EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015014665 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9780 bases
Position: chr22:17223855-17233634
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015030793	SYF2	PF08231.12	2.3e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015021304	-	4307	-	ENSORLP00015030793	238 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015014665's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015014665's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSG00000117614	SYF2	90	82.569	Homo_sapiens
ENSORLG00015014665	syf2	100	89.076	ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015014665	syf2	81	83.854	ENSAMEG00000010134	-	98	83.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015014665	syf2	99	75.934	ENSAMEG00000010115	-	99	75.934	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015014665	syf2	97	90.086	ENSACIG00000023688	syf2	93	90.086	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015014665	syf2	93	87.783	ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015014665	syf2	100	88.655	ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.655	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015014665	syf2	100	88.655	ENSAPEG00000018858	syf2	92	88.655	Amphiprion_percula
ENSORLG00015014665	syf2	91	92.627	ENSATEG00000007745	syf2	100	87.815	Anabas_testudineus
ENSORLG00015014665	syf2	84	85.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015014665	syf2	86	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015014665	syf2	70	70.659	ENSACAG00000026777	-	100	70.659	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	ENSANAG00000032473	SYF2	99	77.083	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015014665	syf2	100	89.496	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.496	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015014665	syf2	100	82.008	ENSAMXG00000004051	syf2	100	82.008	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.028	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.028	Bos_taurus
ENSORLG00015014665	syf2	87	53.333	WBGene00019402	syf-2	90	52.607	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.028	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	ENSCAFG00000012895	-	93	78.603	Canis_familiaris
ENSORLG00015014665	syf2	98	73.504	ENSCAFG00000030331	-	97	73.504	Canis_familiaris
ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	ENSCAFG00020021091	-	93	78.603	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015014665	syf2	76	74.176	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	82.569	Capra_hircus
ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	ENSTSYG00000005114	SYF2	89	82.407	Carlito_syrichta
ENSORLG00015014665	syf2	83	82.828	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	Cavia_aperea
ENSORLG00015014665	syf2	99	77.273	ENSCPOG00000005326	SYF2	99	77.273	Cavia_porcellus
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	77.083	Cebus_capucinus
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSCATG00000026917	SYF2	99	76.250	Cercocebus_atys
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.486	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	76.250	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015014665	syf2	70	62.275	ENSCHOG00000005273	-	92	62.275	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSCPBG00000025073	SYF2	98	77.686	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015014665	syf2	89	54.460	ENSCING00000003017	-	89	54.930	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015014665	syf2	89	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSORLG00015014665	syf2	100	67.083	ENSCANG00000037322	SYF2	99	67.083	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015014665	syf2	99	77.917	ENSCGRG00001020733	Syf2	99	77.917	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015014665	syf2	82	83.163	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.915	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015014665	syf2	92	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	97	85.345	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015014665	syf2	94	92.377	ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.540	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015014665	syf2	100	81.092	ENSDARG00000004706	syf2	100	81.092	Danio_rerio
ENSORLG00015014665	syf2	98	77.637	ENSDNOG00000047605	SYF2	97	77.637	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015014665	syf2	98	77.917	ENSDORG00000001274	Syf2	98	77.917	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015014665	syf2	90	56.019	FBgn0033556	CG12343	94	56.019	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015014665	syf2	94	64.574	ENSETEG00000015729	SYF2	96	64.574	Echinops_telfairi
ENSORLG00015014665	syf2	83	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015014665	syf2	100	68.182	ENSEASG00005004232	-	100	68.182	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSEASG00005004224	-	89	83.486	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSECAG00000010440	-	91	83.486	Equus_caballus
ENSORLG00015014665	syf2	100	78.151	ENSECAG00000012023	-	96	78.151	Equus_caballus
ENSORLG00015014665	syf2	73	67.045	ENSEEUG00000015084	SYF2	96	67.045	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015014665	syf2	100	81.933	ENSELUG00000003465	syf2	100	81.933	Esox_lucius
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSFCAG00000010324	-	75	83.486	Felis_catus
ENSORLG00015014665	syf2	96	78.879	ENSFCAG00000043095	-	94	78.879	Felis_catus
ENSORLG00015014665	syf2	86	83.333	ENSFALG00000000460	SYF2	94	78.788	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015014665	syf2	99	77.178	ENSFDAG00000008310	SYF2	99	77.178	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015014665	syf2	95	76.549	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.549	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015014665	syf2	90	87.907	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	Gadus_morhua
ENSORLG00015014665	syf2	94	82.743	ENSGALG00000013639	SYF2	90	82.743	Gallus_gallus
ENSORLG00015014665	syf2	100	89.076	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	Gambusia_affinis
ENSORLG00015014665	syf2	93	92.793	ENSGACG00000007305	syf2	100	89.167	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.945	ENSGAGG00000010670	SYF2	98	78.099	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	82.569	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015014665	syf2	100	89.496	ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.517	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015014665	syf2	91	73.611	ENSHGLG00000004304	-	90	74.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.028	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.028	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015014665	syf2	100	85.714	ENSHCOG00000012904	syf2	78	85.714	Hippocampus_comes
ENSORLG00015014665	syf2	100	83.682	ENSIPUG00000019859	syf2	100	83.682	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015014665	syf2	61	77.397	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015014665	syf2	84	83.417	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015014665	syf2	100	90.756	ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015014665	syf2	91	94.470	ENSLBEG00000014425	syf2	100	88.655	Labrus_bergylta
ENSORLG00015014665	syf2	92	80.909	ENSLACG00000012064	SYF2	92	80.909	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015014665	syf2	100	82.353	ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015014665	syf2	77	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSORLG00015014665	syf2	93	81.532	ENSLAFG00000023150	-	91	81.532	Loxodonta_africana
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	76.250	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	81.651	Macaca_mulatta
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	76.250	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	76.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015014665	syf2	91	92.627	ENSMAMG00000010403	syf2	98	87.395	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015014665	syf2	100	89.076	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.076	Maylandia_zebra
ENSORLG00015014665	syf2	84	85.427	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015014665	syf2	99	78.750	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	78.750	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015014665	syf2	84	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSORLG00015014665	syf2	99	78.750	ENSMOCG00000022938	Syf2	99	78.750	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015014665	syf2	95	88.000	ENSMMOG00000002396	syf2	94	88.000	Mola_mola
ENSORLG00015014665	syf2	92	77.727	ENSMODG00000013951	-	96	77.727	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015014665	syf2	100	85.892	ENSMALG00000010706	syf2	100	86.307	Monopterus_albus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	83.486	Mus_caroli
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	83.486	Mus_musculus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	83.486	Mus_pahari
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	83.486	Mus_spretus
ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	ENSMPUG00000015801	-	89	82.569	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	ENSMPUG00000015802	-	89	81.651	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015014665	syf2	100	78.151	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.151	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015014665	syf2	99	75.820	ENSNGAG00000007912	Syf2	99	75.820	Nannospalax_galili
ENSORLG00015014665	syf2	100	80.165	ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.165	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	82.569	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015014665	syf2	99	76.763	ENSOPRG00000012870	SYF2	99	76.763	Ochotona_princeps
ENSORLG00015014665	syf2	92	72.018	ENSODEG00000014338	-	90	72.018	Octodon_degus
ENSORLG00015014665	syf2	97	77.311	ENSODEG00000017664	-	100	77.311	Octodon_degus
ENSORLG00015014665	syf2	100	88.655	ENSONIG00000008213	syf2	100	88.655	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015014665	syf2	85	82.673	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	ENSOCUG00000013050	SYF2	89	83.028	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015014665	syf2	97	98.712	ENSORLG00000028820	syf2	100	98.712	Oryzias_latipes
ENSORLG00015014665	syf2	100	99.160	ENSORLG00020018333	syf2	100	99.160	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015014665	syf2	100	94.118	ENSOMEG00000013911	syf2	100	94.118	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	82.569	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015014665	syf2	82	55.897	ENSOARG00000006269	-	100	55.897	Ovis_aries
ENSORLG00015014665	syf2	92	81.818	ENSOARG00000006348	-	89	81.818	Ovis_aries
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	82.569	Pan_paniscus
ENSORLG00015014665	syf2	96	78.879	ENSPPRG00000001651	-	94	78.879	Panthera_pardus
ENSORLG00015014665	syf2	96	79.741	ENSPPRG00000001638	-	94	79.741	Panthera_pardus
ENSORLG00015014665	syf2	99	77.686	ENSPTIG00000005711	-	88	77.686	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015014665	syf2	96	78.879	ENSPTIG00000007036	-	94	78.879	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	82.569	Pan_troglodytes
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSPANG00000008139	SYF2	99	76.250	Papio_anubis
ENSORLG00015014665	syf2	100	81.933	ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.933	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015014665	syf2	97	77.872	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	77.872	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015014665	syf2	93	88.235	ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.235	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015014665	syf2	99	78.333	ENSPEMG00000008283	Syf2	99	78.333	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015014665	syf2	93	81.982	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	81.982	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015014665	syf2	96	90.393	ENSPFOG00000004116	syf2	95	90.393	Poecilia_formosa
ENSORLG00015014665	syf2	99	88.936	ENSPLAG00000006691	syf2	98	90.830	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015014665	syf2	100	85.294	ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.837	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015014665	syf2	91	93.519	ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	82.569	Pongo_abelii
ENSORLG00015014665	syf2	99	52.697	ENSPCOG00000027011	SYF2	99	52.697	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015014665	syf2	99	70.339	ENSPVAG00000005841	SYF2	96	69.748	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015014665	syf2	100	89.496	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.496	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015014665	syf2	100	81.513	ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.513	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	83.486	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015014665	syf2	100	74.167	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	74.167	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	ENSRROG00000001347	SYF2	99	76.250	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	76.667	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015014665	syf2	93	80.631	ENSSHAG00000015630	-	89	80.631	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015014665	syf2	86	83.010	ENSSHAG00000007152	-	100	83.010	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015014665	syf2	98	81.116	ENSSFOG00015023647	syf2	98	81.116	Scleropages_formosus
ENSORLG00015014665	syf2	100	85.294	ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.294	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015014665	syf2	92	93.119	ENSSDUG00000013072	syf2	100	87.815	Seriola_dumerili
ENSORLG00015014665	syf2	92	93.119	ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015014665	syf2	96	61.638	ENSSARG00000012889	SYF2	97	61.181	Sorex_araneus
ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.486	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015014665	syf2	100	88.235	ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.235	Stegastes_partitus
ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	82.569	Sus_scrofa
ENSORLG00015014665	syf2	63	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	54.706	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015014665	syf2	100	84.232	ENSTRUG00000001499	syf2	94	85.106	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015014665	syf2	93	86.486	ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.486	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015014665	syf2	92	61.009	ENSTBEG00000017370	SYF2	87	61.009	Tupaia_belangeri
ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	ENSTTRG00000003550	SYF2	97	77.637	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015014665	syf2	92	81.651	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.651	Ursus_americanus
ENSORLG00015014665	syf2	91	81.944	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.193	Ursus_maritimus
ENSORLG00015014665	syf2	96	76.763	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	76.763	Vicugna_pacos
ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	ENSVVUG00000027175	-	93	78.603	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015014665	syf2	86	82.439	ENSVVUG00000027181	-	94	78.017	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015014665	syf2	98	76.824	ENSXETG00000022797	syf2	94	76.824	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015014665	syf2	100	87.815	ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.815	Xiphophorus_maculatus