EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015008095 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: -
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45999 bases
Position: chr13:3564727-3610725
Accession: 101161427
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015007196	Wyosine_form	PF08608.12	9.9e-27	1	1
ENSORLP00015026442	Wyosine_form	PF08608.12	1.1e-26	1	1
ENSORLP00015026439	Wyosine_form	PF08608.12	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015002887	-	2730	XM_011482222	ENSORLP00015026439	743 (aa)	XP_011480524	-
ENSORLT00015002934	-	2022	-	ENSORLP00015007196	673 (aa)	-	-
ENSORLT00015002858	-	3501	-	ENSORLP00015026442	691 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.663	ENSG00000198874	TYW1	98	66.529	Homo_sapiens
ENSORLG00015008095	tyw1	98	55.650	ENSG00000277149	TYW1B	98	58.939	Homo_sapiens
ENSORLG00015008095	tyw1	99	79.814	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	79.283	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	78.711	ENSACIG00000007325	tyw1	99	78.822	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.763	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	79.443	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.895	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	79.576	Amphiprion_percula
ENSORLG00015008095	tyw1	97	77.551	ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.372	Anabas_testudineus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.612	ENSANAG00000037051	-	98	65.152	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015008095	tyw1	99	79.973	ENSACLG00000018688	tyw1	100	79.011	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015008095	tyw1	96	72.176	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	73.757	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	67.308	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	66.804	Bos_taurus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.025	ENSCJAG00000004295	-	98	65.427	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015008095	tyw1	98	64.347	ENSCAFG00000010867	-	98	67.455	Canis_familiaris
ENSORLG00015008095	tyw1	92	62.680	ENSCAFG00020005367	-	99	62.644	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015008095	tyw1	95	67.218	ENSCHIG00000019510	-	98	67.218	Capra_hircus
ENSORLG00015008095	tyw1	91	65.749	ENSTSYG00000008236	-	98	65.391	Carlito_syrichta
ENSORLG00015008095	tyw1	85	62.733	ENSCAPG00000013569	-	100	63.665	Cavia_aperea
ENSORLG00015008095	tyw1	94	64.159	ENSCPOG00000011182	-	99	63.784	Cavia_porcellus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.750	ENSCCAG00000026643	-	98	65.702	Cebus_capucinus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.162	ENSCATG00000043677	-	98	65.978	Cercocebus_atys
ENSORLG00015008095	tyw1	95	64.082	ENSCLAG00000006321	-	98	64.208	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015008095	tyw1	86	68.953	ENSCSAG00000018274	-	98	69.945	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015008095	tyw1	52	82.051	ENSCHOG00000003801	-	55	82.051	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015008095	tyw1	99	64.314	ENSCPBG00000014896	-	99	70.567	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015008095	tyw1	81	56.866	ENSCING00000004125	-	97	58.744	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015008095	tyw1	80	63.706	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.672	Ciona_savignyi
ENSORLG00015008095	tyw1	95	64.979	ENSCANG00000033209	-	98	65.702	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015008095	tyw1	67	76.047	ENSCGRG00001003679	Tyw1	89	73.894	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015008095	tyw1	99	76.604	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	75.936	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015008095	tyw1	97	77.105	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	77.105	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	72.790	ENSDARG00000062987	tyw1	95	73.793	Danio_rerio
ENSORLG00015008095	tyw1	95	67.080	ENSDNOG00000024165	-	98	66.759	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	57.601	ENSDORG00000014772	Tyw1	97	57.402	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015008095	tyw1	65	72.685	ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.804	ENSEASG00005008818	-	98	66.804	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015008095	tyw1	86	81.034	ENSECAG00000023164	-	98	62.483	Equus_caballus
ENSORLG00015008095	tyw1	59	78.947	ENSEEUG00000005950	-	56	78.947	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015008095	tyw1	99	70.472	ENSELUG00000008449	tyw1	98	71.212	Esox_lucius
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.667	ENSFCAG00000014262	-	98	65.928	Felis_catus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	64.552	ENSFALG00000013810	-	99	65.427	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015008095	tyw1	95	64.050	ENSFDAG00000013270	-	98	64.414	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015008095	tyw1	81	78.409	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.049	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.255	ENSGALG00000001110	-	98	66.712	Gallus_gallus
ENSORLG00015008095	tyw1	96	77.459	ENSGACG00000012692	tyw1	99	77.641	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015008095	tyw1	98	64.092	ENSGAGG00000022393	-	98	66.667	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015008095	tyw1	91	56.991	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	58.040	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015008095	tyw1	99	79.706	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.743	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015008095	tyw1	89	65.273	ENSHGLG00000012093	-	100	67.347	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015008095	tyw1	95	64.423	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	65.062	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015008095	tyw1	96	68.837	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	68.100	Hippocampus_comes
ENSORLG00015008095	tyw1	99	71.638	ENSIPUG00000016330	tyw1	96	74.167	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015008095	tyw1	97	64.372	ENSSTOG00000004067	-	92	64.595	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015008095	tyw1	94	64.466	ENSJJAG00000022959	Tyw1	100	63.885	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015008095	tyw1	99	78.884	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	78.059	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015008095	tyw1	99	62.618	ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.395	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015008095	tyw1	94	70.874	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.278	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.575	ENSMFAG00000035457	-	98	66.391	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.575	ENSMMUG00000030374	-	98	66.391	Macaca_mulatta
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.713	ENSMNEG00000041992	-	98	69.945	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.300	ENSMLEG00000039741	-	98	66.116	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015008095	tyw1	97	80.408	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	78.278	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015008095	tyw1	93	81.498	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	82.866	Maylandia_zebra
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.758	ENSMGAG00000002176	-	98	66.940	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015008095	tyw1	95	67.038	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.898	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.978	ENSMICG00000014374	-	99	66.116	Microcebus_murinus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.331	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.944	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015008095	tyw1	96	73.147	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	74.198	Mola_mola
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.667	ENSMODG00000025697	-	98	67.078	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.955	ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.527	Monopterus_albus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.374	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	98	66.481	Mus_caroli
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.651	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	66.759	Mus_musculus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.786	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	98	66.573	Mus_pahari
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.374	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	66.481	Mus_spretus
ENSORLG00015008095	tyw1	94	66.006	ENSMPUG00000016191	-	97	69.196	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015008095	tyw1	95	63.365	ENSMLUG00000013582	-	98	63.798	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.994	ENSNGAG00000002742	Tyw1	98	67.461	Nannospalax_galili
ENSORLG00015008095	tyw1	95	76.602	ENSNBRG00000016996	tyw1	97	79.321	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.068	ENSNLEG00000013210	-	97	65.616	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015008095	tyw1	83	71.429	ENSOPRG00000008734	-	78	62.687	Ochotona_princeps
ENSORLG00015008095	tyw1	95	60.839	ENSODEG00000014729	-	98	60.979	Octodon_degus
ENSORLG00015008095	tyw1	99	78.961	ENSONIG00000005872	tyw1	100	77.867	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015008095	tyw1	94	65.612	ENSOCUG00000003173	-	99	65.306	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015008095	tyw1	100	98.520	ENSORLG00000001393	tyw1	100	98.520	Oryzias_latipes
ENSORLG00015008095	tyw1	99	98.645	ENSORLG00020019361	tyw1	100	98.645	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015008095	tyw1	91	68.876	ENSOGAG00000016555	-	99	65.194	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.758	ENSOARG00000010673	-	98	66.621	Ovis_aries
ENSORLG00015008095	tyw1	95	67.133	ENSPPRG00000004945	-	98	66.388	Panthera_pardus
ENSORLG00015008095	tyw1	98	64.387	ENSPTIG00000019545	-	98	66.388	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015008095	tyw1	98	57.676	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	61.454	Pan_troglodytes
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.025	ENSPANG00000019053	-	98	65.840	Papio_anubis
ENSORLG00015008095	tyw1	99	67.426	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	67.647	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015008095	tyw1	93	74.929	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	74.929	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.759	ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.406	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.763	ENSPFOG00000015855	tyw1	100	77.630	Poecilia_formosa
ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.556	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	77.424	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.630	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	77.497	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015008095	tyw1	98	74.898	ENSPREG00000018773	tyw1	99	74.627	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.890	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	66.391	Pongo_abelii
ENSORLG00015008095	tyw1	95	53.352	ENSPCOG00000015294	-	98	53.014	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015008095	tyw1	99	80.107	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	79.144	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015008095	tyw1	96	73.619	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	74.207	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.786	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.713	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.162	ENSRBIG00000039619	-	98	66.667	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.800	ENSRROG00000039780	-	98	66.529	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015008095	tyw1	94	38.081	YPL207W	-	76	39.306	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.337	ENSSBOG00000025873	-	98	65.014	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.975	ENSSHAG00000010346	-	99	65.877	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015008095	tyw1	97	71.020	ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.659	Scleropages_formosus
ENSORLG00015008095	tyw1	97	79.645	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	78.342	Scophthalmus_maximus
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ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.022	ENSSPUG00000002715	-	98	65.837	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.071	ENSSSCG00000007733	-	98	66.575	Sus_scrofa
ENSORLG00015008095	tyw1	92	66.513	ENSTGUG00000003428	-	98	67.123	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015008095	tyw1	99	76.944	ENSTRUG00000016107	tyw1	97	76.676	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015008095	tyw1	88	81.465	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.030	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015008095	tyw1	98	64.356	ENSUMAG00000015343	-	98	67.036	Ursus_maritimus
ENSORLG00015008095	tyw1	98	63.909	ENSVVUG00000016457	-	98	67.455	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015008095	tyw1	95	68.493	ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.320	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015008095	tyw1	99	75.936	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	77.674	Xiphophorus_maculatus