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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSORLG00015014447 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9698 bases
Position: chr19:7515704-7525401
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015030634	eRF1_2	PF03464.15	1.9e-33	1	1
ENSORLP00015030619	eRF1_2	PF03464.15	2e-33	1	1
ENSORLP00015030660	eRF1_2	PF03464.15	2.2e-33	1	1
ENSORLP00015030634	eRF1_3	PF03465.15	6.6e-26	1	1
ENSORLP00015030660	eRF1_3	PF03465.15	7e-26	1	1
ENSORLP00015030619	eRF1_1	PF03463.15	1.8e-51	1	1
ENSORLP00015030660	eRF1_1	PF03463.15	1.9e-51	1	1
ENSORLP00015030634	eRF1_1	PF03463.15	4.7e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015020972	-	1056	-	ENSORLP00015030619	351 (aa)	-	-
ENSORLT00015033110	-	2661	-	ENSORLP00015030634	360 (aa)	-	-
ENSORLT00015033118	-	2592	-	ENSORLP00015030660	385 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSG00000152684	PELO	100	81.558	Homo_sapiens
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015014447	pelo	70	91.093	ENSAPOG00000023700	-	90	91.093	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015014447	pelo	70	91.093	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.093	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015014447	pelo	97	87.131	ENSACIG00000014386	pelo	97	92.899	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015014447	pelo	100	92.222	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.208	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015014447	pelo	100	92.222	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.208	Amphiprion_percula
ENSORLG00015014447	pelo	100	92.727	ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	Anabas_testudineus
ENSORLG00015014447	pelo	83	72.483	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.483	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015014447	pelo	97	81.067	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.519	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.558	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.130	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015014447	pelo	97	91.153	ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.674	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	Bos_taurus
ENSORLG00015014447	pelo	100	59.722	WBGene00011280	pelo-1	100	59.580	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.818	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.039	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	Capra_hircus
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.078	Carlito_syrichta
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.818	Cavia_porcellus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.818	Cebus_capucinus
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSCATG00000011829	PELO	100	82.078	Cercocebus_atys
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSCSAG00000016692	PELO	100	82.078	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSCHOG00000000523	PELO	100	81.558	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015014447	pelo	97	82.133	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.558	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015014447	pelo	97	63.793	ENSCING00000001979	-	100	63.377	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015014447	pelo	100	65.278	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.195	Ciona_savignyi
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSCANG00000023382	PELO	100	82.078	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015014447	pelo	97	81.322	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.299	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015014447	pelo	97	82.184	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.078	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.948	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.948	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015014447	pelo	100	88.889	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	Danio_rerio
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.667	ENSDNOG00000036721	PELO	100	79.275	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.078	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015014447	pelo	96	69.275	FBgn0011207	pelo	97	67.624	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015014447	pelo	74	76.048	ENSEBUG00000004955	pelo	99	76.023	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.299	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	Esox_lucius
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.558	Felis_catus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.389	ENSFALG00000004559	PELO	100	81.299	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015014447	pelo	81	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.390	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.390	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015014447	pelo	98	89.125	ENSGMOG00000005849	pelo	100	89.091	Gadus_morhua
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.390	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.390	Gambusia_affinis
ENSORLG00015014447	pelo	100	93.889	ENSGACG00000007245	pelo	100	93.766	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015014447	pelo	97	81.867	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.299	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSGGOG00000012635	PELO	100	82.078	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.130	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.818	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015014447	pelo	100	80.260	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015014447	pelo	100	89.444	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	Hippocampus_comes
ENSORLG00015014447	pelo	100	87.500	ENSIPUG00000020627	pelo	100	87.273	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015014447	pelo	100	79.221	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	79.221	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015014447	pelo	100	93.333	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.987	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.558	Loxodonta_africana
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSMFAG00000000651	PELO	100	82.078	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSMMUG00000039101	PELO	100	82.078	Macaca_mulatta
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSMNEG00000035538	PELO	100	82.078	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSMLEG00000039113	PELO	100	82.078	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015014447	pelo	97	94.638	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.130	Maylandia_zebra
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	81.299	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.818	Microcebus_murinus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.818	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.909	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.909	Mola_mola
ENSORLG00015014447	pelo	100	92.222	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.299	Mus_caroli
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	81.299	Mus_musculus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	81.558	Mus_pahari
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	81.299	Mus_spretus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.039	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.039	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	82.078	Nannospalax_galili
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.130	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSNLEG00000035970	PELO	100	82.078	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.389	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.260	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015014447	pelo	98	81.003	ENSOPRG00000018793	PELO	100	81.003	Ochotona_princeps
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.299	Octodon_degus
ENSORLG00015014447	pelo	96	91.105	ENSONIG00000011511	pelo	100	90.909	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015014447	pelo	100	98.701	ENSORLG00000005827	pelo	100	98.701	Oryzias_latipes
ENSORLG00015014447	pelo	100	98.961	ENSORLG00020016456	pelo	100	98.961	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015014447	pelo	100	96.883	ENSOMEG00000021567	pelo	100	96.883	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.338	ENSOGAG00000027940	PELO	100	82.338	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.299	Ovis_aries
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSPPAG00000038951	PELO	100	82.078	Pan_paniscus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.558	Panthera_pardus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.558	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.818	Pan_troglodytes
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSPANG00000010902	PELO	100	82.078	Papio_anubis
ENSORLG00015014447	pelo	100	89.167	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015014447	pelo	97	82.000	ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.299	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015014447	pelo	74	89.535	ENSPMGG00000014561	pelo	95	89.535	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.558	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015014447	pelo	100	80.779	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.779	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.688	Poecilia_formosa
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.688	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.688	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015014447	pelo	97	82.306	ENSPPYG00000015451	PELO	96	82.078	Pongo_abelii
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.818	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.130	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015014447	pelo	97	89.812	ENSPNAG00000012458	pelo	99	88.571	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	81.818	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSRBIG00000007299	PELO	100	82.078	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	ENSRROG00000035507	PELO	100	82.078	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015014447	pelo	97	33.158	YNL001W	-	97	33.158	Saccharomyces_cerevisiae
ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.558	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSORLG00015014447	pelo	86	77.742	ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015014447	pelo	100	92.208	ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.208	Xiphophorus_maculatus