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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020000386 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18877 bases
Position: chr8:13972366-13991242
Accession: 101171250
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020029757	Xpo1	PF08389.12	7.9e-22	1	1
ENSORLP00020013025	Xpo1	PF08389.12	3.4e-21	1	1
ENSORLP00020012985	Xpo1	PF08389.12	1.1e-19	1	1
ENSORLP00020013025	IBN_N	PF03810.19	1.1e-06	1	1
ENSORLP00020012985	IBN_N	PF03810.19	1.3e-06	1	1
ENSORLP00020029757	IBN_N	PF03810.19	1.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020020261	-	3342	-	ENSORLP00020029757	1113 (aa)	-	-
ENSORLT00020032443	-	4883	-	ENSORLP00020012985	1108 (aa)	-	-
ENSORLT00020032465	-	5009	XM_011478307	ENSORLP00020013025	1150 (aa)	XP_011476609	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.273	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSORLG00020000386	xpo6	100	92.108	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.281	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSAMEG00000011014	XPO6	99	77.005	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.150	ENSACIG00000008055	xpo6	100	91.150	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	92.108	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	92.281	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000386	xpo6	100	92.021	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	92.194	Amphiprion_percula
ENSORLG00020000386	xpo6	100	90.720	ENSATEG00000002273	xpo6	100	90.893	Anabas_testudineus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	78.253	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	78.253	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020000386	xpo6	99	69.299	ENSACAG00000016883	XPO6	99	69.299	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSANAG00000031761	XPO6	99	77.005	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.339	ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.339	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020000386	xpo6	100	76.104	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.104	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.649	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	76.649	Bos_taurus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.094	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.094	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.094	ENSCAFG00000017356	XPO6	99	77.094	Canis_familiaris
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	76.521	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.649	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	76.649	Capra_hircus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	74.153	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	74.153	Carlito_syrichta
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.827	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	76.827	Cavia_porcellus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	77.005	Cebus_capucinus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSCATG00000034030	XPO6	99	77.184	Cercocebus_atys
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.649	ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.649	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020000386	xpo6	91	76.357	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	76.357	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020000386	xpo6	82	85.294	ENSCPBG00000024660	XPO6	98	85.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020000386	xpo6	99	45.977	ENSCING00000006884	-	99	45.977	Ciona_intestinalis
ENSORLG00020000386	xpo6	99	44.190	ENSCSAVG00000000850	-	99	44.166	Ciona_savignyi
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSCANG00000041578	XPO6	99	77.005	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	77.005	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020000386	xpo6	100	89.506	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	89.506	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.130	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	92.015	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020000386	xpo6	97	75.401	ENSDARG00000041217	xpo6	99	75.401	Danio_rerio
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.916	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	76.916	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.094	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	77.094	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020000386	xpo6	87	30.566	FBgn0266572	ebo	92	30.303	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020000386	xpo6	83	75.676	ENSETEG00000018768	XPO6	85	75.676	Echinops_telfairi
ENSORLG00020000386	xpo6	99	60.788	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	60.788	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.362	ENSEASG00005017296	XPO6	99	77.362	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.362	ENSECAG00000008601	XPO6	99	77.362	Equus_caballus
ENSORLG00020000386	xpo6	96	71.547	ENSEEUG00000014587	XPO6	99	71.547	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	85.959	ENSELUG00000009159	xpo6	99	85.959	Esox_lucius
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.362	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	77.362	Felis_catus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.699	ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.699	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.094	ENSFDAG00000012689	XPO6	99	77.094	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.478	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	91.478	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	78.253	ENSGALG00000035360	XPO6	99	78.253	Gallus_gallus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.043	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.043	Gambusia_affinis
ENSORLG00020000386	xpo6	95	77.320	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	77.413	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	77.184	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.414	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	91.587	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.916	ENSHGLG00000009679	-	99	76.916	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020000386	xpo6	94	62.107	ENSHGLG00000003865	-	99	62.205	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020000386	xpo6	94	63.836	ENSHGLG00100001081	-	99	63.937	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.916	ENSHGLG00100003673	-	99	76.916	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020000386	xpo6	100	88.985	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	89.072	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000386	xpo6	100	74.610	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	75.217	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.827	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	76.827	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.649	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	76.649	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	92.735	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	92.735	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.240	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	91.414	Labrus_bergylta
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.163	ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.163	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020000386	xpo6	94	81.063	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.063	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.649	ENSLAFG00000011960	XPO6	99	76.649	Loxodonta_africana
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	77.184	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	77.184	Macaca_mulatta
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	77.184	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	77.184	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	90.807	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	90.980	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.429	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	91.429	Maylandia_zebra
ENSORLG00020000386	xpo6	97	77.505	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	77.505	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020000386	xpo6	99	68.093	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	67.825	Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSMICG00000001923	XPO6	99	77.184	Microcebus_murinus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	77.005	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020000386	xpo6	99	90.656	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	90.656	Mola_mola
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.897	ENSMODG00000015516	XPO6	99	77.897	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020000386	xpo6	99	81.972	ENSMALG00000020612	xpo6	99	82.149	Monopterus_albus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	77.839	Mus_caroli
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.916	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	76.916	Mus_musculus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	77.005	Mus_pahari
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.738	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	76.738	Mus_spretus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.738	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	76.738	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.471	ENSMLUG00000012970	XPO6	99	76.471	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	77.184	Nannospalax_galili
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.500	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	91.674	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.273	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	77.273	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020000386	xpo6	86	78.590	ENSOPRG00000009278	XPO6	86	78.590	Ochotona_princeps
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.916	ENSODEG00000012917	XPO6	99	76.916	Octodon_degus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.587	ENSONIG00000019366	xpo6	100	91.761	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.273	ENSOCUG00000002727	XPO6	99	77.273	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	99.391	ENSORLG00000011231	xpo6	100	99.391	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000386	xpo6	100	99.565	ENSORLG00015003636	xpo6	100	99.565	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000386	xpo6	100	97.043	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	97.043	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.273	ENSOGAG00000012844	XPO6	99	77.273	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.738	ENSOARG00000000960	XPO6	99	76.738	Ovis_aries
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	77.184	Pan_paniscus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.068	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	77.068	Panthera_pardus
ENSORLG00020000386	xpo6	96	76.568	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	76.568	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	77.184	Pan_troglodytes
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.184	ENSPANG00000017103	XPO6	99	77.184	Papio_anubis
ENSORLG00020000386	xpo6	99	80.804	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.804	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.550	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	76.550	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020000386	xpo6	99	90.018	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	90.018	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.005	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020000386	xpo6	99	68.134	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	68.134	Petromyzon_marinus
ENSORLG00020000386	xpo6	96	77.624	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	77.205	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.573	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.573	Poecilia_formosa
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.565	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	91.565	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.739	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	91.739	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020000386	xpo6	97	91.689	ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.689	Poecilia_reticulata
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