EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015011872 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 55533 bases
Position: chr12:9502729-9558261
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015011014	MIF4G	PF02854.19	6e-25	1	1
ENSORLP00015011041	MIF4G	PF02854.19	8.2e-25	1	1
ENSORLP00015011071	MIF4G	PF02854.19	9.8e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015017726	-	1779	-	ENSORLP00015011014	592 (aa)	-	-
ENSORLT00015017800	-	2330	-	ENSORLP00015011041	668 (aa)	-	-
ENSORLT00015017808	-	2411	-	ENSORLP00015011071	695 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.074	ENSG00000134030	CTIF	100	65.385	Homo_sapiens
ENSORLG00015011872	ctif	100	77.852	ENSAPOG00000020192	ctif	100	81.093	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015011872	ctif	87	54.945	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	54.281	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015011872	ctif	100	79.037	ENSACIG00000017099	ctif	100	79.178	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015011872	ctif	100	65.401	ENSAOCG00000014275	ctif	82	91.228	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015011872	ctif	100	81.213	ENSAPEG00000016975	ctif	100	82.570	Amphiprion_percula
ENSORLG00015011872	ctif	100	80.824	ENSATEG00000016752	ctif	100	81.684	Anabas_testudineus
ENSORLG00015011872	ctif	99	58.997	ENSACAG00000018006	CTIF	100	58.468	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.913	ENSANAG00000024925	CTIF	99	56.361	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015011872	ctif	100	79.943	ENSACLG00000005956	ctif	100	80.370	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015011872	ctif	61	59.452	ENSAMXG00000015964	ctif	100	60.585	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015011872	ctif	88	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.822	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.340	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015011872	ctif	97	56.250	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	56.300	Canis_familiaris
ENSORLG00015011872	ctif	97	56.250	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	56.300	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.240	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	55.627	Capra_hircus
ENSORLG00015011872	ctif	90	55.556	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	54.982	Carlito_syrichta
ENSORLG00015011872	ctif	99	53.268	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	52.496	Cavia_aperea
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.459	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	55.784	Cavia_porcellus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.571	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	56.019	Cebus_capucinus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.913	ENSCATG00000038134	CTIF	99	56.361	Cercocebus_atys
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.374	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	56.774	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015011872	ctif	99	55.956	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	55.416	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015011872	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.051	ENSCANG00000030916	CTIF	99	56.501	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.464	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	56.913	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015011872	ctif	99	53.560	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	53.023	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015011872	ctif	100	74.157	ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.843	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015011872	ctif	100	78.125	ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.267	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015011872	ctif	99	66.099	ENSDARG00000090617	ctif	100	63.877	Danio_rerio
ENSORLG00015011872	ctif	74	55.727	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	54.967	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.250	ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.698	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.143	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.051	ENSECAG00000020473	CTIF	100	56.501	Equus_caballus
ENSORLG00015011872	ctif	90	51.658	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	50.613	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015011872	ctif	99	64.690	ENSELUG00000008733	ctif	100	65.404	Esox_lucius
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.982	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSORLG00015011872	ctif	96	56.355	ENSFALG00000008943	CTIF	98	55.907	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.151	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	55.573	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015011872	ctif	100	77.292	ENSFHEG00000004334	ctif	100	77.292	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015011872	ctif	89	89.583	ENSGALG00000035912	-	98	89.583	Gallus_gallus
ENSORLG00015011872	ctif	92	84.746	ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	Gambusia_affinis
ENSORLG00015011872	ctif	67	54.722	ENSGAGG00000020663	CTIF	92	55.867	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.822	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	56.340	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015011872	ctif	100	80.085	ENSHBUG00000018092	ctif	100	80.512	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.913	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	56.320	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.752	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	56.160	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015011872	ctif	99	64.484	ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.696	Hippocampus_comes
ENSORLG00015011872	ctif	99	65.634	ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.566	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.097	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	56.508	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.861	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	57.305	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015011872	ctif	100	77.548	ENSKMAG00000014651	ctif	100	78.434	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015011872	ctif	91	93.220	ENSLBEG00000018277	ctif	99	93.220	Labrus_bergylta
ENSORLG00015011872	ctif	99	64.526	ENSLOCG00000011697	ctif	100	63.824	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015011872	ctif	99	49.163	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.379	Loxodonta_africana
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.913	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	56.361	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.913	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	56.361	Macaca_mulatta
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.913	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	56.361	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.731	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	56.180	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015011872	ctif	100	80.178	ENSMAMG00000014741	ctif	100	80.621	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015011872	ctif	91	77.570	ENSMZEG00005019767	ctif	92	78.037	Maylandia_zebra
ENSORLG00015011872	ctif	88	42.754	ENSMGAG00000001378	CTIF	61	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.960	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	56.369	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.866	ENSMICG00000010167	CTIF	100	56.501	Microcebus_murinus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.792	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	57.236	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015011872	ctif	100	76.156	ENSMMOG00000000831	ctif	100	76.156	Mola_mola
ENSORLG00015011872	ctif	99	55.868	ENSMODG00000003464	CTIF	100	55.246	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015011872	ctif	84	67.976	ENSMALG00000020553	ctif	94	94.118	Monopterus_albus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.075	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	55.538	Mus_caroli
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.495	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.956	Mus_musculus
ENSORLG00015011872	ctif	99	58.320	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	57.767	Mus_pahari
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.182	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.891	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	56.340	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.431	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	55.949	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.903	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	57.351	Nannospalax_galili
ENSORLG00015011872	ctif	100	79.586	ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.030	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.731	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	56.180	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015011872	ctif	99	50.958	ENSMEUG00000000218	CTIF	86	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.522	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	55.968	Ochotona_princeps
ENSORLG00015011872	ctif	99	55.659	ENSODEG00000018390	CTIF	100	55.008	Octodon_degus
ENSORLG00015011872	ctif	99	75.164	ENSONIG00000007750	ctif	100	74.513	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015011872	ctif	84	49.150	ENSOANG00000001337	CTIF	99	49.342	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.640	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	56.190	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015011872	ctif	100	98.283	ENSORLG00000005786	ctif	100	98.283	Oryzias_latipes
ENSORLG00015011872	ctif	100	98.273	ENSORLG00020005385	ctif	100	98.273	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015011872	ctif	100	93.123	ENSOMEG00000007917	ctif	100	93.123	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.752	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	56.109	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.981	ENSOARG00000003754	CTIF	100	56.361	Ovis_aries
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.891	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	56.340	Pan_paniscus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.640	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	56.090	Panthera_pardus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.800	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	56.121	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.891	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	56.340	Pan_troglodytes
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.731	ENSPANG00000017087	CTIF	99	56.180	Papio_anubis
ENSORLG00015011872	ctif	84	58.893	ENSPKIG00000011234	ctif	99	59.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015011872	ctif	88	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015011872	ctif	100	69.559	ENSPMGG00000022958	ctif	100	69.417	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.120	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	56.640	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015011872	ctif	74	56.222	ENSPCIG00000026247	CTIF	82	67.636	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015011872	ctif	100	76.587	ENSPFOG00000009243	ctif	100	76.587	Poecilia_formosa
ENSORLG00015011872	ctif	100	76.728	ENSPLAG00000019171	ctif	100	76.728	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015011872	ctif	100	76.728	ENSPMEG00000020089	ctif	100	76.728	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015011872	ctif	100	74.929	ENSPREG00000017326	ctif	100	74.929	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015011872	ctif	84	55.955	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.102	Pongo_abelii
ENSORLG00015011872	ctif	99	54.675	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	54.101	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.484	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	56.894	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015011872	ctif	100	80.085	ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.512	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015011872	ctif	99	67.382	ENSPNAG00000029174	ctif	100	66.953	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015011872	ctif	99	58.958	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.401	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.800	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	56.250	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.640	ENSRROG00000006039	CTIF	99	56.090	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015011872	ctif	89	86.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	98	86.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015011872	ctif	99	55.887	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	54.934	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015011872	ctif	99	65.727	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.630	Scleropages_formosus
ENSORLG00015011872	ctif	100	79.025	ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.832	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015011872	ctif	100	90.476	ENSSDUG00000016033	ctif	94	90.476	Seriola_dumerili
ENSORLG00015011872	ctif	100	68.041	ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.866	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015011872	ctif	99	58.185	ENSSPUG00000014734	CTIF	93	89.583	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015011872	ctif	100	78.833	ENSSPAG00000003721	ctif	100	79.167	Stegastes_partitus
ENSORLG00015011872	ctif	99	56.844	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	56.200	Sus_scrofa
ENSORLG00015011872	ctif	99	52.422	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	54.930	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015011872	ctif	58	69.364	ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.364	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015011872	ctif	99	67.216	ENSTNIG00000018763	ctif	100	67.049	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015011872	ctif	82	66.250	ENSTBEG00000002613	CTIF	78	66.250	Tupaia_belangeri
ENSORLG00015011872	ctif	99	54.254	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	53.662	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015011872	ctif	85	52.514	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	51.866	Ursus_americanus
ENSORLG00015011872	ctif	99	57.235	ENSUMAG00000002735	CTIF	98	87.500	Ursus_maritimus
ENSORLG00015011872	ctif	52	62.651	ENSVPAG00000001497	-	60	62.651	Vicugna_pacos
ENSORLG00015011872	ctif	97	56.250	ENSVVUG00000014347	CTIF	98	85.417	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015011872	ctif	97	45.524	ENSXETG00000026836	ctif	72	69.084	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015011872	ctif	68	69.007	ENSXCOG00000002477	ctif	98	69.683	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015011872	ctif	100	75.710	ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.847	Xiphophorus_maculatus