EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015012437 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22943 bases
Position: chr22:19882293-19905235
Accession: 101159398
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015011607	NRDE-2	PF08424.10	1.8e-101	1	1
ENSORLP00015011583	NRDE-2	PF08424.10	1.9e-101	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015018470	-	3957	XM_020713690	ENSORLP00015011583	1198 (aa)	XP_020569349	-
ENSORLT00015018499	-	4141	-	ENSORLP00015011607	1150 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015012437's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015012437's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.919	ENSG00000119720	NRDE2	100	68.137	Homo_sapiens
ENSORLG00015012437	nrde2	100	73.134	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	72.682	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.644	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	45.033	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015012437	nrde2	96	71.249	ENSACIG00000014783	nrde2	100	69.558	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	72.185	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	73.300	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015012437	nrde2	100	72.103	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	73.217	Amphiprion_percula
ENSORLG00015012437	nrde2	100	71.002	ENSATEG00000010247	nrde2	99	70.091	Anabas_testudineus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.297	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	45.620	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.235	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	43.689	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015012437	nrde2	99	43.010	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	42.157	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015012437	nrde2	100	71.026	ENSACLG00000025154	nrde2	100	71.192	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015012437	nrde2	84	69.767	ENSAMXG00000034642	nrde2	92	50.119	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.207	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	45.911	Bos_taurus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.252	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	44.563	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	43.022	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.466	Canis_familiaris
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.135	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	45.093	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.280	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	44.454	Capra_hircus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.574	ENSTSYG00000000161	NRDE2	87	47.911	Carlito_syrichta
ENSORLG00015012437	nrde2	96	46.589	ENSCAPG00000012039	NRDE2	88	48.138	Cavia_aperea
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.342	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	45.306	Cavia_porcellus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.215	ENSCCAG00000024917	NRDE2	89	46.375	Cebus_capucinus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.811	ENSCLAG00000015185	NRDE2	87	47.530	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.881	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	44.971	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015012437	nrde2	74	45.667	ENSCHOG00000006165	NRDE2	63	60.526	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015012437	nrde2	99	43.528	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	45.052	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.425	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	45.217	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.082	ENSCGRG00001015658	Nrde2	88	47.189	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.440	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	44.870	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015012437	nrde2	97	64.127	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	66.491	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015012437	nrde2	100	69.843	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	69.925	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	54.177	ENSDARG00000074726	nrde2	100	53.681	Danio_rerio
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.358	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	45.558	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015012437	nrde2	81	47.650	ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.937	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015012437	nrde2	67	49.091	ENSETEG00000000198	NRDE2	65	49.091	Echinops_telfairi
ENSORLG00015012437	nrde2	99	38.376	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	38.160	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.164	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	44.951	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.298	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	44.951	Equus_caballus
ENSORLG00015012437	nrde2	65	57.143	ENSEEUG00000004026	-	74	57.143	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	56.898	ENSELUG00000005973	nrde2	100	56.898	Esox_lucius
ENSORLG00015012437	nrde2	100	45.240	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	45.240	Felis_catus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	46.248	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	45.759	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.975	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	44.780	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015012437	nrde2	100	70.438	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	70.685	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015012437	nrde2	67	70.062	ENSGMOG00000015815	nrde2	91	69.979	Gadus_morhua
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.789	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	45.269	Gallus_gallus
ENSORLG00015012437	nrde2	96	67.655	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	71.550	Gambusia_affinis
ENSORLG00015012437	nrde2	100	68.092	ENSGACG00000012619	nrde2	100	68.174	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.033	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	45.323	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.768	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	44.951	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015012437	nrde2	100	71.026	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	71.358	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.747	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	45.484	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015012437	nrde2	97	45.714	ENSHGLG00100017736	NRDE2	90	47.901	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015012437	nrde2	96	62.376	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	62.795	Hippocampus_comes
ENSORLG00015012437	nrde2	100	49.299	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	48.969	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	43.765	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	44.608	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.508	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	45.447	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	70.968	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	71.878	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015012437	nrde2	95	69.120	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	68.117	Labrus_bergylta
ENSORLG00015012437	nrde2	74	49.766	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.766	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015012437	nrde2	100	52.727	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	53.058	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015012437	nrde2	98	45.782	ENSLAFG00000004966	NRDE2	89	47.717	Loxodonta_africana
ENSORLG00015012437	nrde2	83	47.619	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	67.647	Macaca_mulatta
ENSORLG00015012437	nrde2	100	70.954	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	70.954	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	71.026	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	71.275	Maylandia_zebra
ENSORLG00015012437	nrde2	90	46.800	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	46.800	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.609	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	44.988	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.792	ENSMICG00000016741	NRDE2	88	48.111	Microcebus_murinus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	43.745	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	43.415	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015012437	nrde2	76	67.230	ENSMMOG00000004703	nrde2	92	67.230	Mola_mola
ENSORLG00015012437	nrde2	94	44.115	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	47.024	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015012437	nrde2	95	68.000	ENSMALG00000021869	nrde2	99	67.476	Monopterus_albus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.435	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	47.858	Mus_caroli
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.805	ENSMUSG00000021179	Nrde2	86	48.093	Mus_musculus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.417	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.041	Mus_pahari
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.098	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	89	66.667	Mus_spretus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.261	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	44.399	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.198	ENSMLUG00000007484	NRDE2	87	47.020	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.180	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	44.662	Nannospalax_galili
ENSORLG00015012437	nrde2	96	69.265	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	70.340	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015012437	nrde2	97	45.017	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	43.872	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015012437	nrde2	77	48.617	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.617	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015012437	nrde2	61	56.842	ENSOPRG00000001375	-	60	61.386	Ochotona_princeps
ENSORLG00015012437	nrde2	97	43.786	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	46.654	Octodon_degus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	69.687	ENSONIG00000019512	nrde2	100	69.687	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.545	ENSOCUG00000010083	NRDE2	87	48.186	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	90.191	ENSORLG00000017730	nrde2	100	92.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00015012437	nrde2	100	98.000	ENSORLG00020015965	nrde2	100	98.000	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015012437	nrde2	100	86.462	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	87.126	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.761	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	45.269	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015012437	nrde2	97	43.445	ENSOARG00000003475	NRDE2	88	45.549	Ovis_aries
ENSORLG00015012437	nrde2	97	45.823	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	48.891	Pan_paniscus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	45.240	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	45.240	Panthera_pardus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	45.484	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	45.484	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.875	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	45.098	Pan_troglodytes
ENSORLG00015012437	nrde2	100	49.836	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	49.959	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.182	ENSPSIG00000005588	NRDE2	100	44.489	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015012437	nrde2	96	63.555	ENSPMGG00000024089	nrde2	99	62.034	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.426	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	48.369	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015012437	nrde2	52	42.730	ENSPMAG00000003270	-	99	44.245	Petromyzon_marinus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.603	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.521	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	68.261	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	68.673	Poecilia_formosa
ENSORLG00015012437	nrde2	100	69.827	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	70.239	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015012437	nrde2	100	69.655	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	70.066	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015012437	nrde2	100	70.123	ENSPREG00000009066	nrde2	99	70.535	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015012437	nrde2	89	46.004	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	46.435	Pongo_abelii
ENSORLG00015012437	nrde2	71	64.615	ENSPCAG00000016399	NRDE2	69	64.615	Procavia_capensis
ENSORLG00015012437	nrde2	95	44.540	ENSPCOG00000024684	NRDE2	87	46.798	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015012437	nrde2	97	42.237	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	41.206	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	69.748	ENSPNYG00000022833	nrde2	97	73.122	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015012437	nrde2	96	53.237	ENSPNAG00000015807	nrde2	95	53.309	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015012437	nrde2	91	43.599	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	43.011	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.169	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	44.971	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015012437	nrde2	99	45.492	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	45.240	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015012437	nrde2	100	51.518	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.764	Scleropages_formosus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	68.564	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	68.724	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	72.832	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	72.254	Seriola_dumerili
ENSORLG00015012437	nrde2	91	75.124	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	84.848	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015012437	nrde2	96	46.990	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	47.782	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	70.367	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	71.656	Stegastes_partitus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.926	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	44.839	Sus_scrofa
ENSORLG00015012437	nrde2	98	46.333	ENSTGUG00000012462	-	99	45.833	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015012437	nrde2	82	66.772	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	65.823	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015012437	nrde2	89	50.219	ENSTBEG00000011834	NRDE2	83	51.481	Tupaia_belangeri
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.180	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	44.346	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015012437	nrde2	93	45.604	ENSUAMG00000004159	NRDE2	93	46.406	Ursus_americanus
ENSORLG00015012437	nrde2	95	42.679	ENSUMAG00000006393	NRDE2	96	44.261	Ursus_maritimus
ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.643	ENSVVUG00000018202	NRDE2	87	47.475	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015012437	nrde2	97	43.528	ENSXETG00000015708	nrde2	100	42.787	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015012437	nrde2	96	66.816	ENSXCOG00000013298	nrde2	96	67.212	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015012437	nrde2	100	70.173	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	70.583	Xiphophorus_maculatus