
ENSORLG00015003636	xpo6	100	59.714	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	59.767	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.599	ENSEASG00005017296	XPO6	100	75.599	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.599	ENSECAG00000008601	XPO6	100	75.599	Equus_caballus
ENSORLG00015003636	xpo6	97	69.811	ENSEEUG00000014587	XPO6	99	69.811	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	84.435	ENSELUG00000009159	xpo6	100	84.435	Esox_lucius
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.599	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	75.599	Felis_catus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	76.588	ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.762	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.311	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	75.311	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.217	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	91.217	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	76.522	ENSGALG00000035360	XPO6	100	76.522	Gallus_gallus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.783	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	90.783	Gambusia_affinis
ENSORLG00015003636	xpo6	95	75.619	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	75.619	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	75.421	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.154	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	91.327	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.391	ENSHGLG00000009679	-	100	75.391	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015003636	xpo6	94	61.792	ENSHGLG00000003865	-	99	61.792	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015003636	xpo6	94	63.522	ENSHGLG00100001081	-	99	63.522	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.304	ENSHGLG00100003673	-	99	75.304	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015003636	xpo6	100	88.725	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	88.812	Hippocampus_comes
ENSORLG00015003636	xpo6	100	74.697	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	75.303	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	74.978	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	74.978	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	74.889	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	74.889	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	92.087	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	92.087	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.980	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	91.154	Labrus_bergylta
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.333	ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.333	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015003636	xpo6	94	80.979	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.979	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.867	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	74.867	Loxodonta_africana
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	75.421	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	75.421	Macaca_mulatta
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	75.421	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	75.421	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.546	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	90.720	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.980	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	91.154	Maylandia_zebra
ENSORLG00015003636	xpo6	97	75.758	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	75.758	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015003636	xpo6	99	66.870	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	66.609	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSMICG00000001923	XPO6	100	75.421	Microcebus_murinus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.217	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	75.217	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015003636	xpo6	100	88.998	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	88.998	Mola_mola
ENSORLG00015003636	xpo6	100	76.281	ENSMODG00000015516	XPO6	100	76.281	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015003636	xpo6	99	80.836	ENSMALG00000020612	xpo6	99	81.098	Monopterus_albus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	100	75.244	Mus_caroli
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.155	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	75.155	Mus_musculus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	75.244	Mus_pahari
ENSORLG00015003636	xpo6	100	74.978	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	74.978	Mus_spretus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.956	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	74.956	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.689	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	74.689	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.400	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	75.400	Nannospalax_galili
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.240	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	91.414	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.510	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	75.510	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015003636	xpo6	87	74.390	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	74.419	Ochotona_princeps
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.413	ENSODEG00000012917	XPO6	100	75.413	Octodon_degus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.327	ENSONIG00000019366	xpo6	100	91.500	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.488	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.488	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	99.130	ENSORLG00000011231	xpo6	100	99.130	Oryzias_latipes
ENSORLG00015003636	xpo6	100	99.565	ENSORLG00020000386	xpo6	100	99.565	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015003636	xpo6	100	96.957	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	96.957	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.488	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	75.488	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.956	ENSOARG00000000960	XPO6	100	74.956	Ovis_aries
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	75.421	Pan_paniscus
ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.292	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	75.292	Panthera_pardus
ENSORLG00015003636	xpo6	96	74.747	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	74.747	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	75.421	Pan_troglodytes
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.421	ENSPANG00000017103	XPO6	100	75.421	Papio_anubis
ENSORLG00015003636	xpo6	100	79.654	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.740	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.934	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	74.934	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015003636	xpo6	99	88.820	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	88.820	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.244	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015003636	xpo6	99	67.882	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	67.882	Petromyzon_marinus
ENSORLG00015003636	xpo6	97	75.964	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	75.527	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.312	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.312	Poecilia_formosa
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.304	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	91.304	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.478	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	91.478	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015003636	xpo6	97	91.421	ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.421	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.510	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	75.510	Pongo_abelii
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ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.510	ENSPCOG00000017886	XPO6	100	75.510	Propithecus_coquereli
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