EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015017702 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1790 bases
Position: chr16:18341096-18342885
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015032723	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	3.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015025134	-	937	-	ENSORLP00015032723	288 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015017702	rpp38	90	40.000	ENSG00000152464	RPP38	88	45.946	Homo_sapiens
ENSORLG00015017702	rpp38	92	62.774	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	62.132	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.343	ENSAMEG00000018832	RPP38	89	42.692	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015017702	rpp38	89	73.077	ENSACIG00000011592	rpp38	94	71.154	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	61.806	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	61.189	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015017702	rpp38	92	65.683	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	65.056	Amphiprion_percula
ENSORLG00015017702	rpp38	92	67.041	ENSATEG00000000731	rpp38	95	65.637	Anabas_testudineus
ENSORLG00015017702	rpp38	86	45.136	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	45.349	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015017702	rpp38	92	68.302	ENSACLG00000016962	rpp38	96	69.173	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015017702	rpp38	92	67.925	ENSACLG00000016958	rpp38	96	68.797	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015017702	rpp38	86	45.490	ENSAMXG00000025023	rpp38	91	45.833	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	42.807	ENSBTAG00000007702	RPP38	88	45.174	Bos_taurus
ENSORLG00015017702	rpp38	90	45.185	ENSCAFG00000024373	RPP38	89	45.000	Canis_familiaris
ENSORLG00015017702	rpp38	90	45.185	ENSCAFG00020008008	RPP38	89	45.000	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015017702	rpp38	89	43.704	ENSCHIG00000012484	RPP38	88	44.788	Capra_hircus
ENSORLG00015017702	rpp38	96	40.767	ENSCPOG00000003981	RPP38	95	41.637	Cavia_porcellus
ENSORLG00015017702	rpp38	91	41.758	ENSCLAG00000010194	RPP38	89	42.529	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015017702	rpp38	84	40.392	ENSCSAG00000019055	RPP38	88	41.313	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015017702	rpp38	90	44.485	ENSCHOG00000004335	RPP38	89	44.444	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.772	ENSCGRG00001001395	Rpp38	92	42.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.772	ENSCGRG00000017441	Rpp38	92	42.803	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015017702	rpp38	92	59.480	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	59.551	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015017702	rpp38	92	60.806	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.905	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	50.365	ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.368	Danio_rerio
ENSORLG00015017702	rpp38	93	42.199	ENSDNOG00000040314	RPP38	89	42.537	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	39.789	ENSDORG00000009783	Rpp38	93	41.353	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015017702	rpp38	90	42.279	ENSETEG00000002839	RPP38	88	42.126	Echinops_telfairi
ENSORLG00015017702	rpp38	94	41.404	ENSEASG00005019783	RPP38	88	41.729	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	39.249	ENSEEUG00000014677	RPP38	89	40.149	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	53.082	ENSELUG00000010160	rpp38	97	51.027	Esox_lucius
ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.696	ENSFCAG00000022449	RPP38	89	41.538	Felis_catus
ENSORLG00015017702	rpp38	86	47.490	ENSFALG00000014804	RPP38	88	45.349	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015017702	rpp38	91	42.491	ENSFDAG00000018669	RPP38	89	41.762	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015017702	rpp38	92	63.538	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	64.260	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015017702	rpp38	87	45.736	ENSGALG00000008794	RPP38	86	44.961	Gallus_gallus
ENSORLG00015017702	rpp38	56	74.375	ENSGACG00000009258	rpp38	99	74.375	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	67.925	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	68.797	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015017702	rpp38	91	43.571	ENSHGLG00000012144	RPP38	89	42.586	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015017702	rpp38	86	44.622	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.744	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	40.636	ENSSTOG00000025699	RPP38	86	41.887	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	42.308	ENSJJAG00000007523	Rpp38	93	42.751	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015017702	rpp38	88	63.462	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	63.462	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015017702	rpp38	94	69.091	ENSLBEG00000006853	rpp38	97	67.286	Labrus_bergylta
ENSORLG00015017702	rpp38	85	43.284	ENSLACG00000006502	RPP38	62	50.811	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015017702	rpp38	90	45.985	ENSLOCG00000018347	rpp38	90	46.642	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015017702	rpp38	90	42.751	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	43.411	Loxodonta_africana
ENSORLG00015017702	rpp38	84	40.000	ENSMMUG00000007679	RPP38	88	40.927	Macaca_mulatta
ENSORLG00015017702	rpp38	93	66.543	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	65.909	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	68.679	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	69.549	Maylandia_zebra
ENSORLG00015017702	rpp38	92	67.925	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	68.797	Maylandia_zebra
ENSORLG00015017702	rpp38	87	46.899	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	46.512	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00015017702	rpp38	94	42.143	ENSMAUG00000003644	Rpp38	92	42.803	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015017702	rpp38	94	42.553	ENSMOCG00000007020	Rpp38	93	40.741	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015017702	rpp38	93	64.444	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	64.662	Mola_mola
ENSORLG00015017702	rpp38	87	42.188	ENSMODG00000024091	RPP38	90	41.406	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015017702	rpp38	94	63.121	ENSMALG00000002356	rpp38	96	61.594	Monopterus_albus
ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.262	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	93	42.379	Mus_caroli
ENSORLG00015017702	rpp38	94	42.199	ENSMUSG00000049950	Rpp38	93	41.264	Mus_musculus
ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.772	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	93	42.007	Mus_pahari
ENSORLG00015017702	rpp38	94	42.199	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	93	41.264	Mus_spretus
ENSORLG00015017702	rpp38	94	44.211	ENSMPUG00000018523	RPP38	89	45.769	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015017702	rpp38	88	40.299	ENSMLUG00000002153	RPP38	89	42.471	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015017702	rpp38	94	41.696	ENSNGAG00000011066	Rpp38	93	41.852	Nannospalax_galili
ENSORLG00015017702	rpp38	89	69.650	ENSNBRG00000006994	rpp38	94	71.206	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015017702	rpp38	93	68.889	ENSONIG00000020467	rpp38	96	69.259	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015017702	rpp38	89	39.773	ENSOCUG00000022768	-	87	41.270	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015017702	rpp38	89	40.530	ENSOCUG00000024367	-	87	42.063	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015017702	rpp38	97	94.604	ENSORLG00000009219	rpp38	100	94.604	Oryzias_latipes
ENSORLG00015017702	rpp38	100	96.875	ENSORLG00020011503	rpp38	100	96.875	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015017702	rpp38	97	82.500	ENSOMEG00000005414	rpp38	100	82.143	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015017702	rpp38	96	41.216	ENSOGAG00000008059	RPP38	88	43.191	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015017702	rpp38	89	44.074	ENSOARG00000004534	RPP38	88	44.788	Ovis_aries
ENSORLG00015017702	rpp38	99	37.874	ENSPPAG00000041577	RPP38	90	38.176	Pan_paniscus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.297	ENSPPRG00000015329	RPP38	89	42.205	Panthera_pardus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.356	ENSPTIG00000007188	RPP38	89	41.544	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015017702	rpp38	99	37.874	ENSPTRG00000002318	RPP38	90	38.176	Pan_troglodytes
ENSORLG00015017702	rpp38	90	46.014	ENSPKIG00000025652	rpp38	94	45.907	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015017702	rpp38	91	44.238	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	43.462	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.972	ENSPEMG00000008375	Rpp38	93	42.222	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015017702	rpp38	91	45.423	ENSPCIG00000009096	RPP38	85	46.332	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015017702	rpp38	72	61.137	ENSPFOG00000016823	rpp38	94	61.194	Poecilia_formosa
ENSORLG00015017702	rpp38	95	61.131	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	59.341	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015017702	rpp38	92	56.667	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	55.185	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015017702	rpp38	90	63.670	ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.202	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015017702	rpp38	90	40.741	ENSPPYG00000002113	RPP38	88	41.699	Pongo_abelii
ENSORLG00015017702	rpp38	85	41.667	ENSPVAG00000007155	RPP38	89	41.825	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	68.302	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	69.173	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015017702	rpp38	86	47.619	ENSPNAG00000010633	rpp38	91	47.876	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015017702	rpp38	91	45.865	ENSRNOG00000038025	Rpp38	93	45.283	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015017702	rpp38	91	41.901	ENSSHAG00000015529	RPP38	90	42.188	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015017702	rpp38	93	64.312	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	63.498	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	65.530	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	66.415	Seriola_dumerili
ENSORLG00015017702	rpp38	92	65.909	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	66.415	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015017702	rpp38	91	39.080	ENSSARG00000012099	RPP38	87	37.945	Sorex_araneus
ENSORLG00015017702	rpp38	96	42.857	ENSSPUG00000005237	-	94	41.818	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015017702	rpp38	91	41.328	ENSSPUG00000008560	-	90	39.768	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015017702	rpp38	96	43.206	ENSSPUG00000018363	-	95	42.182	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015017702	rpp38	92	63.158	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	62.406	Stegastes_partitus
ENSORLG00015017702	rpp38	89	40.794	ENSSSCG00000027110	RPP38	88	40.230	Sus_scrofa
ENSORLG00015017702	rpp38	86	44.318	ENSTGUG00000001366	RPP38	91	43.411	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015017702	rpp38	94	60.145	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	61.194	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015017702	rpp38	91	44.203	ENSTTRG00000004420	RPP38	88	44.828	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015017702	rpp38	91	42.391	ENSUAMG00000002618	RPP38	89	43.462	Ursus_americanus
ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.554	ENSUMAG00000012382	RPP38	89	43.511	Ursus_maritimus
ENSORLG00015017702	rpp38	90	44.815	ENSVVUG00000005272	RPP38	89	44.615	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015017702	rpp38	92	40.860	ENSXETG00000003419	rpp38	96	40.364	Xenopus_tropicalis