EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020000264 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11985 bases
Position: chr16:29784003-29795987
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020027582	zf-C2H2	PF00096.26	1e-31	1	6
ENSORLP00020027582	zf-C2H2	PF00096.26	1e-31	2	6
ENSORLP00020027582	zf-C2H2	PF00096.26	1e-31	3	6
ENSORLP00020027582	zf-C2H2	PF00096.26	1e-31	4	6
ENSORLP00020027582	zf-C2H2	PF00096.26	1e-31	5	6
ENSORLP00020027582	zf-C2H2	PF00096.26	1e-31	6	6
ENSORLP00020027582	zf-met	PF12874.7	1.9e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020031029	-	4383	-	ENSORLP00020027582	385 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020000264	-	85	53.409	ENSORLG00020017164	-	99	53.409
ENSORLG00020000264	-	67	50.685	ENSORLG00020017528	-	92	50.685
ENSORLG00020000264	-	81	38.636	ENSORLG00020004313	-	78	38.636
ENSORLG00020000264	-	54	51.176	ENSORLG00020007018	-	84	51.176
ENSORLG00020000264	-	63	51.613	ENSORLG00020009139	-	98	50.000
ENSORLG00020000264	-	64	52.482	ENSORLG00020018069	-	97	52.482
ENSORLG00020000264	-	52	55.752	ENSORLG00020007074	-	90	54.717
ENSORLG00020000264	-	68	49.102	ENSORLG00020009089	-	85	49.102
ENSORLG00020000264	-	68	48.750	ENSORLG00020006148	-	78	48.750
ENSORLG00020000264	-	50	48.148	ENSORLG00020001707	-	77	48.148
ENSORLG00020000264	-	52	47.143	ENSORLG00020010916	-	55	47.143
ENSORLG00020000264	-	76	46.296	ENSORLG00020008891	-	97	47.403
ENSORLG00020000264	-	50	45.181	ENSORLG00020018495	-	64	45.181
ENSORLG00020000264	-	79	43.529	ENSORLG00020010038	-	92	43.529
ENSORLG00020000264	-	71	51.765	ENSORLG00020017483	-	98	51.765
ENSORLG00020000264	-	68	36.923	ENSORLG00020004370	-	92	36.923
ENSORLG00020000264	-	71	48.466	ENSORLG00020008018	-	91	48.466
ENSORLG00020000264	-	70	41.176	ENSORLG00020016666	-	90	41.176
ENSORLG00020000264	-	70	38.095	ENSORLG00020011808	-	72	38.095
ENSORLG00020000264	-	69	46.012	ENSORLG00020008346	-	98	46.012
ENSORLG00020000264	-	65	45.882	ENSORLG00020009180	-	97	44.253
ENSORLG00020000264	-	77	41.304	ENSORLG00020007967	-	91	44.706
ENSORLG00020000264	-	88	39.080	ENSORLG00020009184	-	94	50.336
ENSORLG00020000264	-	74	41.860	ENSORLG00020018844	wt1	55	41.860
ENSORLG00020000264	-	75	35.398	ENSORLG00020018921	-	95	37.589
ENSORLG00020000264	-	85	49.080	ENSORLG00020010804	-	94	50.000
ENSORLG00020000264	-	68	49.102	ENSORLG00020010880	-	90	49.102
ENSORLG00020000264	-	66	46.626	ENSORLG00020010250	-	99	45.506
ENSORLG00020000264	-	52	38.272	ENSORLG00020009554	-	80	38.272
ENSORLG00020000264	-	56	33.742	ENSORLG00020014595	PRDM15	51	33.742
ENSORLG00020000264	-	66	50.920	ENSORLG00020009857	-	97	50.307
ENSORLG00020000264	-	74	45.509	ENSORLG00020009943	-	97	47.727
ENSORLG00020000264	-	69	49.080	ENSORLG00020011075	-	75	49.080
ENSORLG00020000264	-	68	45.294	ENSORLG00020020419	-	92	45.294
ENSORLG00020000264	-	83	43.885	ENSORLG00020000219	-	80	43.885
ENSORLG00020000264	-	73	46.108	ENSORLG00020009419	-	98	47.059
ENSORLG00020000264	-	65	38.182	ENSORLG00020010285	znf646	66	38.182
ENSORLG00020000264	-	70	49.102	ENSORLG00020008240	-	74	49.102
ENSORLG00020000264	-	53	42.143	ENSORLG00020018503	-	69	42.767
ENSORLG00020000264	-	68	45.455	ENSORLG00020010953	-	94	41.206
ENSORLG00020000264	-	75	46.471	ENSORLG00020015703	-	81	46.471
ENSORLG00020000264	-	71	45.783	ENSORLG00020008424	-	96	45.783
ENSORLG00020000264	-	53	45.625	ENSORLG00020010020	-	74	45.625
ENSORLG00020000264	-	53	44.444	ENSORLG00020019341	-	74	59.375
ENSORLG00020000264	-	68	46.622	ENSORLG00020000246	-	99	46.622
ENSORLG00020000264	-	58	47.222	ENSORLG00020016754	-	95	47.222
ENSORLG00020000264	-	69	52.761	ENSORLG00020017850	-	97	52.761
ENSORLG00020000264	-	50	36.842	ENSORLG00020000009	znf710b	51	36.842
ENSORLG00020000264	-	70	53.503	ENSORLG00020000481	-	97	52.695
ENSORLG00020000264	-	65	48.718	ENSORLG00020010171	-	97	46.429
ENSORLG00020000264	-	52	41.071	ENSORLG00020008744	-	70	41.071
ENSORLG00020000264	-	68	43.529	ENSORLG00020005212	wt1b	51	42.453
ENSORLG00020000264	-	71	45.695	ENSORLG00020021857	-	77	45.695
ENSORLG00020000264	-	66	40.120	ENSORLG00020016037	-	93	43.293
ENSORLG00020000264	-	64	36.970	ENSORLG00020012229	zbtb41	54	35.227
ENSORLG00020000264	-	66	46.914	ENSORLG00020011149	-	78	46.914
ENSORLG00020000264	-	71	52.096	ENSORLG00020010636	-	90	52.096
ENSORLG00020000264	-	72	48.876	ENSORLG00020010560	-	100	48.958
ENSORLG00020000264	-	68	45.794	ENSORLG00020001912	znf236	65	45.794

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020000264	-	70	48.551	ENSATEG00000007658	-	94	50.781	Anabas_testudineus
ENSORLG00020000264	-	51	35.193	ENSAMXG00000037695	-	57	35.193	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020000264	-	63	39.205	ENSAMXG00000013492	-	96	43.558	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020000264	-	68	38.783	ENSCVAG00000018383	-	95	39.777	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020000264	-	57	44.138	ENSEBUG00000006666	-	84	44.138	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000264	-	52	42.162	ENSELUG00000022942	-	57	42.162	Esox_lucius
ENSORLG00020000264	-	74	48.503	ENSELUG00000007694	-	92	48.503	Esox_lucius
ENSORLG00020000264	-	76	47.222	ENSGAFG00000013366	-	75	47.222	Gambusia_affinis
ENSORLG00020000264	-	64	43.243	ENSGAFG00000021139	-	97	43.243	Gambusia_affinis
ENSORLG00020000264	-	64	51.818	ENSGAFG00000021143	-	87	51.818	Gambusia_affinis
ENSORLG00020000264	-	79	47.929	ENSHCOG00000001242	-	87	47.929	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	53	40.000	ENSHCOG00000007464	-	98	40.000	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	52	44.366	ENSHCOG00000008133	-	53	44.366	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	51	46.099	ENSHCOG00000019388	-	68	46.099	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	70	48.214	ENSHCOG00000015355	-	87	50.476	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	72	46.108	ENSHCOG00000001256	-	91	46.108	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	54	48.276	ENSHCOG00000019006	-	63	48.276	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	54	41.509	ENSHCOG00000014781	-	66	41.509	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	51	47.552	ENSHCOG00000020976	-	53	47.552	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	55	49.693	ENSHCOG00000001318	-	100	49.693	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000264	-	75	42.373	ENSKMAG00000000556	-	94	32.615	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020000264	-	54	39.744	ENSLBEG00000025139	-	74	39.744	Labrus_bergylta
ENSORLG00020000264	-	52	42.941	ENSONIG00000018151	-	97	42.941	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020000264	-	77	47.486	ENSORLG00000022677	-	87	47.486	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	71	46.023	ENSORLG00000026432	-	78	46.023	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	52	48.466	ENSORLG00000029814	-	73	48.466	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	64	57.042	ENSORLG00000029994	-	93	57.042	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	74	47.977	ENSORLG00000028433	-	98	47.977	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	84	45.509	ENSORLG00000029172	-	94	45.509	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	71	45.517	ENSORLG00000023809	-	96	45.517	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	65	48.466	ENSORLG00000023806	-	95	47.337	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	66	43.500	ENSORLG00000027271	-	90	43.500	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	100	97.297	ENSORLG00000028261	-	85	97.297	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	69	42.222	ENSORLG00000013863	-	91	54.118	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	74	40.212	ENSORLG00000029493	-	78	43.151	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	71	44.079	ENSORLG00000027366	-	95	48.171	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	72	42.466	ENSORLG00000028456	-	96	38.516	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	64	41.489	ENSORLG00000012485	-	77	38.224	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	68	48.503	ENSORLG00000000247	-	92	48.503	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	54	50.685	ENSORLG00000027009	-	90	50.685	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	73	44.898	ENSORLG00000026684	-	97	44.898	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	68	38.764	ENSORLG00000030610	-	82	43.046	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	55	49.112	ENSORLG00000023086	-	93	49.112	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	64	46.763	ENSORLG00000029896	-	92	46.763	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	54	53.409	ENSORLG00000000420	-	81	53.409	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	71	46.897	ENSORLG00000028381	-	95	44.910	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	71	46.108	ENSORLG00000028168	-	97	46.108	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	70	49.102	ENSORLG00000025200	-	74	49.102	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	76	49.701	ENSORLG00000023744	-	98	49.102	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	68	46.784	ENSORLG00000027974	-	90	46.784	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	78	44.444	ENSORLG00000001749	-	99	46.626	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	68	46.108	ENSORLG00000027575	-	95	46.108	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	84	41.803	ENSORLG00000027303	-	91	38.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	68	51.534	ENSORLG00000000557	-	99	51.534	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	65	42.515	ENSORLG00000021951	-	98	42.515	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	54	49.315	ENSORLG00000000191	-	93	49.315	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000264	-	66	44.720	ENSORLG00015011524	-	86	44.720	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	52	45.087	ENSORLG00015007164	-	93	45.087	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	52	47.929	ENSORLG00015009640	-	91	47.929	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	69	47.879	ENSORLG00015019853	-	81	47.879	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	76	47.853	ENSORLG00015012826	-	96	47.853	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	72	47.305	ENSORLG00015008013	-	98	47.305	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	69	41.830	ENSORLG00015012904	-	98	41.830	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	72	40.845	ENSORLG00015011496	-	89	40.845	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	82	50.000	ENSORLG00015013417	-	97	50.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	64	45.122	ENSORLG00015007146	-	96	45.122	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000264	-	68	46.667	ENSORLG00015013302	-	93	46.667	Oryzias_latipes_hsok
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