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Description

Ensembl ID: ENSORLG00020000623 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ireb2
Alias: -
Full Name: iron-responsive element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24102 bases
Position: chr6:8112889-8136990
Accession: ZDB-GENE-051205-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020034427	Aconitase	PF00330.20	1.9e-153	1	2
ENSORLP00020034427	Aconitase	PF00330.20	1.9e-153	2	2
ENSORLP00020019889	Aconitase	PF00330.20	2e-153	1	2
ENSORLP00020019889	Aconitase	PF00330.20	2e-153	2	2
ENSORLP00020034386	Aconitase	PF00330.20	2.1e-153	1	2
ENSORLP00020034386	Aconitase	PF00330.20	2.1e-153	2	2
ENSORLP00020034427	Aconitase_C	PF00694.19	3.3e-37	1	1
ENSORLP00020034386	Aconitase_C	PF00694.19	3.4e-37	1	1
ENSORLP00020019889	Aconitase_C	PF00694.19	3.4e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020035346	-	3176	-	ENSORLP00020034386	1030 (aa)	-	-
ENSORLT00020029144	-	5752	-	ENSORLP00020019889	1017 (aa)	-	-
ENSORLT00020029106	-	3095	-	ENSORLP00020034427	1003 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020000623	ireb2	93	60.150	ENSORLG00020010991	aco1	99	60.150

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.601	ENSG00000136381	IREB2	99	68.601	Homo_sapiens
ENSORLG00020000623	ireb2	96	88.302	ENSAPOG00000020564	ireb2	99	88.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	88.302	ENSAPOG00000016684	ireb2	100	88.701	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	88.302	ENSAPOG00000015501	-	99	88.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.872	ENSAMEG00000012645	IREB2	99	67.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020000623	ireb2	97	88.636	ENSACIG00000012557	ireb2	99	88.636	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	89.085	ENSAOCG00000000407	ireb2	99	89.085	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020000623	ireb2	97	88.557	ENSAPEG00000009121	ireb2	99	88.557	Amphiprion_percula
ENSORLG00020000623	ireb2	96	83.056	ENSATEG00000021210	ireb2	99	83.056	Anabas_testudineus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	84.823	ENSATEG00000021145	ireb2	99	84.823	Anabas_testudineus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.705	ENSAPLG00000016388	IREB2	99	67.705	Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.497	ENSANAG00000021994	IREB2	99	68.497	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020000623	ireb2	97	87.835	ENSACLG00000024688	ireb2	99	87.835	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020000623	ireb2	97	78.141	ENSAMXG00000008756	ireb2	100	78.141	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.744	ENSBTAG00000002504	IREB2	99	68.744	Bos_taurus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.640	ENSCJAG00000010259	IREB2	99	68.640	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.328	ENSCAFG00000001766	IREB2	99	68.328	Canis_familiaris
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.328	ENSCAFG00020021072	IREB2	99	69.528	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.847	ENSCHIG00000023111	IREB2	99	68.847	Capra_hircus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.111	ENSTSYG00000011729	IREB2	99	68.111	Carlito_syrichta
ENSORLG00020000623	ireb2	85	65.079	ENSCAPG00000011854	IREB2	99	65.088	Cavia_aperea
ENSORLG00020000623	ireb2	85	68.007	ENSCPOG00000013905	IREB2	99	69.288	Cavia_porcellus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.497	ENSCCAG00000021202	IREB2	99	68.497	Cebus_capucinus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSCATG00000033462	IREB2	99	68.808	Cercocebus_atys
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.951	ENSCLAG00000008985	IREB2	99	68.951	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSCSAG00000014904	IREB2	99	68.808	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	65.869	ENSCHOG00000004107	IREB2	99	65.869	Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020000623	ireb2	98	66.131	ENSCPBG00000024247	IREB2	99	68.985	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.705	ENSCANG00000029420	IREB2	99	68.705	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.913	ENSCGRG00001019234	Ireb2	99	67.913	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020000623	ireb2	97	67.490	ENSCGRG00000016786	Ireb2	99	67.913	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020000623	ireb2	97	82.371	ENSCSEG00000003080	ireb2	99	82.371	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020000623	ireb2	97	86.406	ENSCVAG00000010739	ireb2	98	86.406	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	75.537	ENSDARG00000021466	ireb2	99	75.537	Danio_rerio
ENSORLG00020000623	ireb2	95	66.460	ENSDNOG00000009614	IREB2	99	68.410	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020000623	ireb2	89	62.225	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	60.166	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020000623	ireb2	73	71.951	ENSETEG00000012717	IREB2	74	71.951	Echinops_telfairi
ENSORLG00020000623	ireb2	96	69.199	ENSEASG00005015622	IREB2	99	69.199	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	69.199	ENSECAG00000016731	IREB2	98	72.363	Equus_caballus
ENSORLG00020000623	ireb2	90	66.556	ENSEEUG00000007999	IREB2	99	66.556	Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	80.761	ENSELUG00000023666	ireb2	99	81.070	Esox_lucius
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.847	ENSFCAG00000001921	IREB2	99	68.847	Felis_catus
ENSORLG00020000623	ireb2	88	69.025	ENSFALG00000010640	IREB2	99	69.025	Ficedula_albicollis
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.847	ENSFDAG00000009355	IREB2	99	68.847	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020000623	ireb2	98	86.721	ENSFHEG00000017905	ireb2	98	86.721	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	78.490	ENSGMOG00000009184	ireb2	99	78.490	Gadus_morhua
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.497	ENSGALG00000035462	IREB2	99	67.497	Gallus_gallus
ENSORLG00020000623	ireb2	98	84.347	ENSGAFG00000005145	ireb2	99	84.347	Gambusia_affinis
ENSORLG00020000623	ireb2	96	85.109	ENSGACG00000007341	ireb2	99	85.109	Gasterosteus_aculeatus
ENSORLG00020000623	ireb2	98	65.628	ENSGAGG00000006117	IREB2	95	67.358	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.601	ENSGGOG00000015650	IREB2	99	68.601	Gorilla_gorilla
ENSORLG00020000623	ireb2	97	87.732	ENSHBUG00000007184	ireb2	99	87.732	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020000623	ireb2	96	69.367	ENSHGLG00000000783	Ireb2	99	69.367	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020000623	ireb2	96	69.367	ENSHGLG00100019429	Ireb2	99	69.367	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020000623	ireb2	94	82.632	ENSHCOG00000007424	ireb2	99	82.632	Hippocampus_comes
ENSORLG00020000623	ireb2	97	75.689	ENSIPUG00000014808	Ireb2	99	76.200	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.601	ENSSTOG00000009273	IREB2	99	68.601	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	63.344	ENSJJAG00000019768	Ireb2	99	63.344	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	87.615	ENSKMAG00000016020	ireb2	99	87.615	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	87.243	ENSLBEG00000020371	ireb2	99	87.243	Labrus_bergylta
ENSORLG00020000623	ireb2	96	62.462	ENSLACG00000001182	IREB2	99	62.462	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020000623	ireb2	97	75.739	ENSLOCG00000015029	ireb2	100	75.943	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.854	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	68.854	Loxodonta_africana
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSMFAG00000039630	IREB2	99	68.808	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSMMUG00000045680	IREB2	99	68.808	Macaca_mulatta
ENSORLG00020000623	ireb2	96	66.839	ENSMNEG00000039698	IREB2	99	66.839	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSMLEG00000031047	IREB2	99	68.808	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	85.979	ENSMAMG00000023095	ireb2	99	86.674	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	87.835	ENSMZEG00005010935	ireb2	99	87.835	Maylandia_zebra
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.565	ENSMGAG00000003688	IREB2	99	67.565	Meleagris_gallopavo
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.187	ENSMICG00000005757	IREB2	99	68.187	Microcebus_murinus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.809	ENSMOCG00000010784	Ireb2	99	67.809	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020000623	ireb2	96	87.033	ENSMMOG00000001385	ireb2	97	87.033	Mola_mola
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.847	ENSMODG00000011768	IREB2	99	68.847	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020000623	ireb2	96	85.239	ENSMALG00000015314	ireb2	99	85.239	Monopterus_albus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.536	MGP_CAROLIEiJ_G0032235	Ireb2	99	68.536	Mus_caroli
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.536	ENSMUSG00000032293	Ireb2	98	70.455	Mus_musculus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.470	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	99	68.470	Mus_pahari
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.536	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	99	68.536	Mus_spretus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	69.055	ENSMPUG00000010978	IREB2	94	69.055	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.802	ENSMLUG00000006783	IREB2	99	67.802	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.991	ENSNGAG00000017333	Ireb2	99	68.991	Nannospalax_galili
ENSORLG00020000623	ireb2	97	87.732	ENSNBRG00000017676	ireb2	99	87.732	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSNLEG00000008549	IREB2	99	68.808	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020000623	ireb2	72	75.728	ENSMEUG00000001630	-	74	75.728	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020000623	ireb2	96	65.349	ENSOPRG00000000340	IREB2	99	65.349	Ochotona_princeps
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.640	ENSODEG00000015993	IREB2	99	68.640	Octodon_degus
ENSORLG00020000623	ireb2	97	88.041	ENSONIG00000012838	ireb2	99	88.041	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.224	ENSOANG00000013218	-	98	68.224	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020000623	ireb2	90	69.604	ENSOCUG00000009907	IREB2	99	69.604	Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020000623	ireb2	99	99.597	ENSORLG00000001943	ireb2	98	99.027	Oryzias_latipes
ENSORLG00020000623	ireb2	100	97.050	ENSORLG00015014057	ireb2	100	98.081	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020000623	ireb2	100	93.019	ENSOMEG00000005120	ireb2	100	94.646	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020000623	ireb2	96	65.735	ENSOGAG00000010622	IREB2	99	65.735	Otolemur_garnettii
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.318	ENSOARG00000000881	IREB2	99	68.318	Ovis_aries
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSPPAG00000038956	IREB2	99	68.808	Pan_paniscus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.951	ENSPPRG00000003145	IREB2	99	68.951	Panthera_pardus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.744	ENSPTIG00000021418	IREB2	86	68.744	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSPTRG00000007342	IREB2	99	68.808	Pan_troglodytes
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.808	ENSPANG00000015813	IREB2	99	68.808	Papio_anubis
ENSORLG00020000623	ireb2	97	75.231	ENSPKIG00000012755	ireb2	99	75.231	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020000623	ireb2	87	69.416	ENSPSIG00000009905	IREB2	98	69.416	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020000623	ireb2	96	82.952	ENSPMGG00000016828	ireb2	99	82.952	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020000623	ireb2	96	68.120	ENSPEMG00000020204	Ireb2	99	68.120	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020000623	ireb2	96	67.451	ENSPCIG00000019022	IREB2	86	69.304	Phascolarctos_cinereus
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ENSORLG00020000623	ireb2	98	87.156	ENSPLAG00000002220	ireb2	99	87.156	Poecilia_latipinna
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ENSORLG00020000623	ireb2	85	67.292	ENSPVAG00000014630	IREB2	87	67.292	Pteropus_vampyrus
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ENSORLG00020000623	ireb2	98	54.138	ENSXETG00000009774	ireb2	99	55.601	Xenopus_tropicalis
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