EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020000481 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9199 bases
Position: chr17:9115302-9124500
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	1	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	2	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	3	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	4	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	5	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	6	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	7	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	8	9
ENSORLP00020016507	zf-C2H2	PF00096.26	9.1e-60	9	9
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	1	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	2	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	3	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	4	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	5	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	6	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	7	8
ENSORLP00020016529	zf-C2H2	PF00096.26	5e-55	8	8
ENSORLP00020016507	zf-met	PF12874.7	2.5e-23	1	4
ENSORLP00020016507	zf-met	PF12874.7	2.5e-23	2	4
ENSORLP00020016507	zf-met	PF12874.7	2.5e-23	3	4
ENSORLP00020016507	zf-met	PF12874.7	2.5e-23	4	4
ENSORLP00020016529	zf-met	PF12874.7	1.7e-13	1	3
ENSORLP00020016529	zf-met	PF12874.7	1.7e-13	2	3
ENSORLP00020016529	zf-met	PF12874.7	1.7e-13	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020024844	-	1152	-	ENSORLP00020016529	383 (aa)	-	-
ENSORLT00020024805	-	1140	-	ENSORLP00020016507	379 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020000481	-	92	49.711	ENSORLG00020011075	-	86	52.351
ENSORLG00020000481	-	94	48.582	ENSORLG00020021857	-	82	47.119
ENSORLG00020000481	-	88	54.054	ENSORLG00020010020	-	70	57.795
ENSORLG00020000481	-	94	56.354	ENSORLG00020004370	-	99	56.983
ENSORLG00020000481	-	97	55.161	ENSORLG00020017164	-	99	57.875
ENSORLG00020000481	-	89	57.447	ENSORLG00020007074	-	95	59.394
ENSORLG00020000481	-	81	37.551	ENSORLG00020009554	-	76	38.496
ENSORLG00020000481	-	87	43.598	ENSORLG00020018495	-	64	44.178
ENSORLG00020000481	-	82	57.511	ENSORLG00020010647	-	86	57.511
ENSORLG00020000481	-	83	53.488	ENSORLG00020006148	-	85	53.488
ENSORLG00020000481	-	96	52.427	ENSORLG00020010171	-	99	52.308
ENSORLG00020000481	-	95	59.722	ENSORLG00020010560	-	99	54.909
ENSORLG00020000481	-	96	45.833	ENSORLG00020004313	-	76	43.617
ENSORLG00020000481	-	83	40.088	ENSORLG00020003948	ZNF384	61	37.719
ENSORLG00020000481	-	92	55.721	ENSORLG00020017528	-	97	57.962
ENSORLG00020000481	-	95	52.759	ENSORLG00020008346	-	100	53.333
ENSORLG00020000481	-	82	41.350	ENSORLG00020018051	prdm5	79	41.350
ENSORLG00020000481	-	97	52.695	ENSORLG00020000264	-	70	53.503
ENSORLG00020000481	-	92	42.361	ENSORLG00020001912	znf236	74	40.972
ENSORLG00020000481	-	96	35.507	ENSORLG00020010285	znf646	87	35.507
ENSORLG00020000481	-	89	48.515	ENSORLG00020009139	-	98	49.554
ENSORLG00020000481	-	97	47.196	ENSORLG00020021196	-	76	46.914
ENSORLG00020000481	-	79	48.235	ENSORLG00020019341	-	82	61.765
ENSORLG00020000481	-	96	50.638	ENSORLG00020007599	-	84	50.638
ENSORLG00020000481	-	96	51.394	ENSORLG00020020419	-	94	51.394
ENSORLG00020000481	-	98	54.028	ENSORLG00020007967	-	98	55.440
ENSORLG00020000481	-	96	52.153	ENSORLG00020009184	-	99	57.868
ENSORLG00020000481	-	78	43.860	ENSORLG00020005815	-	73	43.860
ENSORLG00020000481	-	90	54.187	ENSORLG00020004353	-	95	56.923
ENSORLG00020000481	-	90	54.839	ENSORLG00020007018	-	91	56.439
ENSORLG00020000481	-	99	53.846	ENSORLG00020010880	-	96	56.716
ENSORLG00020000481	-	94	51.773	ENSORLG00020000246	-	99	52.330
ENSORLG00020000481	-	94	42.254	ENSORLG00020011808	-	71	42.254
ENSORLG00020000481	-	96	53.361	ENSORLG00020015703	-	79	53.361
ENSORLG00020000481	-	76	36.735	ENSORLG00020001758	-	56	36.735
ENSORLG00020000481	-	86	57.082	ENSORLG00020017514	-	90	57.082
ENSORLG00020000481	-	90	40.000	ENSORLG00020004889	ZNF319	96	41.522
ENSORLG00020000481	-	94	60.127	ENSORLG00020016754	-	99	60.127
ENSORLG00020000481	-	91	51.364	ENSORLG00020011149	-	99	53.906
ENSORLG00020000481	-	87	50.000	ENSORLG00020010950	-	94	51.887
ENSORLG00020000481	-	98	55.508	ENSORLG00020010953	-	95	56.579
ENSORLG00020000481	-	98	43.721	ENSORLG00020018921	-	94	46.231
ENSORLG00020000481	-	97	35.125	ENSORLG00020000009	znf710b	63	36.131
ENSORLG00020000481	-	96	48.276	ENSORLG00020000219	-	84	46.354
ENSORLG00020000481	-	96	52.227	ENSORLG00020008424	-	97	52.632
ENSORLG00020000481	-	95	54.487	ENSORLG00020009180	-	97	60.000
ENSORLG00020000481	-	78	52.612	ENSORLG00020011234	-	76	53.435
ENSORLG00020000481	-	80	53.153	ENSORLG00020019227	-	50	50.459
ENSORLG00020000481	-	82	59.748	ENSORLG00020000161	-	79	59.748
ENSORLG00020000481	-	77	48.333	ENSORLG00020001922	-	85	46.970
ENSORLG00020000481	-	86	42.259	ENSORLG00020006144	-	85	41.398
ENSORLG00020000481	-	94	48.858	ENSORLG00020005132	-	92	42.407
ENSORLG00020000481	-	98	52.313	ENSORLG00020009089	-	87	52.313
ENSORLG00020000481	-	95	38.361	ENSORLG00020012229	zbtb41	55	38.538
ENSORLG00020000481	-	85	50.160	ENSORLG00020008484	-	86	51.211
ENSORLG00020000481	-	80	44.737	ENSORLG00020001791	-	51	41.304
ENSORLG00020000481	-	96	56.034	ENSORLG00020010804	-	98	54.980
ENSORLG00020000481	-	92	39.590	ENSORLG00020018685	znf319b	85	39.590
ENSORLG00020000481	-	96	63.889	ENSORLG00020009419	-	96	63.889
ENSORLG00020000481	-	97	59.471	ENSORLG00020017850	-	96	59.471
ENSORLG00020000481	-	98	57.143	ENSORLG00020018069	-	96	56.989
ENSORLG00020000481	-	96	48.305	ENSORLG00020010250	-	95	55.263
ENSORLG00020000481	-	86	44.444	ENSORLG00020004162	znf341	54	44.444
ENSORLG00020000481	-	84	35.928	ENSORLG00020010937	patz1	57	36.095
ENSORLG00020000481	-	96	52.536	ENSORLG00020008018	-	94	53.358
ENSORLG00020000481	-	97	56.388	ENSORLG00020017483	-	96	59.242
ENSORLG00020000481	-	95	53.279	ENSORLG00020010636	-	91	48.739
ENSORLG00020000481	-	85	38.095	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	91	38.947
ENSORLG00020000481	-	81	47.205	ENSORLG00020003719	GFI1B	55	48.684
ENSORLG00020000481	-	78	41.606	ENSORLG00020008787	snai2	56	41.791
ENSORLG00020000481	-	81	49.074	ENSORLG00020010038	-	58	49.038
ENSORLG00020000481	-	96	57.255	ENSORLG00020008891	-	96	57.895
ENSORLG00020000481	-	81	50.862	ENSORLG00020006820	-	67	50.000
ENSORLG00020000481	-	80	55.285	ENSORLG00020009965	-	93	49.765
ENSORLG00020000481	-	89	43.200	ENSORLG00020002128	-	96	43.200
ENSORLG00020000481	-	85	45.860	ENSORLG00020002817	GFI1	70	47.826
ENSORLG00020000481	-	97	49.550	ENSORLG00020000639	-	78	49.057
ENSORLG00020000481	-	93	52.727	ENSORLG00020008933	-	93	52.727
ENSORLG00020000481	-	96	54.487	ENSORLG00020008240	-	73	56.081
ENSORLG00020000481	-	97	47.234	ENSORLG00020016037	-	97	52.766
ENSORLG00020000481	-	95	52.764	ENSORLG00020016666	-	91	51.980
ENSORLG00020000481	-	87	39.316	ENSORLG00020007790	zbtb48	55	41.791
ENSORLG00020000481	-	80	42.857	ENSORLG00020011478	scrt2	59	37.500
ENSORLG00020000481	-	98	54.266	ENSORLG00020009943	-	99	55.282
ENSORLG00020000481	-	79	48.810	ENSORLG00020010932	-	73	51.471
ENSORLG00020000481	-	96	57.647	ENSORLG00020010916	-	90	57.647
ENSORLG00020000481	-	81	43.624	ENSORLG00020018791	-	90	42.647
ENSORLG00020000481	-	94	55.676	ENSORLG00020001707	-	98	50.413
ENSORLG00020000481	-	82	40.659	ENSORLG00020012967	scrt1b	60	36.806
ENSORLG00020000481	-	96	40.574	ENSORLG00020008744	-	67	44.275
ENSORLG00020000481	-	93	39.000	ENSORLG00020018503	-	75	38.462
ENSORLG00020000481	-	93	57.143	ENSORLG00020009857	-	98	57.143

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020000481	-	82	52.308	ENSAPOG00000021367	-	50	52.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	96	51.741	ENSAPOG00000022007	-	87	48.205	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	94	51.316	ENSAPOG00000022267	-	86	51.316	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	86	51.237	ENSAPOG00000020125	-	70	50.172	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	82	46.888	ENSAPOG00000003193	znf1056	88	46.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	96	53.448	ENSAPOG00000018490	-	63	53.589	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	97	45.550	ENSAPOG00000022273	-	54	49.693	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	82	51.880	ENSAPOG00000021997	-	96	53.968	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000481	-	98	53.608	ENSACIG00000013470	-	96	55.396	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	95	52.778	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	91	52.778	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	99	49.351	ENSACIG00000011515	-	97	49.200	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	91	53.219	ENSACIG00000010637	-	58	53.219	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	97	52.406	ENSACIG00000006806	-	82	53.333	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	82	54.082	ENSACIG00000009780	-	73	54.082	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	80	51.366	ENSACIG00000009755	-	85	51.366	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000481	-	96	50.307	ENSAOCG00000007146	-	50	50.311	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000481	-	80	50.781	ENSAOCG00000010498	-	64	44.516	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000481	-	96	49.515	ENSAOCG00000012829	-	71	50.251	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000481	-	82	46.473	ENSAOCG00000003494	si:dkey-7i4.5	90	46.473	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000481	-	97	50.575	ENSAOCG00000000655	-	89	50.575	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000481	-	80	50.510	ENSAPEG00000013113	-	61	47.739	Amphiprion_percula
ENSORLG00020000481	-	96	49.515	ENSAPEG00000018332	-	71	50.251	Amphiprion_percula
ENSORLG00020000481	-	96	49.515	ENSAPEG00000018316	-	71	50.251	Amphiprion_percula
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