EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020000246 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2737 bases
Position: chr2:5768896-5771632
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	1	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	2	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	3	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	4	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	5	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	6	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	7	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	8	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	9	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	10	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	11	12
ENSORLP00020027183	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-74	12	12
ENSORLP00020027183	zf-met	PF12874.7	3.5e-28	1	7
ENSORLP00020027183	zf-met	PF12874.7	3.5e-28	2	7
ENSORLP00020027183	zf-met	PF12874.7	3.5e-28	3	7
ENSORLP00020027183	zf-met	PF12874.7	3.5e-28	4	7
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ENSORLP00020027183	zf-met	PF12874.7	3.5e-28	6	7
ENSORLP00020027183	zf-met	PF12874.7	3.5e-28	7	7
ENSORLP00020027183	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.8e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020000015	-	1281	-	ENSORLP00020027183	426 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020000246	-	86	35.347	ENSORLG00020007790	zbtb48	56	35.347
ENSORLG00020000246	-	87	67.372	ENSORLG00020010916	-	69	61.240
ENSORLG00020000246	-	99	50.568	ENSORLG00020016037	-	95	49.784
ENSORLG00020000246	-	86	35.693	ENSORLG00020018503	-	71	36.152
ENSORLG00020000246	-	99	51.351	ENSORLG00020000639	-	76	50.943
ENSORLG00020000246	-	86	37.576	ENSORLG00020008744	-	67	37.576
ENSORLG00020000246	-	88	65.468	ENSORLG00020011149	-	88	62.284
ENSORLG00020000246	-	81	43.689	ENSORLG00020006433	-	79	43.689
ENSORLG00020000246	-	72	36.364	ENSORLG00020011808	-	55	36.364
ENSORLG00020000246	-	83	37.415	ENSORLG00020001758	-	56	37.607
ENSORLG00020000246	-	99	46.286	ENSORLG00020016666	-	89	46.286
ENSORLG00020000246	-	98	49.550	ENSORLG00020001707	-	97	48.768
ENSORLG00020000246	-	80	41.071	ENSORLG00020012967	scrt1b	60	41.071
ENSORLG00020000246	-	91	63.107	ENSORLG00020004353	-	96	62.019
ENSORLG00020000246	-	86	40.373	ENSORLG00020001602	gfi1ab	57	40.373
ENSORLG00020000246	-	99	64.167	ENSORLG00020009943	-	99	61.356
ENSORLG00020000246	-	94	54.187	ENSORLG00020008484	-	98	54.187
ENSORLG00020000246	-	86	41.250	ENSORLG00020002817	GFI1	52	41.250
ENSORLG00020000246	-	99	72.468	ENSORLG00020009419	-	94	75.472
ENSORLG00020000246	-	95	32.056	ENSORLG00020004162	znf341	56	35.912
ENSORLG00020000246	-	99	46.622	ENSORLG00020000264	-	68	46.622
ENSORLG00020000246	-	99	50.118	ENSORLG00020021857	-	51	60.481
ENSORLG00020000246	-	99	71.368	ENSORLG00020010560	-	100	61.279
ENSORLG00020000246	-	99	71.429	ENSORLG00020010880	-	96	69.565
ENSORLG00020000246	-	86	54.005	ENSORLG00020010020	-	98	54.005
ENSORLG00020000246	-	86	39.850	ENSORLG00020018051	prdm5	74	39.850
ENSORLG00020000246	-	93	58.635	ENSORLG00020011234	-	97	56.039
ENSORLG00020000246	-	99	40.260	ENSORLG00020007599	-	83	39.957
ENSORLG00020000246	-	86	38.109	ENSORLG00020018685	znf319b	93	38.109
ENSORLG00020000246	-	86	40.274	ENSORLG00020018495	-	64	40.274
ENSORLG00020000246	-	96	55.866	ENSORLG00020007074	-	98	55.866
ENSORLG00020000246	-	99	53.125	ENSORLG00020017850	-	95	50.820
ENSORLG00020000246	-	81	32.331	ENSORLG00020002684	-	76	32.331
ENSORLG00020000246	-	86	38.255	ENSORLG00020000009	znf710b	53	38.255
ENSORLG00020000246	-	99	53.114	ENSORLG00020009184	-	99	51.264
ENSORLG00020000246	-	99	68.327	ENSORLG00020008933	-	99	68.327
ENSORLG00020000246	-	82	41.538	ENSORLG00020010932	-	72	41.538
ENSORLG00020000246	-	98	42.958	ENSORLG00020003719	GFI1B	80	42.958
ENSORLG00020000246	-	90	52.414	ENSORLG00020009965	-	90	46.552
ENSORLG00020000246	-	86	50.820	ENSORLG00020017528	-	73	50.820
ENSORLG00020000246	-	99	62.609	ENSORLG00020009857	-	99	63.028
ENSORLG00020000246	-	85	48.013	ENSORLG00020009139	-	98	46.309
ENSORLG00020000246	-	74	37.500	ENSORLG00020001791	-	51	37.500
ENSORLG00020000246	-	95	64.681	ENSORLG00020010647	-	93	60.076
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ENSORLG00020000246	-	96	37.056	ENSORLG00020012229	zbtb41	50	35.691
ENSORLG00020000246	-	99	46.961	ENSORLG00020017483	-	97	46.336
ENSORLG00020000246	-	96	45.198	ENSORLG00020010950	-	96	49.074
ENSORLG00020000246	-	99	60.563	ENSORLG00020016754	-	89	60.563
ENSORLG00020000246	-	99	47.328	ENSORLG00020005132	-	90	47.328
ENSORLG00020000246	-	99	56.322	ENSORLG00020008240	-	75	56.322
ENSORLG00020000246	-	81	42.857	ENSORLG00020019789	snai1a	50	42.857
ENSORLG00020000246	-	99	50.450	ENSORLG00020021196	-	74	50.450
ENSORLG00020000246	-	99	63.736	ENSORLG00020004313	-	62	60.335
ENSORLG00020000246	-	98	33.673	ENSORLG00020010285	znf646	99	33.673
ENSORLG00020000246	-	88	57.895	ENSORLG00020007018	-	82	57.895
ENSORLG00020000246	-	99	56.075	ENSORLG00020009089	-	84	56.075
ENSORLG00020000246	-	96	51.379	ENSORLG00020018069	-	96	51.908
ENSORLG00020000246	-	99	56.145	ENSORLG00020008018	-	90	57.061
ENSORLG00020000246	-	82	30.380	ENSORLG00020010937	patz1	54	30.380
ENSORLG00020000246	-	85	38.849	ENSORLG00020011478	scrt2	53	38.849
ENSORLG00020000246	-	99	50.562	ENSORLG00020015703	-	98	50.562
ENSORLG00020000246	-	82	46.903	ENSORLG00020019341	-	61	73.529
ENSORLG00020000246	-	86	40.146	ENSORLG00020006820	-	74	40.146
ENSORLG00020000246	-	99	57.330	ENSORLG00020010171	-	99	63.110
ENSORLG00020000246	-	95	59.811	ENSORLG00020010250	-	92	60.518
ENSORLG00020000246	-	99	52.330	ENSORLG00020000481	-	94	51.773
ENSORLG00020000246	-	86	48.864	ENSORLG00020017514	-	90	48.864
ENSORLG00020000246	-	99	58.590	ENSORLG00020007967	-	90	63.333
ENSORLG00020000246	-	99	40.230	ENSORLG00020002128	-	95	40.230
ENSORLG00020000246	-	99	56.061	ENSORLG00020019227	-	88	56.061
ENSORLG00020000246	-	100	44.848	ENSORLG00020000219	-	92	44.848
ENSORLG00020000246	-	93	41.667	ENSORLG00020001912	znf236	73	41.667
ENSORLG00020000246	-	99	43.243	ENSORLG00020018921	-	91	43.243
ENSORLG00020000246	-	99	42.515	ENSORLG00020020419	-	93	42.515
ENSORLG00020000246	-	99	58.442	ENSORLG00020017164	-	95	57.377
ENSORLG00020000246	-	99	68.067	ENSORLG00020010953	-	93	68.067
ENSORLG00020000246	-	96	60.218	ENSORLG00020009180	-	98	64.889
ENSORLG00020000246	-	86	38.315	ENSORLG00020004889	ZNF319	91	39.216
ENSORLG00020000246	-	99	69.364	ENSORLG00020004370	-	99	69.364
ENSORLG00020000246	-	99	64.686	ENSORLG00020010804	-	98	64.602
ENSORLG00020000246	-	88	65.952	ENSORLG00020011075	-	81	65.952
ENSORLG00020000246	-	99	47.577	ENSORLG00020010038	-	90	47.577
ENSORLG00020000246	-	92	38.039	ENSORLG00020009554	-	81	38.039
ENSORLG00020000246	-	99	64.388	ENSORLG00020010636	-	87	64.388
ENSORLG00020000246	-	96	63.429	ENSORLG00020000161	-	95	63.429
ENSORLG00020000246	-	93	38.342	ENSORLG00020006144	-	75	42.105
ENSORLG00020000246	-	99	55.844	ENSORLG00020006148	-	81	55.844
ENSORLG00020000246	-	99	62.740	ENSORLG00020008891	-	99	62.976
ENSORLG00020000246	-	88	42.345	ENSORLG00020018791	-	83	42.345
ENSORLG00020000246	-	92	64.706	ENSORLG00020008424	-	96	60.150
ENSORLG00020000246	-	84	42.748	ENSORLG00020001922	-	81	40.909
ENSORLG00020000246	-	98	63.529	ENSORLG00020008346	-	100	65.292

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020000246	-	89	50.303	ENSAPOG00000000601	-	78	50.303	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	99	43.590	ENSAPOG00000017148	-	59	43.590	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	86	56.250	ENSAPOG00000010330	-	73	56.250	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	82	48.810	ENSAPOG00000014372	-	61	48.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	82	58.667	ENSAPOG00000016615	-	83	58.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	79	48.673	ENSAPOG00000010645	-	61	48.673	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	86	56.716	ENSAPOG00000003414	-	97	56.716	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000246	-	90	48.101	ENSAOCG00000007347	-	87	48.101	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000246	-	99	47.826	ENSAPEG00000004256	-	97	47.826	Amphiprion_percula
ENSORLG00020000246	-	99	58.197	ENSATEG00000007658	-	72	58.197	Anabas_testudineus
ENSORLG00020000246	-	96	43.056	ENSAMXG00000013492	-	96	47.348	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020000246	-	86	46.617	ENSCING00000024717	-	87	46.617	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020000246	-	98	59.574	ENSCVAG00000016924	-	54	59.574	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020000246	-	83	41.121	ENSCVAG00000011712	-	52	41.121	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020000246	-	99	39.701	ENSCVAG00000018383	-	93	39.701	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020000246	-	88	43.052	ENSEBUG00000000422	-	69	43.052	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	87	46.429	ENSEBUG00000003418	-	95	46.429	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	86	48.026	ENSEBUG00000001569	-	82	48.026	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	86	44.498	ENSEBUG00000001308	-	69	44.498	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	85	49.315	ENSEBUG00000015472	-	62	49.315	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	90	48.810	ENSEBUG00000006666	-	93	48.810	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	85	48.223	ENSEBUG00000013874	-	54	48.223	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	81	48.084	ENSEBUG00000014768	-	67	48.084	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	86	47.260	ENSEBUG00000000436	-	78	47.260	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	88	46.614	ENSEBUG00000004992	-	54	46.614	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000246	-	86	44.828	ENSEBUG00000003232	-	54	44.604	Eptatretus_burgeri
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