EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015019113 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29371 bases
Position: chr12:5163837-5193207
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015033591	IBN_N	PF03810.19	9.7e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015026643	-	6060	-	ENSORLP00015033591	888 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00015019113's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00015019113's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00015019113	tnpo1	56	83.600	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	83.800
ENSORLG00015019113	tnpo1	100	86.374	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	86.374

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.264	Homo_sapiens
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	98.083	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.179	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.291	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015019113	tnpo1	87	97.017	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.017	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	98.083	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	98.083	Amphiprion_percula
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.407	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	97.407	Anabas_testudineus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.177	ENSAPLG00000009619	-	97	89.908	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.799	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.799	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	82.976	ENSANAG00000025351	-	99	82.976	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	57.953	ENSANAG00000027118	-	97	61.353	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.672	ENSANAG00000022453	-	99	92.672	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.716	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	95.716	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	94.376	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	94.151	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.010	Bos_taurus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.785	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	92.999	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.999	Canis_familiaris
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	90.643	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	90.643	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.123	Capra_hircus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.492	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.813	Carlito_syrichta
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.672	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	92.672	Cebus_capucinus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	93.123	Cercocebus_atys
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.785	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.123	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00015019113	tnpo1	94	81.699	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.699	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.799	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.799	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015019113	tnpo1	100	76.484	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.924	Ciona_savignyi
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.123	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.010	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	93.099	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.099	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.378	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	95.378	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.069	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	97.069	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	94.707	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	94.257	Danio_rerio
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	87.416	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.416	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015019113	tnpo1	93	93.253	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.245	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015019113	tnpo1	100	58.380	FBgn0035693	CG8219	99	58.043	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015019113	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSORLG00015019113	tnpo1	95	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.595	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	93.123	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.123	Equus_caballus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	88.743	ENSELUG00000002821	tnpo1	99	88.139	Esox_lucius
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	93.123	Felis_catus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.687	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.687	Ficedula_albicollis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.785	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.297	ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	97.297	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.697	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.697	Gadus_morhua
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.897	ENSGALG00000015014	TNPO1	99	92.897	Gallus_gallus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.963	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	96.963	Gambusia_affinis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.716	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.716	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.799	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.799	Gopherus_agassizii
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	78.065	ENSGGOG00000022535	-	98	78.065	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	93.123	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.520	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	97.520	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	ENSHGLG00000000970	-	99	92.785	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015019113	tnpo1	97	72.558	ENSHGLG00100000963	-	99	71.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	92.757	ENSHGLG00100017090	-	99	92.757	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.236	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	93.236	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.843	ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	96.843	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015019113	tnpo1	91	93.688	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.193	Labrus_bergylta
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	87.209	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.209	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.039	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.039	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	98	92.379	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.379	Loxodonta_africana
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.123	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.010	Macaca_mulatta
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.123	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.123	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	98.083	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.069	ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	97.069	Maylandia_zebra
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	93.010	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.515	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.515	Microcebus_murinus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.010	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015019113	tnpo1	87	96.766	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.766	Mola_mola
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.830	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.830	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.167	ENSMALG00000009782	tnpo1	99	96.167	Monopterus_albus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	99	93.035	Mus_caroli
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	99	93.284	Mus_musculus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.897	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	93.159	Mus_pahari
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	99	93.284	Mus_spretus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.123	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	92.666	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.666	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.123	Nannospalax_galili
ENSORLG00015019113	tnpo1	87	97.276	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.276	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSNLEG00000004572	TNPO1	99	93.123	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00015019113	tnpo1	90	87.935	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.935	Ochotona_princeps
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.785	Octodon_degus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.753	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.753	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015019113	tnpo1	92	94.146	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.146	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	86.916	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.916	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015019113	tnpo1	87	99.223	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	99.223	Oryzias_latipes
ENSORLG00015019113	tnpo1	100	99.662	ENSORLG00020011559	tnpo1	100	99.662	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015019113	tnpo1	100	99.099	ENSOMEG00000014567	tnpo1	100	99.099	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.123	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSOARG00000005038	TNPO1	83	93.010	Ovis_aries
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.123	Pan_paniscus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSPPRG00000022336	TNPO1	99	93.123	Panthera_pardus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	93.123	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015019113	tnpo1	94	81.994	ENSPTRG00000047731	-	99	81.994	Pan_troglodytes
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.123	Pan_troglodytes
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.123	Papio_anubis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	91.094	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	91.094	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.912	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.912	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.356	ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	93.581	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	93.099	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.099	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	94.138	ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	94.138	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.191	ENSPFOG00000011447	tnpo1	99	97.191	Poecilia_formosa
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.191	ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	97.191	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.632	ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	97.632	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.188	ENSPREG00000020705	tnpo1	99	97.188	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.010	Pongo_abelii
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.123	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.010	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.297	ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	97.297	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.476	ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.926	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	99	93.010	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	93.123	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	93.123	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	ENSSBOG00000029256	TNPO1	99	92.785	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	94.035	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.035	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.721	ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	95.721	Scleropages_formosus
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	96.963	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.963	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.971	ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	97.971	Seriola_dumerili
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.858	ENSSLDG00000014578	tnpo1	99	97.858	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	93.123	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.971	ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	97.971	Stegastes_partitus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	93.123	Sus_scrofa
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	91.518	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.518	Taeniopygia_guttata
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.280	ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	96.280	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015019113	tnpo1	69	91.191	ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	91.191	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015019113	tnpo1	87	93.333	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	Tupaia_belangeri
ENSORLG00015019113	tnpo1	96	89.474	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.474	Tursiops_truncatus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSUMAG00000007635	TNPO1	99	93.123	Ursus_maritimus
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.177	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.177	Vicugna_pacos
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	ENSVVUG00000007338	TNPO1	99	93.123	Vulpes_vulpes
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	91.883	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.883	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.410	ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	97.410	Xiphophorus_maculatus