EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020001021 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1774 bases
Position: chr10:1395540-1397313
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020009173	RVT_1	PF00078.27	8.7e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020015491	-	1774	-	ENSORLP00020009173	403 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020001021	-	80	32.219	ENSORLG00020002173	-	72	32.219
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ENSORLG00020001021	-	52	41.232	ENSORLG00020001304	-	54	41.232
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ENSORLG00020001021	-	98	32.170	ENSORLG00020004729	-	58	32.170
ENSORLG00020001021	-	94	31.169	ENSORLG00020015063	-	75	31.169
ENSORLG00020001021	-	100	53.350	ENSORLG00020006709	-	72	53.350
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ENSORLG00020001021	-	98	31.592	ENSORLG00020012063	-	53	31.592
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ENSORLG00020001021	-	98	31.579	ENSORLG00020003828	-	51	31.579
ENSORLG00020001021	-	94	31.169	ENSORLG00020009707	-	75	31.169
ENSORLG00020001021	-	98	31.172	ENSORLG00020010410	-	83	31.172
ENSORLG00020001021	-	82	32.143	ENSORLG00020010414	-	70	32.143
ENSORLG00020001021	-	98	31.078	ENSORLG00020018691	-	57	31.078
ENSORLG00020001021	-	67	34.296	ENSORLG00020020066	-	66	34.296
ENSORLG00020001021	-	98	32.161	ENSORLG00020000622	-	59	32.161
ENSORLG00020001021	-	98	31.156	ENSORLG00020021677	-	80	31.156
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ENSORLG00020001021	-	80	32.219	ENSORLG00020021900	-	71	32.219
ENSORLG00020001021	-	94	31.169	ENSORLG00020011734	-	75	31.169
ENSORLG00020001021	-	98	31.514	ENSORLG00020006422	-	53	31.514
ENSORLG00020001021	-	55	36.000	ENSORLG00020005670	-	83	36.000
ENSORLG00020001021	-	97	31.111	ENSORLG00020008083	-	84	31.111
ENSORLG00020001021	-	69	33.096	ENSORLG00020021536	-	76	33.096
ENSORLG00020001021	-	65	31.203	ENSORLG00020022162	-	69	31.203
ENSORLG00020001021	-	97	30.556	ENSORLG00020011261	-	96	30.556
ENSORLG00020001021	-	98	31.172	ENSORLG00020016342	-	53	31.172
ENSORLG00020001021	-	98	31.830	ENSORLG00020019399	-	72	33.168
ENSORLG00020001021	-	75	30.323	ENSORLG00020016069	-	94	30.323
ENSORLG00020001021	-	98	30.923	ENSORLG00020012251	-	53	30.923
ENSORLG00020001021	-	98	31.421	ENSORLG00020008999	-	53	31.421
ENSORLG00020001021	-	67	34.296	ENSORLG00020001344	-	68	34.296
ENSORLG00020001021	-	94	30.334	ENSORLG00020006220	-	74	30.334
ENSORLG00020001021	-	56	39.912	ENSORLG00020011701	-	55	39.912
ENSORLG00020001021	-	67	34.307	ENSORLG00020002465	-	67	34.307
ENSORLG00020001021	-	80	31.498	ENSORLG00020016243	-	85	31.498
ENSORLG00020001021	-	99	30.000	ENSORLG00020019661	-	76	30.000
ENSORLG00020001021	-	54	32.883	ENSORLG00020005292	-	62	32.883
ENSORLG00020001021	-	100	51.238	ENSORLG00020011014	-	83	51.238
ENSORLG00020001021	-	82	32.143	ENSORLG00020018736	-	80	32.143
ENSORLG00020001021	-	64	30.189	ENSORLG00020006841	-	50	30.189
ENSORLG00020001021	-	88	30.471	ENSORLG00020015554	-	97	30.851
ENSORLG00020001021	-	98	30.576	ENSORLG00020010320	-	84	30.576
ENSORLG00020001021	-	98	32.170	ENSORLG00020004099	-	51	32.170
ENSORLG00020001021	-	63	34.866	ENSORLG00020003812	-	67	34.866

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020001021	-	89	30.707	ENSAOCG00000004576	-	98	30.707	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020001021	-	89	30.623	ENSAPEG00000024502	-	98	30.623	Amphiprion_percula
ENSORLG00020001021	-	99	31.961	ENSATEG00000014607	-	78	31.961	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	51	33.333	ENSATEG00000002253	-	62	33.333	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	52	37.963	ENSATEG00000014313	-	62	37.963	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	99	31.719	ENSATEG00000015931	-	80	31.719	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	99	32.367	ENSATEG00000002739	-	66	32.367	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	99	32.446	ENSATEG00000015490	-	66	32.446	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	80	30.982	ENSATEG00000023197	-	51	30.982	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	97	32.426	ENSATEG00000004857	-	85	32.426	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001021	-	99	30.024	ENSACLG00000004998	-	90	30.508	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	78	30.462	ENSACLG00000001865	-	87	30.462	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	98	30.958	ENSACLG00000014413	-	59	30.958	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	70	32.056	ENSACLG00000001556	-	61	32.056	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	98	30.288	ENSACLG00000019194	-	53	30.288	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	97	30.612	ENSACLG00000005489	-	57	30.749	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	98	30.151	ENSACLG00000008572	-	90	30.151	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	87	31.768	ENSACLG00000023425	-	99	31.169	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	76	32.051	ENSACLG00000002685	-	83	32.051	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	98	32.108	ENSACLG00000014911	-	61	32.108	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	83	30.548	ENSACLG00000027135	-	97	30.548	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	79	30.435	ENSACLG00000010474	-	60	32.364	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	63	33.977	ENSACLG00000020388	-	77	32.270	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	97	31.920	ENSACLG00000010082	-	71	31.920	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	82	30.357	ENSACLG00000006327	-	69	30.000	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	100	48.387	ENSACLG00000006688	-	86	48.387	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	97	30.102	ENSACLG00000007954	-	58	30.102	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	99	31.220	ENSACLG00000013932	-	74	31.220	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	81	30.060	ENSACLG00000013483	-	96	30.060	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	98	30.221	ENSACLG00000013061	-	55	30.221	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	83	30.973	ENSACLG00000022277	-	80	31.402	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001021	-	98	32.754	ENSACLG00000022853	-	74	32.754	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001021	-	74	31.023	ENSPNAG00000003449	-	91	31.023	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001021	-	67	33.091	ENSPNAG00000001796	-	52	33.091	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001021	-	57	32.906	ENSPNAG00000013203	-	86	33.471	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001021	-	67	31.868	ENSSFOG00015016391	-	77	31.868	Scleropages_formosus
ENSORLG00020001021	-	63	32.549	ENSSFOG00015008653	-	65	32.549	Scleropages_formosus
ENSORLG00020001021	-	63	35.135	ENSSDUG00000000707	-	81	35.135	Seriola_dumerili
ENSORLG00020001021	-	82	31.928	ENSSPAG00000002518	-	68	31.928	Stegastes_partitus
ENSORLG00020001021	-	59	31.120	ENSTRUG00000025266	-	86	31.120	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020001021	-	98	30.693	ENSXMAG00000027958	-	61	30.693	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020001021	-	98	30.273	ENSXMAG00000024274	-	74	30.296	Xiphophorus_maculatus
ENSORLG00020001021	-	54	35.426	ENSXMAG00000019451	-	60	35.426	Xiphophorus_maculatus