EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015018600 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: si:dkey-86e18.1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 128239 bases
Position: chr4:27672230-27800468
Accession: ZDB-GENE-041014-18
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015017573	Isy1	PF06246.12	1.5e-07	1	1
ENSORLP00015033289	Isy1	PF06246.12	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015034788	-	2620	-	ENSORLP00015017573	306 (aa)	-	-
ENSORLT00015034782	-	2747	-	ENSORLP00015033289	306 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015018600's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015018600's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	57.276	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	57.276	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	54.397	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	54.397	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	56.766	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	56.766	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	57.188	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	57.188	Amphiprion_percula
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	58.117	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	58.117	Anabas_testudineus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	56.376	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	56.678	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	48.397	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	48.397	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	49.201	ENSCSEG00000007482	-	99	49.201	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	57.188	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	57.188	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	46.205	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	46.205	Danio_rerio
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	46.708	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	46.708	Esox_lucius
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	57.929	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	57.929	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	77	66.390	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	66.390	Gambusia_affinis
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	56.376	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	56.678	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	44.737	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	44.737	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	60.000	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	60.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	50.498	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	50.163	Labrus_bergylta
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	39.032	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	39.032	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	44.554	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	46.429	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	55.215	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	55.215	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	56.376	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	56.678	Maylandia_zebra
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	56.209	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	56.209	Mola_mola
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	55.937	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.094	Monopterus_albus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	52.843	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	53.247	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	57.047	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	57.329	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	97.059	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	97.059	Oryzias_latipes
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	95.098	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	95.098	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	80.921	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	80.921	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	41.914	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	99	41.914	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	47.213	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	47.213	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	59.494	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	59.494	Poecilia_formosa
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	59.048	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	59.048	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	58.861	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.861	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	54.575	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	54.575	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	97	56.040	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	56.352	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	46.053	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	46.053	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	99	42.671	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	42.671	Scleropages_formosus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	96	53.292	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	98	53.963	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	59.748	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	59.748	Seriola_dumerili
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	58.621	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	58.621	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	61.146	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	61.146	Stegastes_partitus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	53.094	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	53.746	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	54.248	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	54.248	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	57.372	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	57.372	Xiphophorus_maculatus