EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020001707 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4771 bases
Position: chr4:23830576-23835346
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	1	7
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	2	7
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	3	7
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	4	7
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	5	7
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	6	7
ENSORLP00020001000	zf-C2H2	PF00096.26	8.8e-37	7	7
ENSORLP00020001000	zf-met	PF12874.7	8.1e-12	1	2
ENSORLP00020001000	zf-met	PF12874.7	8.1e-12	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020013754	-	891	-	ENSORLP00020001000	296 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020001707	-	83	47.101	ENSORLG00020010950	-	97	51.429
ENSORLG00020001707	-	82	53.555	ENSORLG00020011149	-	83	53.555
ENSORLG00020001707	-	88	54.338	ENSORLG00020010560	-	99	51.570
ENSORLG00020001707	-	89	45.536	ENSORLG00020016754	-	95	45.536
ENSORLG00020001707	-	93	50.510	ENSORLG00020010953	-	96	42.761
ENSORLG00020001707	-	75	48.077	ENSORLG00020000639	-	59	46.364
ENSORLG00020001707	-	98	51.210	ENSORLG00020017850	-	96	54.091
ENSORLG00020001707	-	87	48.193	ENSORLG00020004313	-	58	48.193
ENSORLG00020001707	-	75	58.000	ENSORLG00020017528	-	71	58.000
ENSORLG00020001707	-	89	50.000	ENSORLG00020008424	-	92	50.000
ENSORLG00020001707	-	95	49.495	ENSORLG00020011234	-	90	49.495
ENSORLG00020001707	-	96	45.200	ENSORLG00020020419	-	97	49.107
ENSORLG00020001707	-	98	47.436	ENSORLG00020008933	-	91	47.436
ENSORLG00020001707	-	75	51.685	ENSORLG00020019341	-	81	58.696
ENSORLG00020001707	-	81	41.964	ENSORLG00020007790	zbtb48	54	41.964
ENSORLG00020001707	-	75	41.975	ENSORLG00020001758	-	55	41.975
ENSORLG00020001707	-	76	40.553	ENSORLG00020018685	znf319b	85	40.164
ENSORLG00020001707	-	98	50.413	ENSORLG00020000481	-	94	55.676
ENSORLG00020001707	-	76	46.460	ENSORLG00020007599	-	74	46.460
ENSORLG00020001707	-	75	50.000	ENSORLG00020021196	-	50	50.000
ENSORLG00020001707	-	95	53.093	ENSORLG00020000161	-	95	53.093
ENSORLG00020001707	-	83	37.555	ENSORLG00020012229	zbtb41	51	38.288
ENSORLG00020001707	-	92	53.125	ENSORLG00020009419	-	95	53.125
ENSORLG00020001707	-	76	55.405	ENSORLG00020015703	-	51	55.909
ENSORLG00020001707	-	76	51.724	ENSORLG00020010020	-	74	51.724
ENSORLG00020001707	-	98	45.139	ENSORLG00020000219	-	78	45.139
ENSORLG00020001707	-	81	40.000	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	65	40.000
ENSORLG00020001707	-	97	54.505	ENSORLG00020009857	-	96	54.505
ENSORLG00020001707	-	95	36.735	ENSORLG00020009554	-	76	38.589
ENSORLG00020001707	-	77	41.441	ENSORLG00020012967	scrt1b	70	41.441
ENSORLG00020001707	-	82	36.496	ENSORLG00020004162	znf341	54	33.962
ENSORLG00020001707	-	98	53.153	ENSORLG00020017483	-	92	53.153
ENSORLG00020001707	-	83	47.552	ENSORLG00020009965	-	89	47.273
ENSORLG00020001707	-	74	49.231	ENSORLG00020004353	-	95	49.231
ENSORLG00020001707	-	96	50.505	ENSORLG00020008891	-	99	52.273
ENSORLG00020001707	-	95	50.612	ENSORLG00020009089	-	63	50.612
ENSORLG00020001707	-	98	36.719	ENSORLG00020010285	znf646	86	36.719
ENSORLG00020001707	-	97	48.768	ENSORLG00020000246	-	98	49.550
ENSORLG00020001707	-	87	44.156	ENSORLG00020001912	znf236	72	44.156
ENSORLG00020001707	-	81	44.361	ENSORLG00020018495	-	64	44.361
ENSORLG00020001707	-	81	48.198	ENSORLG00020008018	-	74	48.198
ENSORLG00020001707	-	75	34.286	ENSORLG00020010923	-	57	34.286
ENSORLG00020001707	-	75	52.174	ENSORLG00020006148	-	50	52.174
ENSORLG00020001707	-	98	50.000	ENSORLG00020010636	-	83	50.000
ENSORLG00020001707	-	83	52.511	ENSORLG00020009184	-	97	43.028
ENSORLG00020001707	-	81	40.000	ENSORLG00020018791	-	87	40.359
ENSORLG00020001707	-	75	52.466	ENSORLG00020010916	-	58	52.466
ENSORLG00020001707	-	78	45.000	ENSORLG00020001922	-	85	43.411
ENSORLG00020001707	-	97	53.363	ENSORLG00020018069	-	97	51.364
ENSORLG00020001707	-	76	48.731	ENSORLG00020016666	-	71	45.714
ENSORLG00020001707	-	90	51.813	ENSORLG00020016037	-	97	51.111
ENSORLG00020001707	-	90	57.062	ENSORLG00020009180	-	99	57.062
ENSORLG00020001707	-	83	39.834	ENSORLG00020004889	ZNF319	88	39.834
ENSORLG00020001707	-	75	41.481	ENSORLG00020008787	snai2	55	41.481
ENSORLG00020001707	-	94	50.481	ENSORLG00020007967	-	92	50.481
ENSORLG00020001707	-	91	50.000	ENSORLG00020010171	-	97	52.381
ENSORLG00020001707	-	76	43.636	ENSORLG00020008744	-	67	39.919
ENSORLG00020001707	-	83	54.091	ENSORLG00020007018	-	75	54.091
ENSORLG00020001707	-	75	40.476	ENSORLG00020018051	prdm5	73	40.476
ENSORLG00020001707	-	80	51.754	ENSORLG00020011075	-	75	51.754
ENSORLG00020001707	-	76	49.246	ENSORLG00020010038	-	57	49.246
ENSORLG00020001707	-	83	31.915	ENSORLG00020005815	-	74	35.606
ENSORLG00020001707	-	73	39.259	ENSORLG00020001791	-	66	38.158
ENSORLG00020001707	-	96	56.373	ENSORLG00020017164	-	96	56.373
ENSORLG00020001707	-	99	52.703	ENSORLG00020009943	-	99	52.703
ENSORLG00020001707	-	77	52.511	ENSORLG00020010647	-	84	52.511
ENSORLG00020001707	-	76	52.466	ENSORLG00020021857	-	54	52.466
ENSORLG00020001707	-	74	48.592	ENSORLG00020006820	-	66	48.592
ENSORLG00020001707	-	97	49.206	ENSORLG00020018921	-	91	49.206
ENSORLG00020001707	-	75	54.709	ENSORLG00020017514	-	73	54.709
ENSORLG00020001707	-	93	53.757	ENSORLG00020010880	-	92	55.556
ENSORLG00020001707	-	79	44.444	ENSORLG00020006144	-	74	41.667
ENSORLG00020001707	-	75	46.471	ENSORLG00020005132	-	96	48.182
ENSORLG00020001707	-	92	46.763	ENSORLG00020008484	-	98	46.763
ENSORLG00020001707	-	75	50.909	ENSORLG00020010932	-	68	50.909
ENSORLG00020001707	-	69	48.611	ENSORLG00020002700	znf367	63	48.611
ENSORLG00020001707	-	84	38.261	ENSORLG00020018503	-	76	39.640
ENSORLG00020001707	-	76	38.318	ENSORLG00020000009	znf710b	51	38.053
ENSORLG00020001707	-	77	48.148	ENSORLG00020000264	-	50	48.148
ENSORLG00020001707	-	95	49.029	ENSORLG00020010250	-	97	48.402
ENSORLG00020001707	-	93	33.186	ENSORLG00020014595	PRDM15	52	33.186
ENSORLG00020001707	-	84	47.436	ENSORLG00020009139	-	98	45.361
ENSORLG00020001707	-	99	50.218	ENSORLG00020008346	-	99	50.218
ENSORLG00020001707	-	77	51.765	ENSORLG00020004370	-	79	51.765
ENSORLG00020001707	-	97	41.538	ENSORLG00020002128	-	96	41.538
ENSORLG00020001707	-	86	45.283	ENSORLG00020002817	GFI1	57	45.283
ENSORLG00020001707	-	92	55.556	ENSORLG00020019227	-	63	54.955
ENSORLG00020001707	-	86	44.375	ENSORLG00020003719	GFI1B	65	44.375
ENSORLG00020001707	-	75	57.576	ENSORLG00020007074	-	95	57.576
ENSORLG00020001707	-	98	53.535	ENSORLG00020010804	-	96	53.110

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020001707	-	98	52.414	ENSACIG00000017013	-	75	53.237	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020001707	-	75	49.462	ENSAMXG00000035683	-	91	49.462	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020001707	-	76	48.168	ENSCPBG00000002063	-	56	48.168	Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020001707	-	76	51.825	ENSGAGG00000005331	-	80	51.825	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020001707	-	79	41.509	ENSGAGG00000017640	-	84	41.509	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020001707	-	76	48.187	ENSHCOG00000001292	-	68	48.193	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001707	-	76	49.669	ENSHCOG00000014786	-	94	49.669	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001707	-	82	45.783	ENSIPUG00000015203	-	53	45.783	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020001707	-	82	47.489	ENSIPUG00000015601	-	56	49.701	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020001707	-	80	50.000	ENSLBEG00000011040	-	51	50.000	Labrus_bergylta
ENSORLG00020001707	-	75	52.113	ENSPCIG00000019333	-	99	52.113	Phascolarctos_cinereus
ENSORLG00020001707	-	82	57.051	ENSPFOG00000024567	-	99	56.716	Poecilia_formosa
ENSORLG00020001707	-	91	51.176	ENSPFOG00000011209	-	73	50.581	Poecilia_formosa
ENSORLG00020001707	-	83	48.421	ENSPMEG00000016762	-	92	48.421	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020001707	-	80	46.114	ENSPNAG00000009741	-	58	46.114	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001707	-	81	47.664	ENSPNAG00000018409	-	87	47.664	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020001707	-	80	48.824	ENSPNAG00000008491	-	79	48.824	Pygocentrus_nattereri