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Description

Ensembl ID: ENSORLG00015011785 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: -
Full Name: aconitase 1%2C soluble
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19106 bases
Position: chr18:29760489-29779594
Accession: ZDB-GENE-031118-76
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015010921	Aconitase	PF00330.20	8.5e-181	1	1
ENSORLP00015010956	Aconitase	PF00330.20	8.5e-181	1	1
ENSORLP00015010921	Aconitase_C	PF00694.19	8.7e-44	1	1
ENSORLP00015010956	Aconitase_C	PF00694.19	8.7e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015017624	-	5500	-	ENSORLP00015010921	894 (aa)	-	-
ENSORLT00015017686	-	6202	-	ENSORLP00015010956	894 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00015011785	aco1	99	60.150	ENSORLG00015014057	ireb2	92	60.150

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSG00000122729	ACO1	99	81.644	Homo_sapiens
ENSORLG00015011785	aco1	100	89.038	ENSAPOG00000008670	aco1	100	89.038	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.777	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	81.777	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015011785	aco1	99	88.229	ENSACIG00000014377	aco1	99	88.229	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015011785	aco1	100	89.374	ENSAOCG00000007699	aco1	100	89.374	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015011785	aco1	100	89.262	ENSAPEG00000014370	aco1	100	89.262	Amphiprion_percula
ENSORLG00015011785	aco1	100	89.597	ENSATEG00000000560	aco1	100	89.597	Anabas_testudineus
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.765	ENSAPLG00000015490	ACO1	100	80.765	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015011785	aco1	96	79.930	ENSACAG00000001541	ACO1	99	79.930	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.180	ENSANAG00000003359	ACO1	99	80.180	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015011785	aco1	99	89.013	ENSACLG00000007755	aco1	99	89.013	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015011785	aco1	99	84.719	ENSAMXG00000002499	aco1	100	84.719	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.982	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	81.982	Bos_taurus
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.856	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	80.856	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.440	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	81.440	Canis_familiaris
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.532	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	81.532	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.207	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	82.207	Capra_hircus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.095	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.095	Carlito_syrichta
ENSORLG00015011785	aco1	99	66.779	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	66.667	Cavia_aperea
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.982	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	81.982	Cavia_porcellus
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.631	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	80.631	Cebus_capucinus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.757	ENSCATG00000045333	ACO1	99	81.757	Cercocebus_atys
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.532	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.532	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	81.644	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015011785	aco1	90	64.970	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	64.812	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.990	ENSCPBG00000008077	ACO1	100	80.990	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.419	ENSCANG00000014847	ACO1	99	81.419	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.658	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	82.658	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.869	ENSCGRG00000004877	-	99	81.869	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015011785	aco1	100	84.564	ENSCSEG00000018262	aco1	100	84.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015011785	aco1	100	82.886	ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.886	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	84.607	ENSDARG00000026376	aco1	100	84.607	Danio_rerio
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.532	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	81.532	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.995	ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.995	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015011785	aco1	85	64.362	ENSETEG00000012415	-	85	64.362	Echinops_telfairi
ENSORLG00015011785	aco1	99	56.310	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.310	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.982	ENSEASG00005004602	ACO1	99	81.982	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.869	ENSECAG00000014846	ACO1	99	81.869	Equus_caballus
ENSORLG00015011785	aco1	99	70.495	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	70.495	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015011785	aco1	99	85.843	ENSELUG00000016812	aco1	97	85.843	Esox_lucius
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.194	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	81.194	Felis_catus
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.765	ENSFALG00000001167	ACO1	100	80.765	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.194	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	81.194	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015011785	aco1	100	88.031	ENSFHEG00000005619	aco1	100	88.031	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015011785	aco1	99	84.763	ENSGMOG00000005514	aco1	99	84.667	Gadus_morhua
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.877	ENSGALG00000002162	ACO1	100	80.877	Gallus_gallus
ENSORLG00015011785	aco1	100	88.702	ENSGACG00000001637	aco1	100	88.702	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	80.877	ENSGAGG00000023315	ACO1	100	80.877	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.532	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	81.532	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015011785	aco1	99	88.901	ENSHBUG00000008952	aco1	99	88.901	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.419	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	81.419	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.419	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.419	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015011785	aco1	100	85.123	ENSHCOG00000015881	aco1	100	85.123	Hippocampus_comes
ENSORLG00015011785	aco1	99	83.671	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	83.671	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.658	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	82.658	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.432	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	82.432	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015011785	aco1	100	88.591	ENSKMAG00000015759	aco1	100	88.591	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015011785	aco1	100	84.693	ENSLBEG00000013866	aco1	100	84.693	Labrus_bergylta
ENSORLG00015011785	aco1	75	69.436	ENSLACG00000000936	ACO1	99	69.254	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.300	ENSLOCG00000011082	aco1	99	82.300	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	79.392	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.392	Loxodonta_africana
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.532	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	81.532	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	81.644	Macaca_mulatta
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.419	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	81.419	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	81.644	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015011785	aco1	100	89.821	ENSMAMG00000002915	aco1	100	89.821	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	85.507	ENSMZEG00005012733	aco1	100	85.173	Maylandia_zebra
ENSORLG00015011785	aco1	99	65.705	ENSMGAG00000008851	ACO1	100	65.705	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.207	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	82.207	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.306	ENSMICG00000006540	ACO1	99	81.306	Microcebus_murinus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.658	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	82.658	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015011785	aco1	99	87.191	ENSMMOG00000020282	aco1	99	87.191	Mola_mola
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.081	ENSMODG00000004463	ACO1	99	81.081	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015011785	aco1	100	89.038	ENSMALG00000019764	aco1	100	89.038	Monopterus_albus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.995	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	82.995	Mus_caroli
ENSORLG00015011785	aco1	99	83.108	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	83.108	Mus_musculus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.770	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	82.770	Mus_pahari
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.995	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.995	Mus_spretus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.757	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	81.757	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015011785	aco1	99	79.955	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	79.955	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.320	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	82.320	Nannospalax_galili
ENSORLG00015011785	aco1	99	72.018	ENSNBRG00000008973	aco1	99	71.795	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.194	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	81.194	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015011785	aco1	89	76.659	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	76.659	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015011785	aco1	99	78.041	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	78.041	Ochotona_princeps
ENSORLG00015011785	aco1	99	79.279	ENSODEG00000001240	-	99	79.279	Octodon_degus
ENSORLG00015011785	aco1	99	76.914	ENSODEG00000015432	-	99	76.577	Octodon_degus
ENSORLG00015011785	aco1	99	88.901	ENSONIG00000019869	aco1	99	88.901	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015011785	aco1	81	82.410	ENSOANG00000012132	ACO1	99	82.410	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.403	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	81.180	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015011785	aco1	99	99.101	ENSORLG00000020656	aco1	100	99.101	Oryzias_latipes
ENSORLG00015011785	aco1	99	98.764	ENSORLG00020010991	aco1	100	98.764	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015011785	aco1	99	93.603	ENSOMEG00000000660	aco1	99	93.603	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.757	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	81.757	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.207	ENSOARG00000014707	ACO1	98	82.207	Ovis_aries
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	81.644	Pan_paniscus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.306	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	81.306	Panthera_pardus
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.194	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	81.194	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	81.644	Pan_troglodytes
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.644	ENSPANG00000025270	ACO1	99	81.644	Papio_anubis
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.399	ENSPKIG00000023168	aco1	99	82.399	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015011785	aco1	99	81.102	ENSPSIG00000008030	ACO1	100	81.102	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015011785	aco1	100	88.479	ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.479	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015011785	aco1	99	82.658	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	82.658	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015011785	aco1	99	79.481	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	80.562	Phascolarctos_cinereus
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ENSORLG00015011785	aco1	99	81.081	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	81.081	Pongo_abelii
ENSORLG00015011785	aco1	77	86.792	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	86.792	Procavia_capensis
ENSORLG00015011785	aco1	88	82.636	ENSPCOG00000021198	ACO1	99	82.636	Propithecus_coquereli
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ENSORLG00015011785	aco1	99	88.901	ENSPNYG00000009425	aco1	99	88.901	Pundamilia_nyererei
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ENSORLG00015011785	aco1	99	88.229	ENSXMAG00000023603	aco1	99	88.229	Xiphophorus_maculatus