EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00015021856 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: -
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hsok
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14707 bases
Position: chr20:13734802-13749508
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00015035350	IBN_N	PF03810.19	6e-14	1	1
ENSORLP00015035294	IBN_N	PF03810.19	6.1e-14	1	1
ENSORLP00015035277	IBN_N	PF03810.19	5.5e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00015029858	-	5435	-	ENSORLP00015035277	1027 (aa)	-	-
ENSORLT00015029904	-	5615	-	ENSORLP00015035294	1087 (aa)	-	-
ENSORLT00015029960	-	5110	-	ENSORLP00015035350	1079 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.267	ENSG00000196497	IPO4	99	45.680	Homo_sapiens
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.013	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	79.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.066	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	44.096	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00015021856	ipo4	100	76.755	ENSACIG00000004246	ipo4	100	77.339	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.110	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	82.222	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.293	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	82.222	Amphiprion_percula
ENSORLG00015021856	ipo4	93	81.175	ENSATEG00000017082	ipo4	99	81.773	Anabas_testudineus
ENSORLG00015021856	ipo4	85	47.614	ENSACAG00000003973	-	97	47.722	Anolis_carolinensis
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.744	ENSANAG00000037973	IPO4	99	45.161	Aotus_nancymaae
ENSORLG00015021856	ipo4	100	77.645	ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.921	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00015021856	ipo4	100	67.801	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	68.537	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.506	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.783	Bos_taurus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.209	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.622	Callithrix_jacchus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.822	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.799	Canis_familiaris
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.387	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.828	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.413	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.598	Capra_hircus
ENSORLG00015021856	ipo4	98	44.906	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	45.269	Carlito_syrichta
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.540	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	45.891	Cavia_porcellus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.116	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	45.530	Cebus_capucinus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.361	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.806	Cercocebus_atys
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.446	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.799	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00015021856	ipo4	90	45.982	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	43.041	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00015021856	ipo4	92	37.012	ENSCING00000008639	-	99	36.914	Ciona_intestinalis
ENSORLG00015021856	ipo4	92	37.598	ENSCSAVG00000011482	-	98	37.856	Ciona_savignyi
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.080	ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.530	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.218	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	44.547	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.218	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	44.547	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00015021856	ipo4	100	75.432	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	74.977	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00015021856	ipo4	99	76.270	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	76.299	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	72.452	ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.095	Danio_rerio
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.556	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	45.463	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.921	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.337	Dipodomys_ordii
ENSORLG00015021856	ipo4	96	31.227	FBgn0042177	CG32164	97	31.082	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015021856	ipo4	97	30.961	FBgn0042178	CG32165	97	31.321	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00015021856	ipo4	99	43.974	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.750	Echinops_telfairi
ENSORLG00015021856	ipo4	90	46.856	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.904	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.664	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.706	Equus_caballus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	70.796	ENSELUG00000020628	ipo4	100	72.313	Esox_lucius
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.614	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.614	Felis_catus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	41.781	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	42.149	Fukomys_damarensis
ENSORLG00015021856	ipo4	89	79.810	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	84.559	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	74.382	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	75.092	Gadus_morhua
ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.579	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	80.220	Gambusia_affinis
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.105	ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.921	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.080	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	45.530	Gorilla_gorilla
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.749	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	78.565	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.164	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	45.614	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.883	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	45.337	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00015021856	ipo4	99	75.045	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.373	Hippocampus_comes
ENSORLG00015021856	ipo4	100	71.205	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.205	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.706	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	46.076	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.251	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	45.791	Jaculus_jaculus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.642	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	80.642	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.493	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	78.676	Labrus_bergylta
ENSORLG00015021856	ipo4	100	50.000	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.000	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00015021856	ipo4	79	63.520	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	63.520	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.802	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.434	Loxodonta_africana
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.361	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.806	Macaca_fascicularis
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.361	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.806	Macaca_mulatta
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.267	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	45.714	Macaca_nemestrina
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.361	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.806	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.197	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.565	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.381	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	78.657	Maylandia_zebra
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.783	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.700	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.258	ENSMICG00000001719	IPO4	99	45.522	Microcebus_murinus
ENSORLG00015021856	ipo4	98	44.026	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.993	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00015021856	ipo4	100	77.544	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	77.360	Mola_mola
ENSORLG00015021856	ipo4	99	43.333	ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.923	Monodelphis_domestica
ENSORLG00015021856	ipo4	100	77.085	ENSMALG00000001587	ipo4	100	77.269	Monopterus_albus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.496	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.658	Mus_caroli
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.126	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	46.163	Mus_musculus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.352	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	46.468	Mus_pahari
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.403	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	46.468	Mus_spretus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.891	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	46.168	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.259	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	45.485	Myotis_lucifugus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.158	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	45.251	Nannospalax_galili
ENSORLG00015021856	ipo4	100	81.601	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.969	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.841	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	46.118	Ochotona_princeps
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.446	ENSODEG00000002609	IPO4	99	45.706	Octodon_degus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	81.601	ENSONIG00000014574	ipo4	100	81.509	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.663	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.843	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	99.513	ENSORLG00000006457	ipo4	100	99.513	Oryzias_latipes
ENSORLG00015021856	ipo4	100	99.172	ENSORLG00020004286	ipo4	100	99.172	Oryzias_latipes_hni
ENSORLG00015021856	ipo4	99	89.684	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	89.807	Oryzias_melastigma
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.789	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.783	Otolemur_garnettii
ENSORLG00015021856	ipo4	99	43.809	ENSOARG00000019188	IPO4	99	44.112	Ovis_aries
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.173	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	45.253	Pan_paniscus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.799	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.799	Panthera_pardus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.706	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.706	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.986	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	45.346	Pan_troglodytes
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.455	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.899	Papio_anubis
ENSORLG00015021856	ipo4	99	66.267	ENSPKIG00000007683	-	99	65.685	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015021856	ipo4	100	64.867	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	65.293	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00015021856	ipo4	99	71.311	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	71.769	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.126	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	44.311	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00015021856	ipo4	94	45.695	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	45.161	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.202	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	80.385	Poecilia_formosa
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.293	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.477	Poecilia_latipinna
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.202	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	80.385	Poecilia_mexicana
ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.560	ENSPREG00000017605	ipo4	100	79.927	Poecilia_reticulata
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.267	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	45.622	Pongo_abelii
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.915	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.891	Procavia_capensis
ENSORLG00015021856	ipo4	98	44.623	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	44.486	Propithecus_coquereli
ENSORLG00015021856	ipo4	98	45.566	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.826	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.853	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	80.129	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00015021856	ipo4	100	72.769	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	72.769	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.630	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.917	Rattus_norvegicus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.173	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	45.622	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.080	ENSRROG00000011492	IPO4	99	45.530	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.279	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	44.659	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.995	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.444	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00015021856	ipo4	99	66.422	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.239	Scleropages_formosus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	63.628	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	63.260	Scleropages_formosus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.541	ENSSMAG00000019912	ipo4	100	82.222	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	76.400	ENSSDUG00000017513	ipo4	100	76.217	Seriola_dumerili
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ENSORLG00015021856	ipo4	86	45.432	ENSSARG00000010701	IPO4	81	45.926	Sorex_araneus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.900	ENSSPAG00000008486	ipo4	100	81.359	Stegastes_partitus
ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.319	ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.691	Sus_scrofa
ENSORLG00015021856	ipo4	100	74.839	ENSTRUG00000012832	ipo4	100	74.839	Takifugu_rubripes
ENSORLG00015021856	ipo4	99	72.335	ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.243	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00015021856	ipo4	99	42.488	ENSTBEG00000009781	IPO4	99	41.935	Tupaia_belangeri
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ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.147	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.332	Ursus_americanus
ENSORLG00015021856	ipo4	96	53.261	ENSXETG00000014621	ipo4	99	45.404	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.073	ENSXCOG00000005208	ipo4	100	77.434	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.202	ENSXMAG00000006041	ipo4	100	80.385	Xiphophorus_maculatus