EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015018271 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: -
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 423 bases
Position: chr24:622161-622583
Accession: ZDB-GENE-081110-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015017253	PTH2	PF01981.16	9.3e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015025723	-	354	-	ENSORLP00015017253	117 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015018271's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015018271's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSG00000184924	PTRHD1	83	56.410	Homo_sapiens
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	92	80.342	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	55.556	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.051	ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	82.051	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	92	80.342	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	92	80.342	Amphiprion_percula
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSATEG00000019199	ptrhd1	92	80.342	Anabas_testudineus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSANAG00000019089	PTRHD1	83	56.410	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.906	ENSACLG00000000814	ptrhd1	92	82.906	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	73.276	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	73.276	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	59.829	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	83	59.829	Bos_taurus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	97	48.246	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	44.444	Caenorhabditis_elegans
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	55.556	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	83	55.556	Canis_familiaris
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.974	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	83	58.974	Capra_hircus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	83	55.556	Carlito_syrichta
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	83	56.410	Cavia_porcellus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	83	56.410	Cebus_capucinus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.034	ENSCATG00000033690	PTRHD1	83	56.034	Cercocebus_atys
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	80	56.410	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	83	56.410	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	43.966	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	84	43.966	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	82	55.556	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.759	ENSCING00000019647	-	97	57.759	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCANG00000034444	PTRHD1	83	56.410	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	55	56.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	83	56.410	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	92	81.197	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	92	81.197	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	76.068	ENSDARG00000016122	ptrhd1	92	76.068	Danio_rerio
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	77	55.556	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	54.701	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	83	54.701	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	59.829	FBgn0038446	CG14903	97	59.829	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	44.828	ENSETEG00000009379	-	85	44.828	Echinops_telfairi
ENSORLG00015018271	ptrhd1	50	61.017	ENSETEG00000001615	-	70	61.017	Echinops_telfairi
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	60.345	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	40.678	ENSEASG00005001302	-	82	40.678	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	40.678	ENSECAG00000005314	-	79	40.678	Equus_caballus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSECAG00000017730	PTRHD1	83	56.410	Equus_caballus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	59.829	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	83	59.829	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	74.359	ENSELUG00000003837	ptrhd1	92	74.359	Esox_lucius
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	83	55.556	Felis_catus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.120	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	83	58.120	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	92	80.342	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.034	ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	56.034	Gallus_gallus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	92	81.197	Gambusia_affinis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSGACG00000006743	ptrhd1	91	81.197	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	91	57.265	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	92	55.556	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.051	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	92	82.051	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.120	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	83	58.120	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	83	57.265	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSHGLG00100004341	-	85	56.410	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	91	81.197	Hippocampus_comes
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	73.504	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	73.504	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	83	56.410	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	84	56.410	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	97	80.531	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	80.531	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	92	81.197	Labrus_bergylta
ENSORLG00015018271	ptrhd1	89	70.192	ENSLACG00000018052	PTRHD1	92	65.812	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	75.000	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	90	75.000	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	83	57.265	Loxodonta_africana
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	83	55.556	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	83	55.556	Macaca_mulatta
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	83	55.556	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	54.310	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	83	54.310	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	77.778	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	92	77.778	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.906	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	92	82.906	Maylandia_zebra
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	83	57.265	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.120	ENSMICG00000001578	PTRHD1	83	58.120	Microcebus_murinus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.410	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	79.487	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	92	79.487	Mola_mola
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSMODG00000015895	PTRHD1	85	57.265	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	78.632	ENSMALG00000003471	ptrhd1	92	78.632	Monopterus_albus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	83	55.556	Mus_caroli
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	55.556	Mus_musculus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	83	55.556	Mus_spretus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	83	57.265	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	83	56.410	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	83	57.265	Nannospalax_galili
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.906	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	92	82.906	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	56.410	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015018271	ptrhd1	50	61.017	ENSMEUG00000010482	-	71	61.017	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.120	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	83	58.120	Ochotona_princeps
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSODEG00000007805	PTRHD1	80	55.556	Octodon_degus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.051	ENSONIG00000015722	ptrhd1	85	82.051	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	83	57.265	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	100.000	ENSORLG00000028768	ptrhd1	99	100.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	99.145	ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	99.145	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	94.017	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	91	94.017	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	53.846	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	83	53.846	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.974	ENSOARG00000018052	PTRHD1	83	58.974	Ovis_aries
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	83	56.410	Pan_paniscus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	83	55.556	Panthera_pardus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	83	55.556	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	83	56.410	Pan_troglodytes
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSPANG00000006781	PTRHD1	83	57.265	Papio_anubis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	70.085	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	79	70.085	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	78.632	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	92	78.632	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	89	68.269	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	92	64.957	Petromyzon_marinus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.120	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	58.120	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	79.487	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	82	79.487	Poecilia_formosa
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	79.487	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	92	79.487	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	92	80.342	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	80.342	ENSPREG00000017624	ptrhd1	92	80.342	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	83	56.410	Pongo_abelii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	83	57.265	Procavia_capensis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	83	57.265	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.120	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	83	58.120	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.906	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	92	82.906	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	75.214	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	75.214	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	83	56.410	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	83	56.410	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSRROG00000029627	PTRHD1	83	56.410	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	83	57.265	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	56.410	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	76.068	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	76.068	Scleropages_formosus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	79.487	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	91	79.487	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.051	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	78	82.051	Seriola_dumerili
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.051	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	92	82.051	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	58.974	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	87	58.974	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.906	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	92	82.906	Stegastes_partitus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	84	47.959	ENSSSCG00000040441	-	78	47.959	Sus_scrofa
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	60.684	ENSTGUG00000015169	-	85	60.684	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	77.778	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	92	77.778	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	78.632	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	78.632	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	53.846	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	83	53.846	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	83	56.410	Ursus_americanus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	57.265	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	83	57.265	Vicugna_pacos
ENSORLG00015018271	ptrhd1	88	66.019	ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.931	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	92	81.197	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	81.197	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	92	81.197	Xiphophorus_maculatus