EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020001020 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2 (1 of many)
Alias: -
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4129 bases
Position: chr1:26737418-26741546
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020024144	IBN_N	PF03810.19	1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020007725	TNPO2 (1 of many)-201	1515	-	ENSORLP00020024144	504 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	83.600	ENSORLG00020011559	tnpo1	56	83.400
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSORLG00020015785	tnpo2	56	95.200

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSG00000105576	TNPO2	100	90.588	Homo_sapiens
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSAPOG00000013185	-	66	95.200	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSAPOG00000009339	TNPO2	56	98.600	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	88.200	ENSAMEG00000012123	TNPO2	55	87.800	Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSACIG00000009586	-	65	98.600	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.400	ENSACIG00000007518	tnpo2	63	95.400	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSAOCG00000010374	tnpo2	56	95.200	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSAOCG00000010152	-	56	98.600	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSAPEG00000013268	-	56	98.600	Amphiprion_percula
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSAPEG00000008429	tnpo2	56	95.200	Amphiprion_percula
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSATEG00000019171	-	56	98.600	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	94.600	ENSATEG00000024761	TNPO2	56	94.600	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.800	ENSACAG00000003576	TNPO2	56	90.600	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSANAG00000036645	TNPO2	56	90.600	Aotus_nancymaae
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSACLG00000020672	-	58	98.600	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.000	ENSACLG00000001853	tnpo2	56	95.000	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSAMXG00000010246	tnpo2	55	95.200	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.818	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	90.419	Bos_taurus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCJAG00000005096	TNPO2	56	90.800	Callithrix_jacchus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCAFG00020005115	TNPO2	56	90.800	Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.800	ENSCHIG00000011718	TNPO2	57	90.400	Capra_hircus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSTSYG00000003828	TNPO2	56	90.800	Carlito_syrichta
ENSORLG00020001020	TNPO2	88	90.950	ENSCAPG00000015700	TNPO2	50	90.724	Cavia_aperea
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.600	ENSCPOG00000007033	TNPO2	56	90.200	Cavia_porcellus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCCAG00000024574	TNPO2	56	90.800	Cebus_capucinus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCATG00000042599	TNPO2	57	90.800	Cercocebus_atys
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.600	ENSCLAG00000013442	TNPO2	56	90.200	Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCSAG00000006597	TNPO2	56	90.800	Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCPBG00000023892	TNPO2	56	91.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020001020	TNPO2	95	89.979	ENSCANG00000027834	TNPO2	55	89.770	Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	56	90.800	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	56	90.800	Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.000	ENSCSEG00000011477	-	64	95.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	88.600	ENSCSEG00000012923	tnpo2	55	88.600	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSCVAG00000001908	TNPO2	56	98.400	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.417	ENSCVAG00000002750	tnpo2	56	92.415	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	89.200	ENSDARG00000038239	tnpo2	56	89.200	Danio_rerio
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	78.088	ENSDNOG00000043264	TNPO2	54	77.888	Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.800	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.971	Dipodomys_ordii
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	70.495	FBgn0024921	Tnpo	57	70.099	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSEASG00005004160	TNPO2	56	90.600	Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSECAG00000013673	TNPO2	56	90.600	Equus_caballus
ENSORLG00020001020	TNPO2	97	96.538	ENSELUG00000016542	-	66	96.538	Esox_lucius
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	96.000	ENSELUG00000008680	tnpo2	55	96.000	Esox_lucius
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSFCAG00000000467	TNPO2	55	90.600	Felis_catus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.600	ENSFDAG00000021543	TNPO2	56	90.200	Fukomys_damarensis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.617	ENSFHEG00000016501	tnpo2	56	92.615	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSFHEG00000009734	TNPO2	57	98.400	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	80.600	ENSGMOG00000009021	tnpo2	55	79.800	Gadus_morhua
ENSORLG00020001020	TNPO2	83	98.148	ENSGMOG00000014237	-	52	98.148	Gadus_morhua
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSGAFG00000010401	TNPO2	56	98.400	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.216	ENSGAFG00000018993	tnpo2	58	93.214	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSGAGG00000010150	TNPO2	56	91.000	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSHBUG00000018317	-	56	98.600	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.000	ENSHBUG00000014849	tnpo2	56	95.000	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.400	ENSHGLG00000016928	TNPO2	56	90.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	89.400	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	89.051	Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSHCOG00000020440	-	56	98.400	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.600	ENSHCOG00000005914	tnpo2	56	92.600	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.400	ENSIPUG00000005768	tnpo2	56	95.400	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.800	ENSIPUG00000006884	TNPO2	56	95.800	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSSTOG00000006952	TNPO2	56	90.800	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	56	90.800	Jaculus_jaculus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	89.800	ENSKMAG00000021274	TNPO2	56	89.800	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.200	ENSKMAG00000018430	TNPO2	56	98.200	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSLBEG00000005301	-	56	98.600	Labrus_bergylta
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.600	ENSLBEG00000026241	tnpo2	58	95.600	Labrus_bergylta
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	86.400	ENSLACG00000012322	TNPO2	56	86.200	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.400	ENSLOCG00000006178	tnpo2	56	95.400	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSLAFG00000003661	TNPO2	56	90.800	Loxodonta_africana
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMFAG00000037531	TNPO2	57	90.800	Macaca_fascicularis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMMUG00000005684	TNPO2	56	90.800	Macaca_mulatta
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMNEG00000041024	TNPO2	57	90.800	Macaca_nemestrina
ENSORLG00020001020	TNPO2	95	89.979	ENSMLEG00000018391	TNPO2	53	90.812	Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSMAMG00000011862	-	56	98.600	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	94.200	ENSMAMG00000023658	tnpo2	63	94.200	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSMZEG00005007408	-	56	98.600	Maylandia_zebra
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.235	ENSMZEG00005011298	TNPO2	58	91.235	Maylandia_zebra
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.000	ENSMZEG00005023965	tnpo2	56	95.000	Maylandia_zebra
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMICG00000016153	TNPO2	57	90.800	Microcebus_murinus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	56	90.800	Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.000	ENSMMOG00000021390	TNPO2	64	98.000	Mola_mola
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	89.066	ENSMMOG00000005063	TNPO2	60	89.066	Mola_mola
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.400	ENSMODG00000006888	TNPO2	56	92.400	Monodelphis_domestica
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.000	ENSMALG00000006232	TNPO2	56	98.000	Monopterus_albus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	93.400	ENSMALG00000004721	tnpo2	56	93.400	Monopterus_albus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	56	90.800	Mus_caroli
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	91.971	Mus_musculus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	56	90.800	Mus_pahari
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	56	90.800	Mus_spretus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSMPUG00000004663	TNPO2	56	90.800	Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020001020	TNPO2	93	91.026	ENSMLUG00000012669	TNPO2	55	90.598	Myotis_lucifugus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	56	90.800	Nannospalax_galili
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	85.600	ENSNBRG00000006242	TNPO2	54	85.600	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSNBRG00000023849	TNPO2	56	98.600	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020001020	TNPO2	100	74.653	ENSNLEG00000012758	TNPO2	55	74.851	Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	84.000	ENSMEUG00000016658	TNPO2	57	84.000	Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.600	ENSODEG00000009670	TNPO2	56	90.200	Octodon_degus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.000	ENSONIG00000002147	tnpo2	56	95.000	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSONIG00000017706	-	56	98.600	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSOANG00000010051	TNPO2	56	90.800	Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSORLG00000010363	tnpo2	56	95.200	Oryzias_latipes
ENSORLG00020001020	TNPO2	100	99.802	ENSORLG00000011763	TNPO2	100	99.802	Oryzias_latipes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	94.000	ENSORLG00015005489	tnpo2	56	93.800	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020001020	TNPO2	100	99.802	ENSORLG00015003941	TNPO2	100	99.802	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSOMEG00000014877	TNPO2	56	95.200	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	99.400	ENSOMEG00000013440	TNPO2	56	99.400	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.800	ENSOARG00000011717	TNPO2	58	90.400	Ovis_aries
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPPAG00000019494	TNPO2	56	90.800	Pan_paniscus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPPRG00000003075	TNPO2	56	90.800	Panthera_pardus
ENSORLG00020001020	TNPO2	96	84.679	ENSPTIG00000011213	TNPO2	62	84.472	Panthera_tigris_altaica
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPTRG00000010535	TNPO2	56	90.800	Pan_troglodytes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPANG00000016857	TNPO2	56	90.800	Papio_anubis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	93.600	ENSPKIG00000004824	tnpo2	56	93.600	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020001020	TNPO2	94	92.308	ENSPKIG00000002899	-	55	90.644	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	87.103	ENSPSIG00000010215	TNPO2	56	86.905	Pelodiscus_sinensis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSPMGG00000016459	TNPO2	64	98.600	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	94.611	ENSPMGG00000022850	tnpo2	100	93.613	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	56	90.800	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSORLG00020001020	TNPO2	97	89.322	ENSPCIG00000015327	TNPO2	52	92.094	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.800	ENSPFOG00000005417	TNPO2	56	98.800	Poecilia_formosa
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.016	ENSPFOG00000012466	tnpo2	56	93.014	Poecilia_formosa
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.800	ENSPLAG00000010687	TNPO2	59	98.800	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.016	ENSPLAG00000018842	tnpo2	56	93.014	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.016	ENSPMEG00000006069	tnpo2	56	93.014	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.800	ENSPMEG00000014011	-	56	98.800	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.617	ENSPREG00000001121	TNPO2	56	92.615	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.800	ENSPREG00000000415	TNPO2	56	98.800	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPPYG00000009602	TNPO2	56	90.800	Pongo_abelii
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	83.499	ENSPCAG00000014916	TNPO2	56	83.101	Procavia_capensis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPCOG00000018386	TNPO2	56	90.800	Propithecus_coquereli
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSPVAG00000013411	TNPO2	55	90.800	Pteropus_vampyrus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSPNYG00000001235	-	58	98.600	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.000	ENSPNYG00000013748	tnpo2	56	95.000	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.400	ENSPNAG00000024491	tnpo2	56	95.400	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	97.800	ENSPNAG00000026208	-	56	97.800	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSRNOG00000003970	Tnpo2	55	90.800	Rattus_norvegicus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSRBIG00000036652	TNPO2	56	90.800	Rhinopithecus_bieti
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSRROG00000040402	TNPO2	56	90.800	Rhinopithecus_roxellana
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSSBOG00000019551	TNPO2	56	90.800	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSORLG00020001020	TNPO2	93	92.521	ENSSHAG00000015858	TNPO2	54	92.521	Sarcophilus_harrisii
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	93.000	ENSSFOG00015010934	tnpo2	56	93.000	Scleropages_formosus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	96.200	ENSSFOG00015018955	TNPO2	56	96.200	Scleropages_formosus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.800	ENSSMAG00000012008	tnpo2	56	95.800	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSSMAG00000004050	-	64	93.825	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.600	ENSSDUG00000001767	tnpo2	56	95.600	Seriola_dumerili
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	ENSSDUG00000002607	TNPO2	56	98.600	Seriola_dumerili
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.600	ENSSLDG00000025629	tnpo2	64	95.600	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSSLDG00000013107	-	56	98.400	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.000	ENSSPUG00000000736	TNPO2	56	90.800	Sphenodon_punctatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	94.611	ENSSPAG00000008511	-	56	94.611	Stegastes_partitus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.200	ENSSPAG00000008512	tnpo2	56	95.200	Stegastes_partitus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSSSCG00000013726	TNPO2	56	90.800	Sus_scrofa
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.400	ENSTRUG00000012698	tnpo2	56	92.400	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	97.600	ENSTRUG00000009453	TNPO2	56	97.600	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	78.200	ENSTNIG00000003295	TNPO2	51	91.931	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	93.000	ENSTNIG00000014071	TNPO2	55	93.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSTTRG00000005443	TNPO2	56	90.800	Tursiops_truncatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	ENSUAMG00000019621	TNPO2	56	90.800	Ursus_americanus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	86.680	ENSUMAG00000006504	TNPO2	55	86.282	Ursus_maritimus
ENSORLG00020001020	TNPO2	85	90.610	ENSVVUG00000023860	TNPO2	92	89.908	Vulpes_vulpes
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	89.200	ENSXETG00000004771	tnpo2	56	88.400	Xenopus_tropicalis
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSXCOG00000014460	TNPO2	57	98.400	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.400	ENSXMAG00000012793	TNPO2	56	98.400	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020001020	TNPO2	99	92.016	ENSXMAG00000014217	TNPO2	56	93.014	Xiphophorus_maculatus