EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020001791 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 828 bases
Position: chr8:8690224-8691051
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020021816	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-15	1	2
ENSORLP00020021816	zf-C2H2	PF00096.26	9.9e-15	2	2
ENSORLP00020021816	zf-met	PF12874.7	2.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020013624	-	828	-	ENSORLP00020021816	275 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020001791	-	68	35.461	ENSORLG00020010923	-	53	35.461
ENSORLG00020001791	-	74	39.669	ENSORLG00020010880	-	89	39.669
ENSORLG00020001791	-	89	38.849	ENSORLG00020015703	-	81	38.849
ENSORLG00020001791	-	88	36.806	ENSORLG00020009943	-	98	36.806
ENSORLG00020001791	-	95	36.170	ENSORLG00020008744	-	59	36.170
ENSORLG00020001791	-	57	43.421	ENSORLG00020008933	-	63	43.421
ENSORLG00020001791	-	66	38.158	ENSORLG00020001707	-	73	39.259
ENSORLG00020001791	-	59	34.646	ENSORLG00020018503	-	75	34.646
ENSORLG00020001791	-	51	37.500	ENSORLG00020010916	-	54	37.500
ENSORLG00020001791	-	65	37.594	ENSORLG00020010020	-	78	37.594
ENSORLG00020001791	-	91	35.772	ENSORLG00020004313	-	65	35.772
ENSORLG00020001791	-	59	36.486	ENSORLG00020006144	-	84	36.486
ENSORLG00020001791	-	75	38.235	ENSORLG00020011149	-	92	38.235
ENSORLG00020001791	-	59	38.621	ENSORLG00020010171	-	96	37.324
ENSORLG00020001791	-	63	44.595	ENSORLG00020018685	znf319b	74	37.241
ENSORLG00020001791	-	77	43.421	ENSORLG00020009419	-	95	43.421
ENSORLG00020001791	-	59	39.450	ENSORLG00020010038	-	62	53.012
ENSORLG00020001791	-	51	42.105	ENSORLG00020006820	-	56	42.105
ENSORLG00020001791	-	77	38.732	ENSORLG00020005132	-	90	38.732
ENSORLG00020001791	-	52	45.455	ENSORLG00020001912	znf236	55	45.455
ENSORLG00020001791	-	52	40.789	ENSORLG00020004889	ZNF319	62	40.789
ENSORLG00020001791	-	91	41.481	ENSORLG00020021196	-	74	41.481
ENSORLG00020001791	-	72	36.806	ENSORLG00020008891	-	98	36.806
ENSORLG00020001791	-	73	36.154	ENSORLG00020016754	-	94	38.849
ENSORLG00020001791	-	85	34.074	ENSORLG00020018921	-	86	34.074
ENSORLG00020001791	-	51	39.316	ENSORLG00020010647	-	74	39.316
ENSORLG00020001791	-	51	40.230	ENSORLG00020000639	-	75	40.230
ENSORLG00020001791	-	51	47.368	ENSORLG00020017528	-	97	47.368
ENSORLG00020001791	-	62	37.222	ENSORLG00020003719	GFI1B	57	37.222
ENSORLG00020001791	-	92	37.500	ENSORLG00020010560	-	98	41.509
ENSORLG00020001791	-	91	35.766	ENSORLG00020018495	-	77	35.766
ENSORLG00020001791	-	73	37.324	ENSORLG00020009857	-	96	37.324
ENSORLG00020001791	-	93	35.714	ENSORLG00020009089	-	86	35.971
ENSORLG00020001791	-	52	44.706	ENSORLG00020018791	-	83	44.706
ENSORLG00020001791	-	50	38.889	ENSORLG00020007074	-	76	38.889
ENSORLG00020001791	-	80	36.620	ENSORLG00020017850	-	100	36.620
ENSORLG00020001791	-	52	35.766	ENSORLG00020007790	zbtb48	53	35.766
ENSORLG00020001791	-	51	48.649	ENSORLG00020010804	-	86	48.649
ENSORLG00020001791	-	80	39.716	ENSORLG00020010250	-	93	39.716
ENSORLG00020001791	-	58	44.000	ENSORLG00020009554	-	77	44.000
ENSORLG00020001791	-	92	36.111	ENSORLG00020008018	-	90	36.111
ENSORLG00020001791	-	93	44.156	ENSORLG00020000219	-	87	44.156
ENSORLG00020001791	-	72	41.549	ENSORLG00020016666	-	70	43.333
ENSORLG00020001791	-	52	41.667	ENSORLG00020002817	GFI1	57	41.667
ENSORLG00020001791	-	86	36.975	ENSORLG00020010636	-	89	36.975
ENSORLG00020001791	-	52	34.507	ENSORLG00020004353	-	99	34.507
ENSORLG00020001791	-	57	40.789	ENSORLG00020011075	-	73	40.789
ENSORLG00020001791	-	51	39.130	ENSORLG00020010953	-	70	39.130
ENSORLG00020001791	-	52	40.351	ENSORLG00020000009	znf710b	51	40.351
ENSORLG00020001791	-	75	36.000	ENSORLG00020008346	-	99	35.659
ENSORLG00020001791	-	51	38.971	ENSORLG00020007018	-	71	38.971
ENSORLG00020001791	-	51	37.500	ENSORLG00020000246	-	74	37.500
ENSORLG00020001791	-	79	39.837	ENSORLG00020000161	-	93	39.837
ENSORLG00020001791	-	63	50.000	ENSORLG00020009184	-	96	38.028
ENSORLG00020001791	-	75	35.200	ENSORLG00020009180	-	91	45.205
ENSORLG00020001791	-	80	40.714	ENSORLG00020017164	-	99	40.845
ENSORLG00020001791	-	53	51.351	ENSORLG00020009139	-	97	38.776
ENSORLG00020001791	-	50	40.625	ENSORLG00020001922	-	60	38.462
ENSORLG00020001791	-	54	38.158	ENSORLG00020017514	-	73	38.158
ENSORLG00020001791	-	56	44.681	ENSORLG00020007599	-	84	44.681
ENSORLG00020001791	-	69	41.379	ENSORLG00020010950	-	93	41.121
ENSORLG00020001791	-	56	41.481	ENSORLG00020009965	-	88	41.481
ENSORLG00020001791	-	67	40.909	ENSORLG00020002128	-	88	40.602
ENSORLG00020001791	-	52	35.556	ENSORLG00020018051	prdm5	68	35.556
ENSORLG00020001791	-	52	35.075	ENSORLG00020011234	-	71	35.075
ENSORLG00020001791	-	51	36.765	ENSORLG00020008484	-	84	36.765
ENSORLG00020001791	-	51	41.304	ENSORLG00020000481	-	80	44.737
ENSORLG00020001791	-	56	37.037	ENSORLG00020004370	-	70	37.037
ENSORLG00020001791	-	51	37.778	ENSORLG00020020419	-	74	37.778
ENSORLG00020001791	-	75	42.308	ENSORLG00020007967	-	97	42.308
ENSORLG00020001791	-	80	36.986	ENSORLG00020016037	-	93	43.243
ENSORLG00020001791	-	72	42.336	ENSORLG00020018069	-	94	42.336
ENSORLG00020001791	-	51	34.722	ENSORLG00020008424	-	79	34.722
ENSORLG00020001791	-	76	38.571	ENSORLG00020017483	-	99	38.571

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020001791	-	86	43.243	ENSAPOG00000005259	-	91	41.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020001791	-	91	33.333	ENSAPOG00000022174	-	98	34.459	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020001791	-	55	35.135	ENSAPOG00000011470	-	66	35.135	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020001791	-	53	50.980	ENSAPOG00000021980	-	89	50.980	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020001791	-	71	42.857	ENSACIG00000023212	-	81	42.857	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020001791	-	67	38.750	ENSACIG00000001860	-	52	38.750	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020001791	-	82	38.129	ENSACIG00000009717	-	90	40.714	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020001791	-	61	42.143	ENSAOCG00000013978	-	92	42.143	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020001791	-	74	35.135	ENSAOCG00000007388	-	59	35.135	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020001791	-	93	41.045	ENSAPEG00000013550	-	96	41.045	Amphiprion_percula
ENSORLG00020001791	-	61	42.143	ENSAPEG00000012217	-	69	42.143	Amphiprion_percula
ENSORLG00020001791	-	55	39.416	ENSACAG00000015141	-	87	39.416	Anolis_carolinensis
ENSORLG00020001791	-	52	37.333	ENSAMXG00000029059	-	78	31.132	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020001791	-	56	48.148	ENSCSAVG00000006608	-	99	48.148	Ciona_savignyi
ENSORLG00020001791	-	52	42.857	ENSCSAVG00000006650	-	99	42.000	Ciona_savignyi
ENSORLG00020001791	-	62	34.247	ENSCSAVG00000006141	-	100	40.141	Ciona_savignyi
ENSORLG00020001791	-	52	33.566	ENSCSAVG00000006745	-	87	33.566	Ciona_savignyi
ENSORLG00020001791	-	62	36.975	ENSCSAVG00000000690	-	99	37.363	Ciona_savignyi
ENSORLG00020001791	-	56	44.144	ENSCVAG00000002500	-	85	44.144	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020001791	-	52	38.636	ENSCVAG00000002506	-	97	39.286	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020001791	-	52	37.681	ENSCVAG00000018485	-	95	37.681	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020001791	-	53	31.579	ENSCVAG00000013048	-	67	31.579	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020001791	-	52	33.929	FBgn0037120	CG11247	61	32.374	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020001791	-	51	46.296	FBgn0020309	crol	54	46.296	Drosophila_melanogaster
ENSORLG00020001791	-	51	34.722	ENSEBUG00000009220	-	72	34.722	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020001791	-	57	35.616	ENSEBUG00000015456	-	90	35.616	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020001791	-	59	46.429	ENSEBUG00000006811	-	62	46.429	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020001791	-	51	35.036	ENSEBUG00000006233	-	63	34.752	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020001791	-	63	50.704	ENSFHEG00000013486	-	77	50.704	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	74	39.259	ENSFHEG00000013803	-	86	39.259	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	73	40.217	ENSFHEG00000006765	-	73	40.217	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	94	35.461	ENSFHEG00000007396	-	99	35.461	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	94	36.029	ENSFHEG00000013625	-	95	36.029	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	95	40.000	ENSFHEG00000005983	-	86	40.000	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	51	37.500	ENSFHEG00000013820	-	58	37.500	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	51	48.387	ENSFHEG00000013302	-	78	48.387	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	74	37.762	ENSFHEG00000017989	-	86	37.762	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	73	39.437	ENSFHEG00000003405	-	77	43.243	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	63	40.000	ENSFHEG00000017885	-	89	40.000	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	51	40.426	ENSFHEG00000005993	-	73	40.426	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	62	49.091	ENSFHEG00000019704	-	98	49.091	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	87	41.096	ENSFHEG00000016540	-	95	50.000	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	77	40.000	ENSFHEG00000013792	-	90	39.167	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	62	40.580	ENSFHEG00000015571	-	76	40.580	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	86	40.714	ENSFHEG00000021003	-	84	40.714	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020001791	-	79	32.653	ENSGAFG00000000521	-	92	32.870	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001791	-	81	42.857	ENSGAFG00000014188	-	97	48.000	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001791	-	93	39.098	ENSGAFG00000011999	-	95	46.053	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001791	-	52	33.621	ENSGAFG00000003119	-	67	33.621	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001791	-	52	41.905	ENSGAFG00000012733	-	50	40.441	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001791	-	55	37.069	ENSGAFG00000012083	-	50	37.069	Gambusia_affinis
ENSORLG00020001791	-	77	34.234	ENSHCOG00000010332	-	83	34.234	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001791	-	75	39.860	ENSHCOG00000020972	-	99	39.860	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001791	-	51	36.975	ENSHCOG00000008601	-	79	36.975	Hippocampus_comes
ENSORLG00020001791	-	61	43.836	ENSIPUG00000019205	-	53	43.836	Ictalurus_punctatus
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ENSORLG00020001791	-	50	49.091	ENSKMAG00000020025	-	90	49.091	Kryptolebias_marmoratus
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