EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020001622 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1251 bases
Position: chr3:6497416-6498666
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020000915	RVT_1	PF00078.27	4.8e-10	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020013906	-	1251	-	ENSORLP00020000915	303 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSORLG00020001622	-	96	30.976	ENSORLG00020009687	-	52	30.976
ENSORLG00020001622	-	96	54.828	ENSORLG00020011261	-	71	54.828
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ENSORLG00020001622	-	83	52.964	ENSORLG00020010414	-	52	52.964
ENSORLG00020001622	-	96	45.361	ENSORLG00020016788	-	73	45.361
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ENSORLG00020001622	-	96	44.218	ENSORLG00020003888	-	64	44.218
ENSORLG00020001622	-	96	53.103	ENSORLG00020012080	-	61	53.103
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ENSORLG00020001622	-	96	51.195	ENSORLG00020006805	-	61	51.195
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ENSORLG00020001622	-	96	46.599	ENSORLG00020001541	-	75	46.599
ENSORLG00020001622	-	96	54.483	ENSORLG00020002204	-	92	54.483
ENSORLG00020001622	-	96	54.828	ENSORLG00020019862	-	61	54.828
ENSORLG00020001622	-	91	51.613	ENSORLG00020018053	-	55	51.613
ENSORLG00020001622	-	64	42.786	ENSORLG00020016267	-	72	42.786
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ENSORLG00020001622	-	96	51.536	ENSORLG00020008589	-	55	51.536
ENSORLG00020001622	-	96	50.853	ENSORLG00020017390	-	55	50.853
ENSORLG00020001622	-	96	70.790	ENSORLG00020022349	-	54	70.790
ENSORLG00020001622	-	96	91.065	ENSORLG00020014641	-	62	91.065
ENSORLG00020001622	-	96	53.793	ENSORLG00020010320	-	61	53.793
ENSORLG00020001622	-	76	47.186	ENSORLG00020016243	-	64	47.541

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020001622	-	96	46.048	ENSAOCG00000004576	-	79	46.048	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020001622	-	96	45.361	ENSAPEG00000024502	-	78	45.361	Amphiprion_percula
ENSORLG00020001622	-	96	52.234	ENSATEG00000004857	-	63	52.234	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001622	-	96	40.411	ENSATEG00000014055	-	50	40.411	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001622	-	96	52.577	ENSATEG00000015931	-	57	52.577	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001622	-	96	40.753	ENSATEG00000019241	-	82	40.753	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001622	-	96	40.753	ENSATEG00000004798	-	51	40.753	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001622	-	96	52.577	ENSATEG00000014607	-	56	52.577	Anabas_testudineus
ENSORLG00020001622	-	89	45.756	ENSACLG00000005921	-	56	45.205	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	75.517	ENSACLG00000022853	-	54	75.517	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.448	ENSACLG00000017093	-	66	53.448	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	85	52.713	ENSACLG00000000802	-	78	52.713	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	71	41.743	ENSACLG00000013521	-	55	41.743	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	44.483	ENSACLG00000009983	-	79	44.040	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	52.759	ENSACLG00000017363	-	66	52.759	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	98	44.333	ENSACLG00000012076	-	80	44.333	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	48.966	ENSACLG00000013483	-	85	48.966	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	46.233	ENSACLG00000013932	-	54	46.233	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	90	46.324	ENSACLG00000015732	-	79	45.548	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	75.172	ENSACLG00000027135	-	84	75.172	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	78	43.277	ENSACLG00000002591	-	78	43.277	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	47.260	ENSACLG00000015536	-	76	47.260	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	52.759	ENSACLG00000019420	-	58	52.759	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	75.517	ENSACLG00000000230	-	61	75.517	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	96	75.517	ENSACLG00000002171	-	89	75.517	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	72	49.083	ENSACLG00000002725	-	59	49.083	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	88	43.820	ENSACLG00000002685	-	72	43.820	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.103	ENSACLG00000021814	-	52	53.103	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	78	42.373	ENSACLG00000015652	-	90	42.373	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.793	ENSACLG00000013183	-	77	53.793	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	96	53.103	ENSACLG00000010664	-	52	53.103	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	96	49.310	ENSACLG00000014537	-	61	49.310	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	44.483	ENSACLG00000017680	-	84	44.483	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.103	ENSACLG00000000182	-	52	53.103	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	48.973	ENSACLG00000024568	-	69	48.973	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	99	43.709	ENSACLG00000005593	-	79	43.709	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.448	ENSACLG00000026769	-	66	53.448	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.793	ENSACLG00000004232	-	66	53.793	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.103	ENSACLG00000024400	-	56	53.103	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	52.414	ENSACLG00000006202	-	77	52.414	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	81	45.714	ENSACLG00000001865	-	67	45.714	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	46.233	ENSACLG00000020926	-	76	46.233	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	95	44.637	ENSACLG00000023425	-	76	45.205	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.448	ENSACLG00000016639	-	63	53.448	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	53.448	ENSACLG00000008572	-	66	53.448	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	92	76.071	ENSACLG00000027738	-	86	76.071	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	99	44.371	ENSACLG00000017402	-	65	44.371	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	43.103	ENSACLG00000024414	-	76	43.103	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	49.310	ENSACLG00000010284	-	81	49.310	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	50.000	ENSACLG00000005711	-	89	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	96	47.945	ENSACLG00000019417	-	82	47.945	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020001622	-	90	46.324	ENSACLG00000004998	-	65	45.548	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020001622	-	81	55.328	ENSPNAG00000003449	-	74	55.328	Pygocentrus_nattereri
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